WIPF1 - WIPF1

WIPF1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2A41, %% s2A41
Идентификаторы
Псевдонимы	WIPF1, PRPL-2, WASPIP, WIP, WAS2, WAS / WASL член семейства взаимодействующих белков 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602357 MGI: 2178801 ГомолоГен: 86891 Генные карты: WIPF1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q31.1 Начните 174,559,572 бп[1] Конец 174,682,916 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 C3 | 2 43,68 см Начните 73,429,610 бп[2] Конец 73,529,734 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • профилиновое связывание • GO: 0001948 связывание с белками • связывание актина • Привязка домена SH3 • связывание актиновой нити Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • проекция клетки • взъерошить • актиновый цитоскелет • цитоскелет • цитоплазматический пузырек • актиновая нить • актиновый кортикальный пластырь Биологический процесс • Путь передачи сигналов рецептора Fc-гамма, участвующий в фагоцитозе • реакция на другой организм • полимеризация или деполимеризация актина • движение на основе актиновых волокон • сборка макромолекулярного комплекса • актиновый кортикальный пластырь • эндоцитоз • положительная регуляция нуклеации актина • локализация актинового кортикального пластыря Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	7456	215280
Ансамбль	ENSG00000115935	ENSMUSG00000075284
UniProt	O43516	Q8K1I7
RefSeq (мРНК)	NM_001077269 NM_003387	NM_001289722 NM_001289723 NM_153138
RefSeq (белок)	NP_001070737 NP_003378 NP_001362761 NP_001362762 NP_001362763 NP_001362764 NP_001362765 NP_001362766 NP_001362767 NP_001362768	NP_001276651 NP_001276652 NP_694778
Расположение (UCSC)	Chr 2: 174,56 - 174,68 Мб	Chr 2: 73,43 - 73,53 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

WAS / WASL-взаимодействующий член семейства белков 1 (WIP) - это белок что у людей кодируется WIPF1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген кодирует белок, который играет важную роль в организации актинового цитоскелета. Было показано, что сверхэкспрессия WIP в клетках млекопитающих увеличивает полимеризацию актина.^[5] Кодируемый белок связывается с областью белка синдрома Вискотта-Олдрича, который часто мутирует при синдроме Вискотта-Олдрича, Х-сцепленном рецессивном заболевании. Нарушение взаимодействия между этими двумя белками может способствовать заболеванию. Для этого гена были идентифицированы два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.^[6] У пациентов с отсутствием гена WIPF1 уровни белка WASp истощены и присутствуют симптомы WAS.^[7]

Взаимодействия

WIPF1 был показан взаимодействовать с участием Белок синдрома Вискотта-Олдрича,^[5][8] N-WASp, Кортактин,^[9] NCK1,^[8] MYO1e^[10] и ITSN1.^[11] В то время как Белок синдрома Вискотта-Олдрича выражается только в гематопоэтический клеток, WIPF1 экспрессируется повсеместно.^[5] Большинство мутаций, вызывающих синдром Вискотта-Олдрича, локализованы в домене WH1 WASp.^[12] Эти мутации влияют на связывание WASp-WIPF1.^[13] WIPF1 имеет N-вывод профилин связывающий домен, связывание двух актинов WH2 домены, центральный участок полипролина и С-конец WASP Связывающий домен. Белок WASp разрушается в отсутствие WIP; однако повсеместно экспрессируемый ортолог WASp N-WASp остается стабильным в отсутствие WIP.

Работа в дрожжах

Функции и взаимодействия WIPF1 были изучены в нескольких грибковый системы, включая Saccharomyces cerevisiae, Schizosaccharomyces pombe, грибковые микроорганизмы албиканс,^[14] и Magnaporthe grisea.^[15]

Vrp1 дрожжей привлекается к участкам эндоцитоза посредством WASp гомологи. Здесь он взаимодействует с миозином-1 и усиливает опосредованную миозином-1 активацию Комплекс Арп2 / 3.^[16] Помимо роли в эндоцитозе, Saccharomyces cerevisiae Vrp1 участвует в цитокинезе и поляризации клеток.^[17]

В Schizosaccharomyces pombe Считается, что взаимодействие Vrp1 с миозином-1 помогает расположить новые ветви актина рядом с мембраной, увеличивая силу воздействия на мембрану. Это взаимодействие нарушается дрожжевым специфическим белком. Bbc1 / Mti1 / SPAC23A1.17, который конкурирует с Vrp1 за связывание Myo1e гомолог.^[18]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000115935 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000075284 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Рамеш Н., Антон И.М., Хартвиг ​​Дж. Х., Геха Р.С. (декабрь 1997 г.). «WIP, белок, связанный с белком синдрома Вискотта-Альдриха, индуцирует полимеризацию и перераспределение актина в лимфоидных клетках». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 94 (26): 14671–6. Bibcode:1997PNAS ... 9414671R. Дои:10.1073 / pnas.94.26.14671. ЧВК  25088. PMID  9405671.
6. «Ген Entrez: семейство взаимодействующих белков WIPF1 WAS / WASL, член 1».
7. Ланци Г., Моратто Д., Вайро Д., Маснери С., Делмонте О., Паганини Т. и др. (Январь 2012 г.). «Новый первичный иммунодефицит человека из-за дефицита WASP-взаимодействующего белка WIP». Журнал экспериментальной медицины. 209 (1): 29–34. Дои:10.1084 / JEM.20110896. HDL:11379/487873. ЧВК  3260865. PMID  22231303.
8. Антон И.М., Лу В., Майер Б.Дж., Рамеш Н., Геха Р.С. (август 1998 г.). «Белок, взаимодействующий с белком (WIP) синдрома Вискотта-Олдрича, связывается с адаптерным белком Nck». Журнал биологической химии. 273 (33): 20992–5. Дои:10.1074 / jbc.273.33.20992. PMID  9694849.
9. Кинли А.В., Вид С.А., Уивер А.М., Каргинов А.В., Биссонетт Э., Купер Дж. А., Парсонс Дж. Т. (март 2003 г.). «Кортактин взаимодействует с WIP, регулируя активацию Arp2 / 3 и выступание мембраны». Текущая биология. 13 (5): 384–93. Дои:10.1016 / S0960-9822 (03) 00107-6. PMID  12620186. S2CID  17357571.
10. Ченг Дж., Грассарт А., Друбин Д. Г. (август 2012 г.). «Миозин 1E координирует сборку актина и транспортировку грузов во время клатрин-опосредованного эндоцитоза». Молекулярная биология клетки. 23 (15): 2891–904. Дои:10.1091 / mbc.e11-04-0383. ЧВК  3408416. PMID  22675027.
11. Грязнова Т, Кропивко С, Бурдынюк М, Губарь О, Крыклива В, Цыба Л, Рындич А (июль 2015). «Интерсектиновые адаптерные белки связаны с актин-регулирующим белком WIP у инвадоподий». Сотовая связь. 27 (7): 1499–508. Дои:10.1016 / j.cellsig.2015.03.006. PMID  25797047.
12. Раджмохан Р., Раода А., Вонг М. Х., Танабалу Т. (декабрь 2009 г.). «Характеристика мутантов синдрома Вискотта-Олдрича (WAS) с использованием Saccharomyces cerevisiae». FEMS дрожжевые исследования. 9 (8): 1226–35. Дои:10.1111 / j.1567-1364.2009.00581.x. PMID  19817875.
13. Раджмохан Р., Мэн Л., Ю С., Танабалу Т. (апрель 2006 г.). «WASP подавляет дефект роста штамма Saccharomyces cerevisiae las17Delta в присутствии WIP». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 342 (2): 529–36. Дои:10.1016 / j.bbrc.2006.01.160. PMID  16488394.
14. Борт, Николь (19 июля 2010 г.). «Candida albicans Vrp1 необходим для поляризованного морфогенеза и взаимодействует с Wal1 и Myo5» (PDF). Микробиология. 156 (Pt 10): 2962–2969. Дои:10.1099 / микрофон.0.041707-0. PMID  20656786.
15. Хуан Линь (24 января 2017 г.). «MoVrp1, предполагаемый белок верпролина, необходим для бесполого развития и инфицирования рисового грибка Magnaporthe oryzae» (PDF). Научные отчеты. 7: 41148. Bibcode:2017НатСР ... 741148Н. Дои:10.1038 / srep41148. ЧВК  5259722. PMID  28117435.
16. Сироткин, Владимир; Beltzner, Christopher C .; Маршан, Жан-Батист; Поллард, Томас Д. (2005-08-15). «Взаимодействие WASp, миозина-I и верпролина с комплексом Arp2 / 3 во время сборки актинового пятна у делящихся дрожжей». Журнал клеточной биологии. 170 (4): 637–648. Дои:10.1083 / jcb.200502053. ISSN  0021-9525. ЧВК  2171502. PMID  16087707.
17. Munn, Alan L .; Танабалу, Тирумаран (июль 2009 г.). «Верпролин: отличный набор актин-связывающих сайтов и несколько очень ГОРЯЧИХ пролинов». IUBMB Life. 61 (7): 707–712. Дои:10.1002 / iub.195. HDL:10072/30097. ISSN  1521-6551. PMID  19507265. S2CID  6788285.
18. Компакт-диск MacQuarrie, Mangione MC, Carroll R, James M, Gould KL, Sirotkin V (сентябрь 2019 г.). «Адаптерный белок Bbc1 S. pombe регулирует локализацию Wsp1 и Vrp1 во время сборки эндоцитарного актинового пятна». Журнал клеточной науки. 132 (17): jcs233502. Дои:10.1242 / jcs.233502. ЧВК  6771142. PMID  31391237.

дальнейшее чтение

• Рамеш Н., Антон И.М., Мартинес-Килес Н., Геха Р.С. (январь 1999 г.). «Вальсируя с WASP». Тенденции в клеточной биологии. 9 (1): 15–9. Дои:10.1016 / S0962-8924 (98) 01411-1. PMID  10087612.
• Антон И.М., Лу В., Майер Б.Дж., Рамеш Н., Геха Р.С. (август 1998 г.). «Белок, взаимодействующий с белком (WIP) синдрома Вискотта-Олдрича, связывается с адаптерным белком Nck». Журнал биологической химии. 273 (33): 20992–5. Дои:10.1074 / jbc.273.33.20992. PMID  9694849.
• Стюарт Д.М., Тиан Л., Нельсон Д.Л. (апрель 1999 г.). «Мутации, вызывающие синдром Вискотта-Олдрича, нарушают взаимодействие белка синдрома Вискотта-Олдрича (WASP) с белком, взаимодействующим с WASP». Журнал иммунологии. 162 (8): 5019–24. PMID  10202051.
• Вадува Г., Мартинес-Куилс Н., Антон И.М., Мартин Н.С., Геха Р.С., Хоппер А.К., Рамеш Н. (июнь 1999 г.). «Белок, взаимодействующий с WASP человека, WIP, активирует путь клеточной полярности у дрожжей». Журнал биологической химии. 274 (24): 17103–8. Дои:10.1074 / jbc.274.24.17103. PMID  10358064.
• Моро В., Фришкнехт Ф., Рекманн I, Винсентелли Р., Рабут Г., Стюарт Д., Вэй М. (июль 2000 г.). «Комплекс N-WASP и WIP объединяет сигнальные каскады, которые приводят к полимеризации актина». Природа клеточной биологии. 2 (7): 441–8. Дои:10.1038/35017080. PMID  10878810. S2CID  40986646.
• Vetterkind S, Miki H, Takenawa T, Klawitz I, Scheidtmann KH, Preuss U (январь 2002 г.). «Крысиный гомолог белка, взаимодействующего с белком синдрома Вискотта-Олдрича (WASP) (WIP), связывается с актиновыми филаментами, рекрутирует N-WASP из ядра и опосредует мобилизацию актина из стрессовых волокон в пользу образования филоподий». Журнал биологической химии. 277 (1): 87–95. Дои:10.1074 / jbc.M104555200. PMID  11687573.
• Антон И.М., де ла Фуэнте М.А., Симс Т.Н., Фриман С., Рамеш Н., Хартвиг ​​Дж. Х. и др. (Февраль 2002 г.). «Дефицит WIP показывает различную роль WIP и актинового цитоскелета в активации Т- и В-клеток». Иммунитет. 16 (2): 193–204. Дои:10.1016 / S1074-7613 (02) 00268-6. PMID  11869681.
• Скотт М.П., ​​Заппакоста Ф., Ким Е.Ю., Аннан Р.С., Миллер В.Т. (август 2002 г.). «Идентификация новых лигандов домена SH3 для киназы Hck семейства Src. Синдромный белок Вискотта-Олдрича (WASP), WASP-взаимодействующий белок (WIP) и ELMO1». Журнал биологической химии. 277 (31): 28238–46. Дои:10.1074 / jbc.M202783200. PMID  12029088.
• Бенеш С., Ломмель С., Штеффен А., Страдал Т. Е., Скаплхорн Н., Вэй М. и др. (Октябрь 2002 г.). «Движение везикул, вызванное фосфатидилинозитол-4,5-бифосфатом (PIP2), зависит от N-WASP и включает Nck, WIP и Grb2». Журнал биологической химии. 277 (40): 37771–6. Дои:10.1074 / jbc.M204145200. PMID  12147689.
• Zettl M, Way M (сентябрь 2002 г.). «Домены WH1 и EVH1 членов семейств WASP и Ena / VASP связывают различные мотивы последовательностей». Текущая биология. 12 (18): 1617–22. Дои:10.1016 / S0960-9822 (02) 01112-0. PMID  12372256. S2CID  9396610.
• Volkman BF, Prehoda KE, Scott JA, Peterson FC, Lim WA (ноябрь 2002 г.). "Структура комплекса N-WASP EVH1-WIP: понимание молекулярных основ синдрома Вискотта-Олдрича". Ячейка. 111 (4): 565–76. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 01076-0. PMID  12437929. S2CID  13997860.
• Сасахара Й., Рашид Р., Бирн М.Дж., де ла Фуэнте М.А., Абрахам Р.Т., Рамеш Н., Геха Р.С. (декабрь 2002 г.). «Механизм привлечения WASP в иммунологический синапс и его активации после лигирования TCR». Молекулярная клетка. 10 (6): 1269–81. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00728-1. PMID  12504004.
• Люти Дж. Н., Ганди М. Дж., Драхман Дж. Г. (февраль 2003 г.). «Х-связанная тромбоцитопения, вызванная мутацией в гене синдрома Вискотта-Олдрича (WAS), которая нарушает взаимодействие с белком, взаимодействующим с белком WAS (WASP) (WIP)». Экспериментальная гематология. 31 (2): 150–8. Дои:10.1016 / S0301-472X (02) 01023-8. PMID  12591280.
• Кинли А.В., Вид С.А., Уивер А.М., Каргинов А.В., Биссонетт Э., Купер Дж. А., Парсонс Дж. Т. (март 2003 г.). «Кортактин взаимодействует с WIP, регулируя активацию Arp2 / 3 и выступание мембраны». Текущая биология. 13 (5): 384–93. Дои:10.1016 / S0960-9822 (03) 00107-6. PMID  12620186. S2CID  17357571.
• Ким МК, Ким Э.С., Ким Д.С., Чхве И.Х., Мун Т., Юн Ч.Н., Шин Дж.С. (октябрь 2004 г.). «Две новые мутации синдрома Вискотта-Олдрича: молекулярное предсказание взаимодействия между мутировавшим WASP L101P с WASP-взаимодействующим белком путем молекулярного моделирования». Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Молекулярная основа болезни. 1690 (2): 134–40. Дои:10.1016 / j.bbadis.2004.06.007. PMID  15469902.

внешние ссылки

• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: O43516 (WAS / WASL-взаимодействующий член семейства белков 1) на PDBe-KB.