HARS - HARS

HARS1
Доступные конструкции
PDB	Поиск ортолога: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB
	1X59, 2LW7, 4G84, 4G85, 4PHC, 4X5O
Идентификаторы
Псевдонимы	HARS1, HRS, USH3B, CMT2W, гистидил-тРНК синтетаза, HARS, гистидил-тРНК синтетаза 1
Внешние идентификаторы	OMIM: 142810 MGI: 108087 ГомолоГен: 1592 Генные карты: HARS1
Расположение гена (человек)
Chr.	Хромосома 5 (человек)
Конец	140,691,537 бп
Расположение гена (Мышь)
Chr.	Хромосома 18 (мышь)
Конец	36,783,205 бп
Экспрессия РНК шаблон
	Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология
Молекулярная функция	• аминоацил-тРНК лигазная активность; • связывание нуклеотидов; • активность лигазы; • Связывание АТФ; • гистидин-тРНК лигазная активность; • идентичное связывание с белками;
Сотовый компонент	• цитоплазма; • митохондрия; • цитозоль;
Биологический процесс	• аминоацилирование тРНК для трансляции белков; • биосинтез белка; • митохондриальный перевод; • аминоацилирование гистидил-тРНК;
	Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
	3035
	15115
	ENSG00000170445
	ENSMUSG00000001380
	P12081
	Q61035
NM_002109; NM_001258040; NM_001258041; NM_001258042; NM_001289092;
	NM_001289093; NM_001289094
	NM_008214
NP_001244969; NP_001244970; NP_001244971; NP_001276021; NP_001276022;
	NP_001276023; NP_002100
	NP_032240
	Викиданные
Просмотр / редактирование человека	Просмотр / редактирование мыши

Гистидил-тРНК синтетаза (HARS) также известен как гистидин-тРНК лигаза, является фермент который у человека кодируется HARS ген.^[5]^[6]

Функция

Аминоацил-тРНК-синтетазы - это класс ферментов, которые заряжают тРНК с их родственными аминокислоты. Белок, кодируемый этим геном, представляет собой цитоплазматический фермент, который принадлежит к семейству II класса аминоацил тРНК синтетазы. Фермент отвечает за синтез РНК для переноса гистидила, которая необходима для включения гистидин в белки.^[7] Ген расположен в ориентации голова к голове с HARSL на пятой хромосоме, где гомологичные гены имеют двунаправленный промоутер.^[5]

Клиническое значение

Продукт гена - частая цель аутоантитела при аутоиммунном заболевании человека полимиозит /дерматомиозит.^[7]

Взаимодействия

HARS был показан взаимодействовать с участием EEF1B2^[8] и EEF1G.^[8]

использованная литература

^ ^а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170445 - Ансамбль, Май 2017
^ ^а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001380 - Ансамбль, Май 2017
^ "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
^ ^а ^б «Ген Entrez: гистидил-тРНК синтетаза HARS».
^ Васмут Дж. Дж., Карлок Л. Р. (1986). «Хромосомная локализация человеческого гена гистидил-тРНК синтетазы: кластеризация генов, кодирующих аминоацил-тРНК синтетазы, на хромосоме 5 человека». Сомат. Cell Mol. Genet. 12 (5): 513–7. Дои:10.1007 / BF01539922. PMID 3464104. S2CID 28520231.
^ ^а ^б Фрайст В., Верхей Дж. Ф., Рюльманн А., Гаусс Д. Х., Арнез Дж. Г. (1999). «Гистидил-тРНК синтетаза». Биол. Chem. 380 (6): 623–46. Дои:10.1515 / BC.1999.079. PMID 10430027.
^ ^а ^б Сан Ли Дж, Гю Пак С., Пак Х, Соль В., Ли С., Ким С. (2002). «Сеть взаимодействия человеческих аминоацил-тРНК синтетаз и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 291 (1): 158–64. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6398. PMID 11829477.

дальнейшее чтение

Рабен Н., Борриелло Ф., Амин Дж., Хорвиц Р., Фрейзер Д., Плотц П. (1992). «Гистидил-тРНК-синтетаза человека: распознавание сигнатурных участков аминокислот в аминоацил-тРНК-синтетазах класса 2а». Нуклеиновые кислоты Res. 20 (5): 1075–81. Дои:10.1093 / nar / 20.5.1075. ЧВК 312093. PMID 1549469.
Ши М.Х., Цуй Ф.В., Рубин Л.А. (1991). «Клеточная локализация структур-мишеней, распознаваемых антителом против Jo-1: иммунофлуоресцентные исследования на культивируемых миобластах человека». J. Rheumatol. 18 (2): 252–8. PMID 2023220.
Карлок Л. Р., Скареки Д., Дана С. Л., Васмут Дж. Дж. (1985). «Делеционное картирование хромосомы 5 человека с использованием хромосом-специфичных ДНК-зондов». Am. J. Hum. Genet. 37 (5): 839–52. ЧВК 1684692. PMID 2996334.
Васмут Дж. Дж., Карлок Л. Р. (1986). «Хромосомная локализация человеческого гена гистидил-тРНК синтетазы: кластеризация генов, кодирующих аминоацил-тРНК синтетазы, на хромосоме 5 человека». Сомат. Cell Mol. Genet. 12 (5): 513–7. Дои:10.1007 / BF01539922. PMID 3464104. S2CID 28520231.
Цуй FW, Симинович L (1987). «Выделение, структура и экспрессия генов млекопитающих для гистидил-тРНК синтетазы». Нуклеиновые кислоты Res. 15 (8): 3349–67. Дои:10.1093 / nar / 15.8.3349. ЧВК 340734. PMID 3554142.
О'Хэнлон Т.П., Рабен Н., Миллер Ф.В. (1995). «Новый ген, ориентированный в конфигурации« голова к голове »с геном гистидил-тРНК синтетазы человека (HRS), кодирует мРНК, которая предсказывает полипептид, гомологичный HRS». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 210 (2): 556–66. Дои:10.1006 / bbrc.1995.1696. PMID 7755634.
Огата К., Курахаши А., Нишияма С., Терао К. (1994). «Наличие роли белкового комплекса 5SrRNA-L5 (5SRNP) в комплексе треонил- и гистидил-тРНК синтетазы в цитозоле печени крысы». Биохим. Биофиз. Acta. 1218 (3): 388–400. Дои:10.1016/0167-4781(94)90192-9. PMID 8049265.
Маруяма К., Сугано С. (1994). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Цуй Х.В., Мок С., де Соуза Л., Мартин А., Цуй Ф.В. (1993). «Транскрипционный анализ области гена, кодирующей гистидил-тРНК синтетазу человека: идентификация нового двунаправленного регуляторного элемента». Ген. 131 (2): 201–8. Дои:10.1016 / 0378-1119 (93) 90294-Д. PMID 8406012.
Васкес-Абад Д., Карсон Дж. Х., Ротфилд Н. (1996). «Локализация гистидил-тРНК синтетазы (Jo-1) в клеточной линии эпителиальной карциномы гортани человека (клетки HEp-2)». Клеточная ткань Res. 286 (3): 487–91. Дои:10.1007 / s004410050718. PMID 8929351. S2CID 1552865.
Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (1997). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Сан Ли Дж, Гю Пак С., Пак Х, Соль В., Ли С., Ким С. (2002). «Сеть взаимодействия человеческих аминоацил-тРНК синтетаз и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 291 (1): 158–64. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6398. PMID 11829477.
О'Хэнлон Т.П., Миллер Ф.В. (2002). «Геномная организация, транскрипционное картирование и эволюционные последствия человеческого двунаправленного локуса гистидил-тРНК синтетазы (HARS / HARSL)». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 294 (3): 609–14. Дои:10.1016 / S0006-291X (02) 00525-9. PMID 12056811.
Ашерман Д.П., Орисс ТБ, Oddis CV, Wright TM (2002). «Критическое требование для профессиональных APC для выявления Т-клеточных ответов на новые фрагменты гистидил-тРНК синтетазы (Jo-1) при полимиозите с положительным антителом Jo-1». J. Immunol. 169 (12): 7127–34. Дои:10.4049 / jimmunol.169.12.7127. PMID 12471150.
Лу К., Хоуп Л. В., Браш М., Рейнхард К., Коэн С. Н. (2003). «Взаимодействие TSG101 с HRS опосредует эндосомный трафик и подавление рецепторов». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 100 (13): 7626–31. Дои:10.1073 / pnas.0932599100. ЧВК 164637. PMID 12802020.
Руал Дж. Ф., Венкатесан К., Хао Т., Хирозане-Кишикава Т., Дрикот А., Ли Н., Беррис Г. Ф., Гиббонс Ф. Д., Дрезе М., Айви-Гедехуссу Н., Клитгорд Н., Саймон К., Боксем М., Мильштейн С., Розенберг Дж., Голдберг DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Секерра Р., Дусетт-Штамм Л., Кьюсик М.Э., Хилл Д.Е., Рот П.П., Видаль М. (2005). «К карте протеомного масштаба сети взаимодействия белка и белка человека». Природа. 437 (7062): 1173–8. Дои:10.1038 / природа04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Левин С.М., Рабен Н., Се Д., Аскин Ф. Б., Тудер Р., Маллинс М., Розен А., Кашиола-Розен Л. А. (2007). «Новая конформация гистидил-транспортной РНК-синтетазы в легких: ткань-мишень при миозите, ассоциированном с аутоантителами Jo-1». Ревматоидный артрит. 56 (8): 2729–39. Дои:10.1002 / арт.22790. PMID 17665459.

Эта статья о ген на хромосома человека 5 это заглушка. Вы можете помочь Википедии расширяя это.

[refGRCh38Ensembl-1] а ^б ^c ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000170445 - Ансамбль, Май 2017

[refGRCm38Ensembl-2] а ^б ^c GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000001380 - Ансамбль, Май 2017

[3] "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[4] "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.

[entrez-5] а ^б «Ген Entrez: гистидил-тРНК синтетаза HARS».

[pmid3464104-6] Васмут Дж. Дж., Карлок Л. Р. (1986). «Хромосомная локализация человеческого гена гистидил-тРНК синтетазы: кластеризация генов, кодирующих аминоацил-тРНК синтетазы, на хромосоме 5 человека». Сомат. Cell Mol. Genet. 12 (5): 513–7. Дои:10.1007 / BF01539922. PMID 3464104. S2CID 28520231.

[pmid10430027-7] а ^б Фрайст В., Верхей Дж. Ф., Рюльманн А., Гаусс Д. Х., Арнез Дж. Г. (1999). «Гистидил-тРНК синтетаза». Биол. Chem. 380 (6): 623–46. Дои:10.1515 / BC.1999.079. PMID 10430027.

[pmid11829477-8] а ^б Сан Ли Дж, Гю Пак С., Пак Х, Соль В., Ли С., Ким С. (2002). «Сеть взаимодействия человеческих аминоацил-тРНК синтетаз и субъединиц комплекса фактора элонгации 1». Biochem. Биофиз. Res. Сообщество. 291 (1): 158–64. Дои:10.1006 / bbrc.2002.6398. PMID 11829477.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]