ENOD40 - ENOD40
| ENOD40 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 А логотип последовательности для пептида ENOD40. | |||||||||
| Идентификаторы | |||||||||
| Символ | ENOD40 | ||||||||
| Pfam | PF08247 | ||||||||
| ИнтерПро | IPR013186 | ||||||||
| |||||||||
| ENOD40 | |
|---|---|
 Вторичная структура и сохранение последовательности ENOD40 | |
| Идентификаторы | |
| Символ | ENOD40 |
| Рфам | RF01845 |
| Прочие данные | |
| РНК тип | Некодирующая РНК |
| Домен (ы) | Магнолиофита |
| PDB структуры | PDBe |
Enod40, также известный как ранний нодулин 40, является ген нашел в цветущие растения. Ген имеет характеристики обоих белок и Некодирующая РНК гены.[1] Имеются некоторые свидетельства того, что некодирующие характеристики этого гена более консервативны, чем кодирующие белки последовательности.[2]В соевые бобы Enod40 было обнаружено, что оно выражено на ранних этапах формирования азотфиксирующий корневые клубеньки, связанные с симбиотической почвой ризобиальные бактерии.[3][4]Этот ген также активен в корнях, содержащих грибы, образующие фосфатоактивные арбускулярная микориза.[5]Взаимодействие с романом РНК-связывающий белок MtRBP1 (Medicago truncatula РНК-связывающий белок 1) исследованы при разработке Корневой узелок предполагает, что ENOD40 выполняет функцию цитоплазматической релокализации ядерные белки.[6]При исследовании небобовых растений сверхэкспрессия ENOD40 в трансгенных линиях Arabidopsis наблюдалась за снижением роста клеток.[7]
Смотрите также
Рекомендации
- ^ Crespi MD, Jurkevitch E, Poiret M, d'Aubenton-Carafa Y, Petrovics G, Kondorosi E, Kondorosi A (1994). «enod40, ген, экспрессируемый во время органогенеза клубеньков, кодирует нетранслируемую РНК, участвующую в росте растений». EMBO J. 13 (21): 5099–5112. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06839.x. ЧВК 395456. PMID 7957074.
- ^ Гультяев А.П., Русси А (2007). «Идентификация консервативных вторичных структур и сегментов экспансии в РНК enod40 выявляет новые гомологи enod40 в растениях». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (9): 3144–3152. Дои:10.1093 / нар / гкм173. ЧВК 1888808. PMID 17452360.
- ^ Ян В.К., Катинакис П., Хендрикс П., Смолдерс А., де Врис Ф., Спее Дж., Ван Каммен А., Бисселинг Т., Франссен Х. (1993). «Характеристика GmENOD40, гена, показывающего новые образцы клеточно-специфической экспрессии во время развития клубеньков сои». Завод J. 3 (4): 573–585. Дои:10.1046 / j.1365-313X.1993.03040573.x. PMID 8220464.
- ^ Кучи Х, Хата С (1993). «Выделение и характеристика новых кДНК нодулина, представляющих гены, экспрессируемые на ранних стадиях развития клубеньков сои». Мол Джен Генет. 238 (1–2): 106–119. Дои:10.1007 / bf00279537. PMID 7683079.
- ^ ван Рейн П., Фанг Й., Галили С., Шауль О, Ацмон Н., Винингер С., Эшед Ю., Лум М., Ли И, То В, Фуджишиге Н., Капульник Ю., Хирш А. М. (1997). «Экспрессия ранних генов нодулина в микоризах люцерны указывает на то, что пути передачи сигналов, используемые при формировании арбускулярной микоризы и клубеньков, индуцированных Rhizobium, могут быть сохранены». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (10): 5467–5472. Bibcode:1997PNAS ... 94.5467V. Дои:10.1073 / пнас.94.10.5467. ЧВК 24702. PMID 11038545.
- ^ Кампаланс А, Кондороси А, Креспи М (2004). «Enod40, мРНК, содержащая короткую открытую рамку считывания, индуцирует цитоплазматическую локализацию ядерного РНК-связывающего белка в Medicago truncatula». Растительная клетка. 16 (4): 1047–1059. Дои:10.1105 / tpc.019406. ЧВК 412876. PMID 15037734.
- ^ Гуццо Ф, Порталуппи П., Гризи Р., Бароне С., Зампиери С., Франссен Х., Леви М. (2005). «Уменьшение размера клеток, вызванное enod40 у Arabidopsis thaliana». J Exp Bot. 56 (412): 507–513. Дои:10.1093 / jxb / eri028. PMID 15557291.
дальнейшее чтение
- Подковинский Дж., Змиенко А., Флорек Б., Войцеховски П., Рыбарчик А., Вжесински Дж., Цесиолка Дж., Блажевич Дж., Кондороси А., Креспи М., Легоцкий А. (2009). «Трансляционный и структурный анализ самого короткого гена ENOD40 бобовых у Lupinus luteus». Акта Биохим Пол. 56 (1): 89–102. Дои:10.18388 / abp.2009_2520. PMID 19287803.
- Ван X, Хонтелес Дж., Лилло А., Гварнерио С., ван де Пейт Д., Федорова Е., Бисселинг Т., Франссен Х. (2007). «Medicago truncatula ENOD40-1 и ENOD40-2 участвуют в инициации клубеньков и развитии бактероидов». J Exp Bot. 58 (8): 2033–2041. Дои:10.1093 / jxb / erm072. PMID 17452749.
- Гультяев А.П., Русси А (2007). «Идентификация консервативных вторичных структур и сегментов экспансии в РНК enod40 выявляет новые гомологи enod40 в растениях». Нуклеиновые кислоты Res. 35 (9): 3144–3152. Дои:10.1093 / нар / гкм173. ЧВК 1888808. PMID 17452360.
- Мураками Й., Мива Х., Имаидзуми-Анраку Х., Коучи Х., Дауни Дж. А., Кавагути М., Кавасаки С. (2006). «Позиционное клонирование идентифицирует Lotus japonicus NSP2, предполагаемый фактор транскрипции семейства GRAS, необходимый для экспрессии генов NIN и ENOD40 при инициации клубеньков». ДНК Res. 13 (6): 255–265. Дои:10.1093 / dnares / dsl017. PMID 17244637.
- Ли А., Лам MR, Хирш AM (2007). «Экспрессия гена ENOD40 и цитокининовые ответы в немикоризном мутанте Masym3, не вызывающем клубеньков, не микоризном (NodMyc), Melilotus alba Desr». Сигнальное поведение растений. 2 (1): 33–42. Дои:10.4161 / psb.2.1.3734. ЧВК 2633896. PMID 19516966.
- Руттинк Т., Ботинок К., Кийне Дж., Бисселинг Т., Франссен Х. (2006). «ENOD40 влияет на рост клеток табака Bright Yellow-2 за счет изменения кинетики биосинтеза этилена». J Exp Bot. 57 (12): 3271–3282. Дои:10.1093 / jxb / erl089. PMID 16957021.
- Grønlund M, Roussis A, Flemetakis E, Quaedvlieg NE, Schlaman HR, Umehara Y, Katinakis P, Stougaard J, Spaink HP (2005). «Анализ промоторной активности раннего нодулина Enod40 в Lotus japonicus». Мол Растительный Микроб Взаимодействовать. 18 (5): 414–427. Дои:10.1094 / MPMI-18-0414. PMID 15915640.
- Рериг Х, Джон М, Шмидт Дж (2004). «Модификация сахарозосинтазы сои путем S-тиолирования пептидом А ENOD40». Biochem Biophys Res Commun. 325 (3): 864–870. Дои:10.1016 / j.bbrc.2004.10.100. HDL:11858 / 00-001M-0000-0012-3B5C-C. PMID 15541370.
- Дей М., Пожаловатьсявиль А., Харон С., Торризо Л., Кондороси А., Креспи М., Датта С. (2004). «Фитогормональные ответы у растений со сверхэкспрессией enod40 Medicago truncatula и риса». Physiol. Растение. 120 (1): 132–139. Дои:10.1111 / j.0031-9317.2004.0208.x. PMID 15032885.
- Компаан Б., Руттинк Т., Альбрехт С., Мили Р., Бисселинг Т., Франссен Н. (2003). «Идентификация и характеристика линии Zea mays, несущей ENOD40 с меткой транспозона». Biochim Biophys Acta. 1629 (1–3): 84–91. Дои:10.1016 / j.bbaexp.2003.08.004. PMID 14522083.
- Vleghels I, Hontelez J, Ribeiro A, Fransz P, Bisseling T, Franssen H (2003). «Экспрессия ENOD40 во время развития растений томата». Planta. 218 (1): 42–49. Дои:10.1007 / s00425-003-1081-9. PMID 14508686.
- Санти К., фон Гролль Ю., Рибейро А., Чиурацци М., Огю Ф., Богуш Д., Франш С., Павловски К. (2003). «Сравнение индукции клубеньков в бобовых и актиноризных симбиозах: индукция актиноризных клубеньков не включает ENOD40». Мол Растительный Микроб Взаимодействовать. 16 (9): 808–816. Дои:10.1094 / MPMI.2003.16.9.808. PMID 12971604.
- Girard G, Roussis A, Gultyaev AP, Pleij CW, Spaink HP (2003). «Структурные мотивы в РНК, кодируемые геном ранней нодуляции enod40 сои». Нуклеиновые кислоты Res. 31 (17): 5003–5015. Дои:10.1093 / нар / gkg721. ЧВК 212817. PMID 12930950.
- Ларсен К. (2003). «Молекулярное клонирование и характеристика кДНК, кодирующей гомолог ENOD40 райграса (Lolium perenne)». J Plant Physiol. 160 (6): 675–687. Дои:10.1078/0176-1617-00962. PMID 12872490.
- Favery B, Complainville A, Vinardell JM, Lecomte P, Vaubert D, Mergaert P, Kondorosi A, Kondorosi E, Crespi M, Abad P (2002). «Индуцированные эндосимбиозом гены ENOD40 и CCS52a участвуют во взаимодействиях эндопаразитов и нематод у Medicago truncatula». Мол Растительный Микроб Взаимодействовать. 15 (10): 1008–1013. Дои:10.1094 / MPMI.2002.15.10.1008. PMID 12437298.
- Варконьи-Гасич Э., Белый Д.В. (2002). «Семейство генов enod40 клевера белого. Характер экспрессии двух типов генов указывает на их роль в сосудистой функции». Физиология растений. 129 (3): 1107–1118. Дои:10.1104 / стр.010916. ЧВК 166505. PMID 12114565.
- Рориг Х., Шмидт Дж., Миклашевич Э., Шелл Дж., Джон М. (2002). «ENOD40 сои кодирует два пептида, которые связываются с сахарозосинтазой». Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (4): 1915–1920. Bibcode:2002ПНАС ... 99.1915R. Дои:10.1073 / pnas.022664799. ЧВК 122294. PMID 11842184.
- Стахелин К., Харон С., Боллер Т., Креспи М., Кондороси А. (2001). «Растения Medicago truncatula, сверхэкспрессирующие ранний ген нодулина enod40, демонстрируют ускоренную микоризную колонизацию и усиленное образование арбускул». Proc Natl Acad Sci U S A. 98 (26): 15366–15371. Bibcode:2001PNAS ... 9815366S. Дои:10.1073 / pnas.251491698. ЧВК 65035. PMID 11752473.
- Имаидзуми-Анраку Х, Коучи Х, Сёно К., Акао С., Кавагути М. (2000). «Анализ экспрессии ENOD40 в alb1, симбиотическом мутанте Lotus japonicus, который образует пустые узелки с не полностью развитыми сосудистыми пучками узелков». Мол Джен Генет. 264 (4): 402–410. Дои:10.1007 / s004380000330. PMID 11129043.
- Соуза К., Йоханссон С., Харон С., Маньяни Х., Сауттер С., Кондороси А., Креспи М. (2001). «Трансляционные и структурные требования раннего гена нодулина enod40, РНК, содержащей короткую открытую рамку считывания, для выявления клеточно-специфической реакции роста в коре корня корня люцерны». Mol Cell Biol. 21 (1): 354–366. Дои:10.1128 / MCB.21.1.354-366.2001. ЧВК 88808. PMID 11113209.
- Flemetakis E, Kavroulakis N, Quaedvlieg NE, Spaink HP, Dimou M, Roussis A, Katinakis P (2000). «Lotus japonicus содержит два различных гена ENOD40, которые экспрессируются в симбиотических, несимбиотических и эмбриональных тканях». Взаимодействие микробов растений мол. 13 (9): 987–994. Дои:10.1094 / MPMI.2000.13.9.987. PMID 10975655.
- Харон С., Соуза С., Креспи М., Кондороси А. (1999). «Изменение экспрессии enod40 модифицирует развитие корневых клубеньков medicago truncatula, индуцированное sinorhizobium meliloti». Растительная клетка. 11 (10): 1953–1966. Дои:10.1105 / tpc.11.10.1953. ЧВК 144109. PMID 10521525.
- Коучи Х., Такане К., Со РБ, Ладха Дж. К., Редди П.М. (1999). «Рис ENOD40: выделение и анализ экспрессии в клубеньках риса и трансгенных корней сои». Завод J. 18 (2): 121–129. Дои:10.1046 / j.1365-313X.1999.00432.x. PMID 10363365.
- Мирабелла Р., Мартирани Л., Ламберти А., Иаккарино М., Чиурацци М. (1999). «Промотор ENOD40 (2) сои активен в Arabidopsis thaliana и регулируется во времени и пространстве». Завод Мол Биол. 39 (1): 177–181. Дои:10.1023 / А: 1006146627301. PMID 10080720.
- Корич В., Гурмахтиг С., Ливенс С., Ван Монтегю М., Кобуры М. (1998). «Паттерны экспрессии гена ENOD40 в стволовых клубеньках Sesbania rostrata». Завод Мол Биол. 37 (1): 67–76. Дои:10.1023 / А: 1005925607793. PMID 9620265.
- Фанг Y, Хирш AM (1998). «Изучение ранней экспрессии и индукции гена нодулина ENOD40 фактором клубеньков и цитокинином в трансгенной люцерне». Физиология растений. 116 (1): 53–68. Дои:10.1104 / pp.116.1.53. ЧВК 35188. PMID 9449836.
- Харон С., Йоханссон С., Кондороси Э., Кондороси А., Креспи М. (1997). «enod40 вызывает дедифференцировку и деление кортикальных клеток корня бобовых». Proc Natl Acad Sci U S A. 94 (16): 8901–8906. Bibcode:1997PNAS ... 94.8901C. Дои:10.1073 / пнас.94.16.8901. ЧВК 23190. PMID 11038563.
- Минами Э., Коучи Х., Кон-младший, Огава Т., Стейси Дж. (1996). «Экспрессия раннего нодулина, ENOD40, в корнях сои в ответ на различные сигнальные молекулы липохитина». Завод J. 10 (1): 23–32. Дои:10.1046 / j.1365-313X.1996.10010023.x. PMID 8758977.
- Пападопулу К., Русси А., Катинакис П. (1996). «Phaseolus ENOD40 участвует в симбиотических и несимбиотических органогенетических процессах: экспрессии во время развития клубеньков и боковых корней». Завод Мол Биол. 30 (3): 403–417. Дои:10.1007 / BF00049320. PMID 8605294.
- Crespi MD, Jurkevitch E, Poiret M, d'Aubenton-Carafa Y, Petrovics G, Kondorosi E, Kondorosi A (1994). «enod40, ген, экспрессируемый во время органогенеза клубеньков, кодирует нетранслируемую РНК, участвующую в росте растений». EMBO J. 13 (21): 5099–5112. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1994.tb06839.x. ЧВК 395456. PMID 7957074.
- Матвиенко М., Ван де Санде К., Ян В. К., ван Каммен А., Бисселинг Т., Франссен Н. (1994). «Сравнение клонов кДНК ENOD40 сои и гороха, представляющих гены, экспрессируемые как на ранних, так и на поздних стадиях развития клубеньков». Завод Мол Биол. 26 (1): 487–493. Дои:10.1007 / BF00039559. PMID 7948896.