COX6A1 - COX6A1

COX6A1
Идентификаторы
Псевдонимы	COX6A1, COX6A, COX6AL, CMTRID, субъединица цитохром с оксидазы 6A1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602072 MGI: 103099 ГомолоГен: 3219 Генные карты: COX6A1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.31 | 12q24.2 Начинать 120,438,090 бп[1] Конец 120,440,737 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 F | 5 56,06 см Начинать 115,345,642 бп[2] Конец 115,348,981 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • цитохром-с оксидазная активность • GO: 0010576 ферментный регулятор активности Сотовый компонент • мембрана • митохондриальная внутренняя мембрана • митохондрия • митохондриальный комплекс дыхательной цепи IV • неотъемлемый компонент мембраны Биологический процесс • производство метаболитов-предшественников и энергии • трансмембранный перенос ионов водорода • транспорт электронов в митохондриях, цитохром с в кислород • аэробного дыхания • GO: 0048552 регуляция каталитической активности • электронная транспортная цепь Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1337	12861
Ансамбль	ENSG00000111775	ENSMUSG00000041697
UniProt	P12074	P43024
RefSeq (мРНК)	NM_004373	NM_007748
RefSeq (белок)	NP_004364 NP_004364.2	NP_031774
Расположение (UCSC)	Chr 12: 120.44 - 120.44 Мб	Chr 5: 115.35 - 115.35 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица цитохром с оксидазы 6A1, митохондриальная это белок что у людей кодируется COX6A1 ген. Цитохром с оксидаза 6A1 является субъединицей цитохрома c оксидазный комплекс, также известный как Комплекс IV, последний фермент в митохондриальный электронная транспортная цепь. А мутация гена COX6A1 связан с рецессивный аксональная или смешанная форма Болезнь Шарко-Мари-Тута.^[5][6]

Структура

Ген COX6A1, расположенный на q-плече хромосома 12 в позиции 24.2, содержит 3 экзоны и составляет 2653 пар оснований в длину.^[5] Белок COX6A1 весит 12 кДа и состоит из 109 аминокислоты.^[7][8] Белок является субъединицей Комплекс IV, а гетеромерный комплекс, состоящий из 3 каталитических субъединиц, кодируемых митохондриальный гены и множественные структурные субъединицы, кодируемые ядерными генами. Этот ядерный ген кодирует полипептид 1 (изоформу печени) субъединицы VIa, а полипептид 1 обнаружен во всех немышечных тканях. Полипептид 2 (изоформа сердца / мышцы) субъединицы VIa кодируется другим геном, COX6A2, и присутствует только в поперечно-полосатые мышцы. Эти два полипептида имеют 66% идентичности аминокислотной последовательности.^[5]

Функция

Цитохром c оксидаза (ЦОГ) - конечный фермент митохондриальный дыхательная цепь. Это мультисубъединичный ферментный комплекс, который связывает перенос электронов от цитохрома. c к молекулярному кислороду и способствует протонному электрохимическому градиенту через внутреннюю митохондриальную мембрану, чтобы управлять АТФ синтез через протонодвижущая сила. Субъединицы, кодируемые митохондриями, осуществляют перенос электронов в протонной насосной активности. Функции ядерно-кодируемых субъединиц неизвестны, но они могут играть роль в регуляции и сборке комплекса.^[5]

Суммарная реакция:

4 Fe²⁺-цитохром c + 8 часов⁺_в + O₂ → 4 Fe³⁺-цитохром c + 2 часа₂O + 4 H⁺_из^[9]

Клиническое значение

А мутация приводящая к делеции 5 пар оснований в гене COX6A1, связана с Болезнь Шарко-Мари-Тута (CMT). ШМТ - наиболее распространенная наследственная невропатия, которая может быть результатом мутаций в более чем 30 различных локусах. Экспрессия COX6A1 значительно снижена у пораженных людей.^[10]

В Транс-активатор белка транскрипции (Tat) из Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) ингибирует цитохром c активность оксидазы (СОХ) в проницаемых митохондриях, выделенных из образцов печени, сердца и мозга как мыши, так и человека. Быстрая потеря мембранный потенциал (ΔΨ_м) возникает при субмикромолярных дозах Tat и цитохрома c высвобождается из митохондрий.^[11]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000111775 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041697 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: полипептид 1 субъединицы VIa цитохром с оксидазы COX6A1».
6. Эй Y, Хоггард Н., Берт Е., Джеймс Л. А., Варли Дж. М. (сентябрь 1997 г.). «Отнесение COX6A1 к 6p21 и псевдогена (COX6A1P) к 1p31.1 посредством гибридизации in situ и гибридов соматических клеток». Цитогенетика и клеточная генетика. 77 (3–4): 167–8. Дои:10.1159/000134565. PMID  9284905.
7. Zong NC, Li H, Li H, Lam MP, Jimenez RC, Kim CS, Deng N, Kim AK, Choi JH, Zelaya I, Liem D, Meyer D, Odeberg J, Fang C, Lu HJ, Xu T, Weiss J , Дуан Х., Улен М., Йейтс Дж. Р., Апвейлер Р., Ге Дж., Хермякоб Х., Пинг П. (октябрь 2013 г.). «Интеграция биологии кардиального протеома и медицины посредством специализированной базы знаний». Циркуляционные исследования. 113 (9): 1043–53. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.113.301151. ЧВК  4076475. PMID  23965338.
8. «Субъединица цитохром с оксидазы 6А1, митохондриальная». Атлас кардиоорганических белков (COPaKB). Архивировано из оригинал на 2018-07-20. Получено 2018-07-18.
9. Voet D, Voet JG, Pratt CW (2013). «Глава 18». Основы биохимии: жизнь на молекулярном уровне (4-е изд.). Хобокен, Нью-Джерси: Уайли. С. 581–620. ISBN  978-0-470-54784-7.
10. Tamiya G, Makino S, Hayashi M, Abe A, Numakura C, Ueki M, Tanaka A, Ito C, Toshimori K, Ogawa N, Terashima T, Maegawa H, Yanagisawa D, Tooyama I, Tada M, Onodera O, Hayasaka K (Сентябрь 2014 г.). «Мутация COX6A1 вызывает рецессивную аксональную или смешанную форму болезни Шарко-Мари-Тута». Американский журнал генетики человека. 95 (3): 294–300. Дои:10.1016 / j.ajhg.2014.07.013. ЧВК  4157141. PMID  25152455.
11. Lecoeur H, Borgne-Sanchez A, Chaloin O, El-Khoury R, ​​Brabant M, Langonné A, Porceddu M, Brière JJ, Buron N, Rebouillat D, Péchoux C, Deniaud A, Brenner C, Briand JP, Muller S, Rustin П, Якото Э (2012). «Белок Tat ВИЧ-1 непосредственно индуцирует проницаемость митохондриальной мембраны и инактивирует цитохром с оксидазу». Смерть и болезнь клеток. 3 (3): e282. Дои:10.1038 / cddis.2012.21. ЧВК  3317353. PMID  22419111.

дальнейшее чтение

• Hochstrasser DF, Frutiger S, Paquet N, Bairoch A, Ravier F, Pasquali C., Sanchez JC, Tissot JD, Bjellqvist B, Vargas R (декабрь 1992 г.). «Карта белков печени человека: справочная база данных, созданная путем микросеквенирования и сравнения гелей». Электрофорез. 13 (12): 992–1001. Дои:10.1002 / elps.11501301201. PMID  1286669. S2CID  23518983.
• Фабрици Дж. М., Сэдлок Дж., Хирано М., Мита С., Кога Й., Риццуто Р., Зевиани М., Шон Е. А. (октябрь 1992 г.). «Дифференциальная экспрессия генов, определяющих две изоформы субъединицы VIa цитохром с оксидазы человека». Ген. 119 (2): 307–12. Дои:10.1016 / 0378-1119 (92) 90288-Z. PMID  1327966.
• Fabrizi GM, Rizzuto R, Nakase H, Mita S, Kadenbach B., Schon EA (август 1989 г.). «Последовательность кДНК, определяющая субъединицу VIa цитохром с оксидазы человека». Исследования нуклеиновых кислот. 17 (15): 6409. Дои:10.1093 / nar / 17.15.6409. ЧВК  318308. PMID  2549515.
• Шмидт Т.Р., Джарадат С.А., Гудман М., Ломакс М.И., Гроссман Л.И. (июнь 1997 г.). «Молекулярная эволюция цитохром с оксидазы: изменение скорости среди изоформ субъединицы VIa». Молекулярная биология и эволюция. 14 (6): 595–601. Дои:10.1093 / oxfordjournals.molbev.a025798. PMID  9190060.
• Меранте Ф., Линг М., Дункан А.М., Дафф С., Робинсон Б.Х. (июнь 1997 г.). «Клонирование, характеристика и хромосомная локализация генов, связанных с субъединицей VIa цитохром с оксидазы печени человека». Геном. 40 (3): 325–31. Дои:10.1139 / g97-045. PMID  9202413.
• Вонг-Райли М., Го А., Бахман, штат Нью-Джерси, Ломакс, штат Мичиган (апрель 2000 г.). «Ген COX6A1 человека: анализ промотора, выделение кДНК и экспрессия в мозге обезьяны». Ген. 247 (1–2): 63–75. Дои:10.1016 / S0378-1119 (00) 00121-9. PMID  10773445.

внешняя ссылка

• Масс-спектрометрическая характеристика COX6A1 на COPaKB
• Человек COX6A1 расположение генома и COX6A1 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.
• Обзор всей структурной информации, доступной в PDB за UniProt: P12074 (Субъединица цитохром с оксидазы 6A1, митохондриальная) на PDBe-KB.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.