DDX10 - DDX10

DDX10
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2PL3
Идентификаторы
Псевдонимы	DDX10, HRH-J8, DEAD-бокс-геликаза 10, Dbp4
Внешние идентификаторы	OMIM: 601235 MGI: 1924841 ГомолоГен: 20922 Генные карты: DDX10
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 11 (человек)[1] Группа 11q22.3 Начинать 108,665,069 бп[1] Конец 108,940,927 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 9 (мышь)[2] Группа 9 | 9 A5.3 Начинать 53,098,635 бп[2] Конец 53,248,053 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • РНК-геликазная активность • связывание нуклеотидов • гидролазная активность • Связывание АТФ • GO: 0008026 геликазная активность • связывание нуклеиновой кислоты • Связывание РНК Сотовый компонент • ядрышко • цитоплазма Биологический процесс • Раскрутка вторичной структуры РНК • переднее развитие головы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	1662	77591
Ансамбль	ENSG00000178105	ENSMUSG00000053289
UniProt	Q13206	Q80Y44
RefSeq (мРНК)	NM_004398	NM_029936
RefSeq (белок)	NP_004389	NP_084212
Расположение (UCSC)	Chr 11: 108,67 - 108,94 Мб	Chr 9: 53.1 - 53.25 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Вероятная АТФ-зависимая РНК-геликаза DDX10 является фермент что у людей кодируется DDX10 ген.^[5][6]

МЕРТВАЯ коробка белки, характеризующиеся консервативным мотивом Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), являются предполагаемыми РНК-геликазами. Они причастны к ряду клеточные процессы с изменением РНК вторичная структура такие как инициация трансляции, ядерный и митохондриальный сплайсинг и рибосома и сплайсосома сборка. Судя по структуре их распространения, некоторые члены этого семейства, как полагают, участвуют в эмбриогенез, сперматогенез, и рост клеток и деление. Этот ген кодирует белок DEAD-бокса, и он может участвовать в сборке рибосом. Слияние этого гена и нуклеопорин ген, NUP98, по инверсии 11 (p15q22) транслокация хромосомы обнаруживается у пациентов с de novo или связанными с терапией миелоидный злокачественные новообразования.^[6]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000178105 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000053289 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Savitsky K, Ziv Y, Bar-Shira A, Gilad S, Tagle DA, Smith S, Uziel T, Sfez S, Nahmias J, Sartiel A, Eddy RL, Shows TB, Collins FS, Shiloh Y, Rotman G (январь 1997 г.) . «Человеческий ген (DDX10), кодирующий предполагаемую DEAD-бокс-РНК-геликазу в 11q22-q23». Геномика. 33 (2): 199–206. Дои:10.1006 / geno.1996.0184. PMID  8660968.
6. «Ген Entrez: полипептид 10 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) DDX10».

дальнейшее чтение

• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.
• Андерсен Дж. С., Лам Ю. В., Леунг А. К. и др. (2005). «Динамика нуклеолярного протеома». Природа. 433 (7021): 77–83. Дои:10.1038 / природа03207. PMID  15635413. S2CID  4344740.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Wang SC, Lien HC, Xia W и др. (2004). «Связывание и трансактивация промотора СОХ-2 ядерным рецептором тирозинкиназы ErbB-2». Раковая клетка. 6 (3): 251–61. Дои:10.1016 / j.ccr.2004.07.012. PMID  15380516.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Андерсен Дж. С., Лион CE, Фокс А. Х. и др. (2002). «Направленный протеомный анализ ядрышка человека». Curr. Биол. 12 (1): 1–11. Дои:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID  11790298. S2CID  14132033.
• Накао К., Нишино М., Такеучи К. и др. (2000). «Слияние гена нуклеопорина, NUP98, и предполагаемого гена РНК-геликазы, DDX10, путем инверсии 11 (p15q22) транслокации хромосомы у пациента с миелодиспластическим синдромом, связанным с этопозидом». Междунар. Med. 39 (5): 412–5. Дои:10.2169 / internalmedicine.39.412. PMID  10830185.
• Зубер Дж., Черница О.И., Хинцманн Б. и др. (2000). «Полногеномный обзор мишеней для трансформации RAS». Nat. Genet. 24 (2): 144–52. Дои:10.1038/72799. PMID  10655059. S2CID  21887748.
• Икеда Т., Икеда К., Сасаки К. и др. (1999). «Хромосомная транслокация inv (11) (p15q22) миелодисплазии, связанной с терапией, с транскриптами слияния NUP98-DDX10 и DDX10-NUP98». Int. J. Hematol. 69 (3): 160–4. PMID  10222653.
• Лян В.К., Кларк Дж. А., Фурнье М. Дж. (1997). «Функция обработки рРНК малой ядрышковой РНК дрожжей U14 может быть восстановлена ​​с помощью консервативного РНК-геликазоподобного белка». Мол. Клетка. Биол. 17 (7): 4124–32. Дои:10.1128 / mcb.17.7.4124. ЧВК  232266. PMID  9199348.
• Арай Й., Хосода Ф., Кобаяши Х. и др. (1997). «Хромосомная транслокация inv (11) (p15q22) de novo и миелоидных злокачественных новообразований, связанных с терапией, приводит к слиянию гена нуклеопорина, NUP98, с предполагаемым геном геликазы РНК, DDX10». Кровь. 89 (11): 3936–44. Дои:10.1182 / кровь.V89.11.3936. PMID  9166830.