BCL9 - BCL9

BCL9
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2GL7, 2VP7, 2VPB, 2VPD, 2ВПЭ, 2VPG, 3SL9
Идентификаторы
Псевдонимы	BCL9, LGS, B-клеточный CLL / лимфома 9, B-клеточный CLL / лимфома 9, коактиватор транскрипции, коактиватор транскрипции BCL9
Внешние идентификаторы	OMIM: 602597 MGI: 1924828 ГомолоГен: 3191 Генные карты: BCL9
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.2 Начинать 147,541,501 бп[1] Конец 147,626,216 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F2.1 Начинать 97,203,662 бп[2] Конец 97,297,917 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание бета-катенина • GO: 0001948 связывание с белками • GO: 0001105 активность коактиватора транскрипции Сотовый компонент • цитоплазма • сеть цис-Гольджи • аппарат Гольджи • ядро клетки • нуклеоплазма • комплекс бета-катенин-TCF Биологический процесс • дифференциация клеток скелетных мышц • канонический путь передачи сигналов Wnt • Сигнальный путь Wnt • поддержание популяции соматических стволовых клеток • дифференцировка миотрубок, участвующих в регенерации скелетных мышц • положительная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • регуляция сигнального пути бета-рецептора трансформирующего фактора роста • сборка комплекса бета-катенин-TCF Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	607	77578
Ансамбль	ENSG00000116128	ENSMUSG00000038256
UniProt	O00512	Q9D219
RefSeq (мРНК)	NM_004326	NM_029933
RefSeq (белок)	NP_004317	NP_084209
Расположение (UCSC)	Chr 1: 147.54 - 147.63 Мб	Chr 3: 97,2 - 97,3 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

B-клеточный CLL / белок лимфомы 9 это белок что у людей кодируется BCL9 ген.^[5][6]

Функция

BCL9 вместе с его паралогенным геном BCL9L (подобный BCL9 или BCL9.2) были тщательно изучены на предмет их роли в качестве транскрипционного бета-катенин кофакторы, фундаментальные для транскрипции генов-мишеней Wnt.^[7]

Последние работы с помощью мыши (Mus musculus ) и данио (Данио Рерио ) в качестве модельных организмов определили древнюю роль BCL9 и BCL9L как ключевые факторы, необходимые для сердечного развития.^[8] Эта работа подчеркивает тканеспецифическую природу механизма действия Wnt / β-catenin и указывает на изменения в BCL9 и BCL9L при врожденных пороках сердца человека.

BCL9 и BCL9L было показано, что они участвуют в др. тканеспецифичных молекулярных механизмах, показывая, что их роль в сигнальном каскаде Wnt является только одним аспектом их способа действия.^[9]

Клиническое значение

BCL9 связан с В-клеточным острым лимфобластным лейкозом. Это может быть целью транслокации при злокачественных новообразованиях B-клеток с аномалиями 1q21. Сверхэкспрессия BCL9 может иметь патогенное значение при злокачественных новообразованиях B-клеток.^[6]

BCL9 и BCL9L являются потенциальными клиническими мишенями для рака человека; например, изменения экспрессии генов, которые они способствуют, связаны с плохим исходом колоректального рака.^[10]

Нравиться BCL2, BCL3, BCL5, BCL6, BCL7A и BCL10, имеет клиническое значение в лимфома.

Общие вариации в гене BCL9, который находится в дистальной области, создают риск шизофрении, а также могут быть связаны с биполярным расстройством и сильное депрессивное расстройство.^[11]

BCL9 вместе с паралогическим белком BCL9l и PYGO2 также выполняют цитоплазматические функции во время развития зубов и особенно важны для формирования эмали. У мышей, лишенных как Pygo1, так и Pygo2 или как Bcl9, так и Bcl9l, развиваются зубы, процесс, который требует регуляции транскрипции Wnt / β-catenin, но эмаль структурно дезорганизована и содержит меньше железа, чем зубы контрольных мышей. Bcl9, Bcl9l и Pygo2 присутствуют в цитоплазме амелобластов, клеток, которые секретируют белки эмали, и колокализуются в этих клетках с амелогенином, основным компонентом эмали, кодируемым AMELX ген, который уже рассматривается как причинный фактор Несовершенный амелогенез в людях. Bcl9 взаимодействует с амелогенином и белками, участвующими в экзоцитозе и везикулярном переносе, что позволяет предположить, что эти белки участвуют в переносе или секреции белков эмали. Следовательно, Bcl9, Bcl9l и Pygo2 обладают цитоплазматическими функциями, отличными от их ролей в качестве транскрипционных кофакторов ниже передачи сигналов Wnt.^[12] Это новое открытие может улучшить наше понимание лечения людей. кариес.^[13]

Связанные генные проблемы

• Синдром делеции 1q21.1
• Синдром дупликации 1q21.1

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000116128 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000038256 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Уиллис Т.Г., Зальцберг И.Р., Койнет Л.Дж., Влодарска И., Стул М., Джадаэль Д.М., Ублюдок С., Треливен Дж. Г., Катовски Д., Сильва М.Л., Дайер М.Дж. (март 1998 г.). «Молекулярное клонирование транслокации t (1; 14) (q21; q32) определяет новый ген (BCL9) на хромосоме 1q21». Кровь. 91 (6): 1873–81. Дои:10.1182 / blood.V91.6.1873. PMID  9490669.
6. «Ген Entrez: BCL9 B-клеточный CLL / лимфома 9».
7. Mosimann C, Hausmann G, Basler K (апрель 2009 г.). «Бета-катенин попадает в хроматин: регуляция активации гена-мишени Wnt». Обзоры природы. Молекулярная клеточная биология. 10 (4): 276–86. Дои:10.1038 / nrm2654. PMID  19305417.
8. Канту, Клаудио; Фелькер, Анастасия; Циммерли, Дарио; Пруммель, Карин; Кабельо, Елена; Кьяваччи, Елена; Мендес-Асеведо, Кевин; Кирхгеорг, Люсия; Сибилла, Бургер; Риполл, Хорхе; Валента, Томас; Хаусманн, Джордж; Вилен, Натали; Агуэ, Мишель; Бургер, Алекса; Панакова, Даниела; Баслер, Конрад; Мосиманн, Кристиан (1 ноября 2018 г.). «Мутации в генах Bcl9 и Pygo вызывают врожденные пороки сердца из-за тканеспецифических нарушений передачи сигналов Wnt / β-катенина». Гены и развитие. 32 (21–22): 1443–1458. Дои:10.1101 / gad.315531.118. ЧВК  6217730. PMID  30366904.
9. Канту С., Циммерли Д., Хаусманн Дж., Валента Т., Мур А., Агует М., Basler K (сентябрь 2014 г.). «Pax6-зависимая, но независимая от β-катенина, функция белков Bcl9 в развитии хрусталика мышей». Гены и развитие. 28 (17): 1879–84. Дои:10.1101 / гад.246140.114. ЧВК  4197948. PMID  25184676.
10. Мур А.Е., Андерле П., Канту С., Родригес П., Видеманн Н., Барутио Ф., Дека Дж., Андре С., Валента Т. (01.12.2015). «Передача сигналов BCL9 / 9L-β-катенина связана с плохим исходом при колоректальном раке». EBioMedicine. 2 (12): 1932–1943. Дои:10.1016 / j.ebiom.2015.10.030. ЧВК  4703711. PMID  26844272.
11. Ли Дж, Чжоу Дж, Джи В, Фэн Дж, Чжао Цюй, Лю Дж, Ли Т, Ли И, Чен П, Цзэн З, Ван Т, Ху З, Чжэн Л, Ван Ю, Шэнь Й, Хэ Л, Ши Ю (2011). «Общие варианты в гене BCL9, вызывающие риск шизофрении». Архив общей психиатрии. 68 (3): 232–40. Дои:10.1001 / archgenpsychiatry.2011.1. PMID  21383261.
12. Канто С., Пагелла П., Шайей Т.Д., Циммерли Д., Валента Т., Хаусманн Г., Баслер К., Мициадис Т.А. (07.02.2017). «Цитоплазматическая роль транскрипционных кофакторов Wnt / β-катенина Bcl9, Bcl9l и Pygopus в формировании зубной эмали». Sci. Сигнал. 10 (465): eaah4598. Дои:10.1126 / scisignal.aah4598. ISSN  1945-0877. PMID  28174279.
13. «Мутировавшие гены приводят к дефектам зубной эмали, что увеличивает риск кариеса». Новости-Medical.net. 2017-02-07. Получено 2017-02-08.

дальнейшее чтение

• Busson-Le Coniat M, Salomon-Nguyen F, Dastugue N, Maarek O, Lafage-Pochitaloff M, Mozziconacci MJ, Baranger L, Brizard F, Radford I, Jeanpierre M, Bernard OA, Berger R (декабрь 1999 г.). «Флуоресцентный гибридизационный анализ in situ аномалий хромосомы 1 при гемопоэтических нарушениях: перестройки сателлита ДНК II и новые повторяющиеся транслокации». Лейкемия. 13 (12): 1975–81. Дои:10.1038 / sj / leu / 2401587. PMID  10602418.
• Крампс Т., Питер О., Бруннер Э., Неллен Д., Фрош Б., Чаттерджи С., Муроне М., Цюллиг С., Баслер К. (апрель 2002 г.). «Передача сигналов Wnt / wingless требует BCL9 / legless-опосредованного рекрутирования пигопов в ядерный комплекс бета-катенин-TCF» (PDF). Клетка. 109 (1): 47–60. Дои:10.1016 / S0092-8674 (02) 00679-7. PMID  11955446.
• Knoll A, Dvorák J, Rohrer GA, Cepica S (апрель 2002 г.). «Связывание и цитогенетическое картирование гена BCL9 с хромосомой 4 свиньи». Генетика животных. 33 (2): 162–3. Дои:10.1046 / j.1365-2052.2002.0831e.x. PMID  12047235.
• Townsley FM, Thompson B, Bienz M (февраль 2004 г.). «Остатки Pygopus, необходимые для его связывания с Legless, имеют решающее значение для транскрипции и развития». Журнал биологической химии. 279 (7): 5177–83. Дои:10.1074 / jbc.M309722200. PMID  14612447.
• Hoffmans R, Basler K (сентябрь 2004 г.). «Идентификация и in vivo роль взаимодействия Armadillo-Legless». Разработка. 131 (17): 4393–400. Дои:10.1242 / dev.01296. PMID  15294866.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М. А., Кантли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Сампьетро Дж., Дальберг С.Л., Чо США, Хайндс Т.Р., Кимелман Д., Сюй В. (октябрь 2006 г.). «Кристаллическая структура комплекса бета-катенин / BCL9 / Tcf4». Молекулярная клетка. 24 (2): 293–300. Дои:10.1016 / j.molcel.2006.09.001. PMID  17052462.
• Hoffmans R, Basler K (январь 2007 г.). «BCL9-2 связывает Arm / beta-catenin Tyr142-независимым образом и требует Pygopus для его функции в передаче сигналов Wg / Wnt». Механизмы развития. 124 (1): 59–67. Дои:10.1016 / j.mod.2006.09.006. PMID  17113272.

внешняя ссылка

• Человек BCL9 расположение генома и BCL9 страница сведений о гене в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: O00512 (B-клеточный CLL / белок лимфомы 9) на PDBe-KB.