Тетранатрий трис (дисульфонат батофенантролина) рутений (II) - Tetrasodium tris(bathophenanthroline disulfonate)ruthenium(II)

Тетранатрий трис (дисульфонат батофенантролина) рутений (II)
Тетранатрий трис (дисульфонат батофенантролина) рутений (II) .png
Идентификаторы
ECHA InfoCard100.120.143 Отредактируйте это в Викиданных
Характеристики
C72ЧАС42N6Na4О18RUS6
Молярная масса1664.54 г · моль−1
Если не указано иное, данные для материалов приведены в их стандартное состояние (при 25 ° C [77 ° F], 100 кПа).
проверитьY проверять (что проверитьY☒N ?)
Ссылки на инфобоксы

Тетранатрий трис (дисульфонат батофенантролина) рутений (II) (Na4Ru (бит / с)3) представляет собой натриевую соль координационное соединение. В таком виде это соль из сульфоновая кислота. Это соединение является продолжением фенантролин ряд координационных соединений. Трис (дисульфонат батофенантролина) рутения (II), относящийся к анионному фрагменту, используется в качестве белок краситель в биохимия для дифференциации и обнаружения различных белков в лабораторных условиях.

В былые времена, 2-D электрофорез широко применяется в качестве стандартной процедуры для отдельный сложные белковые смеси в протеомных исследованиях (Протеомика ). Визуализация белков с помощью трис рутения (II) (дисульфоната батофентролина) стала прочно обоснованным и широко используемым методом протеомного анализа. [1][2][3][4][5][6][7][8][9][10][11][12][13][14][15][16] и важный шаг в экспрессия гена профилирование.

Для белка обнаружение, выгодно использовать флуоресцентный этикетки, содержащие хромофоры у которых больше длина волны возбуждения и длина волны излучения чем ароматный аминокислоты. Красители, используемые на этом важном этапе, должны сочетать в себе такие качества, как хорошие отношение сигнал / фон (контрастность), широкий линейный динамический диапазон, широкий диапазон применения, фотохимический стабильность и совместимость с методами идентификации белков, например масс-спектрометрии (MS) или Вестерн-блоттинг.

Первоначально рутений комплекс переходных металлов, трис (4,7-дифенил-1,10-фенантролин дисульфонат) рутения (II), также называемый трис (батофентролин дисульфонат ) (Руб. / Сек.) был синтезирован Bannwarth [17] как молекула-предшественник для красителя, который использовался как нерадиоактивный этикетка для олиго нуклеотиды.[18] Позже Rabilloud et al.[19] использовали RuBPS в качестве флуоресцентной метки для обнаружения белка в полиакриламид гели.[20] Тот факт, что RuBPS не только легко синтезировать, но и легко обрабатывать, стимулировал дальнейшие разработки в этой области.

Ламанда и др. улучшил RuBPS окрашивание протокол путем выборочного обесцвечивания полиакриламидной матрицы при сохранении содержания белка настойка. Этот новый метод имел ряд преимуществ, таких как сильные сигналы, улучшенное соотношение сигнал / фон, лучшая линейность и улучшенное разрешение базовой линии.[21]

Рекомендации

  1. ^ Miller, I .; Crawford, J .; Джанацца, Э. (октябрь 2006 г.). «Белковые красители для протеомных приложений: Что, когда, почему?". Протеомика. 6 (20): 5385–5408. Дои:10.1002 / pmic.200600323. PMID  16991193.
  2. ^ Брайборн, Малин; Аднер, Микаэль; Карделл, Ларс-Олаф (2005). «Псориазин, один из нескольких новых белков, идентифицированных в жидкости для промывания носа от аллергиков и неаллергиков с помощью 2-мерного гель-электрофореза и масс-спектрометрии». Респираторные исследования. 6 (1): 118. Дои:10.1186/1465-9921-6-118. ЧВК  1282590. PMID  16236163.
  3. ^ Клерк, Анджела; Каллингфорд, Тимоти Э .; Кемп, Тимоти Дж .; Кеннеди, Роберт А .; Сагден, Питер Х. (2005). «Регулирование экспрессии генов и белков при гипертрофии сердечных миоцитов и апоптозе». Достижения в регуляции ферментов. 45 (1): 94–111. Дои:10.1016 / j.advenzreg.2005.02.007. PMID  16084574.
  4. ^ Schaller, A .; Троллер, Р .; Molina, D .; Gallati, S .; Aebi, C .; Штутцманн Майер, П. (январь 2006 г.). «Быстрое типирование субпопуляций Moraxella catarrhalis на основе белков внешней мембраны с использованием масс-спектрометрии». Протеомика. 6 (1): 172–180. Дои:10.1002 / pmic.200500086. PMID  16317771.
  5. ^ Стасык, Т .; Morandell, S .; Бакры, Р .; Feuerstein, I .; Huck, C.W .; Stecher, G .; Бонн, Г. К .; Хубер, Л. А. (июль 2005 г.). «Количественное определение фосфопротеинов путем комбинации двухмерного разностного гель-электрофореза и фосфоспецифического флуоресцентного окрашивания». Электрофорез. 26 (14): 2850–2854. Дои:10.1002 / elps.200500026. PMID  15966015.
  6. ^ Berger, K .; Wissmann, D .; Ihling, C .; Kalkhof, S .; Beck-Sickinger, A .; Sinz, A .; Paschke, R .; Фюрер Д. (ноябрь 2004 г.). «Количественный протеомный анализ при доброкачественной узловой болезни щитовидной железы с использованием флуоресцентного трис (дисульфоната батофенантролина) рутения II». Молекулярная и клеточная эндокринология. 227 (1–2): 21–30. Дои:10.1016 / j.mce.2004.08.001. PMID  15501581.
  7. ^ Görg, A .; Weiss, W .; Данн, М. Дж. (Декабрь 2004 г.). «Современная технология двумерного электрофореза для протеомики». Протеомика. 4 (12): 3665–3685. Дои:10.1002 / pmic.200401031. PMID  15543535.
  8. ^ Смейкал, Г. Б .; Робинсон, М. Х .; Лазарев, А. (август 2004 г.). «Сравнение флуоресцентных красителей: относительная фотостабильность и дифференциальное окрашивание белков в двумерных гелях». Электрофорез. 25 (15): 2511–2519. Дои:10.1002 / elps.200406005. PMID  15300770.
  9. ^ Junca, H .; Plumeier, I .; Hecht, H. J. R .; Пайпер, Д. Х. (декабрь 2004 г.). «Различие в кинетическом поведении вариантов катехол-2,3-диоксигеназы из загрязненной окружающей среды». Микробиология. 150 (12): 4181–4187. Дои:10.1099 / мик. 0.27451-0. PMID  15583170.
  10. ^ Tang, H. Y .; Спайчер, Д. В. (июнь 2005 г.). «Комплексное префракционирование протеома с использованием изоэлектрофокусировки раствора в микромасштабе». Экспертный обзор протеомики. 2 (3): 295–306. Дои:10.1586/14789450.2.3.295. PMID  16000077.
  11. ^ Пьет, Андре; Деруо, Аделина; Геркенс, Паскаль; Noens, Elke E.E .; Маццуккелли, Габриэль; Вион, Себастьен; Koerten, Henk K .; Титгемейер, Фриц; Де Пау, Эдвин; Лепринс, Пьер; van Wezel, Gilles P .; Галлени, Морено; Ригали, Себастьян (2005). "От спящих до прорастающих спор Streptomyces coelicolor A3 (2): Новые перспективы crp Нулевой мутант ". Журнал протеомных исследований. 4 (5): 1699–1708. Дои:10.1021 / pr050155b. PMID  16212423.
  12. ^ Куаглино, Даниэла; Боралди, Федерика; Бини, Лука; Вольпи, Никола (апрель 2004 г.). "Белковый профиль фибробластов: роль протеомики". Современная протеомика. 1 (2): 167. Дои:10.2174/1570164043379424.
  13. ^ Hjernø, K .; Alm, R .; Canbäck, B.R .; Matthiesen, R .; Трайковски, К .; Björk, L .; Roepstorff, P .; Эмануэльссон, К. (2006). «Снижение регуляции аллергена, гомологичного Bet v 1 клубники, в сочетании с путем биосинтеза флавоноидов у бесцветных мутантов клубники». Протеомика. 6 (5): 1574–1587. Дои:10.1002 / pmic.200500469. PMID  16447153.
  14. ^ Гербер, Исак Б .; Лаукенс, Крис; Виттерс, Эрвин; Дубери, Ян А. (2006). "Липополисахарид-чувствительные фосфопротеины в Nicotiana tabacum клетки ». Физиология и биохимия растений. 44 (5–6): 369–379. Дои:10.1016 / j.plaphy.2006.06.015. PMID  16889970.
  15. ^ Chevallet, M .; Димер, Х. Л. Н .; Luche, S .; Van Dorsselaer, A .; Rabilloud, T .; Лейзе-Вагнер, Э. (2006). «Улучшенная совместимость с масс-спектрометрией обеспечивается окрашиванием аммиачным серебром». Протеомика. 6 (8): 2350–2354. arXiv:q-bio / 0611083. Дои:10.1002 / pmic.200500567. ЧВК  2797540. PMID  16548061.
  16. ^ Ламанда, Андреас; Чеаиб, Зейнаб; Тургут, Мелек Дилек; Лусси, Адриан (2007). Имхоф, Аксель (ред.). «Буферизация белков в модельных системах и в цельной слюне человека». PLoS ONE. 2 (2): e263. Bibcode:2007PLoSO ... 2..263L. Дои:10.1371 / journal.pone.0000263. ЧВК  1803027. PMID  17327922. открытый доступ
  17. ^ http://www.chemie.uni-freiburg.de/orgbio/w3bann/index.html
  18. ^ Bannwarth, W .; Schmidt, D .; Stallard, R.L .; Hornung, C .; Knorr, R .; Мюллер, Ф. (декабрь 1988 г.). «Комплексы батофенантролин-рутений (II) в качестве нерадиоактивных меток для олигонуклеотидов, которые могут быть измерены методами флуоресценции с временным разрешением». Helvetica Chimica Acta. 71 (8): 2085. Дои:10.1002 / hlca.19880710826.
  19. ^ Rabilloud, T .; Strub, J.M .; Luche, S .; Dorsselaer, A .; Лунарди, Дж. Л. (2001). «Сравнение Sypro Ruby и трис рутения II (дисульфонат батофенантролина) в качестве флуоресцентных красителей для обнаружения белка в гелях» (PDF). Протеомика. 1 (5): 699–704. Дои:10.1002 / 1615-9861 (200104) 1: 5 <699 :: AID-PROT699> 3.0.CO; 2-C. PMID  11678039. Архивировано из оригинал (PDF) на 2010-04-01.
  20. ^ «Архивная копия». Архивировано из оригинал на 2011-05-29. Получено 2007-04-26.CS1 maint: заархивированная копия как заголовок (связь)
  21. ^ Lamanda, A .; Zahn, A .; Röder, D .; Ланген, Х. (март 2004 г.). «Улучшенный протокол окрашивания и обесцвечивания трис (дисульфонат батофенантролина) рутения II для лучшего отношения сигнал / фон и улучшенного разрешения исходного уровня». Протеомика. 4 (3): 599–608. Дои:10.1002 / pmic.200300587. PMID  14997483.

внешняя ссылка

Более подробную информацию о окрашивании трис (батофенантролин дисульфонатом) рутения (II) можно найти на [1]