BECN1 - BECN1

BECN1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2П1Л, 2PON, 3DVU, 4DDP, 4MI8
Идентификаторы
Псевдонимы	BECN1, ATG6, VPS30, беклин1, беклин 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 604378 MGI: 1891828 ГомолоГен: 2794 Генные карты: BECN1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q21.31 Начните 42,810,134 бп[1] Конец 42,833,350 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 Д Начните 101,285,952 бп[2] Конец 101,302,286 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание фосфатидилинозитол-3-киназы • GO: 0001948 связывание с белками • Связывание GTPase • связывание убиквитин-протеин-лигазы • связывание протеинкиназы • активность гомодимеризации белков Сотовый компонент • эндосомная мембрана • цитоплазма • митохондриальные мембраны • сеть транс-Гольджи • аппарат Гольджи • цитозоль • ядро клетки • аутофагосома • преаутофагосомная структура • мембрана • дендрит • эндоплазматический ретикулум • фосфатидилинозитол-3-киназный комплекс, класс III • мембрана эндоплазматического ретикулума • фосфатидилинозитол-3-киназный комплекс, класс III, тип II • цитоплазматический пузырек • эндосома • внешний компонент мембраны • фосфатидилинозитол-3-киназный комплекс, класс III, тип I • фагоцитарный пузырек • митохондрия • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • отрицательное регулирование пролиферации клеток • ответ на гипоксию • клеточный ответ на ион алюминия • ответ на витамин Е • лизосомная организация • клеточный цикл • положительная регуляция передачи сигналов фосфатидилинозитол-3-киназы • клеточный ответ на голодание по глюкозе • ответ клеточной защиты • цитокинез • клеточный ответ на стимул эпидермального фактора роста • деление клеток • рецепторный катаболический процесс • аутофагия ядра • клеточный ответ на азотное голодание • GO: 0022415 вирусный процесс • поздний перенос эндосомы в вакуоль • апоптотический процесс • перенос цитоплазмы в вакуоль по пути Cvt • эндоцитоз • поглощение апоптотической клетки • положительная регуляция прикрепления микротрубочек митотического веретена к кинетохоре • амилоид-бета метаболический процесс • развитие нейрона • защитный ответ на вирус • реакция на другой организм • конгресс митотической метафазной пластинки • ответ на наркотик • GO: 0048552 регуляция каталитической активности • отрицательная регуляция метаболического процесса активных форм кислорода • регуляция цитокинеза • отрицательная регуляция апоптотического процесса • отрицательная регуляция гибели клеток • сборка аутофагосом • макроавтофагия • старение • ответ на ион железа (II) • реакция на ион свинца • деубиквитинирование белков • реакция на уровень питательных веществ • клеточный ответ на аминокислотное голодание • клеточный ответ на перекись водорода • клеточный ответ на ион меди • отрицательная регуляция организации лизосом • положительная регуляция сборки аутофагосом • аутофагия митохондрии • митофагия • аутофагия • положительное регулирование аутофагии • ответ на митохондриальную деполяризацию • транспорт от ранней эндосомы к поздней • отрицательная регуляция аутофагии • положительная регуляция гипертрофии сердечной мышцы • отрицательная регуляция сборки аутофагосом • положительная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8678	56208
Ансамбль	ENSG00000126581	ENSMUSG00000035086
UniProt	Q14457	O88597
RefSeq (мРНК)	NM_001313998 NM_001313999 NM_001314000 NM_003766	NM_019584 NM_001359819 NM_001359820 NM_001359821
RefSeq (белок)	NP_001300927 NP_001300928 NP_001300929 NP_003757	NP_062530 NP_001346748 NP_001346749 NP_001346750
Расположение (UCSC)	Chr 17: 42,81 - 42,83 Мб	Chr 11: 101.29 - 101,3 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Беклин-1 это белок что у людей кодируется BECN1 ген.^[5][6] Беклин-1 - млекопитающее ортолог гена 6 дрожжевой аутофагии (Atg6) и BEC-1 в C. elegans нематода.^[7] Этот белок взаимодействует с BCL-2 или PI3k класс III, играющий решающую роль в регуляции обоих аутофагия и смерть клетки.

Роль в болезни

Беклин-1 играет важную роль в туморогенез, и нейродегенерация, будучи замешанным в аутофагический запрограммированная гибель клеток.^[8] Рак яичников с усиленным аутофагия ведет себя менее агрессивно и лучше поддается химиотерапии.^[9]

Шизофрения связан с низким уровнем Беклина-1 в гиппокампе пораженного, что вызывает снижение аутофагия что, в свою очередь, приводит к повышенной гибели нейрональных клеток.^[10]

Взаимодействия

BECN1 был показан взаимодействовать с участием:

• Bcl-2^[5]
• BCL2L2^[11]
• GOPC^[12]
• MAP1LC3A^[9]

Модуляторы

Трегалоза

Трегалоза снижает соотношение p62 / Beclin-1 и увеличивает аутофагия во фронтальной коре мышей ICR, возможно, за счет увеличения Beclin-1.^[13]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000126581 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035086 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Лян XH, Kleeman LK, Jiang HH, Gordon G, Goldman JE, Berry G и др. (Ноябрь 1998 г.). «Защита от фатального энцефалита, вызванного вирусом Синдбис, с помощью беклина, нового белка, взаимодействующего с Bcl-2». Журнал вирусологии. 72 (11): 8586–96. Дои:10.1128 / JVI.72.11.8586-8596.1998. ЧВК  110269. PMID  9765397.
6. «Ген Entrez: BECN1 беклин 1 (спиральный, миозиноподобный взаимодействующий белок BCL2)».
7. Такач-Веллаи К., Веллаи Т., Пуоти А., Пассаннанте М., Викки С., Стрейт А. и др. (Август 2005 г.). «Инактивация гена аутофагии Bec-1 вызывает апоптотическую гибель клеток C. elegans». Текущая биология. 15 (16): 1513–7. Дои:10.1016 / j.cub.2005.07.035. PMID  16111945. S2CID  7404414.
8. Чжун И, Ван Ц.Дж., Ли Х, Ян И, Бэкер Дж.М., Чайт Б.Т. и др. (Апрель 2009 г.). «Четкая регуляция аутофагической активности с помощью Atg14L и Rubicon, связанная с комплексом Beclin 1-фосфатидилинозитол-3-киназы». Природа клеточной биологии. 11 (4): 468–76. Дои:10.1038 / ncb1854. ЧВК  2664389. PMID  19270693.
9. Валенте Дж., Морани Ф., Никотра Дж., Фуско Н., Пераккио С., Титоне Р. и др. (2014). «Экспрессия и клиническое значение белков аутофагии BECLIN 1 и LC3 при раке яичников». BioMed Research International. 2014: 462658. Дои:10.1155/2014/462658. ЧВК  4127242. PMID  25136588.
10. Меренлендер-Вагнер А., Малишкевич А., Шемер З., Удавела М., Гиббонс А., Скарр Э. и др. (Февраль 2015 г.). «Аутофагия играет ключевую роль в патофизиологии шизофрении». Молекулярная психиатрия. 20 (1): 126–32. Дои:10.1038 / mp.2013.174. ЧВК  4320293. PMID  24365867. Сложить резюме – MediLexicon International Ltd.
11. Эрлих С., Мизрахи Л., Сегев О., Линденбойм Л., Змира О., Ади-Харел С. и др. (2007). «Дифференциальные взаимодействия между членами семейства Beclin 1 и Bcl-2». Аутофагия. 3 (6): 561–8. Дои:10.4161 / авто.4713. PMID  17643073.
12. Юэ З., Хортон А., Бравин М., Де Ягер П.Л., Селими Ф., Хайнц Н. (август 2002 г.). «Новый белковый комплекс, связывающий дельта-2-глутаматный рецептор и аутофагию: последствия для нейродегенерации у мышей Lurcher». Нейрон. 35 (5): 921–33. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00861-9. PMID  12372286. S2CID  10534933.
13. Кара Н.З., Токер Л., Агам Дж., Андерсон Г.В., Белмейкер Р.Х., Эйнат Х. (сентябрь 2013 г.). «Трегалоза индуцировала антидепрессантоподобные эффекты и усиление аутофагии у мышей». Психофармакология. 229 (2): 367–75. Дои:10.1007 / s00213-013-3119-4. PMID  23644913. S2CID  17641899.

дальнейшее чтение

• Фундерберк С.Ф., Ван Ц.Дж., Юэ З. (июнь 2010 г.). «Комплекс Beclin 1-VPS34 - на перекрестке аутофагии и не только». Тенденции в клеточной биологии. 20 (6): 355–62. Дои:10.1016 / j.tcb.2010.03.002. ЧВК  3781210. PMID  20356743.
• Ромменс Дж. М., Дюроше Ф., МакАртур Дж., Тонин П., Леблан Дж. Ф., Аллен Т. и др. (Август 1995 г.). «Создание карты транскрипции в центромерном локуса HSD17B по отношению к BRCA1 в 17q21». Геномика. 28 (3): 530–42. Дои:10.1006 / geno.1995.1185. PMID  7490091.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Айта В.М., Лян XH, Мурти В.В., Пинкус Д.Л., Ю.В., Каянис Э. и др. (Июль 1999 г.). «Клонирование и геномная организация беклина 1, кандидата гена-супрессора опухоли на хромосоме 17q21». Геномика. 59 (1): 59–65. Дои:10.1006 / geno.1999.5851. PMID  10395800.
• Лян XH, Джексон С., Симан М., Браун К., Кемпкес Б., Хибшош Х., Левин Б. (декабрь 1999 г.). «Индукция аутофагии и ингибирование онкогенеза беклином 1». Природа. 402 (6762): 672–6. Bibcode:1999Натура 402..672л. Дои:10.1038/45257. PMID  10604474. S2CID  4423132.
• Кихара А., Кабея Ю., Осуми Ю., Йошимори Т. (апрель 2001 г.). «Комплекс беклин-фосфатидилинозитол-3-киназа функционирует в транс-сети Гольджи». EMBO отчеты. 2 (4): 330–5. Дои:10.1093 / embo-reports / kve061. ЧВК  1083858. PMID  11306555.
• Лян XH, Ю Дж, Браун К., Левин Б. (апрель 2001 г.). «Беклин 1 содержит богатый лейцином сигнал ядерного экспорта, который необходим для его функции аутофагии и подавления опухолей». Исследования рака. 61 (8): 3443–9. PMID  11309306.
• Вайнманн А.С., Бартли С.М., Чжан Т., Чжан М.К., Фарнхэм П.Дж. (октябрь 2001 г.). «Использование иммунопреципитации хроматина для клонирования новых промоторов-мишеней E2F». Молекулярная и клеточная биология. 21 (20): 6820–32. Дои:10.1128 / MCB.21.20.6820-6832.2001. ЧВК  99859. PMID  11564866.
• Юэ З., Хортон А., Бравин М., Де Ягер П.Л., Селими Ф., Хайнц Н. (август 2002 г.). «Новый белковый комплекс, связывающий дельта-2-глутаматный рецептор и аутофагию: последствия для нейродегенерации у мышей Lurcher». Нейрон. 35 (5): 921–33. Дои:10.1016 / S0896-6273 (02) 00861-9. PMID  12372286. S2CID  10534933.
• Сун Х, Ся С.Л., Ляо Ц., Ли Ю.Л., Ван Ю.Ф., Ли Т.П., Чжао MJ (февраль 2004 г.). «Гены, кодирующие Pir51, Beclin 1, RbAp48 и альдолазу b, имеют повышенную или понижающую регуляцию при первичной гепатоцеллюлярной карциноме человека». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 10 (4): 509–13. Дои:10.3748 / wjg.v10.i4.509. ЧВК  4716970. PMID  14966907.
• Скарлатти Ф., Бови С., Вентрути А., Сала Дж., Клюзо Ф., Вандевалле А. и др. (Апрель 2004 г.). «Макроаутофагия, опосредованная церамидами, включает ингибирование протеинкиназы B и активацию беклина 1». Журнал биологической химии. 279 (18): 18384–91. Дои:10.1074 / jbc.M313561200. PMID  14970205.
• Фуруя Д., Цудзи Н., Ягихаши А., Ватанабэ Н. (июль 2005 г.). «Беклин 1 усилил индуцированный цис-диамминдихлороплатином апоптоз за счет усиления активности каспазы-9». Экспериментальные исследования клеток. 307 (1): 26–40. Дои:10.1016 / j.yexcr.2005.02.023. PMID  15922724.
• Kruse KB, Brodsky JL, McCracken AA (январь 2006 г.). «Характеристика гена ERAD как VPS30 / ATG6 выявляет два альтернативных и функционально различных пути контроля качества белка: один для растворимого варианта Z человеческого ингибитора альфа-1 протеиназы (A1PiZ), а другой - для агрегатов A1PiZ». Молекулярная биология клетки. 17 (1): 203–12. Дои:10.1091 / mbc.E04-09-0779. ЧВК  1345659. PMID  16267277.
• Цзэн X, Овермейер JH, Мальтийский WA (январь 2006 г.). «Функциональная специфичность комплекса Beclin-Vps34 PI 3-киназы млекопитающих в макроаутофагии по сравнению с эндоцитозом и перемещением лизосомальных ферментов». Журнал клеточной науки. 119 (Pt 2): 259–70. Дои:10.1242 / jcs.02735. PMID  16390869.
• Сибата М., Лу Т., Фуруя Т., Дегтерев А., Мидзусима Н., Йошимори Т. и др. (Май 2006 г.). «Регулирование внутриклеточного накопления мутантного Хантингтина с помощью Беклина 1». Журнал биологической химии. 281 (20): 14474–85. Дои:10.1074 / jbc.M600364200. PMID  16522639.
• Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руаль Дж. Ф. и др. (Май 2006 г.). «Сеть белок-белкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Ячейка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID  16713569. S2CID  13709685.
• Daniel F, Legrand A, Pessayre D, Vadrot N, Descatoire V, Bernuau D (май 2006 г.). «Частичное замалчивание Beclin 1 усугубляет апоптоз, индуцированный доксорубицином и Fas, в клетках HepG2». Всемирный журнал гастроэнтерологии. 12 (18): 2895–900. Дои:10.3748 / wjg.v12.i18.2895. ЧВК  4087807. PMID  16718815.

внешние ссылки

• Человек BECN1 расположение генома и BECN1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt: Q14457 (Беклин-1) на PDBe-KB.