Тимидинкиназа 1 - Thymidine kinase 1

TK1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1W4R, 1XBT, 2ORV, 2WVJ
Идентификаторы
Псевдонимы	TK1, TK2, тимидинкиназа 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 188300 MGI: 98763 ГомолоГен: 37749 Генные карты: TK1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q25.3 Начинать 78,174,091 бп[1] Конец 78,187,233 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 E2 | 11 82,96 см Начинать 117,815,526 бп[2] Конец 117,826,092 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • связывание нуклеотидов • активность нуклеозидкиназы • связывание ионов цинка • связывание ионов металлов • киназная активность • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • Связывание АТФ • тимидинкиназа • активность тимидинкиназы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль Биологический процесс • Процесс биосинтеза ДНК • фосфорилирование • остатки пиримидиновых нуклеозидов • метаболический процесс соединения, содержащего азотистые основания • гомотетрамеризация белков • процесс биосинтеза дезоксирибонуклеозидмонофосфата • Метаболический процесс ДНК • процесс биосинтеза нуклеотидов • метаболический процесс тимидина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	7083	21877
Ансамбль	ENSG00000167900	ENSMUSG00000025574
UniProt	P04183	P04184
RefSeq (мРНК)	NM_003258 NM_001346663 NM_001363848	NM_001271729 NM_009387
RefSeq (белок)	NP_001333592 NP_003249 NP_001350777	NP_001258658 NP_033413
Расположение (UCSC)	Chr 17: 78.17 - 78.19 Мб	Chr 11: 117,82 - 117,83 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Тимидинкиназа 1, растворимая (название гена TK1), человек тимидинкиназа.^[5]

Две формы этого белка были идентифицированы в клетках животных: одна в цитозоле и одна в митохондрии. Активность цитозольного фермента высока в пролиферирующих клетках и достигает пика во время S-фаза из клеточный цикл; в покоящихся клетках он очень низкий.

Взаимодействия

Было показано, что тимидинкиназа 1 взаимодействовать с P21.^[6]

Интерактивная карта проезда

Нажмите на гены, белки и метаболиты ниже, чтобы ссылки на соответствующие статьи.^{[§ 1]}

[[Файл:

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

[[

]]

| {{{bSize}}} px | alt = Активность фторурацила (5-ФУ) редактировать ]]

Активность фторурацила (5-FU) редактировать

1. Интерактивную карту путей можно редактировать на WikiPathways: «ФторпиримидинActivity_WP1601».

Тимидинкиназа 1 при раке

Тимидинкиназа оказывает растущее влияние на сообщество исследователей рака. Было обнаружено, что повышенные уровни TK-1 в сыворотке крови связаны с наличием многих типов злокачественных новообразований, кроме того, было обнаружено, что TK-1 повышается в сыворотке крови еще до появления клинических симптомов.^[7] Это дает возможность для более раннего лечения. Было обнаружено, что повышение уровня ТК-1 в сыворотке коррелирует с возвращением груди и другими формами рака.^[8] TK-1 можно использовать для более раннего выявления рака, определения его стадии и выявления рецидива. Тимидинкиназа 1 может быть измерена на основе ее ферментативной активности.^[9] или с помощью иммуноанализа.^[10]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000167900 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000025574 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: тимидинкиназа 1, растворимая».
6. Хуан Д. Ю., Чанг Ц. Ф. (июнь 2001 г.). «Взаимодействие человеческой тимидинкиназы 1 с p21 (Waf1)». Biochem. J. 356 (Pt 3): 829–34. Дои:10.1042/0264-6021:3560829. ЧВК  1221910. PMID  11389691.
7. Алегре М.М., Робисон Р.А., О'Нил К.Л. (май 2013 г.). «Тимидинкиназа 1: универсальный маркер рака». Рак и клиническая онкология. 2 (1). Дои:10.5539 / cco.v2n1p159.
8. Алегре М.М., Робисон Р.А., О'Нил К.Л. (2012). «Повышение регуляции тимидинкиназы 1 является ранним событием в образовании опухоли груди». Журнал онкологии. 2012: 575647. Дои:10.1155/2012/575647. ЧВК  3388419. PMID  22778736.
9. Мунк-Петерсен Б (2005). «Различия в кинетических свойствах изоферментов тимидинкиназы в нестимулированных и стимулированных фитогемагглютинином лимфоцитах человека». Мол. Клетка. Биохим. 64 (2): 1013–19. Дои:10.1007 / BF00224774. PMID  6504022. S2CID  11326439.
10. He Q, Zhang P, Zou L, et al. (2005). «Концентрация тимидинкиназы 1 в сыворотке (S-TK1) является более чувствительным маркером пролиферации в солидных опухолях человека, чем ее активность». Онкол. Представитель. 14 (4): 1013–19. PMID  16142366.

дальнейшее чтение

• Ким Ю.К., Ли А.С. (1992). «Идентификация сайта связывания с белком в промоторе гена тимидинкиназы человека, необходимого для G1-S-регулируемой транскрипции». J. Biol. Chem. 267 (4): 2723–7. PMID  1370831.
• Барик С., Банерджи А.К. (1991). «Клонирование и экспрессия гена фосфопротеина вируса везикулярного стоматита в Escherichia coli: анализ статуса фосфорилирования по сравнению с транскрипционной активностью». Дж. Вирол. 65 (4): 1719–26. Дои:10.1128 / JVI.65.4.1719-1726.1991. ЧВК  239976. PMID  1848304.
• Садава Д., Бернард Б. (1990). «Переход от цитозольной к митохондриальной тимидинкиназе во время развития в тканях плода человека». Life Sci. 47 (25): 2359–64. Дои:10.1016 / 0024-3205 (90) 90275-В. PMID  2263164.
• Тамия Н., Юса Т., Ямагути Ю., Цукифудзи Р., Куроива Н., Морияма Ю., Фудзимура С. (1989). «Совместная очистка тимидилаткиназы и цитозольной тимидинкиназы из плаценты человека с помощью аффинной хроматографии». Биохим. Биофиз. Acta. 995 (1): 28–35. Дои:10.1016 / 0167-4838 (89) 90229-Х. PMID  2538159.
• Slagel V, Flemington E, Traina-Dorge V, Bradshaw H, Deininger P (1987). «Кластеризация и отношения подсемейства семейства Alu в геноме человека». Мол. Биол. Evol. 4 (1): 19–29. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a040422. PMID  3128713.
• Флемингтон Э., Брэдшоу HD, Трейна-Дорж V, Слагель V, Дейнингер П.Л. (1987). «Последовательность, структура и характеристика промотора гена тимидинкиназы человека». Ген. 52 (2–3): 267–77. Дои:10.1016/0378-1119(87)90053-9. PMID  3301530.
• Шерли Дж. Л., Келли Т. Дж. (1988). «Человеческая цитозольная тимидинкиназа. Очистка и физическая характеристика фермента из клеток HeLa». J. Biol. Chem. 263 (1): 375–82. PMID  3335503.
• Крейдберг Дж. А., Келли Т. Дж. (1986). «Генетический анализ промотора гена тимидинкиназы человека». Мол. Клетка. Биол. 6 (8): 2903–9. Дои:10.1128 / mcb.6.8.2903. ЧВК  367858. PMID  3785218.
• Брэдшоу HD, Дейнингер П.Л. (1984). «Ген тимидинкиназы человека: молекулярное клонирование и нуклеотидная последовательность кДНК, экспрессируемая в клетках млекопитающих». Мол. Клетка. Биол. 4 (11): 2316–20. Дои:10.1128 / mcb.4.11.2316. ЧВК  369060. PMID  6549046.
• Куо В.Л., Хиршхорн Р., Хьюи М.Л., Хиршхорн К. (1996). «Локализация и упорядочение кислой альфа-глюкозидазы (GAA) и тимидинкиназы (TK1) путем флуоресцентной гибридизации in situ». Гм. Genet. 97 (3): 404–6. Дои:10.1007 / BF02185782. PMID  8786092. S2CID  9056186.
• Чанг Ц.Ф., Хуанг Д.Й., Чи Л.М. (1998). «Серин 13 является участком митотического фосфорилирования тимидинкиназы человека». J. Biol. Chem. 273 (20): 12095–100. Дои:10.1074 / jbc.273.20.12095. PMID  9575153.
• Беренштейн Д., Кристенсен Дж. Ф., Кристенсен Т., Хофбауэр Р., Мунк-Петерсен Б. (2000). «Валин, а не метионин, является аминокислотой 106 в цитозольной тимидинкиназе человека (TK1). Влияние на олигомеризацию, стабильность и кинетические свойства». J. Biol. Chem. 275 (41): 32187–92. Дои:10.1074 / jbc.M005325200. PMID  10924519.
• Хуанг Д.Й., Чанг Ц.Ф. (2001). «Взаимодействие человеческой тимидинкиназы 1 с p21 (Waf1)». Biochem. J. 356 (Pt 3): 829–34. Дои:10.1042/0264-6021:3560829. ЧВК  1221910. PMID  11389691.
• Фудзиваки Р., Хата К., Морияма М., Иванари О, Катабучи Х., Окамура Х., Миядзаки К. (2001). «Клиническое значение тимидинкиназы у больных карциномой шейки матки». Онкология. 61 (1): 47–54. Дои:10.1159/000055352. PMID  11474248. S2CID  9006108.
• Фудзиваки Р., Хата К., Накаяма К., Морияма М., Иванари О, Катабучи Х., Окамура Х., Сакаи Е., Миядзаки К. (2002). «Тимидинкиназа при эпителиальном раке яичников: взаимосвязь с другими ферментами пиримидинового пути». Int. J. Рак. 99 (3): 328–35. Дои:10.1002 / ijc.10319. PMID  11992400. S2CID  23856606.
• Мао И, Ву Дж, Ван Н, Хе Л, Ву Ц, Хе Ц, Ског С. (2002). «Сравнительное исследование: иммуногистохимическое определение цитозольной тимидинкиназы и ядерного антигена пролиферирующих клеток при раке молочной железы». Рак Инвест. 20 (7–8): 922–31. Дои:10.1081 / CNV-120005905. PMID  12449723. S2CID  23072666.
• Жиль С.И., Ромен С., Казеллас П., Оуафик Л., Фина Ф., Комбес Т., Вуароку В., Зейтц Дж. Ф., Боннье П., Галиег С., Карайон П., Мартин П. М. (2003). «Анализ мутации в кодирующей последовательности тимидинкиназы 1 при раке груди и колоректального рака». Int. J. Biol. Маркеры. 18 (1): 1–6. Дои:10.5301 / jbm.2008.2452. PMID  12699056.
• Хан Т., Фернандес М., Саркар М., Агарвал Р.П. (2004). «2 ', 3'-Дидезоксицитидин подавляет экспрессию тимидинкиназ 1 и 2 в Т-лимфоидных клетках». Life Sci. 74 (7): 835–42. Дои:10.1016 / j.lfs.2003.07.023. PMID  14659972.
• Ли CL, Лу CY, Ke PY, Chang ZF (2004). «Нарушение АТФ-индуцированной тетрамеризации цитозольной тимидинкиназы человека путем замены серина-13 на аспарагиновую кислоту на участке митотического фосфорилирования». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 313 (3): 587–93. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.11.147. PMID  14697231.
• ONeill KL, Buckwalter M, Murray BK (2001). «Тимидинкиназа: диагностический и прогностический потенциал». Эксперт Преподобный Мол. Диаг. 1 (4): 428–33. Дои:10.1586/14737159.1.4.428. PMID  11901857. S2CID  12790327.
• Topolcan O, Holubec Jr L (2008). «Роль тимидинкиназы при онкологических заболеваниях». Мнение эксперта. Med. Диаг. 2 (2): 129–41. Дои:10.1517/17530059.2.2.129. PMID  23485133.
• Джагарламуди К.К., Шоу М. (2018). «Тимидинкиназа 1 как опухолевый биомаркер: технические достижения предлагают новый потенциал для старого биомаркера». Биомарк. Med. 12 (9): 1035–48. Дои:10.2217 / bmm-2018-0157. PMID  30039979.