AP4E1 - AP4E1

AP4E1
Идентификаторы
ПсевдонимыAP4E1, CPSQ4, SPG51, STUT1, связанный с адаптером белковый комплекс 4 субъединица эпсилон 1, связанный с адаптером белковый комплекс 4 субъединица эпсилон 1
Внешние идентификаторыOMIM: 607244 MGI: 1336993 ГомолоГен: 22397 Генные карты: AP4E1
Расположение гена (человек)
Хромосома 15 (человек)
Chr.Хромосома 15 (человек)[1]
Хромосома 15 (человек)
Геномное расположение AP4E1
Геномное расположение AP4E1
Группа15q21.2Начинать50,908,672 бп[1]
Конец51,005,895 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001252127
NM_007347

NM_175550

RefSeq (белок)

NP_001239056
NP_031373

NP_780759

Расположение (UCSC)Chr 15: 50.91 - 51.01 МбChr 2: 127.01 - 127.07 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Комплексная субъединица AP-4 эпсилон-1 это белок что у людей кодируется AP4E1 ген.[5]

Функция

В гетеротетрамерный адаптерный белок (AP) комплексы сортируют интегральные мембранные белки на различных этапах эндоцитарного и секреторного путей. AP4 состоит из 2 больших цепей, бета-4 (AP4B1 ) и эпсилон-4 (AP4E1; этот ген), средняя цепь, mu-4 (AP4M1 ) и маленькой цепочки сигма-4 (AP4S1 ).[5]

Клиническая значимость

В настоящее время предполагается, что трафик, опосредованный AP4-комплексом, играет решающую роль в развитии и функционировании мозга.[6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции AP4E1. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Ap4e1tm1a (КОМП) Wtsi[14][15] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[16][17][18]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[12][19] Было проведено 24 испытания на гомозиготный мутант мышей и четыре значительных отклонения от нормы.[12] У женщин наблюдалась пониженная вертикальная активность в тест в открытом поле, был ненормальный полный анализ крови, гипоферремия, а уменьшенная мозолистое тело размер и увеличенный боковые желудочки.[12]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000081014 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001998 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б «Entrez Gene: адаптер-родственный белковый комплекс 4».
  6. ^ Абу Джамра Р., Филипп О., Раас-Ротшильд А., Эк Ш., Граф Е., Бухерт Р., Борк Г., Экичи А., Брокшмидт Ф. Ф., Нётен М. М., Мюнних А., Стром TM, Рейс А., Колло Л. (май 2011 г.) «Дефицит адаптивного протеинового комплекса 4 вызывает тяжелую аутосомно-рецессивную умственную отсталость, прогрессирующую спастическую параплегию, застенчивый характер и низкий рост». Am J Hum Genet. 88 (6): 788–95. Дои:10.1016 / j.ajhg.2011.04.019. ЧВК  3113253. PMID  21620353.
  7. ^ "Данные о тревоге для Ap4e1". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ «Данные клинической химии Ap4e1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ «Гематологические данные для Ap4e1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ "Сальмонелла данные о заражении Ap4e1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  11. ^ "Citrobacter данные о заражении Ap4e1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  12. ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x.
  13. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  14. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  15. ^ "Информатика генома мыши".
  16. ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  17. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  18. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247.
  19. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение