Medicago truncatula - Medicago truncatula

Medicago truncatula
Medicago truncatula A17 филиал.JPG
Научная классификация
Королевство:
Plantae
(без рейтинга):
Покрытосеменные
(без рейтинга):
Eudicots
(без рейтинга):
Росиды
Порядок:
Fabales
Семья:
Fabaceae
Подсемейство:
Faboideae
Племя:
Trifolieae
Род:
Medicago
Виды:
М. truncatula
Биномиальное имя
Medicago truncatula
Синонимы

Medicago tribuloides Desr.
Medicago tribuloides var. Breviaculeata Морис
Medicago truncatula var. Breviaculeata (Морис) Урб.
Medicago truncatula var. longiaculeata Urb.
Medicago truncatula var. трибулоиды (Desr.) Burnat
Medicago truncatula f. трицикла Nègre
Medicago truncatula var. трицикла (Nègre) Heyn

Medicago truncatula, то бочка клевер,[2] крепкий лекарь,[3] бочка медик, или бочонок, это небольшой ежегодный бобовые родной для Средиземноморье регион, который используется в геномный исследование. Это низкорослый, клевер в форме растения 10–60 см (3,9–23,6 дюйма) высотой с тройчатыми листьями уходит. Каждый листочек округлый, длиной 1-2 см (0,39-0,79 дюйма), часто с темным пятном в центре. В цветы желтые, производятся поодиночке или в небольшом количестве соцветие от двух до пяти вместе; то фрукты это небольшой колючий стручок.

Этот вид изучается как модельный организм для биологии бобовых, потому что у него небольшой диплоид геном, самооплодотворяется, имеет быстрое время генерации и дает обильные семена, поддается генетическому трансформация, и его геном секвенирован.[4]

Он образует симбиозы с азотфиксирующий ризобия (Sinorhizobium meliloti и Sinorhizobium medicae ) и арбускулярный микоризный грибы, включая Нерегулярный ризофагус (ранее известный как Glomus intraradices ). Модельный завод Arabidopsis thaliana не образует ни симбиоза, ни М. truncatula важный инструмент для изучения этих процессов.

Это также важный корм виды сельскохозяйственных культур в Австралия.

Секвенирование генома

Проект последовательности генома М. truncatula сорт А17 опубликован в журнале Природа в 2011.[4]

В последовательность действий была проведена международным партнерством исследовательских лабораторий с участием исследователей из Университет Оклахомы (НАС), Институт Дж. Крейга Вентера (НАС), Геноскоп (Франция) и Центр Сангера (ВЕЛИКОБРИТАНИЯ). Партнерские организации включают Университет Миннесоты (НАС), Калифорнийский университет в Дэвисе (США), Национальный центр геномных ресурсов (США), Центр Джона Иннеса (Великобритания), Institut National de Recherche Agronomique (Франция), Мюнхенский информационный центр белковых последовательностей (Германия), Университет Вагенингена (Нидерланды) и Гентский университет (Бельгия). В Medicago truncatula Консорциум по секвенированию начал свою деятельность в 2001 году при помощи посевного гранта Фонда Сэмюэля Робертса Нобла. В 2003 г. Национальный научный фонд и 6-я рамочная программа Европейского Союза начала предоставлять большую часть финансирования. К 2009 году было завершено 84% сборки генома.[5]

Сборка последовательности генома в М. truncatula был основан на бактериальные искусственные хромосомы (BAC). Этот же подход используется для секвенирования генома человека, плодовой мухи, Drosophila melanogaster, и модельный завод, Arabidopsis thaliana. В июле 2013 года была выпущена версия генома 4.0.[6] Эта версия объединила последовательности, полученные из секвенирование дробовика с помощью сборок последовательностей на основе BAC, которые помогли заполнить пробелы в ранее отображенных последовательностях.

Параллельная группа, известная как Интернационал Medicago Группа аннотаций генов (IMGAG ) отвечает за идентификацию и описание предполагаемых последовательностей генов в последовательности генома.

Симбиозы с почвенными микроорганизмами

Исследователь Тоби Кирс из Амстердамского университета VU и его сотрудники использовали М. truncatula изучить симбиоз между растениями и грибами - и посмотреть, могут ли партнеры по взаимоотношениям различать хороших и плохих торговцев / поставщиков. Используя меченый углерод для отслеживания источника питательных веществ, протекающих через арбускулярную микоризную систему, исследователи доказали, что растения действительно дали больше углерода более щедрым видам грибов. Ограничивая количество углерода, которое растения отдают грибам, исследователи также продемонстрировали, что грибы действительно передают больше своего фосфора более щедрым растениям.[7]

Смотрите также

использованная литература

  1. ^ Родс, Л. (2016). "Medicago truncatula". Красный список видов, находящихся под угрозой исчезновения МСОП. МСОП. 2016: e.T176489A19401776. Дои:10.2305 / IUCN.UK.2016-3.RLTS.T176489A19401776.en.
  2. ^ "Medicago truncatula". Служба охраны природных ресурсов База данных РАСТЕНИЙ. USDA. Получено 28 января 2016.
  3. ^ "Список BSBI 2007". Ботаническое общество Великобритании и Ирландии. Архивировано из оригинал (XLS) 2014-10-23. Получено 2014-10-17.
  4. ^ а б Янг, Невин Д .; Дебелле, Фредерик; Oldroyd, Giles E.D .; Geurts, Рене; Кэннон, Стивен Б.; Удварди, Майкл К .; Бенедито, Вагнер А .; Mayer, Klaus F. X .; Гузи, Жером; Скуф, Хейко; Ван де Пер, Ив; Проост, Себастьян; Повар, Дуглас Р.; Мейерс, Блейк С.; Спаннагл, Мануэль; Чунг, Фу; Де Мита, Стефан; Кришнакумар, Вивек; Гундлах, Хайдрун; Чжоу, Шигуо; Мадж, Джоанн; Bharti, Arvind K .; Мюррей, Джереми Д.; Наумкина, Марина А .; Розен, Бенджамин; Сильверстайн, Кевин А. Т .; Тан, Хайбао; Ромбаутс, Стефан; Чжао, Патрик X .; и другие. (16 ноября 2011 г.). «Геном Medicago дает представление об эволюции ризобиальных симбиозов». Природа. 480 (7378): 520–524. Bibcode:2011Натура.480..520л. Дои:10.1038 / природа10625. ЧВК  3272368. PMID  22089132.
  5. ^ http://www.medicago.org/genome/genome_stats.php[постоянная мертвая ссылка ]
  6. ^ «JCVI: Medicago / Home». Архивировано из оригинал 10 ноября 2013 г.. Получено 20 февраля 2017.
  7. ^ Милиус, Сьюзен (23 сентября 2013 г.). «Растения и грибы - признание щедрых торговых партнеров». Получено 20 февраля 2017.[мертвая ссылка ]

дальнейшее чтение

Courty, Пьер Эммануэль; Смит, Пенелопа; Кегель, Салли; Редеккер, Дирк; Випф, Дэниел (1 июня 2015 г.). «Поглощение и перенос неорганического азота в полезных взаимодействиях корня растений и микробов». Критические обзоры в науках о растениях. 34 (1–3): 4–16. Дои:10.1080/07352689.2014.897897. S2CID  85772198.

внешние ссылки