Центаврин, альфа 1 - Centaurin, alpha 1

ADAP1
Доступные конструкции PDB Поиск Human UniProt: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3FEH, 3FM8, 3LJU, 3MDB
Идентификаторы
Псевдонимы	ADAP1, CENTA1, GCS1L, p42IP4, Centaurin, alpha 1, ArfGAP с двойными доменами PH 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 608114 MGI: 2442201 ГомолоГен: 55997 Генные карты: ADAP1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 7 (человек)[1] Группа 7p22.3 Начните 897,900 бп[1] Конец 955,407 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 G2 Начните 139,271,876 бп[2] Конец 139,325,622 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase • инозитол 1,3,4,5 тетракисфосфат связывающий • связывание фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфата • связывание фосфатидилинозитола бисфосфата Сотовый компонент • цитоплазма • клеточная мембрана • ядро клетки • цитозоль Биологический процесс • GO: 0043087, GO: 0032313, GO: 0032319, GO: 0032314, GO: 0043088 регуляция активности GTPase • сигнальный путь рецептора клеточной поверхности • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	11033	231821
Ансамбль	ENSG00000105963	ENSMUSG00000056413
UniProt	O75689	н / д
RefSeq (мРНК)	NM_006869 NM_001284308 NM_001284309 NM_001284310 NM_001284311	NM_172723
RefSeq (белок)	NP_001271237 NP_001271238 NP_001271239 NP_001271240 NP_006860	н / д
Расположение (UCSC)	Chr 7: 0,9 - 0,96 Мб	Chr 5: 139,27 - 139,33 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Arf-GAP с белком, содержащим двойной домен PH 1 это белок что у людей кодируется ADAP1 ген.^[5][6]

Взаимодействия

Центаврин, альфа 1, как было показано взаимодействовать с участием:

• Казеинкиназа 1, альфа 1^[7][8]
• Нуклеолин,^[9]
• P110α,^[10]
• PRKCI,^[10]
• Протеинкиназа D1,^[10] и
• Протеинкиназа Mζ.^[10]

Модельные организмы

Модельные организмы были использованы при изучении функции ADAP1. Условный нокаутирующая мышь линия называется Adap1^{tm1a (EUCOMM) Wtsi} был создан на Wellcome Trust Sanger Institute.^[11] Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг^[12] для определения последствий удаления.^{[13][14][15][16]} Выполнены дополнительные экраны:

• Углубленное иммунологическое фенотипирование^[17]
• углубленное фенотипирование костей и хрящей^[18]

Adap1 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Все данные доступны на сайте.[12][17][18]
Инсулин	Нормальный
Гомозиготная жизнеспособность на P14	Нормальный
Гомозиготная фертильность	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный
Рентгенография	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный
Клиническая химия	Нормальный
Гематология 16 недель	Нормальный
Лейкоциты периферической крови 16 недель	Нормальный
Сальмонелла инфекция	Нормальный
Состав эпидермального иммунитета	Нормальный
Проблема гриппа	Аномальный

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000105963 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000056413 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Венкатесварлу К., Оати ПБ, Таваре Дж. М., Джексон Т. Р., Каллен П. Дж. (Июнь 1999 г.). «Идентификация центаурина-альфа1 как потенциального in vivo фосфатидилинозитол 3,4,5-трифосфат-связывающего белка, который функционально гомологичен белку, активирующему GTPase фактора ADP-рибозилирования дрожжей (ARF), Gcs1». Биохимический журнал. 340 (2): 359–63. Дои:10.1042/0264-6021:3400359. ЧВК  1220257. PMID  10333475.
6. «Энтрез Ген: Центаурин CENTA1, альфа 1».
7. Dubois T, Howell S, Zemlickova E, Aitken A (апрель 2002 г.). «Идентификация белков-партнеров, взаимодействующих с казеинкиназой Ialpha». Письма FEBS. 517 (1–3): 167–71. Дои:10.1016 / s0014-5793 (02) 02614-5. PMID  12062430. S2CID  84792445.
8. Дюбуа Т., Кераи П., Земличкова Е., Хауэлл С., Джексон Т.Р., Венкатесварлу К., Каллен П.Дж., Тайберт А.Б., Лароз Л., Роуч П.Дж., Эйткен А. (июнь 2001 г.). «Казеинкиназа I связывается с членами семейства центаурина-альфа фосфатидилинозитол 3,4,5-трифосфат-связывающих белков». Журнал биологической химии. 276 (22): 18757–64. Дои:10.1074 / jbc.M010005200. PMID  11278595.
9. Дюбуа Т., Земликова Е., Хауэлл С., Эйткен А. (февраль 2003 г.). «Центаурин-альфа 1 связывает in vitro и in vivo с нуклеолином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 301 (2): 502–8. Дои:10.1016 / s0006-291x (02) 03010-3. PMID  12565890.
10. Земликова Е., Дюбуа Т., Кераи П., Клоки С., Кроншоу А.Д., Уэйкфилд Р.И., Йоханнес Ф.Дж., Эйткен А. (август 2003 г.). «Центаурин-альфа (1) связывается с изоформами протеинкиназы C и фосфорилируется ими». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 307 (3): 459–65. Дои:10.1016 / s0006-291x (03) 01187-2. PMID  12893243.
11. Гердин А.К. (2010). «Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью». Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
12. «Международный консорциум по фенотипированию мышей».
13. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
14. Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
15. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
16. White JK, Gerdin AK, Karp NA, Ryder E, Buljan M, Bussell JN, Salisbury J, Clare S, Ingham NJ, Podrini C, Houghton R, Estabel J, Bottomley JR, Melvin DG, Sunter D, Adams NC, Sanger Institute Проект генетики мышей, Таннахилл Д., Логан Д.В., Макартур Д.Г., Флинт Дж., Махаджан В.Б., Цанг С.Х., Смит I, Ватт FM, Скарнес В.К., Дуган Джи, Адамс DJ, Рамирес-Солис Р., Брэдли А., Сталь КП (2013) . «Полногеномное поколение и систематическое фенотипирование мышей с нокаутом открывает новые роли для многих генов». Ячейка. 154 (2): 452–64. Дои:10.1016 / j.cell.2013.06.022. ЧВК  3717207. PMID  23870131.
17. «Консорциум иммунофенотипирования инфекций и иммунитета (3i)».
18. «Консорциум OBCD».

дальнейшее чтение

• Венкатесварлу К., Каллен П.Дж. (август 1999 г.). «Молекулярное клонирование и функциональная характеристика человеческого гомолога центаврина-альфа». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 262 (1): 237–44. Дои:10.1006 / bbrc.1999.1065. PMID  10448098.
• Дюбуа Т., Кераи П., Земличкова Е., Хауэлл С., Джексон Т.Р., Венкатесварлу К., Каллен П.Дж., Тайберт А.Б., Лароз Л., Роуч П.Дж., Эйткен А. (июнь 2001 г.). «Казеинкиназа I связывается с членами семейства центаурина-альфа фосфатидилинозитол 3,4,5-трифосфат-связывающих белков». Журнал биологической химии. 276 (22): 18757–64. Дои:10.1074 / jbc.M010005200. PMID  11278595.
• Седехизаде Ф., Ханк Т., Стрикер Р., Хорстмайер А., Бернштейн Х. Г., Райзер Г. (февраль 2002 г.). «Клеточная экспрессия и субклеточная локализация человеческого Ins (1,3,4,5) P (4) -связывающего белка, p42 (IP4), в человеческом мозге и в нейрональных клетках». Исследование мозга. Молекулярные исследования мозга. 99 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0169-328X (01) 00335-7. PMID  11869802.
• Уитли П., Гиббард А. М., Куманов Ф., Олдфилд С., Килгур Э. Э., Прествич Г. Д., Холман Г. Д. (апрель 2002 г.). «Идентификация центаврина-альфа2: фосфатидилинозитид-связывающего белка, присутствующего в жире, сердце и скелетных мышцах». Европейский журнал клеточной биологии. 81 (4): 222–30. Дои:10.1078/0171-9335-00242. PMID  12018390.
• Райзер Г., Бернштейн Г. Г. (декабрь 2002 г.). «Нейроны и бляшки пациентов с болезнью Альцгеймера высоко экспрессируют стыковочный белок нейрональной мембраны p42IP4 / центаурин альфа». NeuroReport. 13 (18): 2417–9. Дои:10.1097/00001756-200212200-00008. PMID  12499840. S2CID  24499944.
• Дюбуа Т., Земликова Е., Хауэлл С., Эйткен А. (февраль 2003 г.). «Центаурин-альфа 1 связывает in vitro и in vivo с нуклеолином». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 301 (2): 502–8. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 03010-3. PMID  12565890.
• Мацуда А., Сузуки Ю., Хонда Дж., Мурамацу С., Мацузаки О, Нагано И., Дои Т., Шимотохно К., Харада Т., Нисида Е., Хаяси Х, Сугано С. (май 2003 г.). «Крупномасштабная идентификация и характеристика человеческих генов, активирующих сигнальные пути NF-kappaB и MAPK». Онкоген. 22 (21): 3307–18. Дои:10.1038 / sj.onc.1206406. PMID  12761501.
• Земликова Е., Дюбуа Т., Кераи П., Клоки С., Кроншоу А.Д., Уэйкфилд Р.И., Йоханнес Ф.Дж., Эйткен А. (август 2003 г.). «Центаурин-альфа (1) связывается с изоформами протеинкиназы C и фосфорилируется ими». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 307 (3): 459–65. Дои:10.1016 / S0006-291X (03) 01187-2. PMID  12893243.
• Венкатесварлу К., Брандом К.Г., Лоуренс Дж.Л. (февраль 2004 г.). «Центаурин-альфа1 представляет собой in vivo фосфатидилинозитол-3,4,5-трифосфат-зависимый GTPase-активирующий белок для ARF6, который участвует в организации актинового цитоскелета» (PDF). Журнал биологической химии. 279 (8): 6205–8. Дои:10.1074 / jbc.C300482200. PMID  14625293. S2CID  34971745.
• Ханк Т., Стрикер Р., Седехизаде Ф, Райзер Г. (январь 2004 г.). «Идентификация структуры гена и субклеточной локализации человеческого центаврина альфа 2 и p42IP4, семейства двух высокогомологичных, Ins 1,3,4,5-P4- / PtdIns 3,4,5-P3-связывающих адаптерных белков» . Журнал нейрохимии. 88 (2): 326–36. Дои:10.1046 / j.1471-4159.2003.02143.x. PMID  14690521.
• Райзер G, Бернштейн HG (январь 2004 г.). «Измененная экспрессия белка p42IP4 / центаурин-альфа 1 в мозге при болезни Альцгеймера и возможное взаимодействие p42IP4 с нуклеолином». NeuroReport. 15 (1): 147–8. Дои:10.1097/00001756-200401190-00028. PMID  15106847. S2CID  23980496.
• Такер Е., Кернс Б., Чепмен С., Хаммонд Дж., Хауэлл А., Тайберт А. (октябрь 2004 г.). «Центаурин альфа-1 arf6 GAP представляет собой нейрональный актин-связывающий белок, который также функционирует посредством GAP-независимой активности, регулируя актиновый цитоскелет». Европейский журнал клеточной биологии. 83 (10): 541–54. Дои:10.1078/0171-9335-00416. PMID  15679100.
• Лоуренс Дж., Манделл С.Дж., Юн Х., Келли Э., Венкатесварлу К. (июнь 2005 г.). «Центаурин-альфа 1, белок, активирующий ГТФазу фактора АДФ-рибозилирования 6, ингибирует интернализацию бета 2-адренорецепторов». Молекулярная фармакология. 67 (6): 1822–8. Дои:10.1124 / моль.105.011338. PMID  15778454. S2CID  85844075.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Хаяси Х., Мацудзаки О, Мурамацу С., Цучия Й., Харада Т., Сузуки Ю., Сугано С., Мацуда А., Нисида Е. (январь 2006 г.). «Центаурин-альфа1 является фосфатидилинозитол-3-киназозависимым активатором митоген-активируемых протеинкиназ ERK1 / 2». Журнал биологической химии. 281 (3): 1332–7. Дои:10.1074 / jbc.M505905200. PMID  16287813.
• Седехизаде Ф, фон Клот С., Ханк Т., Райзер Г. (октябрь 2005 г.). «p42 (IP4) / кентаурин альфа1, специфический для мозга PtdIns (3,4,5) P3 / Ins (1,3,4,5) P4-связывающий белок: перенос через мембрану, индуцированный эпидермальным фактором роста, ингибируется стимуляцией рецептор тромбина, связанный с фосфолипазой C ". Нейрохимические исследования. 30 (10): 1319–30. Дои:10.1007 / s11064-005-8804-1. PMID  16341594. S2CID  12972048.