HDAC7 - HDAC7

HDAC7
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3C0Y, 3C0Z, 3C10, 3ZNR, 3ZNS
Идентификаторы
Псевдонимы	HDAC7, HD7A, HDAC7A, HD7, гистондеацетилаза 7
Внешние идентификаторы	OMIM: 606542 MGI: 1891835 ГомолоГен: 9124 Генные карты: HDAC7
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 12 (человек)[1] Группа 12q13.11 Начните 47,782,722 бп[1] Конец 47,833,132 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 15 (мышь)[2] Группа 15 | 15 F1 Начните 97,792,664 бп[2] Конец 97,844,502 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • связывание ионов металлов • GO: 0001106 транскрипционная корепрессорная активность • связывание протеинкиназы • 14-3-3 связывание с белками • гидролазная активность • связывание протеинкиназы C • активация связывания фактора транскрипции • репрессия связывания фактора транскрипции • связывание хроматина • активность гистондеацетилазы • НАД-зависимая активность гистондеацетилазы (специфическая для H3-K14) • GO: 0001948 связывание с белками • SUMO трансферазная активность Сотовый компонент • нуклеоплазма • цитоплазма • ядро клетки • гистондеацетилазный комплекс • цитозоль Биологический процесс • транскрипция, ДНК-шаблон • отрицательная регуляция передачи сигналов NIK / NF-kappaB • положительное регулирование миграции клеток, участвующих в прорастании ангиогенеза • сборка ячейки-ячейки • васкулогенез • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • деацетилирование гистона H3 • отрицательная регуляция дифференцировки остеобластов • отрицательная регуляция продукции интерлейкина-2 • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • деацетилирование гистонов • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • организация хроматина • белковое сумоилирование Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Виды	Человек	Мышь
Entrez	51564	56233
Ансамбль	ENSG00000061273	ENSMUSG00000022475
UniProt	Q8WUI4	Q8C2B3
RefSeq (мРНК)	NM_001098416 NM_001308090 NM_015401 NM_016596 NM_001368046	NM_001204275 NM_001204276 NM_001204277 NM_001204278 NM_001204279 NM_001204280 NM_001204281 NM_019572 NM_001378971
RefSeq (белок)	NP_001091886 NP_001295019 NP_056216 NP_001354975	NP_001191204 NP_001191205 NP_001191206 NP_001191207 NP_001191208 NP_001191209 NP_001191210 NP_062518 NP_001365900
Расположение (UCSC)	Chr 12: 47,78 - 47,83 Мб	Chr 15: 97,79 - 97,84 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистоновая деацетилаза 7 является фермент что у людей кодируется HDAC7 ген.^[5][6][7]

Функция

Гистоны играют решающую роль в регуляции транскрипции, прогрессии клеточного цикла и событиях развития. Ацетилирование / деацетилирование гистонов изменяет структуру хромосом и влияет на доступ факторов транскрипции к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, имеет гомологию последовательностей с членами семейства гистондеацетилаз. Этот ген является ортологом мышиного гена HDAC7, белок которого способствует репрессии, опосредованной транскрипционным корепрессором SMRT. Для этого гена обнаружено множество альтернативно сплайсированных вариантов транскриптов, кодирующих несколько изоформ.^[7] HDAC7 имеет структурное и функциональное сходство с HDACs 4, 5 и 9, поскольку эти четыре HDAC составляют класс IIa HDAC у высших эукариот. HDAC класса IIa фосфорилируются кальций / кальмодулин-зависимой типазой (CaMK ) и протеинкиназы D (PKD) в ответ на киназозависимую передачу сигналов. HDAC7 обладает небольшой внутренней деацетилазной активностью и, следовательно, требует ассоциации с HDAC класса I, HDAC3 для подавления экспрессии генов. С помощью кристаллических структур человеческого HDAC7 было продемонстрировано, что каталитический домен HDAC7 имеет дополнительный связывающий цинк мотив, специфичный для класса IIa HDAC, прилегающий к активному сайту.^[8] Это, скорее всего, позволит обеспечить распознавание субстрата и белок-белковые взаимодействия, которые необходимы для ферментов HDAC класса IIa.

Альтернативные функции

Хотя было показано, что HDAC7 обладает небольшой внутренней активностью деацетилазы, исследования показали, что HDAC7 может иметь различные альтернативные функции, связанные с развитием, пролиферацией и воспалением.

Одно исследование показало, что HDAC7 подавляет пролиферацию и β-катенин активность в хондроцитах. Это было продемонстрировано путем нокаута HDAC7 у мышей, что затем привело к повышению уровня регулятора клеточного цикла, циклин D3; снижение уровня опухолевого супрессора, стр.21; и повышенный уровень активного бета-катенина. Поскольку каждый из них способствует регулированию пролиферации клеток, делеция HDAC7 увеличивает хондроцит распространение. Это исследование также показало, что передача сигналов через инсулин /Инсулиноподобный фактор роста 1 рецептор привел к увеличению уровней HDAC7 в цитозоле, чем в ядре, и к увеличению уровней активного β-катенина, что указывает на то, что HDAC7 ассоциируется с β-катенином. В течение хондрогенез, HDAC7 перемещается в цитозоль для разложения, указывая на то, что в целом HDAC7 подавляет активность β-катенина в хондроцитах.^[9]

Другое исследование подтвердило вывод, что HDAC7 и β-catenin связаны вместе, продемонстрировав, что HDAC7 контролирует рост эндотелиальных клеток посредством модуляции β-catenin. Это было показано противоположным образом по сравнению с предыдущим исследованием, поскольку HDAC7 был сверхэкспрессирован, а не удален. Они обнаружили, что сверхэкспрессия HDAC7 предотвращает ядерную транслокацию β-катенина, которая затем совпадает с подавлением регулятора клеточного цикла, циклин D1. В целом, это исследование продемонстрировало, что HDAC7 снова взаимодействует с β-катенином, чтобы поддерживать эндотелиальные клетки на стадии низкой пролиферации.^[10]

HDAC7 не только играет роль в пролиферации роста клеток в хондроцитах и ​​эндотелиальных клетках, но также было продемонстрировано, что HDAC7 является решающим игроком в пролиферации раковых клеток, благодаря исследованию, которое продемонстрировало механистическое понимание вклада HDAC7 в прогрессирование опухоли. . Это исследование показало, что нокдаун HDAC7 приводит к значительному аресту клеток между G (1) и S фазами клеточного цикла. Впоследствии нокдаун HDAC7 подавил c-Мой с экспрессия, которая в свою очередь блокирует развитие клеточного цикла. Через иммунопреципитация хроматина Анализы показали, что HDAC7 напрямую связывается с геном c-Myc и, следовательно, подавление HDAC7 снижает уровни мРНК c-Myc.^[11]

Помимо распространения, дополнительное исследование продемонстрировало, что HDAC7 способствует воспалительным ответам у макрофаги. Это было показано сверхэкспрессией HDAC7 в воспалительных макрофагах у мышей. Это чрезмерное выражение способствовало липополисахарид (LPS) -индуцируемая экспрессия HDAC-зависимых генов через HIF-1альфа -зависимый механизм. Это продемонстрировало, что HDAC7 может быть жизнеспособной мишенью для разработки новых противовоспалительных препаратов.^[12]

Взаимодействия

HDAC7A показал себя взаимодействовать с участием:

• BCL6,^[13]
• Рецептор эндотелина типа А,^[14]
• HDAC3,^[15]
• HTATIP,^[16]
• IKZF1,^[17] и
• Корепрессор ядерного рецептора 1.^[15]

Смотрите также

• Гистоновая деацетилаза

использованная литература

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000061273 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000022475 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Маркс П.А., Ричон В.М., Рифкинд Р.А. (август 2000 г.). «Ингибиторы гистондеацетилазы: индукторы дифференцировки или апоптоза трансформированных клеток». Журнал Национального института рака. 92 (15): 1210–6. Дои:10.1093 / jnci / 92.15.1210. PMID  10922406.
6. Као Х.Й., Даунс М., Ордентлич П., Эванс Р.М. (январь 2000 г.). «Выделение новой гистоновой деацетилазы показывает, что деацетилазы класса I и класса II способствуют репрессии, опосредованной SMRT». Гены и развитие. 14 (1): 55–66. Дои:10.1101 / gad.14.1.55 (неактивно 12.10.2020). ЧВК  316336. PMID  10640276.
7. «Ген Entrez: гистондеацетилаза 7A HDAC7A».
8. Шуэц А., Мин Дж., Аллали-Хассани А., Шапира М., Шуен М., Лоппнау П., Мазичек Р., Квятковски Н. П., Льюис Т.А., Маглатин Р.Л., Маклин Т.Х., Бочкарев А., Плотников А.Н., Ведади М., Эроусмит СН (апрель 2008 г.) . «HDAC7 человека несет в себе цинк-связывающий мотив, специфичный для гистондеацетилазы класса IIa, и скрытую деацетилазную активность». Журнал биологической химии. 283 (17): 11355–63. Дои:10.1074 / jbc.M707362200. ЧВК  2431080. PMID  18285338.
9. Брэдли Э.В., Карпио Л. Р., Олсон Э. Н., Вестендорф Дж. Дж. (Январь 2015 г.). «Гистоновая деацетилаза 7 (Hdac7) подавляет пролиферацию хондроцитов и активность β-катенина во время эндохондральной оссификации». Журнал биологической химии. 290 (1): 118–26. Дои:10.1074 / jbc.M114.596247. ЧВК  4281714. PMID  25389289.
10. Маргарити А., Зампетаки А., Сяо К., Чжоу Б., Карамарити Е., Мартин Д., Инь Икс, Майр М., Ли Х., Чжан З., Де Фалько Е., Ху И., Кокерилл Г., Сюй К., Цзэн Л. (апрель 2010 г.). «Гистоновая деацетилаза 7 контролирует рост эндотелиальных клеток посредством модуляции бета-катенина». Циркуляционные исследования. 106 (7): 1202–11. Дои:10.1161 / CIRCRESAHA.109.213165. PMID  20224040.
11. Чжу Ц., Чен Ц., Се З, Ай Дж, Тонг Л., Дин Дж, Гэн М. (март 2011 г.). «Роль гистондеацетилазы 7 (HDAC7) в пролиферации раковых клеток: регуляция c-Myc». Журнал молекулярной медицины. 89 (3): 279–89. Дои:10.1007 / s00109-010-0701-7. PMID  21120446. S2CID  13099326.
12. Шекспир М.Р., Гогенхаус Д.М., Келли Г.М., Камаль Н.А., Гупта П., Лабзин Л.И., Шредер К., Гарсо В., Барберо С., Айер А., Хьюм Д.А., Рид Р.С., Ирвин К.М., Фэрли Д.П., Sweet MJ (2013). «Гистондеацетилаза 7 способствует Toll-подобному рецептору 4-зависимой экспрессии провоспалительного гена в макрофагах». Журнал биологической химии. 288 (35): 25362–74. Дои:10.1074 / jbc.M113.496281. ЧВК  3757200. PMID  23853092.
13. Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (июнь 2002 г.). «Гистоновые деацетилазы класса II напрямую задействуются репрессором транскрипции BCL6» (PDF). Журнал биологической химии. 277 (24): 22045–52. Дои:10.1074 / jbc.M201736200. PMID  11929873. S2CID  19024903.
14. Ли Х.Дж., Чун М., Кандрор К.В. (май 2001 г.). «Tip60 и HDAC7 взаимодействуют с рецептором эндотелина а и могут участвовать в передаче сигналов ниже по течению». Журнал биологической химии. 276 (20): 16597–600. Дои:10.1074 / jbc.C000909200. PMID  11262386.
15. Fischle W., Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E (сентябрь 2001 г.). «Активность гистондеацетилазы HDAC7 человека связана с HDAC3 in vivo». Журнал биологической химии. 276 (38): 35826–35. Дои:10.1074 / jbc.M104935200. PMID  11466315.
16. Сяо Х, Чанг Дж, Као ХЙ, Ян YC (март 2003 г.). «Tip60 - корепрессор для STAT3». Журнал биологической химии. 278 (13): 11197–204. Дои:10.1074 / jbc.M210816200. PMID  12551922.
17. Койпалли Дж., Георгопулос К. (август 2002 г.). "Молекулярное вскрытие репрессивной схемы Икароса". Журнал биологической химии. 277 (31): 27697–705. Дои:10.1074 / jbc.M201694200. PMID  12015313.

дальнейшее чтение

• Verdin E, Dequiedt F, Kasler HG (май 2003 г.). «Гистоновые деацетилазы класса II: универсальные регуляторы». Тенденции в генетике. 19 (5): 286–93. Дои:10.1016 / S0168-9525 (03) 00073-8. PMID  12711221.
• Маруяма К., Сугано С. (январь 1994 г.). «Олиго-кэппинг: простой метод замены кэп-структуры эукариотических мРНК олигорибонуклеотидами». Ген. 138 (1–2): 171–4. Дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID  8125298.
• Судзуки Ю., Ёситомо-Накагава К., Маруяма К., Суяма А., Сугано С. (октябрь 1997 г.). «Создание и характеристика полноразмерной библиотеки кДНК, обогащенной по 5'-концу». Ген. 200 (1–2): 149–56. Дои:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID  9373149.
• Ли Х.Дж., Чун М., Кандрор К.В. (май 2001 г.). «Tip60 и HDAC7 взаимодействуют с рецептором эндотелина а и могут участвовать в передаче сигналов ниже по течению». Журнал биологической химии. 276 (20): 16597–600. Дои:10.1074 / jbc.C000909200. PMID  11262386.
• Fischle W., Dequiedt F, Fillion M, Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E (сентябрь 2001 г.). «Активность гистондеацетилазы HDAC7 человека связана с HDAC3 in vivo». Журнал биологической химии. 276 (38): 35826–35. Дои:10.1074 / jbc.M104935200. PMID  11466315.
• Lemercier C, Brocard MP, Puvion-Dutilleul F, Kao HY, Albagli O, Khochbin S (июнь 2002 г.). «Гистоновые деацетилазы класса II напрямую задействуются репрессором транскрипции BCL6» (PDF). Журнал биологической химии. 277 (24): 22045–52. Дои:10.1074 / jbc.M201736200. PMID  11929873. S2CID  19024903.
• Брайант Х., Фаррелл П.Дж. (октябрь 2002 г.). «Модификация фактора трансдукции и транскрипции во время реактивации вируса Эпштейна-Барра с задержкой». Журнал вирусологии. 76 (20): 10290–8. Дои:10.1128 / JVI.76.20.10290-10298.2002. ЧВК  136559. PMID  12239305.
• Сяо Х, Чанг Дж, Као ХЙ, Ян YC (март 2003 г.). «Tip60 - корепрессор для STAT3». Журнал биологической химии. 278 (13): 11197–204. Дои:10.1074 / jbc.M210816200. PMID  12551922.
• Dequiedt F, Kasler H, Fischle W., Kiermer V, Weinstein M, Herndier BG, Verdin E (май 2003 г.). «HDAC7, тимус-специфическая гистоновая деацетилаза класса II, регулирует транскрипцию Nur77 и апоптоз, опосредованный TCR». Иммунитет. 18 (5): 687–98. Дои:10.1016 / S1074-7613 (03) 00109-2. HDL:11858 / 00-001M-0000-002C-9FC8-8. PMID  12753745.
• Ли СН, Чавла А., Урбизтондо Н., Ляо Д., Бойсверт В.А., Эванс Р.М., Кертисс Л.К. (октябрь 2003 г.). «Транскрипционная репрессия атерогенного воспаления: модуляция с помощью PPARdelta». Наука. 302 (5644): 453–7. Bibcode:2003Наука ... 302..453Л. Дои:10.1126 / science.1087344. PMID  12970571. S2CID  25748599.
• Ли X, Сонг S, Лю Y, Ko SH, Kao HY (август 2004 г.). «Фосфорилирование гистондеацетилазы 7 модулирует ее стабильность и связь с белками 14-3-3». Журнал биологической химии. 279 (33): 34201–8. Дои:10.1074 / jbc.M405179200. PMID  15166223.
• Като Х., Тамамизу-Като С., Шибасаки Ф. (октябрь 2004 г.). «Гистондеацетилаза 7 связывается с индуцируемым гипоксией фактором 1альфа и увеличивает транскрипционную активность». Журнал биологической химии. 279 (40): 41966–74. Дои:10.1074 / jbc.M406320200. PMID  15280364.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д., Элиас Дж. Э., Виллен Дж., Ли Дж., Кон М.А., Кэнтли Л.С., Гиги С.П. (август 2004 г.). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Джин Дж., Смит Ф. Д., Старк С., Уэллс К. Д., Фосетт Дж. П., Кулкарни С., Метальников П., О'Доннелл П., Тейлор П., Тейлор Л., Зугман А., Вудгетт Дж. Р., Лангеберг Л. К., Скотт Д. Д., Поусон Т. (август 2004 г.) . «Протеомный, функциональный и доменный анализ in vivo 14-3-3 связывающих белков, участвующих в регуляции цитоскелета и клеточной организации». Текущая биология. 14 (16): 1436–50. Дои:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID  15324660. S2CID  2371325.

внешние ссылки

• HDAC7A + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.