WWP1 - WWP1

WWP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1ND7, 5 л.с., 5HPT
Идентификаторы
Псевдонимы	WWP1, AIP5, Tiul1, hSDRP1, WW домен, содержащий E3 убиквитин протеинлигазу 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602307 MGI: 1861728 ГомолоГен: 21385 Генные карты: WWP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q21.3 Начните 86,342,547 бп[1] Конец 86,478,420 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 4 (мышь)[2] Группа 4 | 4 A3 Начните 19,608,303 бп[2] Конец 19,708,993 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • активность убиквитин-протеинтрансферазы • трансферазная активность • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 активность убиквитин-протеинлигазы Сотовый компонент • убиквитинлигазный комплекс • цитозоль • клеточная мембрана • внеклеточная экзосома • мембрана • ядро клетки • цитоплазма Биологический процесс • вирусное проникновение • развитие центральной нервной системы • трансмембранный перенос ионов • GO: 0022415 вирусный процесс • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • убиквитинирование белков • преобразование сигнала • убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • протеасомный убиквитин-зависимый белковый катаболический процесс • полиубиквитинирование белков • положительная регуляция белкового катаболического процесса Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	11059	107568
Ансамбль	ENSG00000123124	ENSMUSG00000041058
UniProt	Q9H0M0	Q8BZZ3
RefSeq (мРНК)	NM_007013	NM_001276292 NM_177327 NM_001355222
RefSeq (белок)	NP_008944	NP_001263221 NP_796301 NP_001342151
Расположение (UCSC)	Chr 8: 86,34 - 86,48 Мб	Chr 4: 19.61 - 19.71 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

NEDD4-подобная E3 убиквитин-протеинлигаза WWP1 является фермент что у людей кодируется WWP1 ген.^[5][6][7]

Функция

Белки, содержащие домен WW, обнаружены у всех эукариот и играют важную роль в регуляции широкого спектра клеточных функций, таких как деградация белков, транскрипция и сплайсинг РНК. Этот ген кодирует белок, который содержит 4 тандемных WW-домена и HECT (гомологичный E6-ассоциированному белку карбоксильному концу) домен. Кодируемый белок принадлежит к семейству NEDD4-подобных белков, которые представляют собой молекулы убиквитин-лигазы E3 и регулируют ключевые решения по доставке, включая нацеливание белков на протеосомы или лизосомы. Альтернативный сплайсинг этого гена генерирует по меньшей мере 6 вариантов транскрипта; однако полноразмерный характер этих стенограмм не определен.^[7] В нейронах мышиный ортолог Wwp1 и его гомолог Wwp2 контролируют приобретение полярности, образование и разветвление аксонов, а также миграцию новообразованных нервных клеток в кортикальную пластинку.^[8]

Взаимодействия

WWP1 был показан взаимодействовать с участием:

• CPSF6,^[9]
• KLF2,^[10] и
• Ретикулон 4^[11]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000123124 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041058 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Пироцци Г., МакКоннелл С.Дж., Увегес А.Дж., Картер Дж.М., Спаркс А.Б., Кей Б.К., Фаулкс Д.М. (июнь 1997 г.). «Идентификация новых белков, содержащих домен WW человека, путем клонирования лигандных мишеней». J Biol Chem. 272 (23): 14611–6. Дои:10.1074 / jbc.272.23.14611. PMID  9169421.
6. Вуд Дж. Д., Юань Дж., Марголис Р. Л., Коломер В., Дуан К., Куши Дж., Камински З., Клейдерлейн Дж. Дж., Шарп А. Х., Росс Калифорния (июль 1998 г.). «Атрофин-1, продукт гена DRPLA, взаимодействует с двумя семействами белков, содержащих домен WW». Mol Cell Neurosci. 11 (3): 149–60. Дои:10.1006 / mcne.1998.0677. PMID  9647693. S2CID  20003277.
7. «Ген Entrez: WWP1 WW домен, содержащий E3 убиквитин протеин лигазу 1».
8. Амброзкевич М.С., Шварк М., Кисимото-Суга М., Борисова Е., Хори К., Салазар-Лазаро А., Русанова А., Альтас Б., Пипкорн Л., Бесса П., Шауб Т., Чжан Х, Рабе Т., Рипамонти С., Росарио М., Акияма H, Jahn O, Kobayashi T, Hoshino M, Tarabykin V, Kawabe H (декабрь 2018 г.). «Приобретение полярности в корковых нейронах обусловлено синергическим действием Sox9-регулируемых убиквитин-лигаз Wwp1 и Wwp2 E3 и интронных miR-140». Нейрон. 100 (5): 1097–1115.e15. Дои:10.1016 / j.neuron.2018.10.008. PMID  30392800.
9. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламозас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р.С., Ванденхаут Дж. Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
10. Конкрайт, доктор медицины, Вани М.А., Лингрел Дж. Б. (август 2001 г.). «Крюппель-подобный фактор в легких содержит аутоингибиторный домен, который регулирует его активацию транскрипции путем связывания WWP1, убиквитинлигазы E3». J. Biol. Chem. 276 (31): 29299–306. Дои:10.1074 / jbc.M103670200. PMID  11375995.
11. Цинь Х, Пу Х., Ли М., Ахмед С., Сон Дж. (Декабрь 2008 г.). «Идентификация и структурный механизм нового взаимодействия между убиквитинлигазой WWP1 и Nogo-A, ключевым ингибитором регенерации центральной нервной системы». Биохимия. 47 (51): 13647–58. Дои:10.1021 / bi8017976. PMID  19035836.

дальнейшее чтение

• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Моссер Э.А., Касанов Д.Д., Форсберг Э.К., Кей Б.К., Ней П.А., Бресник Э.Х. (1998). «Физические и функциональные взаимодействия между доменом трансактивации гемопоэтического фактора транскрипции NF-E2 и доменами WW». Биохимия. 37 (39): 13686–95. Дои:10.1021 / bi981310l. PMID  9753456.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (2001). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Genome Res. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Конкрайт, Мэриленд, Вани, Массачусетс, Лингрел Дж. Б. (2001). «Крюппель-подобный фактор в легких содержит аутоингибиторный домен, который регулирует его активацию транскрипции путем связывания WWP1, убиквитинлигазы E3». J. Biol. Chem. 276 (31): 29299–306. Дои:10.1074 / jbc.M103670200. PMID  11375995.
• Фласа М., Горман П., Ройланс Р., Кэнфилд А.Э., Барон М. (2002). «Альтернативный сплайсинг определяет доменную структуру WWP1, белка семейства Nedd4». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 290 (1): 431–7. Дои:10.1006 / bbrc.2001.6206. PMID  11779188.
• Galinier R, Gout E, Lortat-Jacob H, Wood J, Chroboczek J (2003). «Белок аденовируса, участвующий в интернализации вируса, привлекает убиквитин-протеиновые лигазы». Биохимия. 41 (48): 14299–305. Дои:10.1021 / bi020125b. PMID  12450395.
• Verdecia MA, Joazeiro CA, Wells NJ, Ferrer JL, Bowman ME, Hunter T, Noel JP (2003). «Конформационная гибкость лежит в основе лигирования убиквитина, опосредованного лигазой E3 домена WWP1 HECT». Мол. Ячейка. 11 (1): 249–59. Дои:10.1016 / S1097-2765 (02) 00774-8. PMID  12535537.
• Комуро А., Имамура Т., Сайто М., Йошида Ю., Ямори Т., Миядзоно К., Миядзава К. (2004). «Отрицательная регуляция передачи сигналов трансформирующего фактора роста-бета (TGF-бета) с помощью WW-домена, содержащего белок 1 (WWP1)». Онкоген. 23 (41): 6914–23. Дои:10.1038 / sj.onc.1207885. PMID  15221015. S2CID  7742985.
• Колланд Ф., Жак Икс, Троплин В., Мужен С., Грозело С., Гамбург А, Мейл А., Войчик Дж., Легрен П., Готье Дж. М. (2004). «Функциональное протеомное картирование сигнального пути человека». Genome Res. 14 (7): 1324–32. Дои:10.1101 / гр. 2334104. ЧВК  442148. PMID  15231748.
• Seo SR, Lallemand F, Ferrand N, Pessah M, L'Hoste S, Camonis J, Atfi A (2005). «Новая убиквитинлигаза E3 Tiul1 связывается с TGIF для нацеливания Smad2 на деградацию». EMBO J. 23 (19): 3780–92. Дои:10.1038 / sj.emboj.7600398. ЧВК  522797. PMID  15359284.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Чен С., Сун X, Го П, Донг XY, Сетхи П, Ченг X, Чжоу Дж, Лин Дж, Саймонс Дж., Лингрел Дж. Б., Донг Дж. Т. (2006). «Человеческий Kruppel-подобный фактор 5 является мишенью E3-убиквитинлигазы WWP1 для протеолиза в эпителиальных клетках». J. Biol. Chem. 280 (50): 41553–61. Дои:10.1074 / jbc.M506183200. PMID  16223724.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу С., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж.Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (2006). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Flasza M, Nguyen Huu NS, Mazaleyrat S, Clémence S, Villemant C, Clarke R, Baron M (2006). «Регулирование ядерной локализации человеческого белка WWP1, родственного Nedd4, с помощью Notch». Мол. Membr. Биол. 23 (3): 269–76. Дои:10.1080/09687860600665010. PMID  16785210. S2CID  913524.
• Лайне А, Ронаи Зи (2007). «Регулирование локализации и транскрипции p53 с помощью лигазы WWP1 домена HECT E3». Онкоген. 26 (10): 1477–83. Дои:10.1038 / sj.onc.1209924. ЧВК  2997392. PMID  16924229.
• Чен С., Сун X, Го П, Донг XY, Сетхи П., Чжоу В., Чжоу З., Петрос Дж., Фриерсон Х. Ф., Веселла Р. Л., Атфи А., Донг Дж. Т. (2007). «Убиквитин E3-лигаза WWP1 как онкогенный фактор рака простаты человека». Онкоген. 26 (16): 2386–94. Дои:10.1038 / sj.onc.1210021. PMID  17016436. S2CID  24487179.