ARPC4 - ARPC4

ARPC4
Белок ARPC4 PDB 1k8k.png
Доступные конструкции
PDBПоиск ортолога: PDBe RCSB
Идентификаторы
ПсевдонимыARPC4, ARC20, P20-ARC, актин-родственный белок 2/3 комплекс субъединица 4
Внешние идентификаторыOMIM: 604226 MGI: 1915339 ГомолоГен: 4177 Генные карты: ARPC4
Расположение гена (человек)
Хромосома 3 (человек)
Chr.Хромосома 3 (человек)[1]
Хромосома 3 (человек)
Геномное местоположение для ARPC4
Геномное местоположение для ARPC4
Группа3п25.3Начните9,792,495 бп[1]
Конец9,807,726 бп[1]
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

10093

68089

Ансамбль

ENSG00000241553

ENSMUSG00000079426

UniProt

P59998

P59999

RefSeq (мРНК)

NM_005718
NM_001024959
NM_001024960
NM_001198780

NM_001170485
NM_001170486
NM_026552

RefSeq (белок)

NP_001020130
NP_001020131
NP_001185709
NP_005709

NP_001163956
NP_001163957
NP_080828

Расположение (UCSC)Chr 3: 9.79 - 9.81 МбChr 6: 113.38 - 113.39 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Актин-родственный белок 2/3 комплекс субъединица 4 это белок что у людей кодируется ARPC4 ген.[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует одну из семи субъединиц белкового комплекса Arp2 / 3 человека. Белковый комплекс Arp2 / 3 участвует в контроле полимеризации актина в клетках и сохраняется в процессе эволюции. Точная роль белка, кодируемого этим геном, субъединицы p20, еще предстоит определить. Для этого гена были обнаружены три варианта транскрипта, кодирующие две различные изоформы.[7]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции ARPC4. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Arpc4tm1a (EUCOMM) Wtsi[13][14] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[15][16][17]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[11][18] Было проведено 26 испытаний мутант мышей и двух значительных отклонений не наблюдалось.[11] Нет гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, и поэтому ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши; у этих животных не наблюдалось никаких дополнительных значительных отклонений от нормы.[11]

Взаимодействия

ARPC4 продемонстрировал взаимодействовать с ARPC5.[19][20]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000241553 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000079426 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Welch MD, DePace AH, Verma S, Iwamatsu A, Mitchison TJ (август 1997 г.). «Комплекс Arp2 / 3 человека состоит из эволюционно законсервированных субъединиц и локализован в клеточных областях сборки динамических актиновых филаментов». J. Cell Biol. 138 (2): 375–84. Дои:10.1083 / jcb.138.2.375. ЧВК  2138188. PMID  9230079.
  6. ^ Machesky LM, Ривз E, Wientjes F, Mattheyse FJ, Grogan A, Totty NF, Burlingame AL, Hsuan JJ, Segal AW (1997). «Комплекс актинового белка 2/3 млекопитающих локализован в областях ламеллиподиального выступа и состоит из эволюционно консервативных белков». Biochem. J. 328 (Pt 1) (1): 105–12. Дои:10.1042 / bj3280105. ЧВК  1218893. PMID  9359840.
  7. ^ а б «Ген Entrez: комплекс 2/3 родственного актину белка ARPC4, субъединица 4, 20 кДа».
  8. ^ «Данные дисморфологии для Arpc4». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ "Сальмонелла данные о заражении для Arpc4 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ "Citrobacter данные о заражении для Arpc4 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  11. ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  12. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  13. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  14. ^ "Информатика генома мыши".
  15. ^ Скарнес В.С., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт АФ, Брэдли А (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  16. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  17. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь по всем причинам». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  18. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
  19. ^ Миллард TH, Берендт Б., Лаунай С., Фюттерер К., Machesky LM (2003). «Идентификация и характеристика новой человеческой изоформы Arp2 / 3 комплексной субъединицы p16-ARC / ARPC5». Cell Motil. Цитоскелет. 54 (1): 81–90. Дои:10.1002 / см.10087. PMID  12451597.
  20. ^ Чжао X, Ян З, Цянь М, Чжу X (2001). «Взаимодействия между субъединицами человеческого комплекса Arp2 / 3: p20-Arc как центр». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 280 (2): 513–7. Дои:10.1006 / bbrc.2000.4151. PMID  11162547.

дальнейшее чтение

  • Уэлч, доктор медицины, Ивамацу А., Митчисон Т.Дж. (1997). «Полимеризация актина индуцируется белковым комплексом Arp2 / 3 на поверхности Listeria monocytogenes». Природа. 385 (6613): 265–9. Дои:10.1038 / 385265a0. PMID  9000076. S2CID  4358529.
  • Робинсон Р.К., Турбедски К., Кайзер Д.А., Маршан Дж. Б., Хиггс Н. Н., Чо С., Поллард Т. Д. (2001). «Кристаллическая структура комплекса Arp2 / 3». Наука. 294 (5547): 1679–84. Дои:10.1126 / science.1066333. PMID  11721045. S2CID  18088124.
  • Gournier H, Goley ED, Niederstrasser H, Trinh T, Welch MD (2001). «Реконструкция человеческого комплекса Arp2 / 3 показывает критическую роль отдельных субъединиц в сложной структуре и деятельности». Мол. Клетка. 8 (5): 1041–52. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00393-8. PMID  11741539.
  • Геваерт К., Гетальс М., Мартенс Л., Ван Дамм Дж., Стаес А., Томас Г. Р., Вандекеркхове Дж. (2003). «Изучение протеомов и анализ процессинга белков с помощью масс-спектрометрической идентификации отсортированных N-концевых пептидов». Nat. Биотехнология. 21 (5): 566–9. Дои:10.1038 / nbt810. PMID  12665801. S2CID  23783563.
  • Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К., Онг С. Е., Лион CE, Ламонд А. И., Манн М. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
  • Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E , Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (2005). «Сеть взаимодействия белок-белок человека: ресурс для аннотирования протеома». Клетка. 122 (6): 957–68. Дои:10.1016 / j.cell.2005.08.029. HDL:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID  16169070. S2CID  8235923.
  • Розентретер А., Хофманн А., Ксавье С.П., Штумпф М., Ноегель А.А., Клемен С.С. (2007). «Участие коронина 3 в F-актин-зависимых процессах в коре клеток». Exp. Cell Res. 313 (5): 878–95. Дои:10.1016 / j.yexcr.2006.12.015. HDL:10072/14982. PMID  17274980.
  • Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф, Ли Х, Тейлор П., Клими С., Макбрум-Цераевски Л., Робинсон, доктор медицины, О'Коннор Л., Ли М., Тейлор Р., Дхарси М., Хо Й, Хейлбут А., Мур Л., Чжан S, Орнатски O, Бухман YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams С.Л., Моран М.Ф., Морин Г.Б., Топалоглоу Т., Фигейз Д. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.

внешняя ссылка