HIST1H3I - HIST1H3I - Wikipedia

H3C11
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3WKJ, 3B95, 2C1J, 3AYW, 3WA9, 3U4S, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3U31, 2UXN, 3AZK, 2C1N, 5C11, 3QO2, 3X1V, 5C13, 4A0J, 4U68, 5AV8, 4LLB, 3U5O, 1O9S, 4FT2, 4HON, 3W99, 3ZVY, 4Z0R, 5AVC, 1CT6, 1Q3L, 3O37, 3W97, 3SOW, 3КМТ, 4YM6, 4A7J, 3UEE, 2кВт, 4F4U, 3UEF, 3UIG, 4BD3, 3AZL, 4QBR, 4F56, 3AFA, 4ЛКА, 5CPK, 5FFV, 3V43, 5CH1, 3U5P, 3AZI, 3U5N, 3АЖ, 3UIK, 4QBQ, 1U35, 4UY4, 2OT7, 5AV9, 2B2W, 3U3D, 3AZF, 3W98, 4I51, 4X3K, 4FWF, 2B2T, 2B2V, 4A0N, 2кВтДж, 3WAA, 3QJ6, 5DAH, 3AZG, 3AZE, 3X1T, 3RIY, 2L75, 3A1B, 2VPG, 4QBS, 3O35, 5CPJ, 3ZG6, 4YM5, 3AZJ, 2RI7, 3AZN, 3AVR, 5CPI, 2LBM, 3W96, 3O34, 2M0O, 4L7X, 5CH2, 5AV6, 3AZM, 4UP0, 3X1S, 2OX0, 3UII, 3СОУ, 4N4H, 4TN7, 1CS9, 3X1U, 4LXL, 2Б2У, 2OQ6, 3RIG, 5C3I, 4YHP, 5B24, 5D6Y, 4YHZ, 4Z2M, 5HJD, 5HJC, 5HJB, 5B2I, 5HYN, 5FB0, 5FB1, 5IQL, 5B2J, 5JIN
Идентификаторы
Псевдонимы	H3C11, H3.f, H3 / f, H3FF, гистоновый кластер 1, H3i, гистоновый кластер 1, член семейства H3 i, H3-кластерный гистон 11, HIST1H3I, H3C4, H3C7, H3C12, H3C2, H3C8, H3C10, H3C3, H3C6, H3C1
Внешние идентификаторы	OMIM: 602814 MGI: 2448326 ГомолоГен: 134496 Генные карты: H3C11
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 6 (человек)[1] Группа 6p22.1 Начинать 27,871,905 бп[1] Конец 27,872,315 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 13 (мышь)[2] Группа 13 | 13 A3.1 Начинать 23,561,534 бп[2] Конец 23,562,369 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • Связывание ДНК • связывание гистонов • GO: 0001948 связывание с белками • активность гетеродимеризации белков • связывание кадгерина • связывание нуклеосомной ДНК Сотовый компонент • ядерная нуклеосома • мембрана • нуклеоплазма • хромосома • внеклеточная область • ядерная хромосома • внеклеточная экзосома • ядерная хромосома, теломерная область • нуклеосома • ядро клетки • макромолекулярный комплекс Биологический процесс • теломерная организация • метаболический процесс клеточного белка • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • гетеротетрамеризация белков • коагуляция крови • Сборка нуклеосом, зависимая от репликации ДНК • регуляция сайленсинга генов • подавление хроматина на рДНК • отрицательная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • организация хроматина • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • сборка нуклеосом • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-7 • регуляция дифференцировки мегакариоцитов • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8354	319151
Ансамбль	ENSG00000275379	ENSMUSG00000069273
UniProt	P68431	P84228
RefSeq (мРНК)	NM_003533	NM_178205
RefSeq (белок)	NP_066298 NP_003520 NP_003525 NP_003527	NP_835511 NP_835510 NP_783584 NP_038576 NP_473386 NP_835734 NP_835512 NP_835587
Расположение (UCSC)	Chr 6: 27,87 - 27,87 Мб	Chr 13: 23.56 - 23.56 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H3.1 это белок что у людей кодируется HIST1H3I ген.^[5][6][7][8]

Функция

Гистоны являются основными ядерными белками, которые отвечают за нуклеосомную структуру хромосомного волокна в эукариоты. Две молекулы каждого из четырех основных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4) образуют октамер, вокруг которого примерно 146 п.н. ДНК обернуты повторяющимися звеньями, называемыми нуклеосомы. Линкерный гистон, H1, взаимодействует с линкерной ДНК между нуклеосомами и участвует в уплотнении хроматин в структуры более высокого порядка. Этот ген без интронов и кодирует член семейства гистонов H3. Транскрипты этого гена лишены полиА-хвостов, но вместо этого содержат палиндромный терминатор. Этот ген находится в небольшом кластере гистоновых генов на хромосоме 6p22-p21.3.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000275379 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск ансамбля 89: ENSMUSG00000069273 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Альбиг В., Меерганс Т., Денеке Д. (январь 1997 г.). «Характеристика гена H1.5 завершает набор генов подтипа H1 человека». Ген. 184 (2): 141–8. Дои:10.1016 / S0378-1119 (96) 00582-3. PMID  9031620.
6. Альбиг В., Дюнеке Д. (декабрь 1997 г.). «Кластер гистоновых генов человека в локусе D6S105». Генетика человека. 101 (3): 284–94. Дои:10.1007 / s004390050630. PMID  9439656. S2CID  38539096.
7. Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (ноябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
8. "Ген Entrez: HIST1H3I гистоновый кластер 1, H3i".

дальнейшее чтение

• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (декабрь 2003 г.). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 за счет ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». Журнал EMBO. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С., Ван Л., Ли Х., Ли К. Г., Доннелли Р., Уэйд Д. Д., Ламберт П., Кашанчи Ф. (октябрь 2001 г.). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П., Ван Л., Доннелли Р., Уэйд Д. Д., Ламберт П., Ли Х., Ли К. Г., Кашанчи Ф. (ноябрь 2000 г.). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (май 1998 г.). «Активация транскрипции интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека типа 1, ассоциированного с хроматином». Молекулярная и клеточная биология. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.