APPL1 - APPL1

APPL1
Белок APPL1 PDB 2ela.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыAPPL1, APPL, DIP13alpha, MODY14, адаптерный белок, фосфотирозин, взаимодействующий с доменом PH и лейциновой застежкой-молнией 1
Внешние идентификаторыOMIM: 604299 MGI: 1920243 ГомолоГен: 32143 Генные карты: APPL1
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное расположение APPL1
Геномное расположение APPL1
Группа3п14.3Начните57,227,726 бп[1]
Конец57,278,105 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE APPL1 218158 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_012096

NM_145221

RefSeq (белок)

NP_036228

NP_660256

Расположение (UCSC)Chr 3: 57,23 - 57,28 МбChr 14: 26.92 - 26.97 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Адаптерный белок, фосфотирозин, взаимодействующий с доменом PH и лейциновой застежкой-молнией 1 (APPL1), или DCC-взаимодействующий белок 13-альфа (DIP13alpha), представляет собой белок что у людей кодируется APPL1 ген.[5][6][7] APPL1 содержит несколько ключевых доменов взаимодействия: домен гомологии плекстрина (PH), фосфотирозин-связывающий (PTB) домен и Бин – Амфифизин – Рвс (BAR) домен.[8]

Функция

APPL1 - это адаптерный белок локализован для подмножества Rab5 -положительный («ранний») эндосомы, где он привлекает других связывающих партнеров и регулирует торговля пузырьками и эндосомный сигнализация. APPL1 обогащен в очень ранних эндосомах, которые отрицательны по EEA1, указывая на то, что APPL1 влияет на самые ранние стадии эндосомного трафика до того, как EEA1 вступает во владение. Это согласуется с наблюдениями, что APPL1 и EEA1 конкурируют за связывание Rab5. APPL1 влияет на скорость интернализации ключевого эндосомального груза (например, Рецептор EGF ), который зависит от активации Rab5.[8]

Домен PTB APPL1 регулирует многие события передачи сигналов клетками в определенных эндосомных компартментах, иногда называемых «сигнальными эндосомами». Это включает в себя лизофосфатидная кислота (LPA) -индуцированная передача сигналов (вместе с взаимодействующим белком GIPC1 ). Дополнительные роли для APPL1 были определены в ядро где APPL1 может локализоваться после диссоциации от эндосом.[8]

Мутантные исследования

Мутантные аллели мыши для Appl1
Символ-маркер для гена мыши. Этот символ присваивается геномному локусу MGIAppl1
Клоны эмбриональных стволовых клеток мутантных мышей. Это известные целевые мутации этого гена у мыши.Appl1tm1a (КОМП) Wtsi
Пример структуры целевого условного мутантного аллеля для этого гена
Молекулярная структура области Appl1 со вставленной последовательностью мутации
Эти мутантные ES-клетки можно изучать напрямую или использовать для получения мышей с отключенным геном. Изучение этих мышей может пролить свет на функцию Appl1:

видеть Нокаутирующая мышь

Взаимодействия

APPL1 был показан взаимодействовать с Удалено при колоректальном раке,[9] AKT2,[5] но также Rab5, Rab21, OCRL и почти 30 других белков.[8]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000157500 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000040760 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ а б Мицуучи Ю., Джонсон С.В., Сонода Г., Танно С., Големис Е.А., Теста Дж. Р. (сентябрь 1999 г.). «Идентификация гена хромосомы 3p14.3-21.1, APPL, кодирующего адаптерную молекулу, которая взаимодействует с онкопротеин-серин / треонинкиназой AKT2». Онкоген. 18 (35): 4891–8. Дои:10.1038 / sj.onc.1203080. PMID  10490823.
  6. ^ Nechamen CA, Thomas RM, Dias JA (январь 2007 г.). «APPL1, APPL2, Akt2 и FOXO1a взаимодействуют с FSHR в потенциальном сигнальном комплексе». Молекулярная и клеточная эндокринология. 260-262: 93–9. Дои:10.1016 / j.mce.2006.08.014. ЧВК  1782224. PMID  17030088.
  7. ^ «Ген Entrez: адаптерный белок APPL1, взаимодействие фосфотирозина, домен PH и лейциновая молния, содержащая 1».
  8. ^ а б c d Diggins NL, Webb DJ (июнь 2017 г.). «APPL1 - это многофункциональный эндосомный сигнальный адаптерный белок». Сделки Биохимического Общества. 45 (3): 771–779. Дои:10.1042 / bst20160191. ЧВК  5844352. PMID  28620038.
  9. ^ Лю Дж, Яо Ф, Ву Р., Морган М., Торберн А., Финли Р.Л., Чен Ю.К. (июль 2002 г.). «Посредничество апоптотического сигнала DCC посредством DIP13 альфа». Журнал биологической химии. 277 (29): 26281–5. Дои:10.1074 / jbc.M204679200. PMID  12011067.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка