ZFP36L1 - ZFP36L1

ZFP36L1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1W0V, 1W0W
Идентификаторы
Псевдонимы	ZFP36L1, BRF1, Berg36, ERF-1, ERF1, RNF162B, TIS11B, cMG1, ZFP36, подобный белку безымянного пальца 1, ZFP36, белок безымянного пальца, подобный 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 601064 MGI: 107946 ГомолоГен: 31276 Генные карты: ZFP36L1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 14 (человек)[1] Группа 14q24.1 Начинать 68,787,660 бп[1] Конец 68,796,253 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 12 (мышь)[2] Группа 12 | 12 C3 Начинать 80,107,754 бп[2] Конец 80,113,013 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • Привязка элементов AU-rich • связывание ионов металлов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание мРНК • 14-3-3 связывание с белками • Связывание РНК • Связывание мРНК 3'-UTR AU-богатой области • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции, специфичность к РНК-полимеразе II • Связывание мРНК 3'-UTR Сотовый компонент • цитоплазма • ядро клетки • цитозоль • П-боди • рибонуклеопротеин Биологический процесс • развитие слоя спонгиотрофобласта • катаболический процесс мРНК • рост многоклеточного организма • развитие эмбриональных органов • хорио-аллантоисный синтез • васкулогенез • развитие проэпикарда • развитие сердца • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, зависимый от деаденилирования распад • развитие нервной трубки • клеточная пролиферация • регулирование перевода • апоптотический процесс • Дифференцировка Т-клеток в тимусе • регуляция экспрессии генов • отрицательная регуляция дифференцировки эритроцитов • клеточный ответ на стимул инсулина • клеточный ответ на форбол 13-ацетат 12-миристат • Каскад ERK1 и ERK2 • положительная регуляция внутриклеточной локализации мРНК • клеточный ответ на глюкокортикоидный стимул • клеточный ответ на бета-стимул трансформирующего фактора роста • регуляция дифференцировки кератиноцитов • ответ на ранение • положительная регуляция дифференцировки моноцитов • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный ответ на гипоксию • регуляция процесса апоптоза кератиноцитов • регуляция пролиферации кератиноцитов • передача сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • клеточный ответ на фактор некроза опухоли • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста • регуляция процессинга 3'-конца мРНК • Каскад MAPK • обработка мРНК • развитие многоклеточного организма • ядерно-транскрибируемый катаболический процесс мРНК, независимый от деаденилирования распад • каскад p38MAPK • регуляция стабильности мРНК • передача сигналов протеинкиназы B • клеточный ответ на стимул фактора роста фибробластов • регуляция дифференцировки В-клеток • положительное регулирование дифференцировки жировых клеток • регуляция дифференцировки миобластов • развитие мезендодермы • транспорт мРНК • 3'-UTR-опосредованная дестабилизация мРНК • клеточный ответ на цАМФ • клеточный ответ на стимул пептидного гормона • клеточный ответ на солевой стресс • регулирование пролиферации стволовых клеток • клеточный ответ на раффинозу • положительная регуляция катаболического процесса транскрибируемой ядерной мРНК, зависимый от деаденилирования распад • отрицательная регуляция фазового перехода митотического клеточного цикла • транспорт • регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	677	12192
Ансамбль	ENSG00000185650	ENSMUSG00000021127
UniProt	Q07352	P23950
RefSeq (мРНК)	NM_004926 NM_001244698 NM_001244701	NM_007564
RefSeq (белок)	NP_001231627 NP_001231630 NP_004917	NP_031590
Расположение (UCSC)	Chr 14: 68,79 - 68,8 Мб	Chr 12: 80.11 - 80.11 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Коэффициент отклика бутирата 1 это белок что у людей кодируется ZFP36L1 ген.^[5][6]

Функция

Этот ген является членом семейства TIS11 гены раннего ответа. Члены семьи индуцируются различными агонистами, такими как сложный эфир форбола. TPA и митоген полипептида EGF. Ген хорошо законсервирован у разных видов и имеет промотор, который содержит мотивы, наблюдаемые в других генах раннего ответа. Кодируемый белок содержит отличительный предполагаемый цинковый палец домен с повторяющимся мотивом cys-his. Этот связывающий РНК белок, скорее всего, регулирует реакцию на факторы роста.^[6]

Взаимодействия

ZFP36L1 был показан взаимодействовать с MAPK14.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000185650 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000021127 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Бастин С.А., Не XF, Барнард Р.К., Кумар В., Паскаль Дж. К., Браун К.Д., Ли И.М., Уильямс Н.С., Маккей И.А. (август 1994 г.). «Клонирование и характеристика ERF-1, человеческого члена семейства Tis11 генов раннего ответа». ДНК клетки биол. 13 (5): 449–59. Дои:10.1089 / dna.1994.13.449. PMID  8024689.
6. «Ген Entrez: ZFP36L1, белок цинкового пальца 36, C3H типа 1».
7. Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514.

дальнейшее чтение

• Ходсон Д.Д., Джанас М.Л., Галлоуэй А., Белл С.Е., Эндрюс С., Ли С.М., Паннелл Р., Зибель С.В., Макдональд Х.Р., Де Керсмаекер К., Феррандо А.А., Груц Дж., Тернер М. (август 2010 г.). «Делеция РНК-связывающих белков ZFP36L1 и ZFP36L2 приводит к нарушению развития тимуса и Т-лимфобластному лейкозу». Nat. Иммунол. 11 (8): 717–24. Дои:10.1038 / ni.1901. ЧВК  2953641. PMID  20622884.
• Белл С.Е., Санчес М.Дж., Спасич-Боскович О., Санталусия Т., Гамбарделла Л., Бертон Г.Дж., Мерфи Дж.Дж., Нортон Д.Д., Кларк А.Р., Тернер М. (ноябрь 2006 г.). «РНК-связывающий белок Zfp36l1 необходим для нормальной васкуляризации и посттранскрипционно регулирует экспрессию VEGF». Dev. Dyn. 235 (11): 3144–55. Дои:10.1002 / dvdy.20949. PMID  17013884.
• Барнард Р.К., Паскаль Дж.С., Браун К.Д., Маккей И.А., Уильямс Н.С., Бастин С.А. (июль 1993 г.). «Кодирующая последовательность ERF-1, человеческого гомолога Tis11b / cMG1, членов семейства Tis11 генов раннего ответа». Нуклеиновые кислоты Res. 21 (15): 3580. Дои:10.1093 / nar / 21.15.3580. ЧВК  331466. PMID  8346037.
• Maclean KN, см. CG, McKay IA, Bustin SA (ноябрь 1995 г.). «Человеческий непосредственный ранний ген BRF1 отображается на хромосоме 14q22-q24». Геномика. 30 (1): 89–90. Дои:10.1006 / geno.1995.0014. PMID  8595910.
• Нин З.К., Нортон Дж. Д., Ли Дж., Мерфи Дж. Дж. (Октябрь 1996 г.). «Определенные механизмы спасения от апоптоза в человеческих В-клетках Ramos посредством передачи сигналов через CD40 и рецептор интерлейкина-4: роль в ингибировании гена раннего ответа, Berg36». Евро. J. Immunol. 26 (10): 2356–63. Дои:10.1002 / eji.1830261013. PMID  8898945.
• Блэкшир П.Дж., Филлипс Р.С., Васкес-Матиас Дж., Моренвайзер Х. (2003). «Полиморфизмы в генах, кодирующих членов семейства тристетрапролинов тандемных белков цинковых пальцев человека CCCH». Прог. Nucleic Acid Res. Мол. Биол. Прогресс в исследованиях нуклеиновых кислот и молекулярной биологии. 75: 43–68. Дои:10.1016 / S0079-6603 (03) 75002-8. ISBN  9780125400756. PMID  14604009.
• Reppe S, Olstad OK, Rian E, Gautvik VT, Gautvik KM, Jemtland R (ноябрь 2004 г.). «Фактор ответа на бутират 1 регулируется паратиреоидным гормоном и костным морфогенетическим белком-2 в остеобластических клетках». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 324 (1): 218–23. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.09.030. PMID  15465005.
• Ciais D, Cherradi N, Bailly S, Grenier E, Berra E, Pouyssegur J, Lamarre J, Feige JJ (ноябрь 2004 г.). «Дестабилизация мРНК фактора роста эндотелия сосудов белком цинкового пальца TIS11b». Онкоген. 23 (53): 8673–80. Дои:10.1038 / sj.onc.1207939. PMID  15467755.