Эндогеносимбиоз - Endogenosymbiosis

Эндогеносимбиоз является эволюционный процесс, предложенный эволюционным биологом и экологом Роберто Каццолла Гатти, в котором «генные носители» (вирусы, ретровирусы и бактериофаги ) и симбиотический прокариотический клетки (бактерии или археи ) могли делиться частями или всеми своими геномы в эндогенных симбиотических отношениях со своими хозяевами.[1][2][3][4]

Контекст

Связанный процесс симбиогенез или эндосимбиоз был предложен Линн Маргулис в 1967 году. Она утверждала, что внутренний симбиоз бактериоподобных организмов сформировал органеллы, подобные хлоропласты и митохондрии. Она предположила, что это создало эукариоты и, таким образом, стимулировали распространение жизни на Земле. Она утверждала, что этот процесс симбиотического сотрудничества шел вместе с классическим Дарвиновский цикл мутация, естественный отбор и приспособление.[5]

Генетический симбиоз от паразитов

Роберто Каццолла Гатти, доктор философии, доцент Томский государственный университет (Россия) утверждал в своей гипотезе, что «главной вероятной причиной эволюции полового размножения является паразитизм, также представляет собой происхождение биоразнообразия ". Другими словами, эта теория предполагает, что половое воспроизводство действует как консервативная система против включения новых генетических вариаций в ДНК клеток (поддерживаемых системами репарации ДНК) и, вместо этого, эволюция виды могут иметь место только тогда, когда эта консервативная система не в состоянии противостоять включению в геном хозяина гексогенных частей ДНК (и РНК), происходящих от обязанных «паразитарных» элементов (вирусов и фагов), которые устанавливают симбиоз со своими хозяевами ». Как писал Каццолла Гатти в своей оригинальной статье, две параллельные эволюционные линии - половое размножение, похоже, сохраняет то, что эндогеносимбиоз стремится разнообразить. Следуя первому процессу, виды могут медленно и бесконечно адаптироваться к внешним факторам, приспосабливая себя, но не «создавая» новизну. Последний процесс, напротив, приводит к видообразованию из-за внезапных изменений в последовательностях генов. Не только органеллы могут быть симбиотическими с другими клетками, как предположила Линн Маргулис, но и целые части генетического материала, полученные от симбиотических паразитов, могут быть включены в ДНК хозяина, изменяя экспрессию генов и обращаясь к процессу видообразования ".

Эта идея бросает вызов каноническим моделям естественного отбора, основанным на постепенности модели мутации-адаптации, обеспечивая большую поддержку теория прерывистого равновесия предложено Стивен Джей Гулд и Найлз Элдридж.

Доказательства

Два независимых исследования подтверждают эту гипотезу. Джейми Э. Хензи и Велкин Э. Джонсон продемонстрировали, что сложная эволюционная история семейства антивирусных генов IFIT (интерферон-индуцированные белки с тетратрикопептидными повторами) сформировалась в результате непрерывного взаимодействия между млекопитающее хосты и их многочисленные вирусы.[6]

Дэвид Энард и его коллеги подсчитали, что на долю вирусов приходится около 30% всех адаптивных аминокислота изменения в консервативной части протеома человека у млекопитающих. Их результаты предполагают, что вирусы являются одним из основных факторов эволюционных изменений протеомов млекопитающих и человека.[7]

Ранее было подсчитано, что около 7-8% всего генома человека содержат около 100 000 фрагментов ДНК, полученных из эндогенных ретровирусы. Это может быть заниженная оценка.[нужна цитата ]

В 2016 году биологи Сара Р. Бордестейн и Сет Р. Бордестейн сообщили, что гены часто передаются между хозяевами и паразитами. Эукариотические гены часто кооптируются вирусами, а бактериальные гены обычно встречаются в бактериофаги. Присутствие бактериофагов в симбиотических бактериях, которые обязательно проживают в эукариотах, может способствовать переносу эукариотической ДНК на бактериофаги.[8]

использованная литература

  1. ^ Каццолла Гатти, Роберто (2018). «Эндогеносимбиоз: от гипотезы к эмпирическим свидетельствам к единой симбиогенетической теории (УЗО)». Форум теоретической биологии. 11 (1–2): 13–26.
  2. ^ «Два новых исследования подтверждают гипотезу« эндогеносимбиоза »». Phys.org. Октябрь 2016 г.
  3. ^ Гатти, Роберто Каццолла (2015). «Новая идея об эволюции биоразнообразия». bioRxiv  10.1101/019828.
  4. ^ Каццолла Гатти, Роберто (01.03.2016). «Концептуальная модель новой гипотезы об эволюции биоразнообразия». Биология. 71 (3). Дои:10.1515 / biolog-2016-0032. ISSN  1336-9563.
  5. ^ Саган, Линн (1967). «О происхождении митозирующих клеток». J Теор Биол. 14 (3): 255–274. Дои:10.1016/0022-5193(67)90079-3. PMID  11541392.
  6. ^ Хензи, Дж. Э. и Джонсон, У. Э. 2016. Филогенетическое расследование выявляет пару паралогичных генов. eLife, 5, e17224
  7. ^ Энард, Д., Цай, Л., Гвеннап, С., и Петров, Д. А., 2016. Вирусы являются доминирующим фактором адаптации белков у млекопитающих. eLife, 5, e12469
  8. ^ Сара Р. Борденштейн и Сет Р. Борденштейн, модуль ассоциации эукариот в геномах фага WO из Wolbachia, Nature Communications 7, номер статьи: 13155 (2016) doi: 10.1038 / ncomms13155