TFB1M - TFB1M

TFB1M
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4GC5, 4GC9
Идентификаторы
Псевдонимы	TFB1M, CGI75, mtTFB, mtTFB1, CGI-75, фактор транскрипции B1, митохондриальный
Внешние идентификаторы	OMIM: 607033 MGI: 2146851 ГомолоГен: 9343 Генные карты: TFB1M
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6q25.3 Начинать 155,256,134 бп[1] Конец 155,314,493 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 17 (мышь)[2] Группа 17 | 17 A1 Начинать 3,519,256 бп[2] Конец 3,557,781 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность метилтрансферазы • трансферазная активность • Связывание ДНК • рРНК-метилтрансферазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • рРНК (аденин-N6, N6 -) - диметилтрансферазная активность • Связывание РНК Сотовый компонент • митохондриальный матрикс • митохондриальный нуклеоид • митохондрия Биологический процесс • обработка рРНК • метилирование • митохондриальная организация • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • метилирование рРНК • транскрипция, ДНК-шаблон • модификация рРНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	51106	224481
Ансамбль	ENSG00000029639	ENSMUSG00000036983
UniProt	Q8WVM0	Q8JZM0
RefSeq (мРНК)	NM_016020 NM_001350501 NM_001350502	NM_146074
RefSeq (белок)	NP_057104 NP_001337430 NP_001337431	NP_666186
Расположение (UCSC)	Chr 6: 155.26 - 155.31 Мб	Chr 17: 3.52 - 3.56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Диметиладенозинтрансфераза 1, митохондриальная; Фактор транскрипции B1, митохондриальный митохондриальный фермент что в кодируется TFB1M ген.^[5][6][7]

TFB1M - митохондриальная метилтрансфераза, использующая S-аденозил метионин диметилировать два высококонсервативных аденозин остатки на 3'-конце митохондриальной 12S рРНК тем самым регулируя сборку или стабильность малой субъединицы митохондриальной рибосомы.^[6][8][9]

Кроме того, было продемонстрировано, что TFB1M стимулирует транскрипцию с промоторных матриц в in vitro система, содержащая рекомбинантную митохондриальную РНК-полимеразу и TFAM.^[10] Нет экспериментальных данных, подтверждающих, что эта функция имеет место. in vivo; паралогичный TFB2M более специфичен для этой роли.^[11]

Взаимодействия

TFB1M был показан взаимодействовать с TFAM.^[12]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000029639 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000036983 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лай Ч., Чжоу Ц.Й., Чан ЛЙ, Лю Ц.С., Лин В. (август 2000 г.). «Идентификация новых человеческих генов, эволюционно консервативных у Caenorhabditis elegans, с помощью сравнительной протеомики». Genome Res. 10 (5): 703–13. Дои:10.1101 / гр.10.5.703. ЧВК  310876. PMID  10810093.
6. Маккаллох V, Зайдель-Рогол Б.Л., Шадель Г.С. (январь 2002 г.). «Фактор транскрипции митохондрий человека связан с РНК-аденин-метилтрансферазами и связывает S-аденозилметионин». Mol Cell Biol. 22 (4): 1116–25. Дои:10.1128 / MCB.22.4.1116-1125.2002. ЧВК  134642. PMID  11809803.
7. «Ген Entrez: фактор транскрипции В1 TFB1M, митохондриальный».
8. Фалькенберг М, Гаспари М., Рантанен А. и др. (2002). «Митохондриальные факторы транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». Nat. Genet. 31 (3): 289–94. Дои:10,1038 / ng909. PMID  12068295. S2CID  11164308.
9. Методиев М.Д .; Леско Н; Park CB; Camara Y .; Shi Y .; Wibom R .; Hultenby K .; Густафссон CM; Ларссон Н.Г. (Апрель 2009 г.). «Метилирование 12S рРНК необходимо для стабильности in vivo малой субъединицы митохондриальной рибосомы млекопитающих». Cell Metab. 9 (4): 386–97. Дои:10.1016 / j.cmet.2009.03.001. PMID  19356719.
10. Фалькенберг М., Гаспари М., Рантанен А. и др. (2002). «Факторы митохондриальной транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». Nat. Genet. 31 (3): 289–94. Дои:10,1038 / ng909. PMID  12068295. S2CID  11164308.
11. Хиллен, HS; Морозов Ю.И.; Сарфаллах, А; Темяков, Д; Крамер, П. (16 ноября 2017 г.). «Структурные основы инициации митохондриальной транскрипции». Клетка. 171 (5): 1072–1081.e10. Дои:10.1016 / j.cell.2017.10.036. ЧВК  6590061. PMID  29149603.
12. Маккалок, Вики; Шадель Джеральд S (август 2003 г.). «Фактор транскрипции митохондрий человека B1 взаимодействует с С-концевой областью активации h-mtTFA и стимулирует транскрипцию независимо от его активности РНК-метилтрансферазы». Мол. Клетка. Биол. 23 (16): 5816–24. Дои:10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003. ISSN  0270-7306. ЧВК  166325. PMID  12897151.

дальнейшее чтение

• Фалькенберг М., Гаспари М., Рантанен А. и др. (2002). «Факторы митохондриальной транскрипции B1 и B2 активируют транскрипцию мтДНК человека». Nat. Genet. 31 (3): 289–94. Дои:10,1038 / ng909. PMID  12068295. S2CID  11164308.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Зайдель-Рогол Б.Л., Маккалок V, Шадель Г.С. (2003). «Человеческий митохондриальный фактор транскрипции B1 метилирует рибосомную РНК на консервативной стебле-петле». Nat. Genet. 33 (1): 23–4. Дои:10,1038 / ng1064. PMID  12496758. S2CID  169443.
• Рантанен А., Гаспари М., Фалькенберг М. и др. (2003). «Характеристика мышиных генов митохондриальных факторов транскрипции B1 и B2». Мамм. Геном. 14 (1): 1–6. Дои:10.1007 / s00335-002-2218-z. PMID  12532263. S2CID  25379746.
• Маккаллох V, Шадель Г.С. (2003). «Фактор транскрипции митохондрий человека B1 взаимодействует с С-концевой областью активации h-mtTFA и стимулирует транскрипцию независимо от его активности РНК-метилтрансферазы». Мол. Клетка. Биол. 23 (16): 5816–24. Дои:10.1128 / MCB.23.16.5816-5824.2003. ЧВК  166325. PMID  12897151.
• Мунгалл А.Дж., Палмер С.А., Симс С.К. и др. (2003). «Последовательность ДНК и анализ хромосомы 6 человека». Природа. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003Натура.425..805М. Дои:10.1038 / природа02055. PMID  14574404.
• Быховская Ю., Менгеша Е., Ван Д. и др. (2004). «Человеческий митохондриальный фактор транскрипции B1 как ген-модификатор потери слуха, связанный с митохондриальной мутацией A1555G». Мол. Genet. Метаб. 82 (1): 27–32. Дои:10.1016 / j.ymgme.2004.01.020. PMID  15110318.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Глейзер Н., Веркаутерен К., Скарпулла Р.К. (2005). «Контроль факторов специфичности митохондриальной транскрипции (TFB1M и TFB2M) с помощью ядерных респираторных факторов (NRF-1 и NRF-2) и коактиваторов семейства PGC-1». Мол. Клетка. Биол. 25 (4): 1354–66. Дои:10.1128 / MCB.25.4.1354-1366.2005. ЧВК  548005. PMID  15684387.
• Котни Дж., Ван З., Шадель Г.С. (2007). «Относительное количество митохондриальной транскрипционной системы человека и различные роли h-mtTFB1 и h-mtTFB2 в митохондриальном биогенезе и экспрессии генов». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (12): 4042–54. Дои:10.1093 / нар / гкм424. ЧВК  1919481. PMID  17557812.