CLASP1 - CLASP1

CLASP1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 4K92
Идентификаторы
Псевдонимы	CLASP1, MAST1, цитоплазматический линкер-ассоциированный белок 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 605852 MGI: 1923957 ГомолоГен: 41024 Генные карты: CLASP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2q14.2-q14.3 Начните 121,337,776 бп[1] Конец 121,649,587 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 1 (мышь)[2] Группа 1 | 1 E2.3 Начните 118,389,058 бп[2] Конец 118,612,678 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • кинетохорное связывание • связывание дистрогликана • связывание микротрубочек • связывание плюсовых концов микротрубочек • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • Кинетохора конденсированной хромосомы • цитозоль • центросома • аппарат Гольджи • кинетохора микротрубочка • мембрана • цитоскелет кортикальных микротрубочек • очаговая адгезия • шпиндель • центросомная корона • хромосома • плюс-конец микротрубочки • центр организации микротрубочек • клеточная кора • микротрубочка веретена • цитоплазматическая микротрубочка • базальная кора • внеклеточная экзосома • хромосома, центромерная область • цитоскелет • микротрубочки • кинетохора Биологический процесс • установление полярности эпителиальных клеток • нацеливание на пузырьки • Организация Гольджи • GO: 0043148 организация митотического веретена • регуляция перехода эпителия в мезенхиму • регуляция организации цитоскелета микротрубочек • положительная регуляция миграции эпителиальных клеток • выход из митоза • деление клеток • установление или поддержание полярности клеток • положительная регуляция разборки внеклеточного матрикса • положительная регуляция сборки базальной мембраны, участвующей в морфогенезе эмбрионального тела • отрицательная регуляция деполимеризации микротрубочек • сборка митотического веретена • закрепление микротрубочек • G2 / M переход митотического клеточного цикла • образование пучка микротрубочек • отрицательная регуляция полимеризации или деполимеризации микротрубочек • положительное регулирование полимеризации микротрубочек • регулировка узла фокальной адгезии • негативная регуляция заживления ран, распространение клеток эпидермиса • клеточный цикл • положительная регуляция экзоцитоза • отрицательное регулирование сборки напряженных волокон • установление ориентации шпинделя • организация астральных микротрубочек • Организация центра организации микротрубочек • установление локализации митотического веретена • регулирование гаструляции • организация цитоскелета микротрубочек • зарождение микротрубочек • сцепление сестринских хроматид • стыковка цилиарного базального тела • регуляция G2 / M перехода митотического клеточного цикла Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	23332	76707
Ансамбль	ENSG00000074054	ENSMUSG00000064302
UniProt	Q7Z460	Q80TV8
RefSeq (мРНК)	NM_001142273 NM_001142274 NM_001207051 NM_015282 NM_001378003 NM_001378004 NM_001378005	NM_001081276 NM_001293300 NM_001293301 NM_029709 NM_177548 NM_001359328 NM_001359329 NM_001359330 NM_001359331 NM_001359334 NM_001359335 NM_001359336 NM_001359337 NM_001359338 NM_001359339 NM_001359340 NM_001359341 NM_001359342 NM_001359343 NM_001359345 NM_001359346 NM_001359347
RefSeq (белок)	NP_001135745 NP_001135746 NP_001193980 NP_056097 NP_001364932 NP_001364933 NP_001364934	NP_001280229 NP_001280230 NP_083985 NP_001346257 NP_001346258 NP_001346259 NP_001346260 NP_001346263 NP_001346264 NP_001346265 NP_001346266 NP_001346267 NP_001346268 NP_001346269 NP_001346270 NP_001346271 NP_001346272 NP_001346274 NP_001346275 NP_001346276
Расположение (UCSC)	Chr 2: 121,34 - 121,65 Мб	Chr 1: 118.39 - 118.61 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Цитоплазматический линкер-ассоциированный белок 1, также известен как CLASP1, это белок который у человека кодируется CLASP1 ген.^[5]

Функция

CLASP1 принадлежит семейству белки, ассоциированные с микротрубочками участвует в прикреплении микротрубочки к клеточная кора у животных^[6] и растения.^[7] CLASP, такие как CLASP1, взаимодействуют с CLIP (например, CLIP1 ). В клетках животных CLASP1 участвует в регуляции динамики микротрубочек на уровне кинетохора и во всем шпиндель.^[5][8] CLASP1 контролирует взаимодействия астральных микротрубочек с клеточной корой в митозе, что важно для правильного позиционирования и ориентации веретена.^[9]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000074054 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000064302 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: белок 1, связанный с цитоплазматическим линкером CLASP1».
6. Лансберген Г., Григорьев И., Мимори-Кийосуэ Ю. и др. (2006). "CLASP прикрепляют плюс концы микротрубочек к коре клетки через комплекс с LL5beta". Клетка развития. 11 (1): 21–32. Дои:10.1016 / j.devcel.2006.05.012. PMID  16824950.
7. Амброуз Дж. К., Wasteneys GO (2008). «CLASP модулирует взаимодействие микротрубочек и коры головного мозга во время самоорганизации ацентросомных микротрубочек». Молекулярная биология клетки. 19 (11): 4730–4737. Дои:10.1091 / mbc.E08-06-0665. ЧВК  2575154. PMID  18716054.
8. Майато Х., Фэрли Э.А., Ридер С.Л., Сведлоу Дж.Р., Санкель С.Э., Эрншоу В.К. (июнь 2003 г.). «Человеческий CLASP1 - это внешний кинетохорный компонент, который регулирует динамику микротрубочек веретена». Ячейка. 113 (7): 891–904. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00465-3. PMID  12837247.
9. Самора, Катарина П .; Могесси, Биньям; Конвей, Лесли; Росс, Дженнифер Л .; Штраубе, Энн; Макаинш, Эндрю Д. (7 августа 2011 г.). «MAP4 и CLASP1 действуют как предохранительный механизм для поддержания стабильного положения веретена в митозе». Природа клеточной биологии. 13 (9): 1040–1050. Дои:10.1038 / ncb2297. PMID  21822276. S2CID  8869880.

внешние ссылки

• Человек CLASP1 расположение генома и CLASP1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Человек МАСТ1 расположение генома и МАСТ1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Амброуз Дж. К., Wasteneys GO (2008). «CLASP модулирует взаимодействие микротрубочек и коры головного мозга во время самоорганизации ацентросомных микротрубочек». Клетка Mol Biol. 19 (11): 4730–4737. Дои:10.1091 / mbc.E08-06-0665. ЧВК  2575154. PMID  18716054.
• Гальярт Н (2005). «CLIP и CLASP и сотовая динамика». Nat. Преподобный Мол. Cell Biol. 6 (6): 487–98. Дои:10.1038 / nrm1664. PMID  15928712. S2CID  23216754.
• Исикава К., Нагасе Т., Суяма М. и др. (1998). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. X. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые могут кодировать большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (3): 169–76. Дои:10.1093 / dnares / 5.3.169. PMID  9734811.
• Лемос С.Л., Сампайо П., Майато Х. и др. (2000). «Маст, консервативный белок, связанный с микротрубочками, необходимый для организации биполярного митотического веретена». EMBO J. 19 (14): 3668–82. Дои:10.1093 / emboj / 19.14.3668. ЧВК  313969. PMID  10899121.
• Ахманова А., Hoogenraad CC, Драбек К. и др. (2001). «Кламмеры представляют собой связывающие белки CLIP-115 и -170, участвующие в региональной регуляции динамики микротрубочек в подвижных фибробластах». Ячейка. 104 (6): 923–35. Дои:10.1016 / S0092-8674 (01) 00288-4. PMID  11290329.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Maiato H, Fairley EA, Rieder CL и др. (2003). «Человеческий CLASP1 - это внешний кинетохорный компонент, который регулирует динамику микротрубочек веретена». Ячейка. 113 (7): 891–904. Дои:10.1016 / S0092-8674 (03) 00465-3. PMID  12837247.
• Майато Х., Ридер С.Л., Эрншоу В.С., Санкель С.Е. (2004). "Как кинетохоры CLASP динамические микротрубочки?". Клеточный цикл. 2 (6): 511–4. Дои:10.4161 / cc.2.6.576. PMID  14504462.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С. и др. (2004). «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Curr. Биол. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Мимори-Кийосуэ Ю., Григорьев И., Лансберген Г. и др. (2005). «CLASP1 и CLASP2 связываются с EB1 и регулируют динамику плюс-конца микротрубочек в коре головного мозга». J. Cell Biol. 168 (1): 141–53. Дои:10.1083 / jcb.200405094. ЧВК  2171674. PMID  15631994.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Венейбл Дж. П., Буржуа К. Ф., Дэлглиш С. и др. (2005). «Повышающая регуляция повсеместного альтернативного фактора сплайсинга Tra2beta вызывает включение экзона, специфичного для половых клеток». Гм. Мол. Genet. 14 (16): 2289–303. Дои:10.1093 / hmg / ddi233. PMID  16000324.
• Аонума М., Миямото М., Иноуэ Ю.Х. и др. (2006). «Образование пучка микротрубочек и гибель клеток, индуцированные N-концевым фрагментом CLASP / орбиты человека». Сотовая структура. Funct. 30 (1): 7–13. Дои:10.1247 / csf.30.7. PMID  16145243.
• Лансберген Г., Григорьев И., Мимори-Кийосуэ Ю. и др. (2006). «CLASP прикрепляют плюс концы микротрубочек к коре клетки через комплекс с LL5beta». Dev. Ячейка. 11 (1): 21–32. Дои:10.1016 / j.devcel.2006.05.012. PMID  16824950.
• Мимори-Киёсуэ Ю., Григорьев И., Сасаки Х. и др. (2006). «CLASP млекопитающих необходимы для организации митотического веретена и выравнивания кинетохор». Гены Клетки. 11 (8): 845–57. Дои:10.1111 / j.1365-2443.2006.00990.x. PMID  16866869. S2CID  33744175.
• Перейра А.Л., Перейра А.Дж., Майя А.Р. и др. (2007). «CLASP1 и CLASP2 млекопитающих сотрудничают для обеспечения верности митоза путем регулирования веретена и функции кинетохор». Мол. Биол. Ячейка. 17 (10): 4526–42. Дои:10.1091 / mbc.E06-07-0579. ЧВК  1635371. PMID  16914514.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.