DHPS - DHPS

Эта статья о гене, кодирующем фермент дезоксигипузинсинтазу. Для другого фермента, обычно сокращенно DHPS, см. Дигидроптероатсинтетаза. Для использования в других целях см. DHPS (значения).

DHPS
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 1DHS, 1RLZ, 1РОЗ, 1RQD
Идентификаторы
Псевдонимы	DHPS, дезоксигипузинсинтаза, DHS, DS, MIG13, NEDSSWI
Внешние идентификаторы	OMIM: 600944 MGI: 2683592 ГомолоГен: 1453 Генные карты: DHPS
Номер ЕС	2.5.1.46
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 19 (человек)[1] Группа 19п13.13 Начните 12,675,717 бп[1] Конец 12,681,880 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 8 (мышь)[2] Группа 8 | 8 C3 Начните 85,071,757 бп[2] Конец 85,075,162 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • трансферазная активность • GO: 0001948 связывание с белками • идентичное связывание с белками • активность дезоксигипузинсинтазы Сотовый компонент • цитозоль • цитоплазма Биологический процесс • гомотетрамеризация белков • биосинтез белка • положительное регулирование пролиферации Т-клеток • гомеостаз глюкозы • положительное регулирование пролиферации клеток • метаболический процесс спермидина • катаболический процесс спермидина • модификация пептидил-лизина до пептидил-гипузина Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	1725	330817
Ансамбль	ENSG00000095059	ENSMUSG00000060038
UniProt	P49366	Q3TXU5
RefSeq (мРНК)	NM_001206974 NM_001930 NM_013406 NM_001369691 NM_001369692 NM_001369693	NM_001039514 NM_201408
RefSeq (белок)	NP_001193903 NP_001921 NP_037538 NP_001356620 NP_001356621 NP_001356622	NP_001034603
Расположение (UCSC)	Chr 19: 12.68 - 12.68 Мб	Chr 8: 85.07 - 85.08 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Дезоксигипузинсинтаза является фермент что у людей кодируется DHPS ген.^[5][6]

Необычная аминокислота гипузин образуется посттрансляционно и обнаруживается только в одном клеточном белке, эукариотический фактор инициации трансляции 5А. На первом этапе биосинтеза гипузина дезоксигипузинсинтаза катализирует НАД-зависимый перенос бутиламин часть спермидин к эпсилон-аминогруппе определенного лизин остаток белка-предшественника EIF5A с образованием промежуточного дезоксигипузин остаток. Этот ген состоит из девяти экзоны охват 6,6 кб. Выделены три варианта транскрипта. Однако только вариант транскрипта 1 кодирует активный белок. Более короткие варианты могут действовать как факторы модуляции активности DHPS.^[6]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000095059 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000060038 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Джо Я., Wolff EC, Park MH (октябрь 1995 г.). «Клонирование и экспрессия кДНК дезоксигипузинсинтазы человека. Исследования структуры-функции с рекомбинантным ферментом и мутантными белками». J Biol Chem. 270 (38): 22386–92. Дои:10.1074 / jbc.270.38.22386. PMID  7673224.
6. «Энтрез Ген: дезоксигипузинсинтаза DHPS».

дальнейшее чтение

• Клир Х., Чонга Р., Стейнкасерер А. и др. (1995). «Очистка и характеристика дезоксигипузинсинтазы человека из клеток HeLa». FEBS Lett. 364 (2): 207–10. Дои:10.1016 / 0014-5793 (95) 00394-О. PMID  7750572. S2CID  24485865.
• Джо Я., Парк М. Х. (1994). «Структурные особенности предшественника eIF-5A, необходимые для посттрансляционного синтеза дезоксигипузина». J. Biol. Chem. 269 (41): 25916–21. PMID  7929297.
• Бевек Д., Каппель Б., Якше Н. и др. (1996). «Молекулярная характеристика кДНК, кодирующей функциональную дезоксигипузинсинтазу человека, и хромосомное картирование соответствующего локуса гена». FEBS Lett. 378 (2): 195–8. Дои:10.1016 / 0014-5793 (95) 01456-X. PMID  8549832. S2CID  39329481.
• Ян Ю.П., Тао Ю., Чен К.Ю. (1996). «Молекулярное клонирование и функциональная экспрессия кДНК дезоксигипузинсинтазы человека на основе информации метки экспрессируемой последовательности». Biochem. J. 315 (2): 429–34. Дои:10.1042 / bj3150429. ЧВК  1217213. PMID  8615810.
• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Джонс Т., Шир Д., Капетанопулос А. и др. (1996). «Ген, кодирующий дезоксигипузинсинтазу человека (DHPS), отображается на хромосоме 19p13.11-p13.12». Геномика. 35 (3): 635–7. Дои:10.1006 / geno.1996.0416. PMID  8812510.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Ляо Д.И., Вольф ЕС, Парк М.Х., Дэвис Д.Р. (1998). «Кристаллическая структура комплекса НАД дезоксигипузинсинтазы человека: фермент с шарообразным механизмом блокировки активного центра». Структура. 6 (1): 23–32. Дои:10.1016 / S0969-2126 (98) 00004-5. PMID  9493264.
• Мантуано Э., Треттель Ф., Олсен А.С. и др. (1998). «Локализация и геномная структура гена дезоксигипузинсинтазы человека на хромосоме 19p13.2-дистальный 19p13.1» (PDF). Ген. 215 (1): 153–7. Дои:10.1016 / S0378-1119 (98) 00254-6. HDL:2108/46188. PMID  9666110.
• Ли YB, Джо YA, Wolff EC, et al. (1999). «Комплексообразование между дезоксигипузинсинтазой и ее белковым субстратом, предшественником эукариотического фактора инициации трансляции 5A (eIF5A)». Biochem. J. 340 (1): 273–81. Дои:10.1042/0264-6021:3400273. ЧВК  1220246. PMID  10229683.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Обер Д., Хармс Р., Витте Л., Хартманн Т. (2003). «Молекулярная эволюция путем изменения функции. Алкалоид-специфическая гомоспермидинсинтаза сохранила все свойства дезоксигипузинсинтазы, за исключением связывания белка-предшественника eIF5A». J. Biol. Chem. 278 (15): 12805–12. Дои:10.1074 / jbc.M207112200. PMID  12562768.
• Парк Дж. Х., Вольф Э. К., Фолк Дж. Э., Парк М. Х. (2003). «Обращение реакции синтеза дезоксигипузина. Образование спермидина или гомоспермидина из дезоксигипузина с помощью дезоксигипузинсинтазы». J. Biol. Chem. 278 (35): 32683–91. Дои:10.1074 / jbc.M304247200. PMID  12788913.
• Канг К.Р., Чунг С.И. (2004). «Протеинкиназа CK2 фосфорилирует и взаимодействует с дезоксигипузинсинтазой в клетках HeLa». Exp. Мол. Med. 35 (6): 556–64. Дои:10.1038 / emm.2003.73. PMID  14749535.
• Umland TC, Wolff EC, Park MH, Davies DR (2004). «Новая кристаллическая структура дезоксигипузинсинтазы показывает конфигурацию активного фермента и тройного комплекса фермента. НАД.ингибитор». J. Biol. Chem. 279 (27): 28697–705. Дои:10.1074 / jbc.M404095200. PMID  15100216.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т. и др. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Юинг Р.М., Чу П., Элизма Ф. и др. (2007). «Крупномасштабное картирование белок-белковых взаимодействий человека с помощью масс-спектрометрии». Мол. Syst. Биол. 3 (1): 89. Дои:10.1038 / msb4100134. ЧВК  1847948. PMID  17353931.