Малый модификатор, связанный с убиквитином 1 - Small ubiquitin-related modifier 1

SUMO1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4WJQ, 1A5R, 1ТГЗ, 1WYW, 1Y8R, 1Z5S, 2ASQ, 2BF8, 2G4D, 2IO2, 2IY0, 2IY1, 2KQS, 2LAS, 2MW5, 2PE6, 2UYZ, 2VRR, 3KYC, 3KYD, 3RZW, 3UIP, 4WJN, 4WJO, 4WJP, 5АЕК, 2Н1В, 2N1A
Идентификаторы
Псевдонимы	SUMO1, DAP1, GMP1, OFC10, PIC1, SENP2, SMT3, SMT3C, SMT3H3, UBL1, малый убиквитиноподобный модификатор 1, малый убиквитиноподобный модификатор 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601912 MGI: 1197010 ГомолоГен: 2514 Генные карты: SUMO1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q33.1 Начинать 202,206,180 бп[1] Конец 202,238,608 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 C2 Начинать 59,586,558 бп[2] Конец 59,670,834 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фактора транскрипции • активность регулятора калиевых каналов • GO: 0001948 связывание с белками • белковая метка • связывание убиквитин-протеин-лигазы • Связывание РНК • связывание корепрессора транскрипции • связывание с С-концом белка • SUMO трансферазная активность • связывание ферментов • связывание с белками, мостик • связывание рецепторов глюкокортикоидов • небольшой белок, активирующий связывание ферментов • связывание убиквитин-подобной протеинлигазы Сотовый компонент • цитоплазма • Тело PML • ядерное пятнышко • ядерное тело • не мембрана • мембрана • комплекс потенциалзависимых калиевых каналов • клеточная мембрана • синапс • ядерная пора • нуклеоплазма • гетерохроматин • XY тело • дендрит • ядрышко • фибриллярный центр • ядро клетки • гранула ядерного стресса • SUMO активирующий ферментный комплекс • ядерная оболочка • цитозоль Биологический процесс • развитие неба • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регулирование стабильности белка • положительная регуляция сборки белкового комплекса • локализация белка в ядерной поре • стабилизация белка • отрицательная регуляция потенциала действия • отрицательная регуляция активности специфичного для последовательности ДНК связывающего фактора транскрипции • регулирование локализации белка • регулирование сокращения клеток сердечной мышцы • глобальная эксцизионная репарация нуклеотидов генома • Организация тела PML • регуляция пути передачи сигналов, опосредованного гамма-интерфероном • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • восстановление двухниточного разрыва за счет негомологичного соединения концов • регуляция трансмембранного транспорта ионов кальция • положительная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого белкового катаболического процесса • отрицательная регуляция активности калиевых каналов отсроченного выпрямителя • положительная регуляция активности кальций-транспортной АТФазы • Ремонт ДНК • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • клеточный ответ на тепло • клеточный ответ на ион кадмия • белковое сумоилирование • отрицательная регуляция связывания ДНК Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7341	22218
Ансамбль	ENSG00000116030	ENSMUSG00000026021
UniProt	P63165	P63166
RefSeq (мРНК)	NM_003352 NM_001005781 NM_001005782	NM_009460
RefSeq (белок)	NP_001005781 NP_001005782 NP_003343 NP_001358321 NP_001358322 NP_001358323	NP_033486
Расположение (UCSC)	Chr 2: 202.21 - 202.24 Мб	Chr 1: 59.59 - 59.67 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Малый модификатор, связанный с убиквитином 1 это белок что у людей кодируется SUMO1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок, входящий в состав СУМО (небольшой убиквитин-подобный модификатор) семейство белков. Он работает аналогично убиквитин в том, что он связан с белками-мишенями как часть системы посттрансляционной модификации. Однако, в отличие от убиквитина, который нацелен на белки для деградации, этот белок участвует во множестве клеточных процессов, таких как ядерный транспорт, регуляция транскрипции, апоптоз и стабильность белка. Он не активен, пока не будут отщеплены последние четыре аминокислоты на карбокси-конце. Сообщается о нескольких псевдогенах этого гена. Были охарактеризованы альтернативные варианты сплайсинга транскрипции, кодирующие разные изоформы.^[7]

Наиболее расщелина гены имеют сумоилирование компонент .^[8] Анализ хромосомных аномалий у пациентов привел к идентификации и подтверждению SUMO1 как заячья губа и нёбо локус.^[9]

Взаимодействия

Небольшой модификатор, связанный с убиквитином 1, может взаимодействовать с:

• C22orf25,^[10]
• DAXX,^[11][12][13]
• DNMT3B,^[14]
• P53,^[13][15]
• PIAS1,^[16][17]
• PML,^[11][18]
• SAE2,^[19][20]
• SP1,^[21]
• TDG,^[15][22]
• TNFRSF1A,^[6][23]
• TNFRSF6,^[6][12]
• TOP2A,^[24]
• TOP2B,^[24] и
• UBE2I,^{[15][19][25][26]}

Роль в сердце

Сердечная недостаточность Это процесс, в результате которого насосная способность сердца значительно ослабевает, и организм не может обеспечить надлежащее кровообращение. Ослабленное сердце вызывает симптомы усталости, снижение толерантности к физическим нагрузкам и одышку. Пациенты с сердечной недостаточностью имеют значительно повышенный риск смерти по сравнению с людьми с нормальной функцией сердца. Сердечная недостаточность представляет собой серьезную проблему для общественного здравоохранения, поскольку ее заболеваемость растет во всем мире, и она является основной причиной смерти в развитых странах. ^[27]

SUMO 1 является ключевым компонентом сердечной функции, так как он помогает регулировать гомеостаз кальция в митохондрии сердечных клеток. SUMO 1 связан с другим важным сердечным белком, называемым Ca2 + ATPase сарко / эндоплазматического ретикулума, или SERCA2A. SERCA трансмембранный белок, расположенный в саркоплазматический ретикулум сердечных клеток. Его основная функция - регулировать выделение и поглощение внутриклеточного кальция между цитозолем и просветом саркоплазматического ретикулума. Кальций является важным фактором для развития сокращения и расслабления сердечных миоцитов. Таким образом, управление гомеостазом внутриклеточного кальция с помощью SERCA2A имеет решающее значение для общей сердечной деятельности.^[28] Обычно SUMO 1 активирует и стабилизирует SERCA2A за счет связывания лизиновых остатков 480 и 585. Взаимодействие между SUMO 1 и SERCA2A имеет решающее значение для регулирования уровней кальция внутри сердечных миоцитов. Снижение уровня белка SUMO 1 снижает SERCA2A и, таким образом, способствует эффективному усвоению кальция у пациентов с сердечной недостаточностью.^[29]

Как мишень для наркотиков

SUMO 1 может быть важной терапевтической мишенью для улучшения работы сердца у пациентов с сердечной недостаточностью. В модели на мышах введение SUMO 1 посредством генной терапии было связано с улучшенной активностью SERCA2A, что привело к улучшению сердечной функции за счет увеличения сердечной сократимости.^[29] Кроме того, сверхэкспрессия SUMO 1 приводит к ускоренному усвоению кальция, что дает дополнительные доказательства его важности для поддержания адекватного уровня кальция в клетках сердца. Этот конкретный сердечный белок может стать интересной и новой мишенью для лечения сердечной недостаточности в будущем.^[29]

Смотрите также

• SENP6

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116030 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000026021 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Шен З., Пардингтон-Пуртимун ЧП, Комо Дж. К., Мойзис Р. К., Чен Д. Д. (сентябрь 1996 г.). «UBL1, убиквитиноподобный белок человека, связанный с белками RAD51 / RAD52 человека». Геномика. 36 (2): 271–9. Дои:10.1006 / geno.1996.0462. PMID  8812453.
6. Окура Т., Гонг Л., Камитани Т., Вада Т., Окура И., Вэй С.Ф., Чанг Х.М., Йе ET (ноябрь 1996 г.). «Защита от гибели клеток, опосредованной Fas / APO-1 и фактором некроза опухоли, с помощью нового белка, сентрина». Журнал иммунологии. 157 (10): 4277–81. PMID  8906799.
7. «Ген Entrez: супрессор SUMO1 SMT3 гомолога 1 mif two 3 (S. cerevisiae)».
8. Поус Э., Станье П. (декабрь 2007 г.). «Передача сигналов FGF и модификация SUMO: новые игроки в этиологии заячьей губы и / или неба». Тенденции в генетике. 23 (12): 631–40. Дои:10.1016 / j.tig.2007.09.002. PMID  17981355.
9. Диксон MJ, Marazita ML, Beaty TH, Murray JC (2011). «Расщелина губы и неба: понимание генетических влияний и факторов окружающей среды». Природа Обзоры Генетика (12) 167-178.
10. «База данных молекулярных взаимодействий». Архивировано из оригинал на 2006-05-06.
11. Лин ДЙ, Ши Х.М. (июль 2002 г.). «Существенная роль белка микросфер весом 58 кДа в модуляции Daxx-зависимой репрессии транскрипции, что выявлено секвестрацией ядрышек». Журнал биологической химии. 277 (28): 25446–56. Дои:10.1074 / jbc.M200633200. PMID  11948183.
12. Ryu SW, Chae SK, Kim E (декабрь 2000 г.). «Взаимодействие Daxx, белка, связывающего Fas, с сентрином и Ubc9». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 279 (1): 6–10. Дои:10.1006 / bbrc.2000.3882. PMID  11112409.
13. Иванчук С.М., Мондал С., Рутка Ю.Т. (июнь 2008 г.). «p14ARF взаимодействует с DAXX: влияет на HDM2 и p53». Клеточный цикл. 7 (12): 1836–50. Дои:10.4161 / cc.7.12.6025. PMID  18583933.
14. Канг Э.С., Пак CW, Чанг Дж.Х. (декабрь 2001 г.). «Dnmt3b, de novo ДНК-метилтрансфераза, взаимодействует с SUMO-1 и Ubc9 через свою N-концевую область и может быть модифицирована SUMO-1». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 289 (4): 862–8. Дои:10.1006 / bbrc.2001.6057. PMID  11735126.
15. Minty A, Dumont X, Kaghad M, Caput D (ноябрь 2000 г.). «Ковалентная модификация p73alpha с помощью SUMO-1. Двухгибридный скрининг с p73 идентифицирует новые взаимодействующие с SUMO-1 белки и мотив взаимодействия SUMO-1». Журнал биологической химии. 275 (46): 36316–23. Дои:10.1074 / jbc.M004293200. PMID  10961991.
16. Ли Б.Х., Ёсимацу К., Маэда А., Очиай К., Моримацу М., Араки К., Огино М., Морикава С., Арикава Дж. (Декабрь 2003 г.). «Ассоциация нуклеокапсидного белка хантавирусов Сеула и Хантаана с небольшими молекулами, родственными убиквитин-подобному модификатору-1». Вирусные исследования. 98 (1): 83–91. Дои:10.1016 / j.virusres.2003.09.001. PMID  14609633.
17. Кахио Т., Нисида Т., Ясуда Х. (сентябрь 2001 г.). «Участие PIAS1 в сумоилировании супрессора опухолей р53». Молекулярная клетка. 8 (3): 713–8. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00349-5. PMID  11583632.
18. Камитани Т., Нгуен Х.П., Кито К., Фукуда-Камитани Т., Йе ET (февраль 1998 г.). «Ковалентная модификация ПМЛ семейством сентринов убиквитиноподобных белков». Журнал биологической химии. 273 (6): 3117–20. Дои:10.1074 / jbc.273.6.3117. PMID  9452416.
19. Татхам М.Х., Ким С., Ю Би, Джафрей Э, Сонг Дж, Чжэн Дж, Родригес М.С., Хэй РТ, Чен Й (август 2003 г.) «Роль N-концевого сайта Ubc9 в связывании и конъюгации SUMO-1, -2 и -3». Биохимия. 42 (33): 9959–69. Дои:10.1021 / bi0345283. PMID  12924945.
20. Гонг Л., Ли Б., Миллас С., Йе Э. Т. (апрель 1999 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика человеческих AOS1 и UBA2, компонентов комплекса ферментов, активирующих сентрин». Письма FEBS. 448 (1): 185–9. Дои:10.1016 / S0014-5793 (99) 00367-1. PMID  10217437. S2CID  7756078.
21. Ван Ю.Т., Чуанг Дж.Й., Шен М.Р., Ян В.Б., Чанг В.К., Хунг Дж.Д. (июль 2008 г.). «Сумоилирование специфичного белка 1 увеличивает его деградацию, изменяя локализацию и увеличивая протеолитический процесс специфичности белка 1». Журнал молекулярной биологии. 380 (5): 869–85. Дои:10.1016 / j.jmb.2008.05.043. PMID  18572193.
22. Hardeland U, Steinacher R, Jiricny J, Schär P (март 2002 г.). «Модификация тимин-ДНК-гликозилазы человека убиквитин-подобными белками способствует ферментативному обмену». Журнал EMBO. 21 (6): 1456–64. Дои:10.1093 / emboj / 21.6.1456. ЧВК  125358. PMID  11889051.
23. Liou ML, Liou HC (апрель 1999 г.). «Белок, гомологичный убиквитину, DAP-1, связывается с доменом смерти рецептора фактора некроза опухоли (p60) и вызывает апоптоз». Журнал биологической химии. 274 (15): 10145–53. Дои:10.1074 / jbc.274.15.10145. PMID  10187798.
24. Мао Ю., Десаи С.Д., Лю Л.Ф. (август 2000 г.). «Конъюгация SUMO-1 с изоферментами топоизомеразы II ДНК человека». Журнал биологической химии. 275 (34): 26066–73. Дои:10.1074 / jbc.M001831200. PMID  10862613.
25. Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., МакБрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Молекулярная системная биология. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
26. Шен З., Пардингтон-Пуртимун ЧП, Комо Дж. К., Мойзис Р. К., Чен Д. Д. (октябрь 1996 г.). «Ассоциации UBE2I с белками RAD52, UBL1, p53 и RAD51 в дрожжевой двугибридной системе». Геномика. 37 (2): 183–6. Дои:10.1006 / geno.1996.0540. PMID  8921390.
27. Шварц RJ, Yeh ET (2012). «Взвешивание сердечной недостаточности: роль СУМОилирования SERCA2a». Циркуляционные исследования. 110 (2): 198–9. Дои:10.1161 / RES.0b013e318246f187. PMID  22267837.
28. Periasamy M, Huke S (2001). «Уровень помпы SERCA является решающим фактором гомеостаза Ca (2+) и сократимости сердца». Журнал молекулярной и клеточной кардиологии. 33 (6): 1053–63. Дои:10.1006 / jmcc.2001.1366. PMID  11444913.
29. Хо С., Ли А., Чжон Д., О Дж. Дж., Чаанин А. Х., Кизана Е., Пак В. Дж., Хаджар Р. Дж. (2011). «SUMO1-зависимая модуляция SERCA2a при сердечной недостаточности». Природа. 477 (7366): 601–5. Дои:10.1038 / природа10407. ЧВК  3443490. PMID  21900893.

дальнейшее чтение

• Cookson MR (январь 2003 г.). «Пути к паркинсонизму». Нейрон. 37 (1): 7–10. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 01166-2. PMID  12526767. S2CID  14513509.
• Бодди М.Н., Хоу К., Эткин Л.Д., Соломон Э., Фримонт П.С. (сентябрь 1996 г.). «PIC 1, новый убиквитиноподобный белок, который взаимодействует с компонентом PML мультипротеинового комплекса, который нарушается при остром промиелоцитарном лейкозе». Онкоген. 13 (5): 971–82. PMID  8806687.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Шен З, Пардингтон-Пуртимун ЧП, Комо Дж. К., Мойзис Р. К., Чен Д. Д. (октябрь 1996 г.). «Ассоциации UBE2I с белками RAD52, UBL1, p53 и RAD51 в дрожжевой двугибридной системе». Геномика. 37 (2): 183–6. Дои:10.1006 / geno.1996.0540. PMID  8921390.
• Матунис MJ, Coutavas E, Blobel G (декабрь 1996 г.). «Новая убиквитиноподобная модификация модулирует разделение Ran-GTPase-активирующего белка RanGAP1 между цитозолем и комплексом ядерных пор». Журнал клеточной биологии. 135 (6, п. 1): 1457–70. Дои:10.1083 / jcb.135.6.1457. ЧВК  2133973. PMID  8978815.
• Махаджан Р., Дельфин С., Гуан Т., Джерас Л., Мельхиор Ф. (январь 1997 г.). «Небольшой убиквитин-родственный полипептид, участвующий в нацеливании RanGAP1 на комплексный белок RanBP2 ядерных пор». Клетка. 88 (1): 97–107. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81862-0. PMID  9019411. S2CID  17819277.
• Лапента В., Чиурацци П., ван дер Спек П., Пиццути А., Ханаока Ф., Браге С. (март 1997 г.). «SMT3A, человеческий гомолог гена SMT3 S. cerevisiae, отображается на хромосоме 21qter и определяет новое семейство генов». Геномика. 40 (2): 362–6. Дои:10.1006 / geno.1996.4556. PMID  9119407.
• Камитани Т., Нгуен Х.П., Йе ET (май 1997 г.). «Предпочтительная модификация ядерных белков новой убиквитиноподобной молекулой». Журнал биологической химии. 272 (22): 14001–4. Дои:10.1074 / jbc.272.22.14001. PMID  9162015.
• Махаджан Р., Джерас Л., Мельхиор Ф. (январь 1998 г.). «Молекулярная характеристика модификации SUMO-1 RanGAP1 и ее роль в ассоциации ядерной оболочки». Журнал клеточной биологии. 140 (2): 259–70. Дои:10.1083 / jcb.140.2.259. ЧВК  2132567. PMID  9442102.
• Хоу К., Уильямсон Дж., Бодди Н., Шир Д., Фримонт П., Соломон Э. (январь 1998 г.). «Ген PIC1, гомологичный убиквитину: характеристика генов и псевдогенов мыши (Pic1) и человека (UBL1)». Геномика. 47 (1): 92–100. Дои:10.1006 / geno.1997.5091. PMID  9465300.
• Байер П., Арндт А., Мецгер С., Махаджан Р., Мельхиор Ф., Янике Р., Беккер Дж. (Июль 1998 г.). «Определение структуры малого убиквитин-родственного модификатора SUMO-1». Журнал молекулярной биологии. 280 (2): 275–86. Дои:10.1006 / jmbi.1998.1839. PMID  9654451.
• Desterro JM, Rodriguez MS, Hay RT (август 1998 г.). «Модификация IkappaBalpha SUMO-1 ингибирует активацию NF-kappaB». Молекулярная клетка. 2 (2): 233–9. Дои:10.1016 / S1097-2765 (00) 80133-1. PMID  9734360.
• Джо П., Куо С.Дж., Юань Дж., Бленис Дж. (Сентябрь 1998 г.). «Важное требование для каспазы-8 / FLICE в инициации Fas-индуцированного апоптотического каскада». Текущая биология. 8 (18): 1001–8. Дои:10.1016 / S0960-9822 (07) 00420-4. PMID  9740801. S2CID  18129508.
• Камитани Т., Кито К., Нгуен Х.П., Вада Х., Фукуда-Камитани Т., Йе ET (октябрь 1998 г.). «Идентификация трех основных сайтов сенторизации в PML». Журнал биологической химии. 273 (41): 26675–82. Дои:10.1074 / jbc.273.41.26675. PMID  9756909.
• Duprez E, Saurin AJ, Desterro JM, Lallemand-Breitenbach V, Howe K, Boddy MN, Solomon E, de Thé H, Hay RT, Freemont PS (февраль 1999). «Модификация SUMO-1 белка PML острого промиелоцитарного лейкоза: последствия для ядерной локализации». Журнал клеточной науки. 112 (Pt 3) (3): 381–93. PMID  9885291.
• Чен А., Маннен Х., Ли СС (декабрь 1998 г.). «Характеристика убиквитиноподобных кДНК SMT3A и SMT3B мышей и генов / псевдогенов». Международная биохимия и молекулярная биология. 46 (6): 1161–74. Дои:10.1080/15216549800204722. PMID  9891849. S2CID  45939730.
• Okuma T, Honda R, Ichikawa G, Tsumagari N, Yasuda H (январь 1999 г.). «Модификация SUMO-1 in vitro требует двух ферментативных стадий, E1 и E2». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 254 (3): 693–8. Дои:10.1006 / bbrc.1998.9995. PMID  9920803.
• Liou ML, Liou HC (апрель 1999 г.). «Белок, гомологичный убиквитину, DAP-1, связывается с доменом смерти рецептора фактора некроза опухоли (p60) и вызывает апоптоз». Журнал биологической химии. 274 (15): 10145–53. Дои:10.1074 / jbc.274.15.10145. PMID  10187798.

внешняя ссылка

• SUMO1 расположение человеческого гена в Браузер генома UCSC.
• SUMO1 детали человеческого гена в Браузер генома UCSC.