VAC14 - VAC14 - Wikipedia

VAC14
Идентификаторы
Псевдонимы	VAC14, ArPIKfyve, TAX1BP2, TRX, Vac14, компонент комплекса PIKFYVE, компонент VAC14 комплекса PIKFYVE
Внешние идентификаторы	OMIM: 604632 MGI: 2157980 ГомолоГен: 6528 Генные карты: VAC14
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16q22.1-q22.2 Начинать 70,687,439 бп[1] Конец 70,801,160 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 D3-E1 | 8 57,59 см Начинать 110,618,585 бп[2] Конец 110,720,398 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • сигнальная активность рецептора Сотовый компонент • мембрана органеллы • Мембрана Гольджи • эндосома • мембрана ранней эндосомы • эндосомная мембрана • PAS комплекс • эндоплазматический ретикулум • мембрана поздней эндосомы • мембрана • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • внешний компонент вакуолярной мембраны Биологический процесс • GO: 0022415 вирусный процесс • преобразование сигнала • процесс биосинтеза фосфатидилинозита Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	55697	234729
Ансамбль	ENSG00000103043	ENSMUSG00000010936
UniProt	Q08AM6	Q80WQ2
RefSeq (мРНК)	NM_018052 NM_001351157	NM_146216
RefSeq (белок)	NP_060522 NP_001338086	NP_666328
Расположение (UCSC)	Chr 16: 70.69 - 70.8 Мб	Chr 8: 110.62 - 110.72 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гомолог белка VAC14, также известный как ArPIKfyve (Ассоциированный регулятор PIKfyve), является белок что у людей кодируется VAC14 ген.^[5][6][7]

Функции и взаимодействия

Содержание фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфат (PtdIns (3,5) P2) в эндосомальных мембранах динамически изменяется с событиями деления и слияния, которые генерируют или поглощают внутриклеточные транспортные везикулы. Белок ArPIKfyve образует тримолекулярный комплекс, чтобы жестко регулировать уровень PtdIns (3,5) P2. Другими компонентами этого комплекса являются фермент, синтезирующий PtdIns (3,5) P2. ПИКФЫВЕ и содержащая Sac1-домен PtdIns (3,5) P2 5-фосфатаза Sac3, кодируемая геном человека FIG4. VAC14 действует как активатор PIKFYVE.^[5][8] Исследования на мышах, нокаутированных по VAC14, показывают, что, помимо увеличения PtdIns (3,5) P2-продуцирующей активности PIKfyve, VAC14 также контролирует стабильные уровни другого редкого фосфоинозитида, связанного с активностью фермента PIKfyve - фосфатидилинозитол 5-фосфат.

Помимо образования тройного комплекса с PIKfyve и Sac3, ArPIKfyve участвует во многих других взаимодействиях. ArPIKfyve образует стабильный комплекс с PtdIns (3,5) P2-специфической фосфатазой Sac3, тем самым защищая Sac3 от быстрой деградации в протеасоме.^[9] ArPIKfyve образует гомоолигомер через свой карбоксильный конец. Однако количество мономеров в гомоолигомере ArPIKfyve, гетеродимере ArPIKfyve-Sac3 или гетеротримере PIKfyve-ArPIKfyve-Sac3 неизвестно.^[10] Человеческий Vac14 / ArPIKfyve также взаимодействует с доменом PDZ (постсинаптическая плотность) нейрональной синтазы оксида азота. ^[11] но функциональное значение этого взаимодействия до сих пор неясно. ArPIKfyve способствует регулируемой инсулином транслокации GLUT4 на поверхность клетки.^[12]

Уроки из моделей мыши VAC14

Мыши с нокаутом по VAC14 умирают во время или вскоре после рождения и демонстрируют массивную нейродегенерацию. В фибробластах этих мышей уровни PtdIns (3,5) P2 и PtdIns (5) P ниже примерно на 50%.^[13] Спонтанная точечная мутация VAC14 мыши (с заменой лейцина 156 аргинином) связана с уменьшением продолжительности жизни (до 3 недель), размером тела, увеличением желудочков мозга, 50% снижением уровней PtdIns (3,5) P2, ослабленной пигментацией и т. тремор и нарушение двигательной функции.^[14]

VAC14 и болезнь человека

Ген VAC14 еще предстоит убедительно связать с болезнями человека.^[15]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000103043 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000010936 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: гомолог Vac14 (S. cerevisiae)».
6. Дэви Б. Е., Робинсон М. Л. (май 2003 г.). «Врожденная гидроцефалия у мышей hy3 вызвана мутацией сдвига рамки считывания в Hydin, большом новом гене». Гм. Мол. Genet. 12 (10): 1163–70. Дои:10.1093 / hmg / ddg122. PMID  12719380.
7. Сбрисса Д., Иконов О.К., Стракова Дж., Дондапати Р., Млак К., Диб Р., Сильвер Р., Шишева А. (декабрь 2004 г.). «Ортолог Saccharomyces cerevisiae Vac14 млекопитающих, который ассоциирует с активностью фосфоинозитид-5-киназы PIKfyve и повышает ее активность». Мол. Клетка. Биол. 24 (23): 10437–47. Дои:10.1128 / MCB.24.23.10437-10447.2004. ЧВК  529046. PMID  15542851.
8. Сбрисса Д., Иконов О.К., Фу З., Иджуин Т., Грюнберг Дж., Такенава Т., Шишева А. (август 2007 г.). «Аппарат основного белка для синтеза и обмена фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфата у млекопитающих, который регулирует развитие эндосомного транспорта. Новая фосфатаза Sac присоединяется к комплексу ArPIKfyve-PIKfyve». J. Biol. Chem. 282 (33): 23878–91. Дои:10.1074 / jbc.M611678200. PMID  17556371.
9. Иконов О.К., Сбрисса Д., Флиггер Дж., Дельвеккио К., Шишева А. (август 2010). «ArPIKfyve регулирует количество и обмен белка Sac3: нарушение механизма мутацией Sac3I41T, вызывающей расстройство Шарко-Мари-Тута 4J». J. Biol. Chem. 285 (35): 26760–4. Дои:10.1074 / jbc.C110.154658. ЧВК  2930674. PMID  20630877.
10. Сбрисса Д., Иконов О.К., Феннер Х., Шишева А. (декабрь 2008 г.). «Гомомерные и гетеромерные взаимодействия ArPIKfyve формируют основу PIKfyve и Sac3 в комплексе, чтобы способствовать активности и функциональности PIKfyve». J. Mol. Биол. 384 (4): 766–79. Дои:10.1016 / j.jmb.2008.10.009. ЧВК  2756758. PMID  18950639.
11. Лемер Дж. Ф., Макферсон П. С. (декабрь 2006 г.). «Связывание Vac14 с нейрональной синтазой оксида азота: характеристика нового внутреннего мотива распознавания PDZ». FEBS Lett. 580 (30): 6948–54. Дои:10.1016 / j.febslet.2006.11.061. PMID  17161399. S2CID  40346432.
12. Иконов О.К., Сбрисса Д., Дондапати Р., Шишева А. (июль 2007 г.). «Взаимодействие ArPIKfyve-PIKfyve и роль в регулируемой инсулином транслокации GLUT4 и транспорте глюкозы в адипоцитах 3T3-L1». Exp. Cell Res. 313 (11): 2404–16. Дои:10.1016 / j.yexcr.2007.03.024. ЧВК  2475679. PMID  17475247.
13. Чжан Ю., Золов С.Н., Чоу С.Й., Слуцкий С.Г., Ричардсон С.К., Пайпер Р.С., Ян Б., Нау Дж.Дж., Вестрик Р.Дж., Моррисон С.Дж., Мейслер М.Х., Вайсман Л.С. (октябрь 2007 г.). «Потеря Vac14, регулятора сигнального липида фосфатидилинозитол-3,5-бисфосфата, приводит к нейродегенерации у мышей». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 104 (44): 17518–23. Дои:10.1073 / pnas.0702275104. ЧВК  2077288. PMID  17956977.
14. Джин Н., Чоу С.Й., Лю Л., Золов С.Н., Бронсон Р., Дэвиссон М., Петерсен Д.Л., Чжан Ю., Пак С., Дуэкс Д.Е., Голдовиц Д., Мейслер М.Х., Вайсман Л.С. (декабрь 2008 г.). «VAC14 образует ядро ​​белкового комплекса, необходимого для острой взаимной конверсии PI3P и PI (3,5) P (2) у дрожжей и мышей» (PDF). EMBO J. 27 (24): 3221–34. Дои:10.1038 / emboj.2008.248. ЧВК  2600653. PMID  19037259.
15. «VAC14 - гомолог Vac14 (S. cerevisiae)». WikiGenes. Получено 2011-07-16.

дальнейшее чтение

• Мирескандари А., Рид Р.Л., Кашанчи Ф. и др. (1996). «Выделение клона кДНК, TRX, кодирующего человеческий Т-клеточный лимфотрофный вирус типа I Tax1, связывающий белок». Биохим. Биофиз. Acta. 1306 (1): 9–13. Дои:10.1016/0167-4781(96)00012-7. PMID  8611628.