ДЕПТОР - DEPTOR

ДЕПТОР
Идентификаторы
Псевдонимы	ДЕПТОР, DEP.6, DEPDC6, домен DEP, содержащий белок, взаимодействующий с MTOR, домен DEP, содержащий белок, взаимодействующий с MTOR
Внешние идентификаторы	OMIM: 612974 MGI: 2146322 ГомолоГен: 32551 Генные карты: ДЕПТОР
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 8 (человек)[1] Группа 8q24.12 Начинать 119,873,717 бп[1] Конец 120,050,918 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 D1 | 15 21,96 см Начинать 55,112,317 бп[2] Конец 55,259,271 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • внутриклеточный • цитоплазма Биологический процесс • GO: 0007243 внутриклеточная передача сигнала • регуляция внешнего апоптотического сигнального пути • отрицательное регулирование размера клеток • отрицательная регуляция активности протеинкиназы • отрицательная регуляция передачи сигналов TOR Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	64798	97998
Ансамбль	ENSG00000155792	ENSMUSG00000022419
UniProt	Q8TB45	Q570Y9
RefSeq (мРНК)	NM_022783 NM_001283012	NM_001037937 NM_145470
RefSeq (белок)	NP_001269941 NP_073620	NP_001033026 NP_663445
Расположение (UCSC)	Chr 8: 119,87 - 120,05 Мб	Chr 15: 55.11 - 55.26 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

DEP-домен, содержащий mTOR-взаимодействующий белок (ДЕПТОР) также известный как Белок 6, содержащий домен DEP (DEPDC6) это белок что у людей кодируется ДЕПТОР ген.^[5]

Структура

Ген ДЕПТОР встречается только у позвоночных. У человека ДЕПТОР ген находится на 8-й хромосоме, 8q24.12 с размером белка 409 а.о.^[6] Human DEPTOR содержит два N-концевой DEP домены и C-терминал PDZ домен.^[7]

Функция

DEPTOR участвует в сигнальный путь mTOR как эндогенный регулятор. Было показано прямое взаимодействие между DEPTOR и mTOR.^[7] Сверхэкспрессия DEPTOR подавляет активность mTORC1 и mTORC2 in vitro. mTORC1 и mTORC2 могут оба ингибировать DEPTOR через фосфорилирование.^[7]

Метаболизм

Клетка DEPTOR регулирует автономно адипогенез.^[8] В мышцах Baf60c способствует переключению с окислительного на гликолитический миофибриллярный тип посредством DEPTOR-опосредованного Акт / ПКБ активация.^[9] Внутри мозга DEPTOR сильно выражен в гиппокамп, медиобазальный гипоталамус и окружные желудочковые органы.^[10] Избыточная экспрессия DEPTOR в срединно-базальном гипоталамусе защищает мышей от диеты с высоким содержанием жиров. ожирение путем модуляции Акт / ПКБ сигнализация.^[11]

Клинический рак

Хотя в большинстве случаев рака путь mTOR конститутивно активирован и экспрессия DEPTOR низкая, одно исследование показало, что DEPTOR сверхэкспрессируется в множественная миелома клеток и необходим для их выживания.^[7]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000155792 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022419 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: домен DEPDC6, содержащий 6».
6. «Homo sapiens - Семейства белков ансамбля - Ген: DEPTOR (ENSG00000155792)». Браузер генома ансамбля 78.
7. Петерсон Т.Р., Лапланте М., Торин С.К., Санджак И., Канг С.А., Кюль В.М., Грей Н.С., Сабатини Д.М. (май 2009 г.). «DEPTOR - это ингибитор mTOR, который часто сверхэкспрессируется в клетках множественной миеломы и необходим для их выживания». Клетка. 137 (5): 873–86. Дои:10.1016 / j.cell.2009.03.046. ЧВК  2758791. PMID  19446321.
8. Лапланте М., Хорват С., Фестучча В. Т., Бирсой К., Преворсек З., Эфеян А., Сабатини Д. М. (август 2012 г.). «Клетка DEPTOR автономно способствует адипогенезу, и его экспрессия связана с ожирением». Клеточный метаболизм. 16 (2): 202–12. Дои:10.1016 / j.cmet.2012.07.008. ЧВК  3463374. PMID  22883231.
9. Мэн Зи X, Ли С., Ван Л., Ко ХД, Ли Й, Юнг Д. Ю., Окуцу М., Янь З., Ким Дж. К., Лин Дж. Д. (май 2013 г.). «Baf60c управляет гликолитическим метаболизмом в мышцах и улучшает системный гомеостаз глюкозы за счет активации Akt, опосредованной Deptor». Природа Медицина. 19 (5): 640–5. Дои:10,1038 / нм.3144. ЧВК  3650110. PMID  23563706.
10. Caron A, Baraboi ED, Laplante M, Ричард Д. (январь 2015 г.). «DEP-домен, содержащий mTOR-взаимодействующий белок в мозге крысы: распределение экспрессии и потенциальное значение». Журнал сравнительной неврологии. 523 (1): 93–107. Дои:10.1002 / cne.23668. PMID  25159114. S2CID  205683672.
11. Карон, Александр; Лаббе, Себастьян М .; Ланфрей, Дэмиен; Бланшар, Пьер-Жиль; Вилло, Ромен; Рой, Кристиан; Сабатини, Дэвид М .; Ричард, Денис; Лапланте, Матье (2016). «Медиобазальная гиперэкспрессия дептора в гипоталамусе защищает от ожирения, вызванного диетой с высоким содержанием жиров». Молекулярный метаболизм. 5 (2): 102–112. Дои:10.1016 / j.molmet.2015.11.005. ЧВК  4735664. PMID  26909318.

дальнейшее чтение

• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Хартли Дж. Л., Темпл Г. Ф., Браш Массачусетс (ноябрь 2000 г.). «Клонирование ДНК с использованием сайт-специфической рекомбинации in vitro». Геномные исследования. 10 (11): 1788–95. Дои:10.1101 / гр.143000. ЧВК  310948. PMID  11076863.
• Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Böcher M, Blöcker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Düsterhöft A, Beyer A, Köhrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwälder B , Обермайер Б., Тампе Дж., Хойбнер Д., Вамбутт Р., Корн Б., Кляйн М., Поустка А. (март 2001 г.). «К каталогу генов и белков человека: секвенирование и анализ 500 новых полных белков, кодирующих кДНК человека». Геномные исследования. 11 (3): 422–35. Дои:10.1101 / гр. GR1547R. ЧВК  311072. PMID  11230166.
• Симпсон Дж. С., Велленройтер Р., Поустка А., Пепперкок Р., Виманн С. (сентябрь 2000 г.). «Систематическая субклеточная локализация новых белков, идентифицированных с помощью крупномасштабного секвенирования кДНК». Отчеты EMBO. 1 (3): 287–92. Дои:10.1093 / embo-reports / kvd058. ЧВК  1083732. PMID  11256614.
• Wiemann S, Arlt D, Huber W., Wellenreuther R, Schleeger S, Mehrle A, Bechtel S, Sauermann M, Korf U, Pepperkok R, Sültmann H, Poustka A (октябрь 2004 г.). «От ORFeome к биологии: конвейер функциональной геномики». Геномные исследования. 14 (10B): 2136–44. Дои:10.1101 / гр.2576704. ЧВК  528930. PMID  15489336.
• Мехрле А., Розенфельдер Х., Шупп И., дель Валь С., Арльт Д., Хане Ф., Бектель С., Симпсон Дж., Хофманн О., Хиде В., Глаттинг К. Х., Хубер В., Пепперкок Р., Поустка А., Виманн С. (январь 2006 г.). «База данных LIFEdb в 2006 году». Исследования нуклеиновых кислот. 34 (Выпуск базы данных): D415–8. Дои:10.1093 / nar / gkj139. ЧВК  1347501. PMID  16381901.