HIST2H3A - HIST2H3A

H3C15
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 2IIJ, 2X4 Вт, 2X4X, 2X4Y, 3AV1, 3DB3, 3MO8, 3R93, 4МЗФ, 4МЗГ, 4МЖ, 4OUC, 5BO0, 2HIO, 5B0Z, 2ARO, 1EQZ, 1HQ3, 4 КГК, 1TZY, 4UUZ, 2F8N, 5B0Y, 4LD9, 5B40, 5CIU
Идентификаторы
Псевдонимы	H3C15, H3 / n, H3 / o, гистоновый кластер 2, H3a, гистоновый кластер 2 Член семейства H3 a, HIST2H3A, H3-кластерный гистон 15, H3C14, H3C13
Внешние идентификаторы	MGI: 2448329 ГомолоГен: 133885 Генные карты: H3C15
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 1 (человек)[1] Группа 1q21.2 Начните 149,852,619 бп[1] Конец 149,854,274 бп[1]
Генная онтология Молекулярная функция • активность гетеродимеризации белков • Связывание ДНК • связывание гистонов • GO: 0001948 связывание с белками • связывание хроматина • связывание нуклеосомной ДНК Сотовый компонент • внеклеточная экзосома • внеклеточная область • нуклеоплазма • хромосома • нуклеосома • ядро клетки • хроматин Биологический процесс • метаболический процесс клеточного белка • положительная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • коагуляция крови • подавление хроматина на рДНК • сборка нуклеосом • отрицательная регуляция экспрессии генов, эпигенетическая • отрицательная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II • организация хроматина • регуляция сайленсинга генов с помощью miRNA • сигнальный путь, опосредованный интерлейкином-7 • регуляция дифференцировки мегакариоцитов • регуляция дифференцировки гемопоэтических стволовых клеток Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	333932	260423
Ансамбль	ENSG00000203852	н / д
UniProt	Q71DI3	P84228
RefSeq (мРНК)	NM_001005464	NM_013548
RefSeq (белок)	NP_066403 NP_001116847	NP_835511 NP_835510 NP_783584 NP_038576 NP_473386 NP_835734 NP_835512 NP_835587
Расположение (UCSC)	Chr 1: 149,85 - 149,85 Мб	н / д
PubMed поиск	[2]	[3]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Гистоновый кластер 2 член семейства H3 a это белок что у человека кодируется HIST2H3A ген.^[4]

Функция

Гистоны основные ядерные белки которые несут ответственность за нуклеосома структура хромосомное волокно в эукариоты. Эта структура состоит из примерно 146 п.н. ДНК, обернутой вокруг нуклеосомы, октамер состоит из пар каждого из четырех ядерных гистонов (H2A, H2B, H3, и H4 ). Волокно хроматина дополнительно уплотняется за счет взаимодействия линкера. гистон, H1, с ДНК между нуклеосомами, чтобы сформировать более высокий порядок хроматин конструкции. Этот ген без интронов и кодирует зависимый от репликации гистон, который является членом семейства гистонов H3. Транскрипты этого гена отсутствуют. полиА хвосты; вместо этого они содержат палиндромный завершающий элемент. Этот ген обнаружен в гистоновом кластере у человека. хромосома 1. Этот ген является одним из четырех дуплицированных гистоновых генов в кластере; эта запись представляет собой центромерный копия. [предоставлено RefSeq, август 2015 г.].

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000203852 - Ансамбль, Май 2017
2. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
3. «Ссылка на Mouse PubMed:». Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. «Ген Энтреса: член семейства H3 кластера гистонов 2». Получено 2018-08-05.

дальнейшее чтение

• Рутенбург AJ, Wang W, Graybosch DM, Li H, Allis CD, Patel DJ, Verdine GL (август 2006 г.). «Распознавание гистона H3 и презентация модулем WDR5 комплекса MLL1». Nat. Struct. Мол. Биол. 13 (8): 704–12. Дои:10.1038 / nsmb1119. ЧВК  4698793. PMID  16829959.
• Couture JF, Collazo E, Trievel RC (август 2006 г.). «Молекулярное распознавание гистона H3 белком WD40 WDR5». Nat. Struct. Мол. Биол. 13 (8): 698–703. Дои:10.1038 / nsmb1116. PMID  16829960.
• Родригес-Коллазо П., Снайдер С.К., Чиффер Р.К., Златанова Дж., Леуба С.Х., Смит С.Л. (январь 2008 г.). «Передача сигнала цАМФ вызывает быструю потерю фосфорилирования гистона H3 в линиях клеток, происходящих от аденокарциномы молочной железы». Exp. Cell Res. 314 (1): 1–10. Дои:10.1016 / j.yexcr.2007.09.011. ЧВК  4426871. PMID  17950276.
• Хо СС, Ченг СС, Лю Й.Х., Пей Р.Дж., Сюй Й.Х., Йе К.Т., Хо Л.К., Цай М.К., Лай Ю.С. (2008). «Возможная связь между гистоном 3 и цитокератином 18 при гепатоцеллюлярной карциноме человека». В естественных условиях. 22 (4): 457–62. PMID  18712172.
• Песня JJ, Kingston RE (декабрь 2008 г.). «WDR5 взаимодействует с белком лейкемии смешанного происхождения (MLL) через гистоновый H3-связывающий карман». J. Biol. Chem. 283 (50): 35258–64. Дои:10.1074 / jbc.M806900200. ЧВК  2596411. PMID  18840606.
• Xie W., Song C, Young NL, Sperling AS, Xu F, Sridharan R, Conway AE, Garcia BA, Plath K, Clark AT, Grunstein M (февраль 2009 г.). «Ацетилирование гистона h3 лизина 56 связано с основной транскрипционной сетью в эмбриональных стволовых клетках человека». Мол. Клетка. 33 (4): 417–27. Дои:10.1016 / j.molcel.2009.02.004. ЧВК  2671231. PMID  19250903.
• Лумис Р.Дж., Наое Ю., Паркер Дж. Б., Савич В., Бозовский М. Р., Макфарлан Т., Мэнли Дж. Л., Чакраварти Д. (февраль 2009 г.). «Связывание хроматина SRp20 и ASF / SF2 и диссоциация от митотических хромосом модулируются фосфорилированием серина 10 гистона H3». Мол. Клетка. 33 (4): 450–61. Дои:10.1016 / j.molcel.2009.02.003. ЧВК  2667802. PMID  19250906.
• Суфиоглу К., Садли Н., Кунан Д., Кумар Л., Де Мел Д., Лешейм Дж., Синклер А. Дж., Экланд Л. (февраль 2010 г.). «Цинк и DHA оказывают противоположное действие на уровни экспрессии гистонов H3 и H4 в нейрональных клетках человека». Br. J. Nutr. 103 (3): 344–51. Дои:10.1017 / S0007114509991826. PMID  19747413.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.