TRIM11 - TRIM11

TRIM11
Идентификаторы
Псевдонимы	TRIM11, BIA1, RNF92, трехчастный мотив, содержащий 11
Внешние идентификаторы	OMIM: 607868 MGI: 2137355 ГомолоГен: 14225 Генные карты: TRIM11
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q42.13 Начинать 228,393,673 бп[1] Конец 228,406,835 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B1.3 Начинать 58,978,093 бп[2] Конец 58,991,458 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • активность убиквитин-протеинтрансферазы • связывание ионов цинка • связывание фактора транскрипции • GO: 0001948 связывание с белками • специфическое связывание белкового домена • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы • связывание ионов металлов • трансферазная активность Сотовый компонент • цитоплазма • внутриклеточный • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • отрицательная регуляция нейрогенеза • врожденная иммунная система • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • защитный ответ на вирус • убиквитинирование белков • отрицательная регуляция вирусной транскрипции • отрицательная регуляция проникновения вируса в клетку-хозяин • положительное регулирование проникновения вируса в клетку-хозяин • отрицательная регуляция высвобождения вируса из клетки-хозяина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	81559	94091
Ансамбль	ENSG00000154370	ENSMUSG00000020455
UniProt	Q96F44	Q99PQ2
RefSeq (мРНК)	NM_145214	NM_001290988 NM_053168
RefSeq (белок)	NP_660215	NP_001277917 NP_444398
Расположение (UCSC)	Chr 1: 228.39 - 228.41 Мб	Chr 11: 58.98 - 58.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, содержащий трехчастный мотив 11 это белок найден у людей, который кодируется TRIM11 ген.^[5][6]

Белок, кодируемый этим геном, является членом семейство трехчастных мотивов (TRIM). Мотив TRIM включает три цинк-связывающих домена: ЗВЕНЕТЬ, а B-бокс тип 1 и тип B-box 2, а также область спиральной катушки. Этот белок локализуется в ядро и цитоплазма. Его функция не определена.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000154370 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020455 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Реймонд А., Мерони Дж., Фантоцци А., Мерла Дж., Каир С., Лузи Л., Риганелли Д., Занария Е., Мессали С., Кайнарка С., Гуффанти А., Минуччи С., Пеликчи П. Г., Баллабио А. (май 2001 г.). «Семейство трехчастных мотивов идентифицирует клеточные компартменты». EMBO J. 20 (9): 2140–51. Дои:10.1093 / emboj / 20.9.2140. ЧВК  125245. PMID  11331580.
6. "Entrez Gene: TRIM11, содержащий трехчастный мотив 11".

дальнейшее чтение

• Исикава Х, Татикава Х, Миура Y, Такахаши Н. (2006). «TRIM11 связывается и дестабилизирует ключевой компонент опосредованного активатором кофакторного комплекса (ARC105) через систему убиквитин-протеасома». FEBS Lett. 580 (20): 4784–92. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.07.066. PMID  16904669.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.
• Купер СТ, Хэнсон И.М. (2006). «Скрининг белков, которые взаимодействуют с PAX6: C-концевые мутации нарушают взаимодействие с HOMER3, DNCL1 и TRIM11». BMC Genet. 6: 43. Дои:10.1186/1471-2156-6-43. ЧВК  1208879. PMID  16098226.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Ниикура Т., Хашимото Ю., Тадзима Х. и др. (2003). «Белок с трехкомпонентным мотивом TRIM11 связывает и дестабилизирует гуманин, нейропротекторный пептид против поражений, связанных с болезнью Альцгеймера». Евро. J. Neurosci. 17 (6): 1150–8. Дои:10.1046 / j.1460-9568.2003.02553.x. PMID  12670303.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.