ATG12 - ATG12

ATG12
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4ГДК, 4GDL, 4NAW
Идентификаторы
Псевдонимы	ATG12, APG12, APG12L, FBR93, HAPG12, связанные с аутофагией 12
Внешние идентификаторы	OMIM: 609608 MGI: 1914776 ГомолоГен: 37953 Генные карты: ATG12
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 5 (человек)[1] Группа 5q22.3 Начинать 115,828,200 бп[1] Конец 115,841,837 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 18 (мышь)[2] Группа 18 | 18 С Начинать 46,730,144 бп[2] Конец 46,741,580 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • Активность лигазы Atg8 Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана преаутофагосомальной структуры • мембрана фагоцитарных везикул • Комплекс Атг12-Атг5-Атг16 • мембрана • аутофагосома • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • аутофагия • аутофагия ядра • Липидирование C-концевого белка • аутофагия митохондрии • макроавтофагия • сборка аутофагосом Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9140	67526
Ансамбль	ENSG00000145782	ENSMUSG00000032905
UniProt	O94817	Q9CQY1
RefSeq (мРНК)	NM_001277783 NM_004707	NM_026217
RefSeq (белок)	NP_001264712 NP_004698	NP_080493
Расположение (UCSC)	Chr 5: 115,83 - 115,84 Мб	Chr 18: 46.73 - 46.74 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Связанные с аутофагией 12 это белок что у людей кодируется ATG12 ген.^[5][6]

Аутофагия - это процесс массового разрушения белка, при котором компоненты цитоплазмы, включая органеллы, заключены в двухмембранные структуры, называемые аутофагосомами, и доставляются в лизосомы или вакуоли для деградации. ATG12 является человеческим гомологом дрожжевого белка, участвующего в аутофагии (Mizushima et al., 1998). [Предоставлено OMIM]^[6]

Аутофагия требует ковалентного присоединения белка Atg12 к ATG5 через убиквитин -подобная система сопряжения. Конъюгат Atg12-Atg5 затем способствует конъюгации ATG8 к липиду фосфатидилэтаноламин.^[7]

Atg12 участвует в апоптоз. Этот белок способствует апоптозу за счет взаимодействия с антиапоптотическими членами Семейство bcl-2.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000145782 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000032905 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Mizushima N, Sugita H, Yoshimori T., Ohsumi Y (январь 1999 г.). «Новая система конъюгации белков в организме человека. Аналог дрожжевой системы конъюгации Apg12p, необходимой для аутофагии». J Biol Chem. 273 (51): 33889–33892. Дои:10.1074 / jbc.273.51.33889. PMID  9852036.
6. «Ген Entrez: ATG12, гомолог 12 ATG12, связанный с аутофагией (S. cerevisiae)».
7. Дж. Гэн и Д. Дж. Клионски, «Убиквитин-подобные системы конъюгации Atg8 и Atg12 в макроаутофагии. «Модификации белков: за пределами серии обзоров обычных подозреваемых», EMBO Rep, 9 (2008), 859-64.
8. А. Д. Рубинштейн, М. Эйзенштейн, Ю. Бер, С. Бялик и А. Кимчи, «Белок аутофагии Atg12 ассоциируется с антиапоптотическими членами семейства Bcl-2, способствуя митохондриальному апоптозу», Mol Cell, 44 (2011), 698-709

внешняя ссылка

• Человек ATG12 расположение генома и ATG12 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Prigione A, Cortopassi G (2007). «Делеции митохондриальной ДНК и лечение хлорамфениколом стимулируют аутофагический транскрипт ATG12». Аутофагия. 3 (4): 377–80. Дои:10.4161 / авто.4239. PMID  17457038.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–1178. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–2127. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–45. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Mizushima N, Kuma A, Kobayashi Y, et al. (2004). «Мышиный Apg16L, новый белок WD-повтора, нацелен на аутофагическую изоляционную мембрану с помощью конъюгата Apg12-Apg5». J. Cell Sci. 116 (Pt 9): 1679–1688. Дои:10.1242 / jcs.00381. PMID  12665549.
• Мидзусима Н., Ёсимори Т., Осуми Ю. (2003). «Apg10 мыши как Apg12-конъюгирующий фермент: анализ двухгибридным методом, опосредованным конъюгацией». FEBS Lett. 532 (3): 450–454. Дои:10.1016 / S0014-5793 (02) 03739-0. PMID  12482611. S2CID  37247321.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–16903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Танида И., Нишитани Т., Немото Т. и др. (2002). «Apg12p млекопитающих, но не конъюгат Apg12p.Apg5p, облегчает процессинг LC3». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 296 (5): 1164–1170. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 02057-0. PMID  12207896.
• Танида I, Танида-Мияке Э., Нишитани Т. и др. (2002). «Мышиный Apg12p имеет предпочтение субстрата для мышиного Apg7p по сравнению с тремя гомологами Apg8p». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 292 (1): 256–262. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6645. PMID  11890701.
• Танида I, Танида-Мияке Э., Комацу М. и др. (2002). «Гомолог Apg3p / Aut1p человека представляет собой аутентичный фермент E2 для нескольких субстратов, GATE-16, GABARAP и MAP-LC3, и облегчает конъюгацию hApg12p с hApg5p». J. Biol. Chem. 277 (16): 13739–13744. Дои:10.1074 / jbc.M200385200. PMID  11825910.
• Уэно К., Кумагаи Т., Кидзима Т. и др. (1998). «Клонирование и тканевая экспрессия кДНК из хромосомы 5q21-22, которая часто удаляется при распространенном раке легкого». Гм. Genet. 102 (1): 63–68. Дои:10.1007 / s004390050655. PMID  9490301. S2CID  36201527.
• Боналдо М.Ф., Леннон Г., Соарес МБ (1997). «Нормализация и вычитание: два подхода для облегчения открытия генов». Genome Res. 6 (9): 791–806. Дои:10.1101 / гр.6.9.791. PMID  8889548.