EXOC7 - EXOC7

EXOC7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2PFT
Идентификаторы
Псевдонимы	EXOC7, 2-5-3p, EX070, EXO70, EXOC1, Exo70p, YJL085W, компонент комплекса экзоцисты 7, BLOM4
Внешние идентификаторы	OMIM: 608163 MGI: 1859270 ГомолоГен: 41019 Генные карты: EXOC7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 17 (человек)[1] Группа 17q25.1 Начните 76,081,016 бп[1] Конец 76,121,576 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 11 (мышь)[2] Группа 11 | 11 E2 Начните 116,288,001 бп[2] Конец 116,307,233 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • цитозоль • клеточная мембрана • мембрана конуса роста • экзоциста • центриолярный спутник • мембрана • центр организации микротрубочек • Тело Флемминга Биологический процесс • транспорт белка • регулирование проникновения бактерии в клетку-хозяин • регуляция макроаутофагии • экзоцитоз • транспорт Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	23265	53413
Ансамбль	ENSG00000182473	ENSMUSG00000020792
UniProt	Q9UPT5	O35250
RefSeq (мРНК)	NM_001013839 NM_001145297 NM_001145298 NM_001145299 NM_001282313 NM_001282314 NM_015219 NM_001375974 NM_001375975 NM_001375976	NM_001162872 NM_016857 NM_001347636 NM_001362838 NM_001362839 NM_001378960 NM_001378961
RefSeq (белок)	NP_001013861 NP_001138769 NP_001138770 NP_001138771 NP_001269242 NP_001269243 NP_056034 NP_001362903 NP_001362904 NP_001362905	NP_001156344 NP_001334565 NP_058553 NP_001349767 NP_001349768 NP_001365889 NP_001365890
Расположение (UCSC)	Chr 17: 76.08 - 76.12 Мб	Chr 11: 116.29 - 116.31 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Субъединица комплекса экзоцисты exo70
кристаллическая структура s. cerevisiae компонент экзоцисты exo70p
Идентификаторы
Символ	Exo70
Pfam	PF03081
Pfam клан	CL0295
ИнтерПро	IPR004140
Доступные белковые структуры: Pfam   структуры / ECOD   PDB RCSB PDB; PDBe; PDBj PDBsum резюме структуры

Компонент комплекса экзоцисты 7 это белок что у людей кодируется EXOC7 ген.^[5][6] Ранее он назывался Exo70.

Он образует одну из субъединиц экзоциста сложный. Впервые обнаружен в Saccharomyces cerevisiae, эта и другие экзоцисты белки наблюдались у нескольких других эукариот, включая люди.^[7] В С. cerevisiaeкомплекс экзоцисты участвует на поздних стадиях экзоцитоз, и располагается на кончике бутона, основном месте экзоцитоз в дрожжи.^[7] Это взаимодействует с Rho3 GTPase.^[8] Это взаимодействие опосредует одну из трех известных функций Rho3 в полярность ячейки: везикул стыковка и слияние с плазматическая мембрана (две другие функции регулирование из актин полярность и транспорт экзоцитарного пузырьки от материнской клетки к почке).^[9] У человека функции этого белка и комплекса экзоцисты изучены хуже: этот белок экспрессируется в нескольких ткани и считается, что он также участвует в экзоцитозе.^[10]

Взаимодействия

EXOC7 был показан взаимодействовать с EXOC4^[11][12] и RHOQ.^[12]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000182473 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000020792 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, Derge JG, Klausner RD, Collins FS, Wagner L, Shenmen CM, Schuler GD, Altschul SF, Zeeberg B, Buetow KH, Schaefer CF, Bhat NK, Hopkins RF, Jordan H, Moore T. , Макс С.И., Ван Дж., Се Ф., Дьяченко Л., Марусина К., Фармер А.А., Рубин Г.М., Хонг Л., Стэплтон М., Соарес М.Б., Боналдо М.Ф., Казавант Т.Л., Шитц Т.Е., Браунштейн М.Дж., Усдин Т.Б., Тошиюки С., Карнинчи П., Прейндж С., Раха С.С., Локеллано Н.А., Петерс Г.Дж., Абрамсон Р.Д., Муллахи С.Дж., Босак С.А., МакЭван П.Дж., МакКернан К.Дж., Малек Дж.А., Гунаратне П.Х., Ричардс С., Уорли К.С., Хейл С., Гарсия А.М., Гей Л.Дж., Hulyk SW, Villalon DK, Muzny DM, Sodergren EJ, Lu X, Gibbs RA, Fahey J, Helton E, Ketteman M, Madan A, Rodrigues S, Sanchez A, Whiting M, Madan A, Young AC, Shevchenko Y, Bouffard GG , Blakesley RW, Touchman JW, Green ED, Dickson MC, Rodriguez AC, Grimwood J, Schmutz J, Myers RM, Butterfield YS, Krzywinski MI, Skalska U, Smailus DE, Schnerch A, Schein JE, Jones SJ, Marra MA (декабрь 2002). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc Natl Acad Sci U S A. 99 (26): 16899–16903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
6. "Ген Entrez: компонент 7 комплекса экзоцисты EXOC7".
7. ТерБуш Д.Р., Морис Т., Рот Д., Новик П. (декабрь 1996 г.). «Экзоциста - это мультипротеиновый комплекс, необходимый для экзоцитоза у Saccharomyces cerevisiae». EMBO J. 15 (23): 6483–94. Дои:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb01039.x. ЧВК  452473. PMID  8978675.
8. Робинсон Н.Г., Го Л., Имаи Дж., То-Э., Мацуи Ю., Таманой Ф. (май 1999 г.). «Rho3 из Saccharomyces cerevisiae, который регулирует актиновый цитоскелет и экзоцитоз, представляет собой GTPase, которая взаимодействует с Myo2 и Exo70». Мол. Cell. Биол. 19 (5): 3580–7. Дои:10.1128 / MCB.19.5.3580. ЧВК  84150. PMID  10207081.
9. Адамо Дж. Э., Росси Дж., Бреннвальд П. (декабрь 1999 г.). «Rho GTPase Rho3 играет прямую роль в экзоцитозе, отличную от ее роли в полярности актина». Мол. Биол. Клетка. 10 (12): 4121–33. Дои:10.1091 / mbc.10.12.4121. ЧВК  25747. PMID  10588647.
10. Ки Ю., Ю Дж. С., Хазука С. Д., Петерсон К. Э., Сюй СК, Шеллер Р. Х. (декабрь 1997 г.). «Субъединичная структура комплекса экзоцист млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (26): 14438–43. Bibcode:1997PNAS ... 9414438K. Дои:10.1073 / пнас.94.26.14438. ЧВК  25013. PMID  9405631.
11. Sans N, Prybylowski K, Petralia RS, Chang K, Wang YX, Racca C, Vicini S, Wenthold RJ (июнь 2003 г.). «Транспортировка рецептора NMDA через взаимодействие между белками PDZ и комплексом экзоцисты». Nat. Cell Biol. 5 (6): 520–530. Дои:10.1038 / ncb990. PMID  12738960. S2CID  13444388.
12. Иноуэ М., Чанг Л., Хванг Дж., Чан Ш., Салтиель А. Р. (апрель 2003 г.). «Комплекс экзоцисты необходим для доставки Glut4 к плазматической мембране инсулином» (PDF). Природа. 422 (6932): 629–633. Bibcode:2003Натура.422..629I. Дои:10.1038 / природа01533. HDL:2027.42/62982. PMID  12687004. S2CID  4395760.

дальнейшее чтение

• Ки Ю., Ю Дж. С., Хазука С. Д., Петерсон К. Э., Сюй С. К., Шеллер Р. Х. (1998). «Субъединичная структура комплекса экзоцист млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 94 (26): 14438–14443. Дои:10.1073 / пнас.94.26.14438. ЧВК  25013. PMID  9405631.
• Кикуно Р., Нагасе Т., Исикава К., Хиросава М., Миядзима Н., Танака А., Котани Н., Номура Н., Охара О. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XIV. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 6 (3): 197–205. Дои:10.1093 / днарес / 6.3.197. PMID  10470851.
• Soudeyns H, Champagne P, Holloway CL, Silvestri GU, Ringuette N, Samson J, Lapointe N, Sékaly RP (2000). «Временное расширение вариабельной области вариабельной области бета-цепи рецептора Т-клеток CD4 + и CD8 + Т-клеток на ранней стадии инфекции вируса иммунодефицита человека у детей: характеристика увеличенных популяций клеток с помощью фенотипирования рецепторов Т-клеток». J. Infect. Дис. 181 (1): 107–120. Дои:10.1086/315181. PMID  10608757.
• Игнатович О., Томлинсон И.М., Попов А.В., Брюггеманн М., Винтер Г. (2000). «Доминирование внутренних генетических факторов в формировании репертуара человеческого иммуноглобулина Vlambda». J. Mol. Биол. 294 (2): 457–465. Дои:10.1006 / jmbi.1999.3243. PMID  10610771.
• Хольтмайер В., Хеннеманн А., Каспари В.Ф. (2000). «Репертуары IgA и IgM V (H) в толстой кишке человека: данные о широко распространенных клонально размноженных В-клетках». Гастроэнтерология. 119 (5): 1253–1266. Дои:10.1053 / gast.2000.20219. PMID  11054383.
• Бримора А, Валова В.А., Ларсен М.Р., Руфогалис Б.Д., Робинсон П.Дж. (2001). «Комплекс экзоцисты мозга взаимодействует с RalA GTP-зависимым образом: идентификация нового гена Sec3 млекопитающих и второго гена Sec15». J. Biol. Chem. 276 (32): 29792–29797. Дои:10.1074 / jbc.C100320200. PMID  11406615.
• Иноуэ М., Чанг Л., Хван Дж, Чан Ш., Салтиель А.Р. (2003). «Комплекс экзоцисты необходим для доставки Glut4 к плазматической мембране инсулином» (PDF). Природа. 422 (6932): 629–633. Bibcode:2003Натура.422..629I. Дои:10.1038 / природа01533. HDL:2027.42/62982. PMID  12687004. S2CID  4395760.
• Москаленко С., Тонг С., Росс К., Мирей Г., Формстчер Е., Дэви Л., Камонис Дж., Уайт М.А. (2004). «ГТФазы Ral регулируют сборку экзоцист посредством взаимодействий двойных субъединиц». J. Biol. Chem. 278 (51): 51743–51748. Дои:10.1074 / jbc.M308702200. PMID  14525976.
• Ван С., Лю Й., Адамсон К.Л., Вальдез Г., Гуо В., Сюй СК (2005). «Экзоциста млекопитающих, комплекс, необходимый для экзоцитоза, ингибирует полимеризацию тубулина». J. Biol. Chem. 279 (34): 35958–35966. Дои:10.1074 / jbc.M313778200. PMID  15205466.
• Сюй К.Ф., Шен Х, Ли Х, Пачеко-Родригес Дж., Мосс Дж., Воан М. (2005). «Взаимодействие BIG2, белка гуанин-нуклеотидного обмена, ингибируемого брефельдином А, с белком экзоцисты Exo70». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 102 (8): 2784–2789. Bibcode:2005PNAS..102.2784X. Дои:10.1073 / pnas.0409871102. ЧВК  549493. PMID  15705715.
• Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белок-белок человека». Природа. 437 (7062): 1173–1178. Bibcode:2005 Натур.437.1173R. Дои:10.1038 / природа04209. PMID  16189514. S2CID  4427026.
• Босолей С.А., Виллен Дж., Гербер С.А., Раш Дж., Гиги С.П. (2006). «Вероятностный подход к высокопроизводительному анализу фосфорилирования белков и локализации сайтов». Nat. Биотехнология. 24 (10): 1285–1292. Дои:10.1038 / nbt1240. PMID  16964243. S2CID  14294292.

Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и ИнтерПро: IPR004140