Лидер YkoK - YkoK leader

лидер ykoK
RF00380.jpg
Идентификаторы
СимволykoK
РфамRF00380
Прочие данные
РНК типЦис-рег; рибопереключатель
Домен (ы)Бактерии
ТАКТАК: 0000233
PDB структурыPDBe

В Лидер Ыкока или же М-бокс является Mg2+-чувство Структура РНК что контролирует выражение из Белки транспорта ионов магния в бактериях. Это отличная структура для Элемент РНК, чувствительный к магнию.

Лидер Ыкока первоначально описывался как консервированный последовательность с потенциалом рибопереключатель функция найдена вверх по течению из Б. subtilis Ген ykoK и гены со смежными функциями у других бактерий.[1] Примеры консервативной структуры M-бокса РНК встречаются выше каждого из трех основных семейств Mg.2+ переносчики (CorA, MgtE и MgtA / MgtB) у различных видов бактерий.[2]

Молекулярная структура примера M-бокса перед Б. subtilis Ген ykoK включает шесть связанных Mg2+ ионы. Биохимические исследования показывают, что эта M-Box РНК компактируется в присутствии Mg2+ и другие двухвалентный ионы. Этот процесс сворачивания, по-видимому, нарушает структуру антитерминатора и, таким образом, позволяет терминатор транскрипции структура для формирования. Как и ожидалось от этой модели, Б. subtilis клетки подавляют экспрессию нижележащего репортерного гена при росте в присутствии Mg2+. Следовательно, M-бокс, по-видимому, функционирует как генетический выключатель, который важен для поддержания Mg2+ гомеостаз в бактериях.

  • Трехмерное изображение лидера Ыкока. Структура аптамерного домена рибопереключателя M-box из Bacillus subtilis.[2]

Рекомендации

  1. ^ Баррик, Дж. Э .; Корбино К.А.; Winkler WC; Nahvi A; Мандал М; Коллинз Дж; Ли М; Roth A; Сударсан Н; Йона I; Wickiser JK; Брейкер RR (2004). «Новые мотивы РНК предполагают расширение возможностей рибопереключателей в генетическом контроле бактерий». Proc Natl Acad Sci USA. 101 (17): 6421–6426. Дои:10.1073 / pnas.0308014101. ЧВК  404060. PMID  15096624.
  2. ^ а б Dann CE, Wakeman CA, Sieling CL, Baker SC, Irnov I, Winkler WC (2007). «Структура и механизм металл-чувствительной регуляторной РНК». Клетка. 130 (5): 878–892. Дои:10.1016 / j.cell.2007.06.051. PMID  17803910.

внешняя ссылка