HIST2H2AC - HIST2H2AC - Wikipedia

H2AC20
Идентификаторы
Псевдонимы	H2AC20, H2A, H2A-GL101, H2A / q, H2AFQ, гистоновый кластер 2, H2ac, гистоновый кластер 2 Член семейства H2A c, H2A-кластерный гистон 20, HIST2H2AC
Внешние идентификаторы	OMIM: 602797 MGI: 2448316 ГомолоГен: 128596 Генные карты: H2AC20
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.2 Начинать 149,886,975 бп[1] Конец 149,887,364 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 3 (мышь)[2] Группа 3 | 3 F2.1 Начинать 96,220,361 бп[2] Конец 96,220,880 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность гетеродимеризации белков • Связывание ДНК • молекулярная функция Сотовый компонент • нуклеосома • ядро клетки • хромосома • ядерный хроматин • внеклеточная экзосома Биологический процесс • подавление хроматина • организация хроматина • биологический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	8338	319176
Ансамбль	ENSG00000184260	ENSMUSG00000068855
UniProt	Q16777	Q64523
RefSeq (мРНК)	NM_003517	NM_175662
RefSeq (белок)	NP_003508	NP_783593
Расположение (UCSC)	Chr 1: 149,89 - 149,89 Мб	Chr 3: 96.22 - 96.22 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистон H2A типа 2-C это белок что у людей кодируется HIST2H2AC ген.^[5][6][7][8]

Гистоны основные ядерные белки которые несут ответственность за нуклеосома структура хромосомного волокна в эукариоты. Две молекулы каждого из четырех ядерных гистонов (H2A, H2B, H3 и H4) образуют октамер, вокруг которых примерно 146 п.н. ДНК заключен в повторяющиеся единицы, называемые нуклеосомами. Линкерный гистон H1 взаимодействует с линкерной ДНК между нуклеосомами и функционирует в уплотнении хроматин в структуры более высокого порядка. Этот ген не имеет интронов и кодирует члена семейства гистонов H2A.^[8]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000184260 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000068855 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. Collart D, Romain PL, Huebner K, Pockwinse S, Pilapil S, Cannizzaro LA, Lian JB, Croce CM, Stein JL, Stein GS (январь 1993 г.). «Вариантный ген гистона H2B.1 человека, расположенный на хромосоме 1, использует альтернативный процессинг 3'-конца». J Cell Biochem. 50 (4): 374–85. Дои:10.1002 / jcb.240500406. PMID  1469070.
6. Альбиг В., Денеке Д. (февраль 1998 г.). «Кластер гистоновых генов человека в локусе D6S105». Hum Genet. 101 (3): 284–94. Дои:10.1007 / s004390050630. PMID  9439656.
7. Марзлуфф В.Ф., Гонджиди П., Вудс К.Р., Джин Дж., Мальтийский Л.Дж. (октябрь 2002 г.). «Репликационно-зависимые гены гистонов человека и мыши». Геномика. 80 (5): 487–98. Дои:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID  12408966.
8. «Ген Entrez: HIST2H2AC гистоновый кластер 2, H2ac».

дальнейшее чтение

• Эль Харруби А., Пирас Г., Зенсен Р., Мартин М.А. (1998). «Транскрипционная активация интегрированного промотора вируса иммунодефицита человека, ассоциированного с хроматином». Мол. Клетка. Биол. 18 (5): 2535–44. Дои:10.1128 / mcb.18.5.2535. ЧВК  110633. PMID  9566873.
• Кимура А., Хорикоши М. (1999). «Tip60 ацетилирует шесть лизинов определенного класса в коровых гистонах in vitro». Гены Клетки. 3 (12): 789–800. Дои:10.1046 / j.1365-2443.1998.00229.x. PMID  10096020.
• Дэн Л., де ла Фуэнте С., Фу П. и др. (2001). «Ацетилирование Tat ВИЧ-1 с помощью CBP / P300 увеличивает транскрипцию интегрированного генома ВИЧ-1 и усиливает связывание с коровыми гистонами». Вирусология. 277 (2): 278–95. Дои:10.1006 / viro.2000.0593. PMID  11080476.
• Дэн Л., Ван Д., де ла Фуэнте С. и др. (2001). «Повышение активности HAT p300 с помощью Tat ВИЧ-1 на ДНК хроматина». Вирусология. 289 (2): 312–26. Дои:10.1006 / viro.2001.1129. PMID  11689053.
• Чен А., Клейман Ф. Е., Мэнли Дж. Л. и др. (2002). «Аутоубиквитинирование убиквитинлигазы BRCA1 * BARD1 RING». J. Biol. Chem. 277 (24): 22085–92. Дои:10.1074 / jbc.M201252200. PMID  11927591.
• Лан Б.Т., Тан З.Л., Чжоу Дж. И др. (2002). «Ранее не охарактеризованные гистонацетилтрансферазы, участвующие в сперматогенезе млекопитающих». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (13): 8707–12. Дои:10.1073 / pnas.082248899. ЧВК  124363. PMID  12072557.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Юн Х.Г., Чан Д.В., Хуанг З.К. и др. (2003). «Очистка и функциональная характеристика комплекса N-CoR человека: роль HDAC3, TBL1 и TBLR1». EMBO J. 22 (6): 1336–46. Дои:10.1093 / emboj / cdg120. ЧВК  151047. PMID  12628926.
• Fujita K, Shimazaki N, Ohta Y и др. (2004). «Терминальная дезоксинуклеотидилтрансфераза образует тройной комплекс с новым белком ремоделирования хроматина с 82 кДа и гистоном ядра». Гены Клетки. 8 (6): 559–71. Дои:10.1046 / j.1365-2443.2003.00656.x. PMID  12786946.
• Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). «Регулирование экспрессии гена ВИЧ-1 за счет ацетилирования гистонов и набора факторов на промотор LTR». EMBO J. 22 (24): 6550–61. Дои:10.1093 / emboj / cdg631. ЧВК  291826. PMID  14657027.
• Чжан Ю., Гриффин К., Мондал Н., Парвин Дж. Д. (2004). «Фосфорилирование гистона H2A ингибирует транскрипцию на матрице хроматина». J. Biol. Chem. 279 (21): 21866–72. Дои:10.1074 / jbc.M400099200. PMID  15010469.
• Айхара Х., Накагава Т., Ясуи К. и др. (2004). «Нуклеосомная гистинкиназа-1 фосфорилирует H2A Thr 119 во время митоза в раннем эмбрионе дрозофилы». Genes Dev. 18 (8): 877–88. Дои:10.1101 / gad.1184604. ЧВК  395847. PMID  15078818.
• Ван Х, Ван Л., Эрдджумент-Бромаж Х и др. (2004). «Роль убиквитинирования гистона H2A в сайленсинге Polycomb». Природа. 431 (7010): 873–8. Дои:10.1038 / природа02985. PMID  15386022.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.
• Braastad CD, Hovhannisyan H, van Wijnen AJ, et al. (2005). «Функциональная характеристика дупликации кластера гистоновых генов человека». Ген. 342 (1): 35–40. Дои:10.1016 / j.gene.2004.07.036. PMID  15527963.
• Хагивара Т., Хидака Ю., Ямада М. (2005). «Удаление гистона H2A и H4 по аргинину 3 в гранулоцитах HL-60». Биохимия. 44 (15): 5827–34. Дои:10.1021 / bi047505c. PMID  15823041.
• Bonenfant D, Coulot M, Towbin H и др. (2006). «Характеристика вариантов гистона H2A и H2B и их посттрансляционных модификаций с помощью масс-спектрометрии». Мол. Клетка. Протеомика. 5 (3): 541–52. Дои:10.1074 / mcp.M500288-MCP200. PMID  16319397.