TIAL1 - TIAL1

TIAL1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1X4G, 2CQI, 2DH7
Идентификаторы
Псевдонимы	TIAL1, TCBP, TIAR, TIA1, связанный с цитотоксическими гранулами, РНК-связывающий белок, подобный 1, TIA1, цитотоксические гранулы, ассоциированный с РНК-связывающим белком, подобный 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 603413 MGI: 107913 ГомолоГен: 87796 Генные карты: TIAL1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 10 (человек)[1] Группа 10q26.11 Начните 119,571,802 бп[1] Конец 119,597,029 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F3 Начните 128,439,777 бп[2] Конец 128,461,717 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Привязка элементов AU-rich • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК • Связывание ДНК • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области Сотовый компонент • цитоплазма • Гранула стресса • лизосома • внеклеточная экзосома • ядро клетки • нуклеоплазма • рибонуклеопротеин Биологический процесс • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • развитие половых клеток • ответ защиты • деление стволовых клеток • положительное регулирование пролиферации клеток • апоптотический процесс • сигнальный путь рецептора фактора роста фибробластов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7073	21843
Ансамбль	ENSG00000151923	ENSMUSG00000030846
UniProt	Q01085	P70318
RefSeq (мРНК)	NM_001033925 NM_003252 NM_001323964 NM_001323965 NM_001323967 NM_001323968 NM_001323969 NM_001323970	NM_009383 NM_001347640 NM_001347641
RefSeq (белок)	NP_001029097 NP_001310893 NP_001310894 NP_001310896 NP_001310897 NP_001310898 NP_001310899 NP_003243	NP_001334569 NP_001334570 NP_033409
Расположение (UCSC)	Chr 10: 119,57 - 119,6 Мб	Chr 7: 128,44 - 128,46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Нуклеолизин ТИАР это белок что у людей кодируется TIAL1 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства РНК -связывающие белки, имеет три Мотивы распознавания РНК (RRMs) и связывает аденин и уридин -богатые элементы в мРНК и пре-мРНК широкого спектра генов. Он регулирует различные действия, включая контроль трансляции, сращивание и апоптоз. Альтернативные варианты транскрипционного сплайсинга, кодирующие разные изоформы, были охарактеризованы. Было показано, что разные изоформы по-разному действуют в отношении посттранскрипционного сайленсинга.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000151923 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030846 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Каваками А., Тиан К., Дуан Х, Стрёли М., Шлоссман С.Ф., Андерсон П. (октябрь 1992 г.). «Идентификация и функциональная характеристика нуклеолизина, связанного с TIA-1». Proc Natl Acad Sci U S A. 89 (18): 8681–5. Дои:10.1073 / пнас.89.18.8681. ЧВК  49984. PMID  1326761.
6. "Ген Entrez: TIAL1 TIA1 цитотоксические гранулы, связанные с РНК-связывающим белком, подобным 1".

дальнейшее чтение

• Taupin JL, Tian Q, Kedersha N, et al. (1995). «РНК-связывающий белок TIAR перемещается из ядра в цитоплазму во время Fas-опосредованной апоптотической гибели клетки». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 92 (5): 1629–33. Дои:10.1073 / pnas.92.5.1629. ЧВК  42573. PMID  7533298.
• Дембер Л. М., Ким Н. Д., Лю К. К., Андерсон П. (1996). «Отдельные мотивы распознавания РНК TIA-1 и TIAR имеют разные специфичности связывания РНК». J. Biol. Chem. 271 (5): 2783–8. Дои:10.1074 / jbc.271.5.2783. PMID  8576255.
• Дои Т., Минами Т., Ито М. и др. (1997). «Альтернативная форма нуклеолизина связывается с Т-кластерной ДНК в элементе глушителя гена фактора 4 тромбоцитов». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 235 (3): 625–30. Дои:10.1006 / bbrc.1997.6817. PMID  9207209.
• Джин К., Ли В., Нагаяма Т. и др. (2000). «Экспрессия РНК-связывающего белка TIAR увеличивается в нейронах после ишемического повреждения головного мозга». J. Neurosci. Res. 59 (6): 767–74. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-4547 (20000315) 59: 6 <767 :: AID-JNR9> 3.0.CO; 2-K. PMID  10700014.
• Ле Гуинер С., Лежен Ф., Галиана Д. и др. (2001). «TIA-1 и TIAR активируют сплайсинг альтернативных экзонов со слабыми 5'-сайтами сплайсинга с последующим U-богатым участком на их собственных пре-мРНК». J. Biol. Chem. 276 (44): 40638–46. Дои:10.1074 / jbc.M105642200. PMID  11514562.
• Исени Ф., Гарцин Д., Нишио М. и др. (2002). «Конечная РНК вируса Сендай связывает TIAR, клеточный белок, участвующий в индуцированном вирусом апоптозе». EMBO J. 21 (19): 5141–50. Дои:10.1093 / emboj / cdf513. ЧВК  129035. PMID  12356730.
• Ли В., Ли Й, Кедерша Н. и др. (2002). «Клеточные белки TIA-1 и TIAR взаимодействуют с 3 'стволовой петлей комплементарной минус-цепи РНК вируса Западного Нила и способствуют репликации вируса». Дж. Вирол. 76 (23): 11989–2000. Дои:10.1128 / JVI.76.23.11989-12000.2002. ЧВК  136884. PMID  12414941.
• Yu Q, Cok SJ, Zeng C, Morrison AR (2003). «Репрессия трансляции матриксных металлопротеиназ-13 человека с помощью альтернативно сплайсированной формы ограниченного Т-клетками внутриклеточного антиген-родственного белка (TIAR)». J. Biol. Chem. 278 (3): 1579–84. Дои:10.1074 / jbc.M203526200. PMID  12426321.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ле Гуинер К., Женель М.К., Бретнах Р. (2003). «TIA-1 или TIAR требуется для жизнеспособности клеток DT40». J. Biol. Chem. 278 (12): 10465–76. Дои:10.1074 / jbc.M212378200. PMID  12533540.
• Кок SJ, Эктон SJ, Моррисон AR (2003). «Проксимальная область 3'-нетранслируемой области циклооксигеназы-2 распознается мультимерным белковым комплексом, содержащим HuR, TIA-1, TIAR и гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин U». J. Biol. Chem. 278 (38): 36157–62. Дои:10.1074 / jbc.M302547200. PMID  12855701.
• Чжу Х., Хасман Р.А., Янг К.М. и др. (2003). «U1 snRNP-зависимая функция TIAR в регуляции альтернативного процессинга РНК пре-мРНК кальцитонина человека / CGRP». Мол. Cell. Биол. 23 (17): 5959–71. Дои:10.1128 / MCB.23.17.5959-5971.2003. ЧВК  180986. PMID  12917321.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Шукла С., Дирксен В.П., Джойс К.М. и др. (2004). «Белки TIA необходимы, но недостаточны для тканеспецифического сплайсинга субъединицы 1 миозинфосфатазы». J. Biol. Chem. 279 (14): 13668–76. Дои:10.1074 / jbc.M314138200. PMID  14736875.
• Эсклатин А, Таддео Б, Ройзман Б (2004). «Вирус простого герпеса 1 индуцирует накопление TIA-1 / TIAR в цитоплазме, а также синтез и накопление в цитоплазме тристетрапролина, двух клеточных белков, которые связывают и дестабилизируют РНК, богатые AU». Дж. Вирол. 78 (16): 8582–92. Дои:10.1128 / JVI.78.16.8582-8592.2004. ЧВК  479066. PMID  15280467.
• Хуа Й, Чжоу Дж (2004). «Белок выживания мотонейрона облегчает сборку стрессовых гранул». FEBS Lett. 572 (1–3): 69–74. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.07.010. PMID  15304326. S2CID  27599172.
• Suswam EA, Nabors LB, Huang Y и др. (2005). «IL-1beta индуцирует стабилизацию мРНК IL-8 в клетках злокачественного рака груди через 3'-нетранслируемую область: участие дивергентных РНК-связывающих факторов HuR, KSRP и TIAR». Int. J. Рак. 113 (6): 911–9. Дои:10.1002 / ijc.20675. PMID  15514971. S2CID  33272692.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Suswam EA, Li YY, Mahtani H, King PH (2005). «Новые ДНК-связывающие свойства РНК-связывающего белка TIAR». Нуклеиновые кислоты Res. 33 (14): 4507–18. Дои:10.1093 / нар / gki763. ЧВК  1184220. PMID  16091628.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q01085 (Nucleolysin TIAR) в PDBe-KB.