Белок, связанный с аутофагией 13 - Autophagy-related protein 13 - Wikipedia

ATG13
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 5C50
Идентификаторы
Псевдонимы	ATG13, KIAA0652, PARATARG8, связанные с аутофагией 13
Внешние идентификаторы	OMIM: 615088 MGI: 1196429 ГомолоГен: 32229 Генные карты: ATG13
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11p11.2 Начинать 46,617,527 бп[1] Конец 46,674,818 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 2 (мышь)[2] Группа 2 | 2 E1 Начинать 91,674,618 бп[2] Конец 91,710,576 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • Киназный комплекс ATG1 / ULK1 • митохондрия • преаутофагосомная структура • мембрана эндоплазматического ретикулума Биологический процесс • аутофагия • макроавтофагия • сборка аутофагосом • положительное регулирование доставки белка в митохондрии • митофагия • ответ на митохондриальную деполяризацию • регуляция макроаутофагии Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9776	51897
Ансамбль	ENSG00000175224	ENSMUSG00000027244
UniProt	O75143	Q91YI1
RefSeq (мРНК)	NM_001142673 NM_001205119 NM_001205120 NM_001205121 NM_001205122 NM_001346311 NM_001346312 NM_001346313 NM_001346314 NM_001346315 NM_001346316 NM_001346317 NM_001346318 NM_001346319 NM_001346320 NM_001346321 NM_001346322 NM_001346323 NM_001346324 NM_001346325 NM_001346326 NM_001346327 NM_001346328 NM_001346329 NM_001346330 NM_001346331 NM_001346332 NM_001346333 NM_001346334 NM_001346335 NM_001346336 NM_001346337 NM_001346338 NM_001346340 NM_001346342 NM_001346344 NM_001346346 NM_001346348 NM_001346349 NM_001346350 NM_001346351 NM_001346352 NM_001346353 NM_001346354 NM_001346355 NM_001346356 NM_001346357 NM_001346358 NM_001346359 NM_001346360 NM_014741	NM_145528 NM_001355416 NM_001355417 NM_001355418 NM_001355419 NM_001355420 NM_001355421
RefSeq (белок)	NP_001136145 NP_001192048 NP_001192049 NP_001192050 NP_001192051 NP_001333240 NP_001333241 NP_001333242 NP_001333243 NP_001333244 NP_001333245 NP_001333246 NP_001333247 NP_001333248 NP_001333249 NP_001333250 NP_001333251 NP_001333252 NP_001333253 NP_001333254 NP_001333255 NP_001333256 NP_001333257 NP_001333258 NP_001333259 NP_001333260 NP_001333261 NP_001333262 NP_001333263 NP_001333264 NP_001333265 NP_001333266 NP_001333267 NP_001333269 NP_001333271 NP_001333273 NP_001333275 NP_001333277 NP_001333278 NP_001333279 NP_001333280 NP_001333281 NP_001333282 NP_001333283 NP_001333284 NP_001333285 NP_001333286 NP_001333287 NP_001333288 NP_001333289 NP_055556	NP_663503 NP_001342345 NP_001342346 NP_001342347 NP_001342348 NP_001342349 NP_001342350
Расположение (UCSC)	Chr 11: 46.62 - 46.67 Мб	Chr 2: 91,67 - 91,71 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Белок, связанный с аутофагией 13 также известный как ATG13 это белок что у людей кодируется KIAA0652 ген.^[5]

ATG13 - это аутофагия фактор, необходимый для фагосома формирование. ATG13 является целью Киназа TOR сигнальный путь, регулирующий аутофагию через фосфорилирование ATG13 и ULK1, и регулирование ATG13-ULK1-RB1CC1 сложный.^[6][7][8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000175224 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000027244 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. "Энтрез Джин: KIAA0652".
6. Mercer CA, Kaliappan A, Dennis PB (июль 2009 г.). «Новый человеческий связывающий белок Atg13, Atg101, взаимодействует с ULK1 и необходим для макроаутофагии». Аутофагия. 5 (5): 649–62. Дои:10.4161 / авто.5.5.8249. PMID  19287211.
7. Хосокава Н., Хара Т., Кайзука Т., Киши С., Такамура А., Миура Ю., Иемура С., Нацумэ Т., Такехана К., Ямада Н., Гуан Д. Л., Оширо Н., Мидзусима Н. (апрель 2009 г.). «Зависимая от питательных веществ ассоциация mTORC1 с комплексом ULK1 – Atg13 – FIP200, необходимая для аутофагии». Мол. Биол. Клетка. 20 (7): 1981–91. Дои:10.1091 / mbc.E08-12-1248. ЧВК  2663915. PMID  19211835.
8. Чан Е.Ю., Лонгатти А., Макнайт, Северная Каролина, Туз С.А. (январь 2009 г.). "Инактивированные киназой белки ULK ингибируют аутофагию через свои консервативные С-концевые домены с использованием механизма, независимого от Atg13". Мол. Клетка. Биол. 29 (1): 157–71. Дои:10.1128 / MCB.01082-08. ЧВК  2612494. PMID  18936157.

внешняя ссылка

• Человек ATG13 расположение генома и ATG13 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Хосокава Н., Сасаки Т., Иемура С. и др. (2009). «Atg101, новый белок аутофагии млекопитающих, взаимодействующий с Atg13». Аутофагия. 5 (7): 973–9. Дои:10.4161 / авто.5.7.9296. PMID  19597335.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Кимура К., Вакамацу А., Сузуки Ю. и др. (2006). «Диверсификация транскрипционной модуляции: широкомасштабная идентификация и характеристика предполагаемых альтернативных промоторов генов человека». Genome Res. 16 (1): 55–65. Дои:10.1101 / гр. 4039406. ЧВК  1356129. PMID  16344560.
• Чан ЭЮ (2009). «mTORC1 фосфорилирует комплекс регуляции аутофагии ULK1-mAtg13-FIP200». Научная сигнализация. 2 (84): pe51. Дои:10.1126 / scisignal.284pe51. PMID  19690328. S2CID  206673207.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К. и др. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Юнг Ч., Джун CB, Ро Ш. и др. (2009). «Комплексы ULK-Atg13-FIP200 служат посредниками для передачи сигналов mTOR в машину аутофагии». Мол. Биол. Клетка. 20 (7): 1992–2003. Дои:10.1091 / mbc.E08-12-1249. ЧВК  2663920. PMID  19225151.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Исикава К., Нагасе Т., Суяма М. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
• Чан Е.Ю., Лонгатти А., Макнайт, Северная Каролина, Туз С.А. (2009). "Инактивированные киназой белки ULK ингибируют аутофагию через свои консервативные С-концевые домены с использованием механизма, независимого от Atg13". Мол. Клетка. Биол. 29 (1): 157–71. Дои:10.1128 / MCB.01082-08. ЧВК  2612494. PMID  18936157.
• Ганли И.Г., Лам дю Х, Ван Дж. И др. (2009). «Комплекс ULK1 · ATG13 · FIP200 опосредует передачу сигналов mTOR и необходим для аутофагии». J. Biol. Chem. 284 (18): 12297–305. Дои:10.1074 / jbc.M900573200. ЧВК  2673298. PMID  19258318.
• Sinzelle L, Kapitonov VV, Grzela DP, et al. (2008). «Транспозиция реконструированного элемента Предвестника в человеческих клетках и функциональная гомология с двумя клеточными генами, производными от транспозонов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 105 (12): 4715–20. Дои:10.1073 / pnas.0707746105. ЧВК  2290759. PMID  18339812.