BOP1 - BOP1

BOP1
Идентификаторы
ПсевдонимыBOP1, блок пролиферации 1, фактор биогенеза рибосом BOP1
Внешние идентификаторыOMIM: 610596 MGI: 1334460 ГомолоГен: 6612 Генные карты: BOP1
Расположение гена (человек)
Хромосома 8 (человек)
Chr.Хромосома 8 (человек)[1]
Хромосома 8 (человек)
Геномное расположение BOP1
Геномное расположение BOP1
Группа8q24.3Начните144,262,045 бп[1]
Конец144,291,438 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE BOP1 212563 в формате fs.png

PBB GE BOP1 216397 s at fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez
Ансамбль
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_015201

NM_013481

RefSeq (белок)

NP_056016

NP_038509

Расположение (UCSC)Chr 8: 144.26 - 144.29 МбChr 15: 76.45 - 76.48 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Белок биогенеза рибосом BOP1 это белок что у людей кодируется BOP1 ген.[5][6]

Функция

Это WD40 повторить -содержащий ядрышковый белок, участвующий в процессинге рРНК, тем самым контролируя ячейка цикл.[7] Требуется для созревания 25С и 5,8С рибосомальный РНК. Это может служить важным фактором в рибосома образование, которое координирует процессинг спейсерных областей в пре-рРНК. Пес1-Боп1 сложный состоит из нескольких компонентов: BOP1, GRWD1, PES1, ORC6L, и RPL3 и участвует в рибосомах биогенез и изменил сегрегация хромосом. Сверхэкспрессия BOP1 увеличивает процент многополюсные шпиндели в человеческие клетки. Нарушение регуляции пути BOP1 может способствовать колоректальному опухолеобразованию у люди.[8] Повышенные уровни Bop1 индуцируют субкомплексы Bop1 / WDR12 и Bop1 / Pes1, а сборка и целостность комплекса PeBoW очень чувствительны к изменениям в уровнях белка Bop1.[9]

Ноп7п-Erb1p -Ytm1p, обнаруженный в дрожжах, потенциально является гомологичный комплекс Pes1-Bop1-WDR12, поскольку он участвует в контроле биогенеза рибосом и Фаза S вход. Целостность комплекса PeBoW необходима для биогенеза рибосом и пролиферации клеток в млекопитающее клетки.[10] В лямблиях виды конкретный цитоскелет белок, бета-гиардин, взаимодействует с Bop1.[7]

Структура

BOP1NT
Идентификаторы
СимволBOP1NT
PfamPF08145
ИнтерПроIPR012953

BOP1 содержит консервативный N-концевой домен, BOP1NT.

использованная литература

  1. ^ а б c ENSG00000285301 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000261236, ENSG00000285301 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022557 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (март 1996 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК Res. 2 (4): 167–74, 199–210. Дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID  8590280.
  6. ^ «Энтрез Ген: блок пролиферации BOP1 1».
  7. ^ а б Ким Дж., Гу Си, Чунг Х. Дж., Ян Х. В., Йонг Т. С., Ли К. Х., Пак С. Дж. (Январь 2006 г.). «Взаимодействие бета-гиардина с белком Bop1 в Giardia lamblia». Паразитол. Res. 98 (2): 138–44. Дои:10.1007 / s00436-005-0040-8. PMID  16362343. S2CID  24519868.
  8. ^ Killian A, Sarafan-Vasseur N, Sesboüé R, Le Pessot F, Blanchard F, Lamy A, Laurent M, Flaman JM, Frébourg T (сентябрь 2006 г.). «Вклад гена BOP1, расположенного на 8q24, в колоректальный онкогенез». Гены Хромосомы Рак. 45 (9): 874–81. Дои:10.1002 / gcc.20351. PMID  16804918. S2CID  38299400.
  9. ^ Рормозер М., Хельцель М., Гримм Т., Маламусси А., Харасим Т., Орбан М., Пфистерер И., Грубер-Эбер А., Креммер Е., Эйк Д. (май 2007 г.). «Взаимозависимость Pes1, Bop1 и WDR12 контролирует локализацию ядрышек и сборку комплекса PeBoW, необходимого для созревания 60S субъединицы рибосомы». Мол. Cell. Биол. 27 (10): 3682–94. Дои:10.1128 / MCB.00172-07. ЧВК  1899993. PMID  17353269.
  10. ^ Hölzel M, Rohrmoser M, Schlee M, Grimm T., Harasim T., Malamoussi A, Gruber-Eber A., ​​Kremmer E, Hiddemann W., Bornkamm GW, Eick D. (август 2005 г.). «WDR12 млекопитающих является новым членом комплекса Pes1-Bop1 и необходим для биогенеза рибосом и пролиферации клеток». J. Cell Biol. 170 (3): 367–78. Дои:10.1083 / jcb.200501141. ЧВК  2171466. PMID  16043514.

внешние ссылки

дальнейшее чтение

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR012953