CKAP4 - CKAP4

CKAP4
Идентификаторы
ПсевдонимыCKAP4, CLIMP-63, ERGIC-63, p63, белок 4, связанный с цитоскелетом, белок 4, связанный с цитоскелетом, CLIMP63
Внешние идентификаторыMGI: 2444926 ГомолоГен: 4970 Генные карты: CKAP4
Расположение гена (человек)
Хромосома 12 (человек)
Chr.Хромосома 12 (человек)[1]
Хромосома 12 (человек)
Геномное расположение CKAP4
Геномное расположение CKAP4
Группа12q23.3Начните106,237,881 бп[1]
Конец106,304,279 бп[1]
Экспрессия РНК шаблон
PBB GE CKAP4 200999 s at fs.png

PBB GE CKAP4 200998 s на fs.png
Дополнительные данные эталонного выражения
Ортологи
ВидыЧеловекМышь
Entrez

10970

216197

Ансамбль

ENSG00000136026

ENSMUSG00000046841

UniProt

Q07065

Q8BMK4

RefSeq (мРНК)

NM_006825

NM_175451

RefSeq (белок)

NP_006816

NP_780660

Расположение (UCSC)Chr 12: 106,24 - 106,3 МбChr 10: 84,53 - 84,53 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Цитоскелет-ассоциированный белок 4 это белок что у людей кодируется CKAP4 ген.[5][6]

CKAP4 также исторически известен как CLIMP-63 (мембранный белок 63, связывающий цитоскелет), или просто p63 (в 1990-е гг.) - обильный тип II трансмембранный белок проживает преимущественно в эндоплазматический ретикулум (ER) эукариотических клеток и кодируется у высших позвоночных геном CKAP4.[7][8][9][10][11]

Открытие

CLIMP-63 был обнаружен в начале 1990-х годов как самый S-пальмитоилированный белок во время митоз,[12][13] Тем не менее, эффект этой модификации на сегодняшний день остается неясным. CLIMP-63 широко изучался в 1990-х годах группой Ханса-Петера Хаури (Базельский университет, Швейцария), который охарактеризовал жизнь CLIMP-63 в ER. Совсем недавно различные группы также сообщили о присутствии CLIMP-63 в плазматическая мембрана действует как рецептор, активируемый лигандом.[14][15][16] CLIMP-63 теперь описан как маркер различных видов рака.[17]

Локализация, молекулярные функции и регуляция

Распределение клеток CLIMP-63 было оценено (и повторно оценено) несколько раз за последние два десятилетия. Белок включает цитозольный сегмент, состоящий из положительно заряженной аминокислоты (2–23), которая может действовать как преобладающий мотив для укладки и локализации ER.[18][19] Кроме того, CLIMP-63 был одним из первых обнаруженных ER-образующие белки.[20] и в основном известен своим участием в создании и обслуживании таблиц ER [20][21] Считается, что это происходит после димеризации просвета CLIMP-63. КАТУШКА домены в СНГ (два белка CLIMP-63 одного и того же мембранного слоя ER) и / или транс (между двумя разными слоями мембраны ER, через просвет ER).[20] Кроме того, мультимеризация может ограничить распространение CLIMP-63 из ER-листов.[22]

Также было показано, что CLIMP-63 связывает микротрубочки через свою цитоплазматическую беспорядочный tail, который может помочь прикрепить ER-листы к цитоскелету. Это регулируется фосфорилирование по крайней мере трех сериновых остатков цитозольного хвоста CLIMP-63 (S3, S17 и S19), поскольку фосфорилирование мешает CLIMP-63 микротрубочка связывающая способность.[23]

Кроме того, CLIMP-63 может пройти еще одну посттрансляционная модификация, S-пальмитоилирование цистеина 100 его цитоплазматического домена. Пока только пальмитоилацилтрансфераза ZDHHC2 был идентифицирован как потенциальный регулятор пальмитоилирования CLIMP-63, но поскольку ZDHHC2 находится в основном на плазматической мембране, необходимы дополнительные исследования.[24][25] Последствия S-пальмитоилирования еще предстоит исследовать, но они могут играть роль в клеточном цикле, поскольку пальмитоилирование CLIMP-63, как сообщается, сильно усиливается во время митоза.[12]

Наконец, различные группы показали, что CLIMP-63 служит рецептором клеточной поверхности для различных внеклеточных лигандов, в частности для сурфактантный белок А (SP-A) в альвеолах легких,[15] тканевый активатор плазминогена (tPA) в клетках гладких мышц сосудов [14] и для антипролиферативный фактор (APF) в эпителиальных клетках мочевого пузыря пациентов с интерстициальный цистит беспорядок.[16]

Болезни

Совсем недавно CLIMP-63 был связан с различными типами прогнозов рака. Повышенная регуляция CLIMP-63 наблюдается в холангиоклеточный и гепатоцеллюлярный карцинома, и это коррелирует с появлением метастазов в лимфатических узлах.[17][26]

использованная литература

  1. ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000136026 - Ансамбль, Май 2017
  2. ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000046841 - Ансамбль, Май 2017
  3. ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. ^ Schweizer A, Rohrer J, Jenö P, DeMaio A, Buchman TG, Hauri HP (март 1993 г.). «Обратимо пальмитоилированный резидентный белок (p63) промежуточного компартмента ER-Golgi связан с реанимационным белком циркуляторного шока». Журнал клеточной науки. 104 (3): 685–94. PMID  8314870.
  6. ^ «Ген Entrez: белок 4, связанный с цитоскелетом CKAP4».
  7. ^ «Ген: CKAP4 (ENSG00000136026) - Резюме - Homo sapiens - Браузер генома ансамбля 89». may2017.archive.ensembl.org. Получено 2018-03-26.
  8. ^ "Ген: Ckap4 (ENSMUSG00000046841) - Резюме - Mus musculus - Браузер генома ансамбля 89". may2017.archive.ensembl.org. Получено 2018-03-26.
  9. ^ pubmeddev. «Ссылки PubMed для Гена (выберите 10970) - PubMed - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-03-26.
  10. ^ pubmeddev. «Ссылки PubMed для Гена (выберите 216197) - PubMed - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-03-26.
  11. ^ «Связанный с цитоскелетом CKAP4 белок 4 [Homo sapiens (человек)] - Ген - NCBI». www.ncbi.nlm.nih.gov. Получено 2018-03-26.
  12. ^ а б Манди Д.И., Уоррен Г. (январь 1992 г.). «Митоз и ингибирование внутриклеточного транспорта стимулируют пальмитоилирование белка массой 62 кДа». Журнал клеточной биологии. 116 (1): 135–46. Дои:10.1083 / jcb.116.1.135. ЧВК  2289273. PMID  1730740.
  13. ^ Schweizer A, Ericsson M, Bächi T, Griffiths G, Hauri HP (март 1993 г.). «Характеристика нового мембранного белка 63 кДа. Значение для организации пути ER-to-Golgi». Журнал клеточной науки. 104 (3): 671–83. PMID  8314869.
  14. ^ а б Razzaq TM, Bass R, Vines DJ, Werner F, Whawell SA, Ellis V (октябрь 2003 г.). «Функциональная регуляция тканевого активатора плазминогена на поверхности гладкомышечных клеток сосудов трансмембранным белком p63 типа II (CKAP4)». Журнал биологической химии. 278 (43): 42679–85. Дои:10.1074 / jbc.M305695200. PMID  12913003.
  15. ^ а б Гупта Н., Маневич Ю., Кази А.С., Тао Дж. К., Фишер А.Б., Бейтс С.Р. (сентябрь 2006 г.). «Идентификация и характеристика p63 (CKAP4 / ERGIC-63 / CLIMP-63), белка, связывающего сурфактантный белок А, на пневмоцитах II типа». Американский журнал физиологии. Клеточная и молекулярная физиология легких. 291 (3): L436-46. Дои:10.1152 / ajplung.00415.2005. PMID  16556726.
  16. ^ а б Planey SL, Keay SK, Zhang CO, Zacharias DA (март 2009 г.). «Пальмитоилирование белка 4, связанного с цитоскелетом, посредством DHHC2, регулирует передачу сигналов, опосредованных антипролиферативным фактором». Молекулярная биология клетки. 20 (5): 1454–63. Дои:10.1091 / mbc.E08-08-0849. ЧВК  2649263. PMID  19144824.
  17. ^ а б Ли MH, Донг LW, Ли SX, Tang GS, Pan YF, Zhang J, Wang H, Zhou HB, Tan YX, Hu HP, Wang HY (сентябрь 2013 г.). «Экспрессия белка 4, связанного с цитоскелетом, связана с лимфатическими метастазами и указывает на прогноз пациентов с внутрипеченочной холангиокарциномой после хирургической резекции». Письма о раке. 337 (2): 248–53. Дои:10.1016 / j.canlet.2013.05.003. PMID  23665508.
  18. ^ Швейцер А., Рорер Дж., Хаури Х.П., Корнфельд С. (июль 1994 г.). «Удержание p63 в промежуточном компартменте ER-Golgi зависит от присутствия всех трех его доменов и от его способности образовывать олигомеры». Журнал клеточной биологии. 126 (1): 25–39. Дои:10.1083 / jcb.126.1.25. ЧВК  2120087. PMID  8027183.
  19. ^ Schweizer A, Rohrer J, Slot JW, Geuze HJ, Kornfeld S (июнь 1995 г.). «Переоценка субклеточной локализации p63». Журнал клеточной науки. 108 (6): 2477–85. PMID  7673362.
  20. ^ а б c Klopfenstein DR, Klumperman J, Lustig A, Kammerer RA, Oorschot V, Hauri HP (июнь 2001 г.). «Субдомен-специфическая локализация CLIMP-63 (p63) в эндоплазматическом ретикулуме опосредована его люминальным альфа-спиральным сегментом». Журнал клеточной биологии. 153 (6): 1287–300. Дои:10.1083 / jcb.153.6.1287. ЧВК  2192027. PMID  11402071.
  21. ^ Шибата Ю., Шемеш Т., Принц В.А., Палаццо А.Ф., Козлов М.М., Рапопорт Т.А. (ноябрь 2010 г.). «Механизмы, определяющие морфологию периферического ER». Ячейка. 143 (5): 774–88. Дои:10.1016 / j.cell.2010.11.007. ЧВК  3008339. PMID  21111237.
  22. ^ Никонов А.В., Хаури Х.П., Лауринг Б., Крейбич Г. (июль 2007 г.). «Climp-63-опосредованное связывание микротрубочек с ER влияет на латеральную подвижность транслоконных комплексов». Журнал клеточной науки. 120 (13): 2248–58. Дои:10.1242 / jcs.008979. PMID  17567679.
  23. ^ Ведренне С., Клопфенштейн Д.Р., Хаури Х.П. (апрель 2005 г.). «Фосфорилирование контролирует опосредованное CLIMP-63 прикрепление эндоплазматического ретикулума к микротрубочкам». Молекулярная биология клетки. 16 (4): 1928–37. Дои:10.1091 / mbc.E04-07-0554. ЧВК  1073672. PMID  15703217.
  24. ^ Чжан Дж., Плани С.Л., Себаллос С., Стивенс С.М., Ки С.К., Захариас Д.А. (июль 2008 г.). «Идентификация CKAP4 / p63 в качестве основного субстрата пальмитоилацилтрансферазы DHHC2, предполагаемого супрессора опухоли, с использованием нового метода протеомики». Молекулярная и клеточная протеомика. 7 (7): 1378–88. Дои:10.1074 / mcp.M800069-MCP200. ЧВК  2493380. PMID  18296695.
  25. ^ Sandoz PA, van der Goot FG (апрель 2015 г.). «Сколько жизней у КЛИМП-63?». Сделки Биохимического Общества. 43 (2): 222–8. Дои:10.1042 / BST20140272. ЧВК  4627503. PMID  25849921.
  26. ^ Li SX, Tang GS, Zhou DX, Pan YF, Tan YX, Zhang J, Zhang B, Ding ZW, Liu LJ, Jiang TY, Hu HP, Dong LW, Wang HY (май 2014 г.). «Прогностическое значение ассоциированного с цитоскелетом мембранного белка 4 и его пальмитоилацилтрансферазы DHHC2 в гепатоцеллюлярной карциноме». Рак. 120 (10): 1520–31. Дои:10.1002 / cncr.28593. PMID  24863391. S2CID  37070876.

дальнейшее чтение

внешняя ссылка