ASXL1 - ASXL1

ASXL1
Идентификаторы
ПсевдонимыASXL1, BOPS, MDS, дополнительные половые гребешки, такие как 1, регулятор транскрипции, регулятор транскрипции ASXL 1
Внешние идентификаторыOMIM: 612990 MGI: 2684063 ГомолоГен: 9098 Генные карты: ASXL1
Расположение гена (человек)
Хромосома 20 (человек)
Chr.Хромосома 20 (человек)[1]
Хромосома 20 (человек)
Геномное расположение ASXL1
Геномное расположение ASXL1
Группа20q11.21Начинать32,358,330 бп[1]
Конец32,439,319 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE ASXL1 212237 в fs.png

PBB GE ASXL1 212234 в fs.png

PBB GE ASXL1 212238 в формате fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_001164603
NM_015338
NM_001363734

NM_001039939

RefSeq (белок)

NP_001158075
NP_056153
NP_001350663
NP_001158075.1

NP_001035028

Расположение (UCSC)Chr 20: 32,36 - 32,44 МбChr 2: 153,35 - 153,4 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Предполагаемый белок группы Polycomb ASXL1 это белок что у людей кодируется ASXL1 ген.[5][6]

У дрозофилы ген дополнительных половых гребешков (Asx) кодирует белок, связывающий хроматин, необходимый для нормального определения идентичности сегментов у развивающегося эмбриона. Белок входит в состав Группа белков поликомб, которые необходимы для поддержания стабильной репрессии гомеотических и других локусов. Считается, что этот белок нарушает хроматин в локализованных областях, усиливая транскрипцию определенных генов, подавляя транскрипцию других генов. Хотя функция белка, кодируемого этим геном, неизвестна, он демонстрирует некоторое сходство последовательности с белком, кодируемым геном Asx дрозофилы.[6]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции ASXL1. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Asxl1tm1a (EUCOMM) Wtsi[12][13] был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект по мутагенезу с высокой пропускной способностью для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых.[14][15][16]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.[10][17] Было проведено двадцать пять испытаний мутант мышей и четыре значительных отклонения от нормы.[10] Несколько гомозиготный мутант эмбрионы были идентифицированы во время беременности, а у тех, что были живы, были черепно-лицевые дефекты и дефекты глаз, ни один из них не выжил до отлучение от груди. Остальные испытания проводились на гетерозиготный мутантные взрослые мыши; У этих животных наблюдалось уменьшение числа позвонков и повышение прочности костей.[10]

Рекомендации

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000171456 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000042548 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Фишер К.Л., Бергер Дж., Рандаццо Ф., Брок Х.В. (март 2003 г.). «Человеческий гомолог дополнительных половых гребней, ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ПОЛОВЫЕ гребешки-ПОДОБНЫЙ 1, отображается на хромосоме 20q11». Ген. 306: 115–26. Дои:10.1016 / S0378-1119 (03) 00430-X. PMID  12657473.
  6. ^ а б «Entrez Gene: дополнительные половые гребешки ASXL1, такие как 1 (Drosophila)».
  7. ^ «Данные рентгенографии для Asxl1». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  8. ^ "Сальмонелла данные о заражении Asxl1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  9. ^ "Citrobacter данные о заражении Asxl1 ". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
  10. ^ а б c d Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
  11. ^ Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
  12. ^ «Международный консорциум нокаут-мышей».
  13. ^ "Информатика генома мыши".
  14. ^ Skarnes, W. C .; Rosen, B .; West, A. P .; Koutsourakis, M .; Бушелл, Вт .; Iyer, V .; Mujica, A.O .; Thomas, M .; Harrow, J .; Cox, T .; Джексон, Д .; Severin, J .; Biggs, P .; Fu, J .; Нефедов, М .; Де Йонг, П. Дж .; Стюарт, А. Ф .; Брэдли, А. (2011). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–342. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
  15. ^ Долгин Э (2011). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
  16. ^ Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (2007). «Мышь на все случаи жизни». Клетка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
  17. ^ ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геном Биол. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.

внешняя ссылка

дальнейшее чтение