WSB1 - WSB1

WSB1
Идентификаторы
Псевдонимы	WSB1, SWIP1, WSB-1, повтор WD и блок SOCS, содержащий 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 610091 MGI: 1926139 ГомолоГен: 9218 Генные карты: WSB1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q11.1 Начните 27,294,076 бп[1] Конец 27,315,926 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 B5 Начните 79,239,372 бп[2] Конец 79,254,671 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность убиквитин-протеинтрансферазы Сотовый компонент • внутриклеточный • цитозоль Биологический процесс • убиквитинирование белков • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • полиубиквитинирование белков • посттрансляционная модификация • биологический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	26118	78889
Ансамбль	ENSG00000109046	ENSMUSG00000017677
UniProt	Q9Y6I7	O54927
RefSeq (мРНК)	NM_015626 NM_134264 NM_134265 NM_001348350	NM_001042565 NM_019653
RefSeq (белок)	NP_056441 NP_599027 NP_001335279	NP_001036030 NP_062627
Расположение (UCSC)	Chr 17: 27.29 - 27.32 Мб	Chr 11: 79.24 - 79.25 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Повторение WD и белок 1, содержащий SOCS-бокс это белок что у людей кодируется WSB1 ген.^[5][6][7]

Этот ген кодирует член подсемейства WD-белков. Этот белок имеет высокую идентичность последовательности с белками мыши и цыплят. Он содержит несколько WD-повторов, охватывающих большую часть белка, и один SOCS коробка в C-конец. Альтернативно сращивание варианты расшифровки кодирование различных изоформы были обнаружены для этого гена.^[7]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000109046 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000017677 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Василяускас Д., Хэнкок С., Stern CD (август 1999 г.). «SWiP-1: новый SOCS-бокс, содержащий белок WD, регулируемый сигнальными центрами и Shh во время развития». Мех Дев. 82 (1–2): 79–94. Дои:10.1016 / S0925-4773 (99) 00014-3. PMID  10354473. S2CID  15357835.
6. Кайл Б.Т., Шульман Б.А., Александр В.С., Никола Н.А., Мартин Х.М., Hilton DJ (июнь 2002 г.). «Коробка SOCS: история разрушения и деградации». Тенденции Biochem Sci. 27 (5): 235–41. Дои:10.1016 / S0968-0004 (02) 02085-6. PMID  12076535.
7. «Ген Entrez: повтор WSB1 WD и SOCS box-содержащий 1».

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ху RM, Хан ZG, Song HD и др. (2000). «Профили экспрессии генов в оси гипоталамус-гипофиз-надпочечники человека и клонирование полноразмерной кДНК». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 97 (17): 9543–8. Дои:10.1073 / pnas.160270997. ЧВК  16901. PMID  10931946.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (2001). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Genome Res. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Виманн С., Вейль Б., Велленройтер Р. и др. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. К., Велленройтер Р., Поустка А. и др. (2001). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». EMBO Rep. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Камура Т., Буриан Д., Ян К. и др. (2001). «Muf1, новый белок с богатым лейцином повтора, взаимодействующий с элонгином BC, который может собираться с Cul5 и Rbx1 для восстановления убиквитинлигазы». J. Biol. Chem. 276 (32): 29748–53. Дои:10.1074 / jbc.M103093200. PMID  11384984.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Виманн С., Арльт Д., Хубер В. и др. (2004). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Genome Res. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Dentice M, Bandyopadhyay A, Gereben B и др. (2005). «Hedgehog-индуцируемая субъединица убиквитинлигазы WSB-1 модулирует активацию гормона щитовидной железы и секрецию PTHrP в развивающейся пластинке роста». Nat. Cell Biol. 7 (7): 698–705. Дои:10.1038 / ncb1272. ЧВК  1761694. PMID  15965468.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И. и др. (2006). «База данных LIFEdb в 2006 году». Нуклеиновые кислоты Res. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.
• Ву Дж.С., Имм Дж. Х., Мин СК и др. (2006). «Структурное и функциональное понимание области B30.2 / SPRY». EMBO J. 25 (6): 1353–63. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600994. ЧВК  1422157. PMID  16498413.
• Chen QR, Bilke S, Wei JS и др. (2006). «Повышенное количество копий WSB1 коррелирует с его сверхэкспрессией, что связано с увеличением выживаемости при нейробластоме». Гены Хромосомы Рак. 45 (9): 856–62. Дои:10.1002 / gcc.20349. PMID  16804916. S2CID  3099056.