GTPBP3 - GTPBP3
Модификация тРНК GTPase GTPBP3, митохондриальная является фермент что в человеке кодируется GTPBP3 ген на хромосоме 19.[5][6]
Ген GTPBP3 кодирует GTP -связывающий белок, эволюционно сохраненный от бактерий до млекопитающих [7] и который локализован на митохондрия и функции в тРНК модификация.[6] По крайней мере, две основные изоформы из-за альтернативное сращивание известны Кроме того, полиморфизм на валин 250 известен и может влиять на глухоту, вызванную аминоглидозидами.[6]
Структура
Ген GTPBP3 содержит 10 экзонов,[6] и кодирует ~ 44 кДа GTP -связывающий белок, который эволюционно сохраняется от бактерий до млекопитающих.[7] N-концевой домен модификации митохондриальной тРНК GTPase опосредует димеризацию белка калий-независимым образом,[8] что, как полагают, связано со строительством сайта связывания для донора из одной углеродной единицы в его тРНК функция реакции модификации.[8]
Функция
Модификация митохондриальной тРНК Считается, что ГТФаза катализирует образование 5-тауринометилуридина (τm (5) U) в положении антикодонного колебания пяти митохондриальных тРНК.[9] Ген был впервые обнаружен в дрожжах, где мутация дрожжевого гомолога человеческого GTPBP3, MSS1, вызывает респираторный дефект у дрожжей только тогда, когда митохондрии 155 рРНК P (R) 454 присутствует. Последний эквивалент человека 12 рРНК Мутация A1555G, которая, как было установлено, связана с глухотой. Следовательно, GTPBP3 и его дрожжевой гомолог выполняют функцию модификации митохондриальной функции. У человека GTPBP3 повсеместно экспрессируется во множестве тканей в множестве транскриптов.[7] Считается, что в качестве фермента модификации тРНК он действует для модификации взаимодействия кодон-антикодон, что согласуется с его модификацией тяжести фенотипов в мутации 12S рРНК A1555G.
Клиническое значение
Известно, что мутации в GTPBP3 вызывают гипертрофическая кардиомиопатия и митохондриальные дефекты.[9] Лица с гомозиготный или же составной гетерозиготный мутации в GTPBP3 с комбинированным дефицитом дыхательная цепь комплексы в скелетных мышцах,[9] которые требуют митохондриальной трансляции комплексных субъединиц, кодируемых митохондриями, для сборки. Мутации GTPBP3 вызывают серьезные дефекты трансляции митохондрий. Большинство охарактеризованных субъектов имели лактоацидоз и гипертрофическая кардиомиопатия.
Полиморфизм валина 250 на GTPBP3 связан с тяжестью вызванной аминогликозидами глухоты у человека, заболевания, связанного с гомоплазменный Мутация A1555G в кодируемой митохондриями 12S рРНК характеризуется глухотой, варьирующей от глубокой врожденной потери слуха до нормального слуха.
Рекомендации
- ^ а б c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000130299 - Ансамбль, Май 2017
- ^ а б c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000007610 - Ансамбль, Май 2017
- ^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
- ^ Магрини С.М., Папи М.Г., Марлетта Ф., Томаселли С., Челлай Э., Мунгай В., Бити Дж. (Апрель 1993 г.). «Хордома-естественная история, лечение и прогноз. Опыт отделения лучевой терапии Флоренции (1956–1990) и критический обзор литературы». Acta Oncologica. 31 (8): 847–51. Дои:10.3109/02841869209089717. PMID 1290633.
- ^ а б c d «Ген Entrez: GTPBP3 GTP-связывающий белок 3 (митохондриальный)».
- ^ а б c Ли X, Гуань MX (2002). «Человеческий митохондриальный GTP-связывающий белок, связанный с модификацией тРНК, может модулировать фенотипическую экспрессию митохондриальной мутации 12S рРНК, связанной с глухотой». Мол. Клетка. Биол. 22 (21): 7701–11. Дои:10.1128 / mcb.22.21.7701-7711.2002. ЧВК 135671. PMID 12370316.
- ^ а б Вильярроя М., Прадо С., Эстеве Дж. М., Сориано М. А., Агуадо С., Перес-Мартинес Д., Мартинес-Феррандис Д. И., Йим Л., Виктор В. М., Себолла Е., Монтанер А., Кнехт Е., Арменгод М. Э. (2008). «Характеристика человеческого GTPBP3, GTP-связывающего белка, участвующего в модификации митохондриальной тРНК». Мол. Клетка. Биол. 28 (24): 7514–31. Дои:10.1128 / MCB.00946-08. ЧВК 2593442. PMID 18852288.
- ^ а б c Копайтич Р., Николлс Т.Дж., Рорбах Дж., Методиев М.Д., Фрайзингер П., Мандель Х., Ванландер А., Геззи Д., Карроццо Р., Тейлор Р.В., Марквард К., Мураяма К., Виланд Т., Шварцмайр Т., Майр Дж. , Saada A, Ohtake A, Invernizzi F, Lamantea E, Sommerville EW, Pyle A, Chinnery PF, Crushell E, Okazaki Y, Kohda M, Kishita Y, Tokuzawa Y, Assouline Z, Rio M, Feillet F, Mousson de Camaret B , Chretien D, Munnich A, Menten B, Sante T, Smet J, Régal L, Lorber A, Khoury A, Zeviani M, Strom TM, Meitinger T, Bertini ES, Van Coster R, Klopstock T, Rötig A, Haack TB, Минчук М, Прокиш Х (2014). «Мутации в GTPBP3 вызывают дефект трансляции митохондрий, связанный с гипертрофической кардиомиопатией, лактоацидозом и энцефалопатией». Являюсь. J. Hum. Genet. 95 (6): 708–20. Дои:10.1016 / j.ajhg.2014.10.017. ЧВК 4259976. PMID 25434004.
дальнейшее чтение
- Ли X, Гуань MX (ноябрь 2002 г.). «Человеческий митохондриальный GTP-связывающий белок, связанный с модификацией тРНК, может модулировать фенотипическую экспрессию митохондриальной мутации 12S рРНК, связанной с глухотой». Молекулярная и клеточная биология. 22 (21): 7701–11. Дои:10.1128 / MCB.22.21.7701-7711.2002. ЧВК 135671. PMID 12370316.
- Ли X, Гуань MX (декабрь 2003 г.). «Идентификация и характеристика гена GTPBP3 мыши, кодирующего митохондриальный GTP-связывающий белок, участвующий в модификации тРНК». Сообщения о биохимических и биофизических исследованиях. 312 (3): 747–54. Дои:10.1016 / j.bbrc.2003.10.187. PMID 14680828.
- Быховская Ю., Менгеша Е., Ван Д., Ян Х., Эстивилл Х, Шохат М., Фишель-Годсиан Н. (ноябрь 2004 г.). «Фенотип несиндромальной глухоты, связанный с митохондриальной мутацией A1555G, модулируется ферментами, модифицирующими митохондриальную РНК, MTO1 и GTPBP3». Молекулярная генетика и метаболизм. 83 (3): 199–206. Дои:10.1016 / j.ymgme.2004.07.009. PMID 15542390.
- Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг Д.С., Чжан Л.В., Вонг С.Л., Франклин Дж., Ли С., Альбала Дж. С., Лим Дж., Фраутон С., Лламосас Э, Чевик С., Бекс С., Ламеш П., Сикорски Р. С., Ванденхаут Дж., Зогби HY, Смоляр А., Босак С., Секерра Р., Дусет-Штамм Л., Кусик М.Э., Хилл Д.Е., Рот Ф.П., Видаль М. (октябрь 2005 г.). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Лим Дж., Хао Т., Шоу К., Патель А.Дж., Сабо Дж., Руал Дж. Ф., Фиск С.Дж., Ли Н., Смоляр А., Хилл Д.Е., Барабаши А.Л., Видал М., Зогби Х.Ю. (май 2006 г.). «Сеть межбелкового взаимодействия для унаследованных атаксий человека и нарушений дегенерации клеток Пуркинье». Клетка. 125 (4): 801–14. Дои:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
 | Эта статья о ген на хромосома человека 19 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это. |