TWF2 - TWF2

TWF2
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2VAC, 2W0I
Идентификаторы
Псевдонимы	TWF2, A6RP, A6r, PTK9L, MSTP011, твинфилин, связывающий актин протеин 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 607433 MGI: 1346078 ГомолоГен: 5272 Генные карты: TWF2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п21.2 Начинать 52,228,612 бп[1] Конец 52,239,158 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 F1 Начинать 106,203,108 бп[2] Конец 106,215,389 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • связывание мономера актина • GO: 0001948 связывание с белками • связывание актина • связывание фосфатидилинозитол-4,5-бисфосфата • Связывание АТФ • связывание протеинкиназы C • Связывание РНК • связывание кадгерина • связывание актиновой нити Сотовый компонент • проекция клетки • филоподий • конус роста • внутриклеточный • стереоцилия • перинуклеарная область цитоплазмы • внеклеточная экзосома • цитоскелет • ламеллиподиум • цитоплазма • миофибрилла • актиновая нить Биологический процесс • клеточный ответ на ретиноевую кислоту • регуляция организации актинового цитоскелета • отрицательная регуляция полимеризации актиновых филаментов • клеточный ответ на стимул фактора роста • организация проекции клеток • положительная регуляция развития проекции нейронов • положительная регуляция удлинения аксона • положительная регуляция сборки ламеллиподиума • регулировка длины микроворсинок • секвестирование мономеров актина • колючий конец актинового филамента • регулировка сборки ламеллиподиумов • деполимеризация актиновых филаментов Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	11344	23999
Ансамбль	ENSG00000247596	ENSMUSG00000023277
UniProt	Q6IBS0	Q9Z0P5
RefSeq (мРНК)	NM_007284	NM_011876
RefSeq (белок)	NP_009215	NP_036006
Расположение (UCSC)	Chr 3: 52.23 - 52.24 Мб	Chr 9: 106,2 - 106,22 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Твинфилин-2 это белок что у людей кодируется TWF2 ген.^[5][6][7]

Белок, кодируемый этим геном, был идентифицирован по его взаимодействию с каталитическим доменом протеинкиназа C-zeta. Кодируемый белок содержит актин -обвязка сайта и АТФ -обвязка сайта. Он наиболее близок к твинфилину (PTK9), консервативному белку, связывающему мономер актина.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000247596 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000023277 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Ровер А., Киттштейн В., Маркс Ф., Гшвендт М. (август 1999 г.). «Клонирование, экспрессия и характеристика белка, родственного A6». Eur J Biochem. 263 (2): 518–25. Дои:10.1046 / j.1432-1327.1999.00537.x. PMID  10406962.
6. Вартиайнен МК, Сарккинен Э.М., Матилайнен Т., Салминен М., Лаппалайнен П. (сентябрь 2003 г.). «У млекопитающих есть две изоформы твинфилина, субклеточная локализация и тканевое распределение которых регулируется по-разному». J Biol Chem. 278 (36): 34347–55. Дои:10.1074 / jbc.M303642200. PMID  12807912.
7. «Ген Entrez: TWF2 twinfilin, актин-связывающий белок, гомолог 2 (Drosophila)».

дальнейшее чтение

• Ямада С., Учимура Э., Уэда Т. и др. (2007). «Идентификация твинфилина-2 как фактора, участвующего в росте нейритов, с помощью скрининга на основе РНКи». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 363 (4): 926–30. Дои:10.1016 / j.bbrc.2007.09.069. PMID  17910947.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Раш Дж., Мориц А., Ли К.А. и др. (2005). «Иммуноаффинное профилирование фосфорилирования тирозина в раковых клетках». Nat. Биотехнология. 23 (1): 94–101. Дои:10.1038 / nbt1046. PMID  15592455. S2CID  7200157.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, et al. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.