ACSL3 - ACSL3

ACSL3
Идентификаторы
Псевдонимы	ACSL3, ACS3, FACL3, PRO2194, член семейства длинноцепочечных ацил-CoA синтетаз 3, член семейства длинноцепочечных ацил-CoA синтетаз 3, LACS3, LACS 3
Внешние идентификаторы	OMIM: 602371 MGI: 1921455 ГомолоГен: 3278 Генные карты: ACSL3
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q36.1 Начните 222,860,942 бп[1] Конец 222,944,639 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 C4 | 1 40,84 см Начните 78,657,825 бп[2] Конец 78,707,743 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание нуклеотидов • специфическое связывание белкового домена • активность лигазы • каталитическая активность • Связывание АТФ • связывание протеинкиназы • активность длинноцепочечной жирной кислоты-CoA лигазы • деканоат - активность CoA лигазы • активность ацил-КоА лигазы Сотовый компонент • мембрана органеллы • неотъемлемый компонент мембраны • аппарат Гольджи • мембрана эндоплазматического ретикулума • мембрана • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • липидная капля • пероксисомальная мембрана • пероксисома • митохондриальная наружная мембрана • эндоплазматический ретикулум • митохондрия • перинуклеарная область цитоплазмы Биологический процесс • положительная регуляция транспорта белков плазматической мембраны по Гольджи • реакция на органическое циклическое соединение • реакция на питательные вещества • липидный обмен • метаболический процесс жирных кислот • развитие мозга • процесс биосинтеза жирных кислот • процесс биосинтеза длинноцепочечных жирных ацил-КоА • положительное регулирование секреции • импорт длинноцепочечных жирных кислот • сборка липопротеиновых частиц очень низкой плотности • метаболизм • метаболический процесс длинноцепочечных жирных кислот • положительная регуляция процесса биосинтеза фосфатидилхолина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	2181	74205
Ансамбль	ENSG00000123983	ENSMUSG00000032883
UniProt	O95573	Q9CZW4
RefSeq (мРНК)	NM_004457 NM_203372 NM_001354158 NM_001354159	NM_001033606 NM_001136222 NM_028817
RefSeq (белок)	NP_004448 NP_976251 NP_001341087 NP_001341088	NP_001028778 NP_001129694 NP_083093
Расположение (UCSC)	Chr 2: 222,86 - 222,94 Мб	Chr 1: 78.66 - 78.71 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Длинноцепочечные жирные кислоты - КоА-лигаза 3 является фермент что в люди кодируется ACSL3 ген.^[5]

Функция

Белок, кодируемый этим геном, представляет собой изофермент длинной цепи жирная кислота -кофермент А лигаза семья. Хотя отличается субстратная специфичность, субклеточный локализация и ткань распределения, все изоферменты этого семейства превращают свободные длинноцепочечные жирные кислоты в жирный ацил-КоА сложные эфиры, и тем самым играть ключевую роль в липид биосинтез и разложение жирных кислот. Этот изофермент в высокой степени экспрессируется в головном мозге и преимущественно использует миристат, арахидонат, и эйкозапентаеноат в качестве подложек. В аминокислота последовательность этого изофермента на 92% идентична последовательности крыса гомолог. Для этого гена были обнаружены два варианта транскрипта, кодирующие один и тот же белок.^[5]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000123983 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032883 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: член 3 семейства длинноцепочечных ацил-CoA синтетазы ACSL3».

внешняя ссылка

• Человек ACSL3 расположение генома и ACSL3 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Брютон Л.А., ван Херверден Л., Чотай К.А., Винтер Р.М. (октябрь 1992 г.). «Картирование гена краниосиностоза: доказательства связи синдрома Сэтре-Чотцена с дистальной хромосомой 7p». Журнал медицинской генетики. 29 (10): 681–685. Дои:10.1136 / jmg.29.10.681. ЧВК  1016122. PMID  1433226.
• Баккен AM, Фарстад М, Холмсен Х. (февраль 1991 г.). «Идентичность между пальмитоил-КоА синтетазой и арахидоноил-КоА синтетазой в тромбоцитах человека?». Биохимический журнал. 274 (Pt 1) (1): 145–52. Дои:10.1042 / bj2740145. ЧВК  1149932. PMID  1848073.
• Bronfman M, Inestrosa NC, Nervi FO, Leighton F (декабрь 1984 г.). «Ацил-КоА синтетаза и пероксисомальные ферменты бета-окисления в печени человека. Количественный анализ их субклеточной локализации». Биохимический журнал. 224 (3): 709–20. Дои:10.1042 / bj2240709. ЧВК  1144505. PMID  6240978.
• Роуз С.С., Кинг А.А., Саммерс Д., Палмер Р., Ян С., Уилки А.О., Рирдон В., Малкольм С., Винтер Р.М. (август 1994 г.). «Локализация генетического локуса синдрома Saethre-Chotzen в области 6 сМ хромосомы 7 с использованием четырех случаев с явно сбалансированными транслокациями в 7p21.2». Молекулярная генетика человека. 3 (8): 1405–1408. Дои:10.1093 / hmg / 3.8.1405. PMID  7987323.
• Fujino T, Kang MJ, Suzuki H, Iijima H, Yamamoto T. (июль 1996 г.). «Молекулярная характеристика и экспрессия ацил-КоА синтетазы 3 крысы». Журнал биологической химии. 271 (28): 16748–16752. Дои:10.1074 / jbc.271.28.16748. PMID  8663269.
• Боналду М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (сентябрь 1996 г.). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Геномные исследования. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.
• Минекура Х., Фуджино Т, Канг МДж, Фудзита Т, Эндо Й, Ямамото ТТ (май 1997 г.). "КДНК ацил-кофермента А-синтетазы 3 человека и локализация ее гена (ACS3) в полосе хромосомы 2q34-q35". Геномика. 42 (1): 180–181. Дои:10.1006 / geno.1997.4710. PMID  9177793.
• Минекура Х, Кан MJ, Инагаки Y, Сузуки Х, Сато Х, Фуджино Т, Ямамото ТТ (октябрь 2001 г.). «Геномная организация и единицы транскрипции гена ацил-КоА синтетазы 3 человека». Ген. 278 (1–2): 185–192. Дои:10.1016 / S0378-1119 (01) 00714-4. PMID  11707336.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес М.Б., Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Е., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи П., Прейндж С., Раха С.С., Локеллано Н.А., Петерс Г.Дж., Абрамсон Р.Д., Муллахи С.Дж., Босак С.А., МакЭван П.Дж., МакКернан К.Дж., Малек Дж.А., Гунаратне П.Х., Ричардс С., Уорли К.С., Хейл С., Гарсия А.М., Гей Л.Дж., Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (декабрь 2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 99 (26): 16899–16903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Mashek DG, Bornfeldt KE, Coleman RA, Berger J, Bernlohr DA, Black P, DiRusso CC, Farber SA, Guo W, Hashimoto N, Khodiyar V, Kuypers FA, Maltais LJ, Nebert DW, Renieri A, Schaffer JE, Stahl A , Уоткинс П.А., Василиу В., Ямамото Т.Т. (октябрь 2004 г.). «Пересмотренная номенклатура семейства генов длинноцепочечной ацил-КоА синтетазы млекопитающих». Журнал липидных исследований. 45 (10): 1958–1961. Дои:10.1194 / мл. E400002-JLR200. PMID  15292367.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–12135. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Цяо С., Туохимаа П. (ноябрь 2004 г.). «Витамин D3 подавляет экспрессию синтазы жирных кислот, стимулируя экспрессию длинноцепочечной жирной кислоты-CoA лигазы 3 в клетках рака простаты». Письма FEBS. 577 (3): 451–454. Дои:10.1016 / j.febslet.2004.10.044. PMID  15556626. S2CID  25190904.
• Rohozinski J, Lamb DJ, Bishop CE (апрель 2006 г.). «UTP14c - это недавно приобретенный ретроген, связанный со сперматогенезом и фертильностью у человека». Биология размножения. 74 (4): 644–651. Дои:10.1095 / биолрепрод.105.046698. PMID  16354793.
• Ту LC, Ян X, Худ Л., Линь Б. (апрель 2007 г.). «Протеомический анализ взаимодействия гена 1, регулируемого нижестоящим N-myc, и его взаимодействия с программой андрогенного ответа в клетках рака простаты» (PDF). Молекулярная и клеточная протеомика. 6 (4): 575–588. Дои:10.1074 / mcp.M600249-MCP200. PMID  17220478. S2CID  7203032.
• Чжоу Ю., Абиди П., Ким А., Чен В., Хуан Т. Т., Кремер Ф. Б., Лю Дж. (Октябрь 2007 г.). «Активация транскрипции ACSL3 и ACSL5 печени онкостатином m снижает гипертриглицеридемию за счет усиленного бета-окисления». Артериосклероз, тромбоз и биология сосудов. 27 (10): 2198–2205. Дои:10.1161 / ATVBAHA.107.148429. PMID  17761945.