Александр Старк - Alexander Stark

Александр Старк
Альма-матер
Научная карьера
Поляэкспрессия генов в развитии, транскрипция
Учреждения
ДокторантРоберт Б. Рассел
Интернет сайтwww.imp.ac.в/ группы/ Александр-Старк/

Александр Старк (1974 г.р.) биохимик и компьютерный биолог работает над регулированием экспрессия гена в развитии.[1] Он старший научный сотрудник НИИ молекулярной патологии (IMP) в Венский биоцентр и адъюнкт-профессор Венский медицинский университет.[2]

ранняя жизнь и образование

Александр Старк вырос в Баден-Вюртемберг, Германия. Он изучал биохимию в Тюбингенский университет и получил диплом по биохимии в 2000 году.[3] В 2001 году он начал исследования для докторантуры в группе Роберта Б. (Роба) Рассела в Европейская лаборатория молекулярной биологии (EMBL) и получил докторскую степень в Кельнский университет в 2004 г.[3] Старк проработал в EMBL еще один год в качестве промежуточного постдока.

Карьера

В 2005 году,[3] Старк стал постдокторантом в группах Эрик С. Ландер и Манолис Келлис в Broad Institute из Массачусетский технологический институт и Гарвардский университет и Лаборатория компьютерных наук и искусственного интеллекта Массачусетского технологического института (CSAIL) в Бостоне, США. Его постдокторское исследование было поддержано EMBO, HFSP, и Фонд Шеринга.

В 2008,[3] Старк стал лидером группы[4] на НИИ молекулярной патологии (IMP) в Вена В 2015 году получил звание старшего научного сотрудника.[5] Он был назначен адъюнкт-профессором Венский медицинский университет в 2017 году.[2]

Исследование

Александр Старк изучает регуляцию экспрессия гена в ответ на стимулы развития или окружающей среды, чтобы узнать, как транскрипция а транскрипционные сети определяют клеточные программы и программы развития.[6][1]

В частности, он исследует, как транскрипция регулируется на уровне усилитель и кор-промоутер ДНК элементы, а фактор транскрипции и белки-кофакторы, которые опосредуют активацию транскрипции. Он использует общегеномные функциональные анализы, биоинформатику и масс-спектрометрии, и разрабатывает инновационные репортерные анализы (такие как STARR-seq ), которые обеспечивают прямое функциональное считывание.[1]

Некоторые из наиболее цитируемых публикаций Старка включают Принципы распознавания микроРНК-мишеней,[7] bantam кодирует микроРНК, регулируемую развитием, которая контролирует пролиферацию клеток и регулирует проапоптотический ген, скрытый в Drosophila,[8] и модификации гистонов в энхансерах человека отражают глобальную экспрессию генов, специфичных для клеточного типа.[9]

Награды и достижения

Александр Старк был выбран молодым исследователем EMBO в 2012 году;[10] объявлен "высоко цитируемым исследователем" Thomson Reuters в 2014[11] и избран членом EMBO в 2015 году.[12][13]

Среди других грантов и стипендий Старк получил стартовый грант Европейский исследовательский совет (ERC) в 2009 г. и консолидирующий грант ERC в 2015 г.[14] Он входит в редколлегию Гены и развитие[15] и Молекулярная системная биология.[16]

Рекомендации

  1. ^ а б c "Александр Старк - Системная биология регуляторных мотивов и сетей". НИИ молекулярной патологии. Получено 2018-02-11.
  2. ^ а б "Александр Старк". Научно-исследовательский институт молекулярной патологии GmbH. IMP. Получено 2019-02-14.
  3. ^ а б c d "Александр Старк". Лаборатория Старка. НИИ молекулярной патологии. Получено 11 марта 2019.
  4. ^ https://www.imp.ac.at/fileadmin/content/About_IMP/Research_Reports/2008_IMP_Research_Report.pdf
  5. ^ https://www.imp.ac.at/fileadmin/content/IMP_ResearchReport.pdf
  6. ^ «Расшифровка цис-регуляторного транскрипционного кода». Лаборатория Старка. 2018-02-05. Получено 2018-02-11.
  7. ^ Бреннеке Дж., Старк А., Рассел Р. Б., Коэн С. М. (2005) Принципы распознавания микроРНК-мишени. PLoS Biol 3 (3): e85. https://doi.org/10.1371/journal.pbio.0030085
  8. ^ Бреннеке, Юлиус (4 апреля 2003 г.). «Бантам кодирует микроРНК, регулируемую развитием, которая контролирует пролиферацию клеток и регулирует проапоптотический ген, скрытый в дрозофиле». 113 (1): 25–36. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00231-9. Цитировать журнал требует | журнал = (помощь)
  9. ^ Хайнцман, Натаниэль (7 мая 2009 г.). «Модификации гистонов в энхансерах человека отражают глобальную экспрессию генов, специфичных для определенного типа клеток». Природа. 459 (7243): 108–112. Bibcode:2009Натура.459..108H. Дои:10.1038 / природа07829. ЧВК  2910248. PMID  19295514.
  10. ^ «Найди молодого следователя». EMBO.
  11. ^ Патология, НИИ Молекуляр. «Александр Старк среди самых цитируемых исследователей мира».
  12. ^ Патология, НИИ Молекуляр. «Пресс-релиз: награда EMBO для Александра Старка».
  13. ^ «Найти участника». EMBO.
  14. ^ «Ученый IMP Алекс Старк получил грант консолидатора ERC». idw-online.de.
  15. ^ «Гены и развитие - О журнале». genesdev.cshlp.org.
  16. ^ "Редакторы и Правление - Молекулярная системная биология". msb.embopress.org.

внешняя ссылка