Кортиковирус - Corticovirus

Кортиковирус
2w0c capsid.png
Собранный капсид состоит из белков P2 и P3.[1]
Классификация вирусов е
(без рейтинга):Вирус
Область:Вариднавирия
Королевство:Bamfordvirae
Тип:Преплазмивирикота
Заказ:Винавиралес
Семья:Corticoviridae
Род:Кортиковирус
Типовой вид
Вирус псевдоальтеромонады PM2

Кортиковирус это род вирусы в семье Corticoviridae.[2] Кортиковирусы бактериофаги; то есть их естественные хозяева находятся бактерии. Род включает два вида, в том числе типовой вид Вирус псевдоальтеромонады PM2 (также известен как Фаг Pseudoalteromonas PM2 или же бактериофаг PM2).[2][3] Название происходит от латинского кора, кортицис (что означает «корка» или «кора»). Тем не мение, профаги тесно связанные с PM2, в изобилии присутствуют в геномах водных бактерий, что позволяет предположить, что экологическое значение кортиковирусов может быть недооценено.[4] Бактериофаг PM2 был впервые описан в 1968 г. после выделения из морская вода отобран с побережья Чили.[5]

Таксономия

Группа: dsDNA

[2]

Вирусология

Вироны состоят из круга, икосаэдр, без оболочки капсид диаметром 60 нм и внутренний липид мембрана расположен между внешним и внутренним белок ракушка.[6] Оболочки состоят из трех слоев, на поверхности которых виден узор с отличительными чертами:[7] включая шипы, похожие на кусты, торчащие из двенадцати вершины.[8]

Икосаэдрический капсид (Т = 21) равен 56 нанометры (нм) в диаметре и состоит из 1200 белков P1 (шип) и 60 P2 (капсид). Шипы связывания пентамерного рецептора выступают из 12 осей пятого порядка. Капсид включает внутреннее липидное ядро, содержащее структурные белки от P3 до P10.

Геном

Геном не сегментирован, составляет 13% от веса вируса и содержит одну молекулу кольцевой, суперскрученный, двухцепочечный ДНК 10 кгбазы в длину. В геноме есть грамм + c содержание 43%.[9] Он кодирует ~ 21 белок.

Транскрипция состоит из трех оперонов.

Репликация генома происходит по механизму катящегося круга, инициированному кодируемой вирусом эндонуклеазой P12.

РодСтруктураСимметрияКапсидГеномное расположениеГеномная сегментация
КортиковирусМногогранникТ = 21Без оболочкиКруговойОдночастный

Жизненный цикл

Репликация вируса происходит в цитоплазме. Проникновение в клетку-хозяина достигается путем адсорбции на поверхности клетки-хозяина с последующим слиянием вирусной мембраны с внешней мембраной клетки-хозяина и последующей доставкой генома внутрь клетки.[10] Транскрипция с использованием ДНК-шаблона - это метод транскрипции. Бактерии рода Псевдоальтеромонады служат естественным хозяином. Кортиковирус PM2 является литическим вирусом и в конце цикла инфицирования разрушает клетку-хозяин, используя уникальную систему лизиса, состоящую из кодируемых фагом белков P17 и P18, а также неидентифицированного автолизина хозяина.[11] Однако идентификация PM2-подобных провирусов в бактериальных геномах указывает на то, что другие члены этого семейства могут быть вирусами умеренного климата. Пути передачи - пассивное распространение.[3]

РодДетали хостаТканевый тропизмДетали входаДетали выпускаСайт репликацииСайт сборкиПередача инфекции
КортиковирусБактерииНиктоИнъекцияЛизисЦитоплазмаЦитоплазмаПассивная диффузия

Рекомендации

  1. ^ Abrescia, Nicola G.A .; Граймс, Джонатан М .; Kivelä, Hanna M .; Ассенберг, Рене; Саттон, Джефф Ч .; Мясник, Сара Дж .; Bamford, Jaana K.H .; Bamford, Dennis H .; Стюарт, Дэвид I. (сентябрь 2008 г.). «Понимание эволюции вирусов и биогенеза мембран на основе структуры морского липид-содержащего бактериофага PM2». Молекулярная клетка. 31 (5): 749–761. Дои:10.1016 / j.molcel.2008.06.026. PMID  18775333.
  2. ^ а б c "Corticoviridae". Отчет ICTV Online (10).
  3. ^ а б «Вирусная зона». ExPASy. Получено 15 июн 2015.
  4. ^ Крупович М., Бэмфорд Д.Х. (2007). «Предполагаемые профаги, связанные с литическим бесхвостым фагом морской дцДНК PM2, широко распространены в геномах водных бактерий» (PDF). BMC Genomics. 8: 236. Дои:10.1186/1471-2164-8-236. ЧВК  1950889. PMID  17634101.
  5. ^ Эспехо, Ромилио Т .; Канело, Элиана С. (апрель 1968 г.). «Свойства бактериофага PM2: липидсодержащий бактериальный вирус». Вирусология. 34 (4): 738–747. Дои:10.1016/0042-6822(68)90094-9.
  6. ^ Кивельд, Х.М., Калккинен, Н. и Бэмфорд, Д.Х. (2002). Бактериофаг PM2 имеет белковый капсид, окружающий сферическое липидно-белковое ядро ​​» J. Virol. 76, 8169-8178.
  7. ^ Кивельд, Х.М., Мяннистё, Р.Х., Калккинен, Н. и Бамфорд, Д.Х. (1999). Очистка и белковый состав PM2, первого выделенного липидсодержащего бактериального вируса » Вирусология 262, 364-374.
  8. ^ Харрисон, С.С., Каспар, Д.Л., Камерини-Отеро, Р.Д. и Франклин, Р.М. (1971). Расположение липидов и белков в бактериофаге PM2. Nat. Новая биол., 229, 197-201.
  9. ^ Männistö, R.H., Kivelä, H.M., Paulin, L., Bamford, D.H. и Bamford, J.K.H. (1999). Полная последовательность генома PM2, первого липидсодержащего бактериального вируса, который будет изолирован » Вирусология 262, 355-363.
  10. ^ Цвиркайте-Крупович В., Крупович М., Даугелавичюс Р., Бамфорд Д.Х. (2010). «Зависимое от ионов кальция проникновение мембраносодержащего бактериофага PM2 в его хозяина Pseudoalteromonas». Вирусология. 405 (1): 120–128. Дои:10.1016 / j.virol.2010.05.021. PMID  20646729.
  11. ^ Крупович М., Даугелавичюс Р., Бамфорд Д.Х. (2007). «Новая система лизиса в PM2, липид-содержащем морском двухцепочечном ДНК-бактериофаге». Мол Микробиол. 64 (6): 1635–48. Дои:10.1111 / j.1365-2958.2007.05769.x. PMID  17555443.

внешняя ссылка