TSG101 - TSG101

TSG101
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1КПП, 1KPQ, 1М4П, 1M4Q, 1S1Q, 2F0R, 3IV1, 3OBQ, 3OBS, 3OBU, 3OBX, 3П9Г, 3P9H, 4EJE, 4YC1, 4ZNY
Идентификаторы
Псевдонимы	TSG101, TSG10, VPS23, восприимчивость к опухоли 101
Внешние идентификаторы	OMIM: 601387 MGI: 106581 ГомолоГен: 4584 Генные карты: TSG101
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11п15.1 Начинать 18,468,336 бп[1] Конец 18,526,951 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 B3 Начинать 46,888,949 бп[2] Конец 46,919,969 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • активность гомодимеризации белков • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • кальций-зависимое связывание с белками • связывание убиквитина • GO: 0001948 связывание с белками • коактиватор транскрипции лиганд-зависимого ядерного рецептора • связывание вириона • связывание убиквитин-протеин-лигазы • GO: 0032403 связывание макромолекулярного комплекса Сотовый компонент • цитоплазма • мультивезикулярное тело • эндосома • поздняя эндосома • мембрана • мембрана поздней эндосомы • клеточная мембрана • ранняя эндосома • ядрышко • эндосомная мембрана • внеклеточная экзосома • ESCRT I комплекс • ядро клетки • цитозоль • клетка-хозяин • центр организации микротрубочек • цитоскелет • мембрана ранней эндосомы • Тело Флемминга Биологический процесс • GO: 0046795 внутриклеточный транспорт вируса • дифференциация клеток • положительная регуляция убиквитин-зависимого эндоцитоза • регуляция внеклеточной сборки экзосом • почкование вируса через комплекс ESCRT хозяина • GO: 0019067 жизненный цикл вируса • транспорт от эндосомы к лизосомам • мультивезикулярная сборка тела • моноубиквитинирование белков • вирусное почкование • дифференцировка кератиноцитов • деление клеток • эндосомный транспорт • GO: 0000046 Созревание аутофагосомы • процесс модификации клеточного белка • регулирование роста клеток • остановка клеточного цикла • транспорт белка • убиквитин-зависимый катаболический процесс белка через мультивезикулярный путь сортировки тела • регуляция активности киназы MAP • положительная регуляция экзосомальной секреции • клеточный цикл • регулирование роста • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательное регулирование пролиферации клеток • GO: 0022415 вирусный процесс • экзосомальная секреция • макроавтофагия • отрицательная регуляция сигнального пути рецептора эпидермального фактора роста • отрицательная регуляция активности рецепторов, активируемых эпидермальным фактором роста • транспорт • внеклеточный транспорт • позитивная регуляция транскрипции, основанной на нуклеиновых кислотах Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7251	22088
Ансамбль	ENSG00000074319	ENSMUSG00000014402
UniProt	Q99816	Q61187
RefSeq (мРНК)	NM_006292	NM_021884 NM_001348088 NM_001348089
RefSeq (белок)	NP_006283	NP_068684 NP_001335017 NP_001335018
Расположение (UCSC)	Chr 11: 18.47 - 18.53 Мб	Chr 7: 46.89 - 46.92 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Ген восприимчивости опухоли 101, также известный как TSG101, это человек ген который кодирует одноименный клеточный белок.

Функция

Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к группе явно неактивных гомологов убиквитин-конъюгированных ферментов. Продукт гена содержит домен спиральной спирали, который взаимодействует с Stathmin, цитозольный фосфопротеин, участвующий в онкогенезе. Белок может играть роль в росте и дифференцировке клеток и действовать как негативный регулятор роста. Установившаяся экспрессия этого гена восприимчивости к опухоли in vitro, по-видимому, важна для поддержания стабильности генома и регуляции клеточного цикла. Мутации и альтернативный сплайсинг в этом гене происходят с высокой частотой при раке груди и предполагают, что дефекты возникают во время онкогенеза и / или прогрессирования рака груди.^[5]

Основная роль TSG101 - участвовать в ESCRT путь. Этот путь способствует почкованию обратной топологии и образованию мультивезикулярных тел (MVB), которые доставляют груз, предназначенный для деградации, к лизосимам.^[6] TSG101 распознает короткий линейный мотив : P (T / S) AP через UEV белковый домен субъединицы VPS23 / TSG101. Сборкой комплекса ESCRT-I руководит C-терминал блок устойчивости (SB) VPS23, N-терминальная половина VPS28 и C-терминальная половина VPS37. В структура в основном состоит из трех длинных параллельных спиральный шпильки, каждая из которых соответствует отдельной субъединице. Дополнительные домены и мотивы выходящие за рамки ядра служат инструментами захвата для критических функций ESCRT-I.^[7][8]

Вирусный угон

TSG101 играет важную роль в патогенезе ВИЧ и другие вирусы. В неинфицированных клетках TSG101 участвует в биогенезе мультивезикулярное тело (MVB),^[9] это указывает на то, что ВИЧ может связывать TSG101, чтобы получить доступ к нижестоящему механизму, который катализирует почкование везикул MVB.^[10]

Взаимодействия

TSG101 был показан взаимодействовать с:

• EP300,^[11]
• HGS,^[12][13]
• LRSAM1,^[12][14]
• P21,^[15]
• P53,^[16] и
• VPS28.^[12][17][18]

Ортолог, Vps23

Vps23_core
escrt-i ядро
Идентификаторы
Символ	Vps23_core
Pfam	PF09454
ИнтерПро	IPR017916
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

У людей ортолог vps23, который имеет компонент ESCRT-1, называется Tsg101. Мутации в Tsg-101 связаны с раком шейки матки, груди, простаты и желудочно-кишечного тракта. В молекулярной биологии vps23 (сортировка вакуолярного белка) является белковый домен. Белки Vps являются компонентами ESCRT (эндосомные сортировочные комплексы, необходимые для транспорта), которые необходимы для сортировки белков на ранней эндосоме. В частности, vps23 является компонентом ESCRT-I. Комплексы ESCRT образуют приводную белок сортировка из эндосомы к лизосомы. Комплексы ESCRT занимают центральное место в рецептор подавление, биогенез лизосом и подающий надежды ВИЧ.

Структура

Дрожжи ESCRT-I состоит из трех белковых субъединиц: VPS23, VPS28 и VPS37. У человека ESCRT-I включает TSG101, VPS28 и один из четырех потенциальных человек VPS37 гомологи.

Смотрите также

• ФГИ-104 - ан ESCRT ингибитор исследуется как противовирусный препарат широкого спектра

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000074319 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000014402 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: ген восприимчивости к опухоли TSG101 101».
6. Хенне В.М., Бучкович Н.Дж., Эмр С.Д. (июль 2011 г.). «Путь ESCRT». Клетка развития. 21 (1): 77–91. Дои:10.1016 / j.devcel.2011.05.015. PMID  21763610.
7. Тео Х, Джилл Дж., Сан Дж., Перишич О., Вепринцев Д.Б., Валлис Й., Эмр С.Д., Уильямс Р.Л. (апрель 2006 г.). «Ядро ESCRT-I и доменные структуры ESCRT-II GLUE показывают роль GLUE в связывании с ESCRT-I и мембранами». Клетка. 125 (1): 99–111. Дои:10.1016 / j.cell.2006.01.047. PMID  16615893. S2CID  14017291.
8. Костеланский М.С., Сан Дж., Ли С., Ким Дж., Гирландо Р., Йерро А., Эмр С. Д., Херли Дж. Х. (апрель 2006 г.). «Структурно-функциональная организация комплекса торговли людьми ESCRT-I». Клетка. 125 (1): 113–26. Дои:10.1016 / j.cell.2006.01.049. ЧВК  1576341. PMID  16615894.
9. Katzmann DJ, Odorizzi G, Emr SD (2002). «Подавление рецепторов и мультивезикулярная сортировка». Nat. Преподобный Мол. Cell Biol. 3 (12): 893–905. Дои:10.1038 / nrm973. PMID  12461556. S2CID  1344520.
10. фон Шведлер Великобритания, Стучелл М., Мюллер Б., Уорд Д.М., Чунг Х.Й., Морита Э., Ван Х.Э., Дэвис Т., Хе Г.П., Симбора Д.М., Скотт А., Краусслих Г.Г., Каплан Дж., Морхам С.Г., Сандквист В.И. (2003). «Белковая сеть почкования ВИЧ». Клетка. 114 (6): 701–13. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00714-1. PMID  14505570. S2CID  16894972.
11. Sun Z, Pan J, Hope WX, Cohen SN, Balk SP (август 1999). «Белок 101 гена восприимчивости опухолей подавляет трансактивацию рецептора андрогенов и взаимодействует с p300». Рак. 86 (4): 689–96. Дои:10.1002 / (sici) 1097-0142 (19990815) 86: 4 <689 :: aid-cncr19> 3.0.co; 2-p. PMID  10440698.
12. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
13. Лу К., Хоуп Л. В., Браш М., Рейнхард К., Коэн С. Н. (июнь 2003 г.). «Взаимодействие TSG101 с HRS опосредует эндосомный трафик и подавление рецепторов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (13): 7626–31. Bibcode:2003ПНАС..100.7626Л. Дои:10.1073 / pnas.0932599100. ЧВК  164637. PMID  12802020.
14. Amit I, Yakir L, Katz M, Zwang Y, Marmor MD, Citri A, Shtiegman K, Alroy I, Tuvia S, Reiss Y, Roubini E, Cohen M, Wides R, Bacharach E, Schubert U, Yarden Y (июль 2004 г. ). «Tal, Tsg101-специфическая убиквитинлигаза Е3, регулирует эндоцитоз рецептора и отпочкование ретровируса». Genes Dev. 18 (14): 1737–52. Дои:10.1101 / gad.294904. ЧВК  478194. PMID  15256501.
15. О Х, Маммукари С., Ненси А., Кабоди С., Коэн С. Н., Dotto GP (апрель 2002 г.). «Отрицательная регуляция роста и дифференцировки клеток с помощью TSG101 посредством ассоциации с p21 (Cip1 / WAF1)». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (8): 5430–5. Bibcode:2002PNAS ... 99.5430O. Дои:10.1073 / pnas.082123999. ЧВК  122786. PMID  11943869.
16. Ли Л., Ляо Дж., Руланд Дж., Мак Т.В., Коэн С.Н. (февраль 2001 г.). «Регуляторная петля TSG101 / MDM2 модулирует деградацию MDM2 и управление обратной связью MDM2 / p53». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (4): 1619–24. Bibcode:2001PNAS ... 98.1619L. Дои:10.1073 / pnas.98.4.1619. ЧВК  29306. PMID  11172000.
17. Stuchell MD, Garrus JE, Müller B, Stray KM, Ghaffarian S, McKinnon R, Kräusslich HG, Morham SG, Sundquist WI (август 2004 г.). «Эндосомный сортировочный комплекс человека, необходимый для транспорта (ESCRT-I), и его роль в почковании ВИЧ-1». J. Biol. Chem. 279 (34): 36059–71. Дои:10.1074 / jbc.M405226200. PMID  15218037.
18. Епископ Н., Вудман П. (апрель 2001 г.). «TSG101 / VPS23 млекопитающего и VPS28 млекопитающего взаимодействуют напрямую и рекрутируются в эндосомы, индуцированные VPS4». J. Biol. Chem. 276 (15): 11735–42. Дои:10.1074 / jbc.M009863200. PMID  11134028.

дальнейшее чтение

• Mazzé FM, Degrève L (2006). «Роль вирусных и клеточных белков в зарождении вируса иммунодефицита человека». Acta Virol. 50 (2): 75–85. PMID  16808324.
• Фрид Е.О., Муланд А.Дж. (2006). «Клеточная биология ВИЧ-1 и других ретровирусов». Ретровирология. 3: 77. Дои:10.1186/1742-4690-3-77. ЧВК  1635732. PMID  17083721.
• Ли Л., Ли Х, Франк У, Коэн С. Н. (1997). «Ген предрасположенности к опухоли TSG101 расположен в полосе р15 хромосомы 11 и мутирован при раке груди человека». Клетка. 88 (1): 143–54. Дои:10.1016 / S0092-8674 (00) 81866-8. PMID  9019400.
• Кунин Э.В., Абагян Р.А. (1997). «TSG101 может быть прототипом класса доминирующих отрицательных регуляторов убиквитина». Nat. Genet. 16 (4): 330–1. Дои:10.1038 / ng0897-330. PMID  9241264. S2CID  36275138.
• Штайнер П., Барнс Д.М., Харрис У.Х., Вайнберг Р.А. (1997). «Отсутствие перестроек в гене предрасположенности к опухоли TSG101 при раке груди человека». Nat. Genet. 16 (4): 332–3. Дои:10.1038 / ng0897-332. PMID  9241265. S2CID  20233125.
• Ли МП, Файнберг А.П. (1997). «Аберрантный сплайсинг, но не мутации TSG101 при раке груди человека». Рак Res. 57 (15): 3131–4. PMID  9242438.
• Гейтер С.А., Барски П., Бэтли С.Дж., Ли Л., де Фой К.А., Коэн С.Н., Пондер Б.А., Калдас С. (1997). «Аберрантный сплайсинг генов TSG101 и FHIT часто встречается при множественных злокачественных новообразованиях и в нормальных тканях и имитирует изменения, ранее описанные в опухолях». Онкоген. 15 (17): 2119–26. Дои:10.1038 / sj.onc.1201591. PMID  9366528.
• Се В., Ли Л., Коэн С. Н. (1998). «Зависимая от клеточного цикла субклеточная локализация белка TSG101 и митотические и ядерные аномалии, связанные с дефицитом TSG101». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 95 (4): 1595–600. Bibcode:1998PNAS ... 95.1595X. Дои:10.1073 / пнас.95.4.1595. ЧВК  19109. PMID  9465061.
• Вагнер К.Ю., Диериссо П., Рукер Э.Б., Робинсон Г.В., Хеннигхаузен Л. (1998). «Геномная архитектура и активация транскрипции гена восприимчивости к опухолям мыши и человека TSG101: общие типы более коротких транскриптов являются истинными альтернативными вариантами сплайсинга». Онкоген. 17 (21): 2761–70. Дои:10.1038 / sj.onc.1202529. PMID  9840940.
• Сунь З., Пан Дж., Хоуп В.Х., Коэн С.Н., Балк С.П. (1999). «Белок 101 гена восприимчивости опухолей подавляет трансактивацию рецептора андрогенов и взаимодействует с p300». Рак. 86 (4): 689–96. Дои:10.1002 / (SICI) 1097-0142 (19990815) 86: 4 <689 :: AID-CNCR19> 3.0.CO; 2-P. PMID  10440698.
• Хиттельман А.Б., Бураков Д., Иньигес-Ллухи Д.А., Фридман Л.П., Гарабедян М.Дж. (1999). «Дифференциальная регуляция транскрипционной активации глюкокортикоидных рецепторов с помощью белков, ассоциированных с AF-1». EMBO J. 18 (19): 5380–8. Дои:10.1093 / emboj / 18.19.5380. ЧВК  1171607. PMID  10508170.
• Rountree MR, Бахман KE, Baylin SB (2000). «DNMT1 связывает HDAC2 и новый корепрессор, DMAP1, с образованием комплекса в фокусах репликации». Nat. Genet. 25 (3): 269–77. Дои:10.1038/77023. PMID  10888872. S2CID  26149386.
• Епископ Н., Вудман П. (2001). «TSG101 / VPS23 млекопитающего и VPS28 млекопитающего взаимодействуют напрямую и рекрутируются в эндосомы, индуцированные VPS4». J. Biol. Chem. 276 (15): 11735–42. Дои:10.1074 / jbc.M009863200. PMID  11134028.
• Ли Л., Ляо Дж., Руланд Дж., Мак Т.В., Коэн С.Н. (2001). «Регуляторная петля TSG101 / MDM2 модулирует деградацию MDM2 и управление обратной связью MDM2 / p53». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (4): 1619–24. Bibcode:2001PNAS ... 98.1619L. Дои:10.1073 / pnas.98.4.1619. ЧВК  29306. PMID  11172000.
• VerPlank L, Bouamr F, LaGrassa TJ, Agresta B, Kikonyogo A, Leis J, Carter CA (2001). «Tsg101, гомолог убиквитин-конъюгированных (E2) ферментов, связывает L-домен в Pr55 ВИЧ типа 1 (Gag)». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (14): 7724–9. Bibcode:2001PNAS ... 98,7724 В. Дои:10.1073 / pnas.131059198. ЧВК  35409. PMID  11427703.
• Гаррус Дж. Э., фон Шведлер Великобритания, Порниллос О. В., Морхам С. Г., Завитц К. Х., Ван Х. Э., Веттштейн Д. А., Бродячий К. М., Кот М., Рич Р. Л., Мышка Д. Г., Сандквист В. И. (2001). «Tsg101 и путь сортировки вакуолярного белка важны для образования почки ВИЧ-1». Клетка. 107 (1): 55–65. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00506-2. PMID  11595185. S2CID  18525780.
• Мартин-Серрано Дж., Занг Т., Bieniasz PD (2002). «ВИЧ-1 и вирус Эбола кодируют небольшие пептидные мотивы, которые рекрутируют Tsg101 в сайты сборки частиц для облегчения выхода». Nat. Med. 7 (12): 1313–9. Дои:10,1038 / нм1201-1313. PMID  11726971. S2CID  19655035.
• Демиров Д.Г., Оно А., Оренштейн Ю.М., Фрид Е.О. (2002). «Сверхэкспрессия N-концевого домена TSG101 ингибирует образование почки ВИЧ-1, блокируя функцию позднего домена». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (2): 955–60. Bibcode:2002ПНАС ... 99..955Д. Дои:10.1073 / pnas.032511899. ЧВК  117412. PMID  11805336.
• Беннетт Н.А., Паттильо Р.А., Лин Р.С., Сие Си, Мерфи Т., Лин Д. (2002). «Экспрессия TSG101 в гинекологических опухолях: взаимосвязь с циклином D1, циклином E, белками p53 и p16». Клетка. Мол. Биол. (Шумный-ле-гран). 47 (7): 1187–93. PMID  11838966.
• Епископ Н., Хорман А., Вудман П. (2002). «Белки vps класса E млекопитающих распознают убиквитин и действуют при удалении конъюгатов эндосомный белок-убиквитин». J. Cell Biol. 157 (1): 91–101. Дои:10.1083 / jcb.200112080. ЧВК  2173266. PMID  11916981.