CDK5R1 - CDK5R1

CDK5R1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1H4L, 1UNG, 1UNH, 1UNL, 3O0G
Идентификаторы
Псевдонимы	CDK5R1, CDK5P35, CDK5R, NCK5A, p23, p25, p35, p35nck5a, циклин-зависимая киназа 5, регуляторная субъединица 1 (p35), регуляторная субъединица 1 циклин-зависимой киназы 5
Внешние идентификаторы	OMIM: 603460 MGI: 101764 ГомолоГен: 31200 Генные карты: CDK5R1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q11.2 Начните 32,486,993 бп[1] Конец 32,491,253 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 B5 | 11 47,94 см Начните 80,477,023 бп[2] Конец 80,481,184 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность протеинкиназы • связывание ионов кальция • связывание рецептора эфрина • связывание кадгерина • GO: 0016534 Активность активатора циклинзависимой протеин-серин / треонинкиназы • киназная активность • GO: 0001948 связывание с белками • связывание протеинкиназы • активность активатора протеин-серин / треонинкиназы • связывание протеазы • связывание актина • связывание ионотропных рецепторов глутамата • связывание альфа-тубулина • связывание бета-тубулина • связывание актиновой нити • активность активатора протеинкиназы Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • мембрана • GO: 0097483, GO: 0097481 постсинаптическая плотность • внутриклеточная мембраносвязанная органелла • конус роста • нервно-мышечное соединение • дендритный позвоночник • аксон • тело нейрональной клетки • дендрит • холоферментный комплекс циклинзависимой протеинкиназы 5 • перинуклеарная область цитоплазмы • сократительное волокно • ядро клетки • нуклеоплазма • клеточная мембрана • микротрубочки • проекция нейрона • пресинапс Биологический процесс • положительная регуляция активности протеинкиназы • регуляция дифференцировки нейронов • Связанный с G-белком сигнальный путь ацетилхолинового рецептора • регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • регуляция организации актинового цитоскелета • развитие эмбриона • ритмический процесс • сигнальный путь рецептора эфрина • клеточная адгезия нейрона • регуляция организации цитоскелета микротрубочек • миграция нейронов • развитие мозжечка • положительная регуляция активности протеин-серин / треонинкиназы • положительная регуляция апоптотического процесса нейронов • развитие мозга • сигнальный путь ионотропного рецептора глутамата • формирование слоя в коре головного мозга • фосфорилирование пептидил-серина • дифференциация нейронов • клеточная пролиферация • фосфорилирование пептидил-треонина • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • развитие проекции нейрона • Радиально ориентированная миграция клеток коры головного мозга • аксональная фасцикуляция • развитие гиппокампа • отрицательная регуляция удлинения аксона • регуляция морфогенеза дендритного шипа • регуляция макроаутофагии • созревание высшего оливарного ядра • положительная регуляция остановки клеточного цикла • положительное регулирование нацеливания белков на мембрану • управление аксоном • регуляция передачи сигнала медиатором класса p53 • фосфорилирование серина белка STAT • организация цитоскелета микротрубочек • развитие эмбриона заканчивается рождением или вылуплением яйца • положительное регулирование полимеризации микротрубочек • положительная регуляция активности циклин-зависимой протеин-серин / треонинкиназы • регуляция цикла синаптических везикул • активация активности протеинкиназы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	8851	12569
Ансамбль	ENSG00000176749	ENSMUSG00000048895
UniProt	Q15078	P61809
RefSeq (мРНК)	NM_003885	NM_009871
RefSeq (белок)	NP_003876	NP_034001
Расположение (UCSC)	Chr 17: 32,49 - 32,49 Мб	Chr 11: 80.48 - 80.48 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Циклинзависимый активатор киназы 5 1 является фермент что у людей кодируется CDK5R1 ген.^[5][6]

Функция

Белок, кодируемый этим геном (p35), является нейрон-специфическим активатором циклин-зависимая киназа 5 (CDK5); активация CDK5 необходима для правильного развития центральной нервной системы. Форма p35 этого белка протеолитически расщепляется Кальпаин, генерируя форму p25. Расщепление p35 на p25 приводит к перемещению белка с периферии клетки в ядерные и перинуклеарные области. P25 нарушает регуляцию активности CDK5, продлевая его активацию и изменяя его клеточное местоположение. Форма p25 накапливается в нейронах головного мозга пациентов с болезнью Альцгеймера. Это накопление коррелирует с увеличением активности киназы CDK5 и может приводить к аберрантно фосфорилированным формам белка тау, ассоциированного с микротрубочками, который способствует Болезнь Альцгеймера.^[6]

В меланоцитарных клетках экспрессия гена CDK5R1 может регулироваться MITF.^[7]

Взаимодействия

CDK5R1 был показан взаимодействовать с участием:

• Актинин, альфа 1^[8]
• Амфифизин,^[9]
• Бета-катенин,^[10]
• CAMK2A,^[11]
• CDK5RAP2,^[12]
• Циклинзависимая киназа 5,^[13][14]
• Белковый НАБОР,^[15]

Смотрите также

• CDK5RAP1
• CDK5RAP2
• CDK5RAP3

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000176749 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000048895 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Цай Л.Х., Делалль И., Кавинесс В.С. мл., Чае Т., Харлоу Э. (октябрь 1994 г.). «p35 представляет собой нервно-специфическую регуляторную субъединицу циклин-зависимой киназы 5». Природа. 371 (6496): 419–23. Дои:10.1038 / 371419a0. PMID  8090221. S2CID  4267944.
6. «Ген Entrez: CDK5R1 циклинзависимая киназа 5, регуляторная субъединица 1 (p35)».
7. Хук К.С., Шлегель Н.С., Эйххофф О.М. и др. (2008). «Новые мишени MITF идентифицированы с использованием двухэтапной стратегии ДНК-микрочипов». Пигментная клетка Melanoma Res. 21 (6): 665–76. Дои:10.1111 / j.1755-148X.2008.00505.x. PMID  19067971. S2CID  24698373.
8. Cheng K, Li Z, Fu WY, Wang JH, Fu AK, Ip NY (август 2002 г.). «Pctaire1 взаимодействует с p35 и является новым субстратом для Cdk5 / p35». J. Biol. Chem. 277 (35): 31988–93. Дои:10.1074 / jbc.M201161200. PMID  12084709.
9. Floyd SR, Porro EB, Slepnev VI, Ochoa GC, Tsai LH, De Camilli P (март 2001 г.). «Амфифизин 1 связывает регуляторную субъединицу p35 циклин-зависимой киназы (cdk) 5 и фосфорилируется cdk5 и cdc2». J. Biol. Chem. 276 (11): 8104–10. Дои:10.1074 / jbc.M008932200. PMID  11113134.
10. Kesavapany S, Lau KF, McLoughlin DM, Brownlees J, Ackerley S, Leigh PN, Shaw CE, Miller CC (январь 2001 г.). «p35 / cdk5 связывает и фосфорилирует бета-катенин и регулирует взаимодействие бета-катенин / пресенилин-1». Евро. J. Neurosci. 13 (2): 241–7. Дои:10.1046 / j.1460-9568.2001.01376.x. PMID  11168528.
11. Дхаван Р., Грир П.Л., Морабито М.А., Орландо Л.Р., Цай Л.Х. (сентябрь 2002 г.). «Циклин-зависимые активаторы киназы 5 p35 и p39 взаимодействуют с альфа-субъединицей Са2 + / кальмодулин-зависимой протеинкиназы II и альфа-актинина-1 кальций-зависимым образом». J. Neurosci. 22 (18): 7879–91. Дои:10.1523 / JNEUROSCI.22-18-07879.2002. ЧВК  6758084. PMID  12223541.
12. Ван Х, Цзин Ю.П., Лам У.Х., Ци З., Чжан М., Ван Дж.Х. (октябрь 2000 г.). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5». J. Biol. Chem. 275 (41): 31763–9. Дои:10.1074 / jbc.M004358200. PMID  10915792.
13. Чен Ф., Студзинский Г.П. (июнь 2001 г.). «Экспрессия нейронального активатора циклин-зависимой киназы 5 p35Nck5a в моноцитарных клетках человека связана с дифференцировкой». Кровь. 97 (12): 3763–7. Дои:10.1182 / blood.V97.12.3763. PMID  11389014.
14. Tarricone C, Dhavan R, Peng J, Areces LB, Tsai LH, Musacchio A (сентябрь 2001 г.). «Структура и регуляция комплекса CDK5-p25 (nck5a)». Мол. Ячейка. 8 (3): 657–69. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4. PMID  11583627.
15. Цюй Д., Ли К., Лим Х.Й., Чунг Н.С., Ли Р., Ван Дж.Х., Ци Р.З. (март 2002 г.). «Белок SET связывает нейрональный активатор Cdk5 p35nck5a и модулирует активность Cdk5 / p35nck5a». J. Biol. Chem. 277 (9): 7324–32. Дои:10.1074 / jbc.M107270200. PMID  11741927.

дальнейшее чтение

• Перуцци Ф., Гордон Дж., Дарбинян Н., Амини С. (2003). «Tat-индуцированная дерегуляция нейрональной дифференцировки и выживания посредством пути фактора роста нервов». J. Neurovirol. 8 Дополнение 2 (2): 91–6. Дои:10.1080/13550280290167885. PMID  12491158.
• Студзинский Г.П., Харрисон Дж.С. (2003). «Нейрональный активатор циклин-зависимой киназы 5 p35Nck5a и активность Cdk5 в моноцитарных клетках». Лейк. Лимфома. 44 (2): 235–40. Дои:10.1080/1042819021000030009. PMID  12688339. S2CID  30242995.
• Такахаши М., Томидзава К., Сато К. и др. (1995). «Новая тау-тубулинкиназа из головного мозга крупного рогатого скота». FEBS Lett. 372 (1): 59–64. Дои:10.1016/0014-5793(95)00955-9. PMID  7556643. S2CID  42295269.
• Тан Д, Юнг Дж, Ли КИ и др. (1995). «Изоформа нейронального активатора циклин-зависимой киназы 5 (Cdk5)». J. Biol. Chem. 270 (45): 26897–903. Дои:10.1074 / jbc.270.45.26897. PMID  7592934.
• Чае Т., Квон Ю.Т., Бронсон Р. и др. (1997). «Мыши, лишенные p35, нейронного специфического активатора Cdk5, демонстрируют дефекты коркового ламинирования, судороги и летальность взрослых». Нейрон. 18 (1): 29–42. Дои:10.1016 / S0896-6273 (01) 80044-1. PMID  9010203. S2CID  18685470.
• Пун Р.Й., Лью Дж., Хантер Т. (1997). «Идентификация функциональных доменов в нейрональном белке-активаторе Cdk5». J. Biol. Chem. 272 (9): 5703–8. Дои:10.1074 / jbc.272.9.5703. PMID  9038181.
• Флетчер А.И., Шуанг Р., Джованнуччи Д.Р. и др. (1999). «Регулирование экзоцитоза с помощью циклин-зависимой киназы 5 посредством фосфорилирования Munc18». J. Biol. Chem. 274 (7): 4027–35. Дои:10.1074 / jbc.274.7.4027. PMID  9933594.
• Патрик Г. Н., Цукерберг Л., Николич М. и др. (2000). «Превращение p35 в p25 нарушает регуляцию активности Cdk5 и способствует нейродегенерации». Природа. 402 (6762): 615–22. Дои:10.1038/45159. PMID  10604467. S2CID  4414281.
• Чинг Ю.П., Ци З., Ван Дж.Х. (2000). «Клонирование трех новых нейрональных белков, связывающих активатор Cdk5». Ген. 242 (1–2): 285–94. Дои:10.1016 / S0378-1119 (99) 00499-0. PMID  10721722.
• Квон Ю.Т., Гупта А., Чжоу Ю. и др. (2000). «Регуляция N-кадгерин-опосредованной адгезии с помощью киназы p35-Cdk5». Curr. Биол. 10 (7): 363–72. Дои:10.1016 / S0960-9822 (00) 00411-5. PMID  10753743. S2CID  16438320.
• Ли М.С., Квон Ю.Т., Ли М. и др. (2000). «Нейротоксичность вызывает расщепление p35 до p25 кальпаином». Природа. 405 (6784): 360–4. Дои:10.1038/35012636. PMID  10830966. S2CID  205006589.
• Ван X, Чинг Ю.П., Лам WH и др. (2000). «Идентификация общей области ассоциации белков в нейрональном активаторе Cdk5». J. Biol. Chem. 275 (41): 31763–9. Дои:10.1074 / jbc.M004358200. PMID  10915792.
• Флойд С.Р., Порро Е.Б., Слепнев В.И. и др. (2001). «Амфифизин 1 связывает регуляторную субъединицу p35 циклин-зависимой киназы (cdk) 5 и фосфорилируется cdk5 и cdc2». J. Biol. Chem. 276 (11): 8104–10. Дои:10.1074 / jbc.M008932200. PMID  11113134.
• Кесавапани С., Лау К.Ф., Маклафлин Д.М. и др. (2001). «p35 / cdk5 связывает и фосфорилирует бета-катенин и регулирует взаимодействие бета-катенин / пресенилин-1». Евро. J. Neurosci. 13 (2): 241–7. Дои:10.1046 / j.1460-9568.2001.01376.x. PMID  11168528.
• Чен Ф, Студзинский Г.П. (2001). «Экспрессия нейронального активатора циклин-зависимой киназы 5 p35Nck5a в моноцитарных клетках человека связана с дифференцировкой». Кровь. 97 (12): 3763–7. Дои:10.1182 / blood.V97.12.3763. PMID  11389014.
• Tarricone C, Dhavan R, Peng J, et al. (2001). «Структура и регуляция комплекса CDK5-p25 (nck5a)». Мол. Ячейка. 8 (3): 657–69. Дои:10.1016 / S1097-2765 (01) 00343-4. PMID  11583627.
• Рашид Т., Банерджи М., Николич М. (2002). «Фосфорилирование Pak1 киназой p35 / Cdk5 влияет на морфологию нейронов». J. Biol. Chem. 276 (52): 49043–52. Дои:10.1074 / jbc.M105599200. PMID  11604394.
• Qu D, Li Q, Lim HY и др. (2002). «Белок SET связывает нейрональный активатор Cdk5 p35nck5a и модулирует активность Cdk5 / p35nck5a». J. Biol. Chem. 277 (9): 7324–32. Дои:10.1074 / jbc.M107270200. PMID  11741927.
• Пацке Х, Цай ЛХ (2002). «Кальпаин-опосредованное расщепление циклин-зависимого активатора киназы-5 с p39 до p29». J. Biol. Chem. 277 (10): 8054–60. Дои:10.1074 / jbc.M109645200. PMID  11784720.

внешние ссылки

• Человек CDK5R1 расположение генома и CDK5R1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.