TOP2A - TOP2A

TOP2A
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ZXM, 1ZXN, 4FM9, 4R1F
Идентификаторы
Псевдонимы	TOP2A, TOP2, TP2A, топоизомераза (ДНК) II альфа, ДНК топоизомераза II альфа
Внешние идентификаторы	OMIM: 126430 MGI: 98790 ГомолоГен: 830 Генные карты: TOP2A
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.2 Начинать 40,388,525 бп[1] Конец 40,417,896 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 D | 11 62,91 см Начинать 98,992,943 бп[2] Конец 99,024,189 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание нуклеотидов • ДНК-зависимая активность АТФазы • активность гомодимеризации белков • связывание гистондеацетилазы • связывание хроматина • изомеразная активность • связывание ионов металлов • ДНК-топоизомеразная активность • связывание с С-концом белка • связывание убиквитина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание лекарств • активность гетеродимеризации белков • связывание ферментов • Связывание АТФ • связывание протеинкиназы C • связывание ионов магния • Связывание ДНК, изгиб • Связывание РНК • GO: 0003918 ДНК-топоизомераза типа II (двухцепочечный разрез, АТФ-гидролиз). Сотовый компонент • цитоплазма • Комплекс ДНК-топоизомеразы (АТФ-гидролизующий) • нуклеоплазма • ядерная хромосома • ядрышко • центриоль • конденсированная хромосома • ядро клетки • комплекс вирусной интеграции • макромолекулярный комплекс • рибонуклеопротеин Биологический процесс • разрешение промежуточных продуктов мейотической рекомбинации • апоптотическая конденсация хромосом • эмбриональное дробление • ритмический процесс • сегрегация хромосом • Метаболический процесс ДНК • белковое сумоилирование • клеточный ответ на стимул повреждения ДНК • Лигирование ДНК • конденсация хромосом • регулирование циркадного ритма • дифференцировка гемопоэтических клеток-предшественников • положительная регуляция апоптотического процесса • контрольная точка целостности митотической ДНК • положительная регуляция репликации вирусного генома • положительное регулирование репликации одноцепочечной вирусной РНК через промежуточное соединение двухцепочечной ДНК • сегрегация сестринских хроматид • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • Топологическое изменение ДНК • отрицательная регуляция раскручивания дуплекса ДНК • женское мейотическое ядерное деление Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7153	21973
Ансамбль	ENSG00000131747	ENSMUSG00000020914
UniProt	P11388	Q01320
RefSeq (мРНК)	NM_001067	NM_011623
RefSeq (белок)	NP_001058	NP_035753
Расположение (UCSC)	Chr 17: 40.39 - 40.42 Мб	Chr 11: 98.99 - 99.02 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-топоизомераза 2-альфа является фермент что у людей кодируется TOP2A ген.

Этот ген кодирует ДНК-топоизомеразу, фермент, который контролирует и изменяет топологические состояния ДНК во время транскрипции. Этот ядерный фермент участвует в таких процессах, как конденсация хромосом, разделение хроматид и снятие торсионного стресса, возникающего во время транскрипции и репликации ДНК. Он катализирует временное разрушение и повторное соединение двух цепей дуплексной ДНК, что позволяет цепям проходить друг через друга, изменяя тем самым топологию ДНК. Две формы этого фермента существуют как вероятные продукты дупликации гена. Ген, кодирующий эту форму, альфа, локализован в хромосоме 17, а ген бета - в хромосоме 3. Ген, кодирующий этот фермент, действует как мишень для нескольких противоопухолевых агентов, и с развитием этого гена были связаны различные мутации. лекарственной устойчивости. Снижение активности этого фермента также может играть роль в атаксии-телеангиэктазии.^[5]

Взаимодействия

TOP2A был показан взаимодействовать с HDAC1,^[6][7] CDC5L,^[8] Малый модификатор, связанный с убиквитином 1^[9] и P53.^[10]

Смотрите также

• Топоизомераза II
• TOP2B - Топоизомераза II бета
• Дублирование гена
• Атаксия-телеангиэктазия

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000131747 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020914 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: TOP2A топоизомераза (ДНК) II альфа 170 кДа».
6. Tsai, S.C; Валков Н; Ян W M; Гамп Дж; Салливан Д; Сето Э (ноябрь 2000 г.). «Гистоновая деацетилаза напрямую взаимодействует с ДНК-топоизомеразой II». Nat. Genet. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 26 (3): 349–53. Дои:10.1038/81671. ISSN  1061-4036. PMID  11062478. S2CID  19301396.
7. Джонсон, С. А.; Padget K; Остин С. А.; Тернер Б. М. (февраль 2001 г.). «Активность деацетилазы связана с топоизомеразой II и необходима для апоптоза, вызванного этопозидом». J. Biol. Chem. Соединенные Штаты. 276 (7): 4539–42. Дои:10.1074 / jbc.C000824200. ISSN  0021-9258. PMID  11136718.
8. Ajuh, P; Kuster B; Панов К; Zomerdijk J C; Mann M; Ламонд А I (декабрь 2000 г.). «Функциональный анализ человеческого комплекса CDC5L и идентификация его компонентов с помощью масс-спектрометрии». EMBO J. АНГЛИЯ. 19 (23): 6569–81. Дои:10.1093 / emboj / 19.23.6569. ISSN  0261-4189. ЧВК  305846. PMID  11101529.
9. Мао, Y; Desai S D; Лю Л. Ф. (август 2000 г.). «Конъюгация SUMO-1 с изоферментами топоизомеразы II ДНК человека». J. Biol. Chem. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 275 (34): 26066–73. Дои:10.1074 / jbc.M001831200. ISSN  0021-9258. PMID  10862613.
10. Коуэлл, И. Г.; Окороков А Л; Cutts S A; Padget K; Bell M; Milner J; Остин С. А. (февраль 2000 г.). «Человеческие топоизомеразы IIальфа и IIбета взаимодействуют с С-концевой областью р53». Exp. Cell Res. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ. 255 (1): 86–94. Дои:10.1006 / excr.1999.4772. ISSN  0014-4827. PMID  10666337.

дальнейшее чтение

• Ватт ПМ, Хиксон ID (1994). «Структура и функции топоизомераз ДНК типа II». Biochem. J. 303 (3): 681–95. Дои:10.1042 / bj3030681. ЧВК  1137600. PMID  7980433.
• Броннер С., Хопфнер Р., Мусли М. (2002). «Транскрипционная регуляция гена топоизомеразы IIalpha человека». Противоопухолевый Res. 22 (2A): 605–12. PMID  12014628.
• Ярвинен Т.А., Лю Э.Т. (2004). «Амплификация и делеция гена топоизомеразы IIальфа (TOP2A) при раке - чаще, чем ожидалось». Цитопатология. 14 (6): 309–13. Дои:10.1046 / j.0956-5507.2003.00105.x. PMID  14632727. S2CID  29586255.