GCFC2 - GCFC2

GCFC2
Идентификаторы
Псевдонимы	GCFC2, C2orf3, DNABF, GCF, TCF9, GC-богатая последовательность ДНК-связывающий фактор 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 189901 MGI: 2141656 ГомолоГен: 2411 Генные карты: GCFC2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 2 (человек)[1] Группа 2п12 Начинать 75,652,000 бп[1] Конец 75,710,985 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 | 6 C3 Начинать 81,923,669 бп[2] Конец 81,959,915 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Активность ДНК-связывающего фактора транскрипции • GO: 0000980 Связывание ДНК, специфичное для последовательности цис-регуляторной области РНК-полимеразы II • Связывание ДНК • GO: 0001078, GO: 0001214, GO: 0001206 ДНК-связывающая активность репрессора транскрипции, специфично для РНК-полимеразы II • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • ядрышко • ядро клетки • Сплайсосомный комплекс пост-мРНК высвобождения U2-типа • нуклеоплазма • цитозоль Биологический процесс • обработка мРНК • сборка сплайсосомального комплекса • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • транскрипция, ДНК-шаблон • Сплайсинг РНК • Сплайсинг мРНК через сплайсосомы Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	6936	330361
Ансамбль	ENSG00000005436	ENSMUSG00000035125
UniProt	P16383	Q8BKT3
RefSeq (мРНК)	NM_001201334 NM_001201335 NM_003203	NM_177884
RefSeq (белок)	NP_001188263 NP_001188264 NP_003194	NP_808552
Расположение (UCSC)	Chr 2: 75,65 - 75,71 Мб	Chr 6: 81.92 - 81.96 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ДНК-связывающий фактор GC-богатой последовательности это белок что у людей кодируется GCFC2 ген.^[5][6][7][8]

Первый мРНК транскрипт, выделенный для этого гена, был частью искусственного химера полученный из двух различных транскриптов генов и грунтовка используется в клонирование процесс (см. присоединение к Genbank M29204). Было установлено, что положительно заряженный амино-конец, присутствующий только в химере, связывает GC-богатые ДНК, ошибочно полагая, что это фактор транскрипции ген.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000005436 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000035125 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Johnson AC, Kageyama R, Popescu NC, Pastan I (февраль 1992 г.). «Экспрессия и хромосомная локализация гена репрессора транскрипции человека GCF». J Biol Chem. 267 (3): 1689–94. PMID  1370479.
6. Кагеяма Р., Пастан I (январь 1990 г.). «Молекулярное клонирование и характеристика фактора связывания ДНК человека, который подавляет транскрипцию». Клетка. 59 (5): 815–25. Дои:10.1016/0092-8674(89)90605-3. PMID  2556218. S2CID  21177070.
7. Anthoni H, Zucchelli M, Matsson H, Muller-Myhsok B, Fransson I, Schumacher J, Massinen S, Onkamo P, Warnke A, Griesemann H, Hoffmann P, Nopola-Hemmi J, Lyytinen H, Schulte-Korne G, Kere J , Nothen MM, Peyrard-Janvid M (апрель 2007 г.). «Локус на 2p12, содержащий совместно регулируемые гены MRPL19 и C2ORF3, связан с дислексией». Хум Мол Генет. 16 (6): 667–77. Дои:10.1093 / hmg / ddm009. PMID  17309879.
8. «Ген Энтреза: открытая рамка считывания 3 хромосомы C2orf3».

внешняя ссылка

• Человек GCFC2 расположение генома и GCFC2 страница сведений о генах в Браузер генома UCSC.

дальнейшее чтение

• Мао П (1999). «[Изменения кДНК и первичной структуры белка человеческого фактора транскрипции GCF]». Хоккайдо Игаку Засши. 74 (4): 315–30. PMID  10480038.
• Такимото М., Мао П, Вэй Г. и др. (1999). «Молекулярный анализ гена GCF выявляет изменения кДНК и аминокислотной последовательности (1)». Биохим. Биофиз. Acta. 1447 (1): 125–31. Дои:10.1016 / S0167-4781 (99) 00127-X. PMID  10500253.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Ота Т., Сузуки Ю., Нисикава Т. и др. (2004). «Полное секвенирование и характеристика 21 243 полноразмерных кДНК человека». Nat. Genet. 36 (1): 40–5. Дои:10,1038 / ng1285. PMID  14702039.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). «Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)». Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Hillier LW, Graves TA, Fulton RS и др. (2005). «Создание и аннотирование последовательностей ДНК хромосом 2 и 4 человека». Природа. 434 (7034): 724–31. Дои:10.1038 / природа03466. PMID  15815621.
• Олсен Ю.В., Благоев Б., Гнад Ф. и др. (2006). «Глобальная, in vivo и сайт-специфическая динамика фосфорилирования в сигнальных сетях». Клетка. 127 (3): 635–48. Дои:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID  17081983. S2CID  7827573.