GIT2 - GIT2

GIT2
Идентификаторы
Псевдонимы	GIT2, КАТ-2, КАТ2, ПКЛ, GIT ArfGAP 2
Внешние идентификаторы	OMIM: 608564 MGI: 1347053 ГомолоГен: 41336 Генные карты: GIT2
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q24.11 Начните 109,929,802 бп[1] Конец 109,996,389 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 5 (мышь)[2] Группа 5 | 5 F Начните 114,727,407 бп[2] Конец 114,775,517 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • GO: 0001948 связывание с белками • связывание ионов металлов • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Активность активатора GTPase Сотовый компонент • очаговая адгезия • нуклеоплазма Биологический процесс • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • регуляция сигнального пути белка рецептора, связанного с G-белком Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	9815	26431
Ансамбль	ENSG00000139436	ENSMUSG00000041890
UniProt	Q14161	Q9JLQ2
RefSeq (мРНК)	NM_001135213 NM_001135214 NM_014776 NM_057169 NM_057170 NM_139201 NM_001330153 NM_001330154	NM_001077359 NM_001077360 NM_019834 NM_001347400
RefSeq (белок)	NP_001128685 NP_001128686 NP_001317082 NP_001317083 NP_055591 NP_476510 NP_476511 NP_631940	NP_001070827 NP_001070828 NP_001334329 NP_062808
Расположение (UCSC)	Chr 12: 109.93 - 110 Мб	Chr 5: 114,73 - 114,78 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

ARF GTPase-активирующий белок GIT2 является фермент что у людей кодируется GIT2 ген.^[5][6][7]

Функция

Этот ген кодирует член семейства белков GIT. Белки GIT взаимодействуют с G-протеиновыми рецепторными киназами и обладают активностью АДФ-фактора рибозилирования (ARF), GTPase-активирующего белка (GAP). Этот ген подвергается обширному альтернативному сплайсингу; хотя было описано десять вариантов транскрипта, полная последовательность была определена только для четырех вариантов. Различные изоформы имеют функциональные различия в отношении активности ARF GAP и связывания G-протеина-рецепторной киназы 2.^[7]

Модельные организмы

Git2 нокаутный фенотип мыши

Характеристика	Фенотип
Гомозигота жизнеспособность	Нормальный
Плодородие	Нормальный
Масса тела	Нормальный
Тревога	Нормальный
Неврологический осмотр	Нормальный
Сила захвата	Нормальный
Горячая тарелка	Аномальный[8]
Дисморфология	Нормальный
Косвенная калориметрия	Нормальный
Тест толерантности к глюкозе	Нормальный
Слуховой ответ ствола мозга	Нормальный
DEXA	Нормальный[9]
Рентгенография	Нормальный
Температура тела	Нормальный
Морфология глаза	Нормальный[10]
Клиническая химия	Аномальный[11]
Гематология	Аномальный[12]
Лимфоциты периферической крови	Нормальный
Микроядерный тест	Нормальный
Вес сердца	Нормальный
Эпидермис хвоста цельный	Нормальный
Гистопатология кожи	Нормальный
Гистопатология мозга	Аномальный
Все тесты и анализы от[13][14]

Модельные организмы были использованы при изучении функции GIT2. Условный нокаутирующая мышь линия, называемая Git2^{Gt (XG510) Byg[15][16]} был создан как часть Международный консорциум Knockout Mouse программа - проект высокопроизводительного мутагенеза для создания и распространения моделей болезней на животных среди заинтересованных ученых - в Wellcome Trust Sanger Institute.^[17][18][19]

Самцы и самки животных прошли стандартизованный фенотипический скрининг для определения последствий удаления.^[13][20] Мышей не хватает Git2 не имели существенных дефектов жизнеспособности или плодородие,^[21][22] были проведены дальнейшие испытания и четыре значительных фенотипы было сообщено:^[13][20]

• Мутант мыши имели различия в их клинический биохимический анализ крови в сравнении с дикого типа контрольные мыши.
• У мутантных мышей-самцов наблюдалось снижение количество лейкоцитов.
• Увеличенная толщина в гиппокамп наблюдалось.
• Самки мышей-мутантов медленнее реагировали на тепло при помещении на горячая тарелка.

Взаимодействия

GIT2 был показан взаимодействовать с участием GIT1.^[23]

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000139436 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000041890 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Premont RT, Claing A, Vitale N, Freeman JL, Pitcher JA, Patton WA, Moss J, Vaughan M, Lefkowitz RJ (ноябрь 1998 г.). «Регулирование бета2-адренорецепторов с помощью GIT1, белка, активирующего GTPase, фактора рибозилирования АДФ, связанного с G-белком, киназой». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 95 (24): 14082–7. Дои:10.1073 / пнас.95.24.14082. ЧВК  24330. PMID  9826657.
6. Premont RT, Claing A, Vitale N, Perry SJ, Lefkowitz RJ (июль 2000 г.). «Семейство GIT белков, активирующих GTPase фактора ADP-рибозилирования. Функциональное разнообразие GIT2 посредством альтернативного сплайсинга». Журнал биологической химии. 275 (29): 22373–80. Дои:10.1074 / jbc.275.29.22373. PMID  10896954.
7. «Ген Entrez: GIT2 G-протеин-связанный рецептор киназы, взаимодействующий 2».
8. "Данные Hotplate для Git2". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
9. «Данные DEXA для Git2». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
10. "Данные морфологии глаза для Git2". Wellcome Trust Институт Сэнгера.
11. «Данные клинической химии для Git2». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
12. «Гематологические данные для Git2». Wellcome Trust Институт Сэнгера.
13. Гердин А.К. (2010). "Программа генетики Sanger Mouse: характеристика мышей с высокой пропускной способностью". Acta Ophthalmologica. 88: 925–7. Дои:10.1111 / j.1755-3768.2010.4142.x. S2CID  85911512.
14. Портал ресурсов мыши, Институт Wellcome Trust Sanger.
15. «Международный консорциум нокаут-мышей».
16. "Информатика генома мыши".
17. Скарнес В.К., Розен Б., Вест А.П., Кутсуракис М., Бушелл В., Айер В., Мухика А.О., Томас М., Харроу Дж., Кокс Т., Джексон Д., Северин Дж., Биггс П., Фу Дж., Нефедов М., де Йонг П.Дж., Стюарт AF, Брэдли А. (июнь 2011 г.). «Ресурс условного нокаута для полногеномного исследования функции генов мыши». Природа. 474 (7351): 337–42. Дои:10.1038 / природа10163. ЧВК  3572410. PMID  21677750.
18. Долгин Э (июнь 2011 г.). "Библиотека мыши настроена на нокаут". Природа. 474 (7351): 262–3. Дои:10.1038 / 474262a. PMID  21677718.
19. Коллинз Ф.С., Россант Дж., Вурст В. (январь 2007 г.). «Мышь по всем причинам». Ячейка. 128 (1): 9–13. Дои:10.1016 / j.cell.2006.12.018. PMID  17218247. S2CID  18872015.
20. ван дер Вейден Л., Уайт Дж. К., Адамс Д. Д., Логан Д. В. (2011). «Набор инструментов генетики мышей: раскрытие функции и механизма». Геномная биология. 12 (6): 224. Дои:10.1186 / gb-2011-12-6-224. ЧВК  3218837. PMID  21722353.
21. Wellcome Trust Институт Сэнгера. "Жизнеспособность данных об отлучении от Git2". Портал ресурсов мыши. www.sanger.ac.Великобритания. Внешняя ссылка в | publisher = (Помогите)
22. Wellcome Trust Институт Сэнгера. "Данные о фертильности для Git2". Портал ресурсов мыши. www.sanger.ac.Великобритания. Внешняя ссылка в | publisher = (Помогите)
23. Kim S, Ko J, Shin H, Lee JR, Lim C, Han JH, Altrock WD, Garner CC, Gundelfinger ED, Premont RT, Kaang BK, Kim E (февраль 2003 г.). «Семейство белков GIT образует мультимеры и ассоциируется с пресинаптическим белком цитоматрицы Piccolo». Журнал биологической химии. 278 (8): 6291–300. Дои:10.1074 / jbc.M212287200. PMID  12473661.

дальнейшее чтение

• Накадзима Д., Окадзаки Н., Ямакава Х., Кикуно Р., Охара О., Нагасе Т. (июнь 2002 г.). «Конструирование готовых к экспрессии клонов кДНК для генов KIAA: ручное культивирование 330 клонов кДНК KIAA». ДНК исследования. 9 (3): 99–106. Дои:10.1093 / днарес / 9.3.99. PMID  12168954.
• Hoefen RJ, Berk BC (апрель 2006 г.). «Многофункциональное семейство белков ЖКТ». Журнал клеточной науки. 119 (Pt 8): 1469–75. Дои:10.1242 / jcs.02925. PMID  16598076.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Нагасе Т., Секи Н., Танака А., Исикава К., Номура Н. (август 1995 г.). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. IV. Кодирующие последовательности 40 новых генов (KIAA0121-KIAA0160), полученные путем анализа клонов кДНК из линии клеток человека KG-1». ДНК исследования. 2 (4): 167–74, 199–210. Дои:10.1093 / dnares / 2.4.167. PMID  8590280.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Тернер С.Э., Браун М.С., Перротта Дж. А., Риди М. С., Николопулос С. Н., Макдональд А. Р., Багродиа С., Томас С., Левенталь П. С. (май 1999 г.). «Мотив паксиллина LD4 связывает PAK и PIX через новый анкириновый повтор 95 кДа, белок ARF-GAP: роль в ремоделировании цитоскелета». Журнал клеточной биологии. 145 (4): 851–63. Дои:10.1083 / jcb.145.4.851. ЧВК  2133183. PMID  10330411.
• Багродиа С., Бейли Д., Ленард З., Харт М., Гуан Дж. Л., Премонт Р. Т., Тейлор С. Дж., Церионе Р. А. (август 1999 г.). «Фосфорилированный тирозин белок, который связывается с важной регуляторной областью холодного семейства p21-активированных белков, связывающих киназу». Журнал биологической химии. 274 (32): 22393–400. Дои:10.1074 / jbc.274.32.22393. PMID  10428811.
• Витале Н., Паттон В.А., Мосс Дж., Воган М., Лефковиц Р.Дж., Премонт RT (май 2000 г.). «Белки GIT, новое семейство фосфатидилинозитол 3,4,5-трифосфат-стимулированных белков, активирующих GTPase для ARF6». Журнал биологической химии. 275 (18): 13901–6. Дои:10.1074 / jbc.275.18.13901. PMID  10788515.
• Hoja MR, Wahlestedt C, Höög C (август 2000 г.). «Стратегия визуальной внутриклеточной классификации не охарактеризованных белков человека». Экспериментальные исследования клеток. 259 (1): 239–46. Дои:10.1006 / excr.2000.4948. PMID  10942595.
• Ку Г.М., Яблонски Д., Мансер Е., Лим Л., Вайс А. (февраль 2001 г.). «Комплекс PAK1-PIX-PKL активируется Т-клеточным рецептором независимо от Nck, Slp-76 и LAT». Журнал EMBO. 20 (3): 457–65. Дои:10.1093 / emboj / 20.3.457. ЧВК  133476. PMID  11157752.
• Мазаки Ю., Хашимото С., Окава К., Цубучи А., Накамура К., Яги Р., Яно Х., Кондо А., Ивамацу А., Мидзогути А., Сабэ Х. (март 2001 г.). «Белок, активирующий АДФ-рибозилирование, GTPase-активирующий белок Git2-short / KIAA0148, участвует в субклеточной локализации паксиллина и актиновой организации цитоскелета». Молекулярная биология клетки. 12 (3): 645–62. Дои:10.1091 / mbc.12.3.645. ЧВК  30970. PMID  11251077.
• Kim S, Ko J, Shin H, Lee JR, Lim C, Han JH, Altrock WD, Garner CC, Gundelfinger ED, Premont RT, Kaang BK, Kim E (февраль 2003 г.). «Семейство белков GIT образует мультимеры и ассоциируется с пресинаптическим белком цитоматрицы Piccolo». Журнал биологической химии. 278 (8): 6291–300. Дои:10.1074 / jbc.M212287200. PMID  12473661.
• Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB, Mukherji M, Stettler-Gill M, Peters EC (май 2004 г.). «Надежное фосфопротеомное профилирование сайтов фосфорилирования тирозина из Т-клеток человека с использованием аффинной хроматографии с иммобилизованным металлом и тандемной масс-спектрометрии». Аналитическая химия. 76 (10): 2763–72. Дои:10.1021 / ac035352d. PMID  15144186.
• Premont RT, Perry SJ, Schmalzigaug R, Roseman JT, Xing Y, Claing A (сентябрь 2004 г.). «Комплекс GIT / PIX: олигомерная сборка белков, активирующих GTPase ARF семейства GIT и факторов обмена гуаниновых нуклеотидов Rac1 / Cdc42 семейства PIX». Сотовая связь. 16 (9): 1001–11. Дои:10.1016 / j.cellsig.2004.02.002. PMID  15212761.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С., Уэллс К. Д., Фосетт Дж. П., Кулкарни С., Метальников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вудгетт-младший, Лангеберг Л. . «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Текущая биология. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660. S2CID  2371325.