Herpesvirales - Herpesvirales
| Herpesvirales | |
|---|---|
 | |
| Упрощенная схема Herpesvirales структура вириона в поперечном сечении. (1) нуклеопротеин, (2) ДНК, (3) капсид, (4) тегумент, (5) оболочка, (6) гликопротеин. Нажмите, чтобы увеличить. | |
 | |
| Электронная микрофотография различных вирусов из Herpesviridae семья в том числе Альфа-герпесвирус человека 3 (Ветряная оспа ), Альфа-герпесвирус человека 1, и Альфа-герпесвирус человека 2 | |
Классификация вирусов  | |
| (без рейтинга): | Вирус |
| Область: | Дуплоднавирия |
| Королевство: | Heunggongvirae |
| Тип: | Пепловирикота |
| Учебный класс: | Herviviricetes |
| Заказ: | Herpesvirales |
| Семьи | |
И увидеть текст | |
В Herpesvirales это порядок дцДНК вирусы (Балтиморская группа I) с животными-хозяевами, характеризующимися общей морфологией, состоящей из икосаэдр капсид заключен в липидную оболочку, содержащую гликопротеин. Общие инфекции у людей, вызываемые членами этого отряда, включают: герпес, генитальный герпес, ветряная оспа, опоясывающий лишай, и железистая лихорадка. Herpesvirales это единственный заказ в классе Herviviricetes, который является единственным классом в типе Пепловирикота.
Вирусология
Морфология
Все члены отряда имеют структуру вириона, которая состоит из ядра ДНК, окруженного икосаэдрическим капсидом, состоящим из 12 пятивалентных и 150 шестивалентных. капсомеры (Т = 16). Капсид имеет диаметр ~ 110 нанометров (нм) и заключен в белковый матрикс, называемый тегументом, который, в свою очередь, окружен липидной оболочкой, содержащей гликопротеин, диаметром около 200 нм. Геном ДНК линейный и двухцепочечный с размерами в диапазоне 125–290 т.п.н.[1] Геном содержит терминальные и внутренние повторяющиеся последовательности, количество и расположение которых варьируются в зависимости от различных субкладов.
Хосты
У всех видов в этом порядке есть животные-хозяева. В Malacoherpesviridae заражают моллюсков (морских ушек и устриц), Аллохерпесвириды заразить анамниоты (лягушки и рыба), а Herpesviridae заразить амниот (рептилии, птицы и млекопитающие). В семье Herpesviridae, роды Ильтовирус и Мардивирус, и род Скутавирус подсемейства Alphaherpesvirinae заражают птиц и рептилий соответственно. Все остальные роды в Herpesviridae заражать только млекопитающих.[2]
Таксономия
По состоянию на июль 2019 года таксономия ICTV гласит, что отряд состоит из трех семейств, трех подсемейств, 19 родов и 122 видов. Таксономия показана ниже от семейства к подсемейству и роду.[3]
- Аллохерпесвириды
- Herpesviridae
- Malacoherpesviridae
История
В герпесвирус был впервые изолирован от синий гну в 1960 г. ветеринаром Уолтер Плаурайт.[4] Род Герпесвирус была создана в 1971 году в первом отчете Международный комитет по таксономии вирусов (ICTV). Этот род состоял из 23 вирусов и 4 групп вирусов. Во втором отчете ICTV в 1976 году этот род был повышен до уровня семейства - Herpetoviridae. Из-за возможной путаницы с вирусами, полученными из рептилии это название было изменено в третьем отчете в 1979 г. на Herpesviridae. В этом отчете семья Herpesviridae был разделен на 3 подсемейства (Alphaherpesvirinae, Betaherpesvirinae и Гаммагерпесвирины) и 5 безымянных родов: перечислен 21 вирус. В 2009 году семья Herpesviridae был возведен в порядок Herpesvirales. Это повышение было вызвано открытием, что герпесвирусы рыбы и моллюски были лишь отдаленно родственниками птицы и млекопитающие.[5] Были созданы две новые семьи - семья Аллохерпесвириды который включает вирусы костных рыб и лягушек, а также вирусы семейства Malacoherpesviridae который содержит моллюсков.
Филогенетика
Единственный белок с широко распространенной консервативностью среди всех членов отряда, хотя и только на аминокислотном уровне, - это субъединица АТФазы в ДНК-терминазе;[1] последний участвует в упаковке ДНК во время сборки вириона.[6]
Филогении, построенные с использованием консервативных участков субъединицы АТФазы ДНК-терминазы, предполагают, что Аллохерпесвириды базальный клады порядка, и что Herpesviridae и Malacoherpesviridae сестры-клады.[7] Учитывая филогенетические расстояния между позвоночными и моллюсками, это предполагает, что герпесвирусы изначально были вирусами рыб и что они эволюционировали вместе со своими хозяевами, чтобы инфицировать других позвоночных.[нужна цитата ]
Номенклатура видов
В Herpesvirales Система именования зародилась в 1973 году и с тех пор претерпела значительные изменения. Все герпесвирусы, описанные с момента принятия этой системы, были названы в соответствии с ней. Рекомендуемая система именования определяет, что название каждого вида состоит из трех частей: первого слова, второго слова и, наконец, числа.
Первое слово должно происходить от таксона (семейства или подсемейства), к которому принадлежит его основной естественный хозяин. Название подсемейства используется для вирусов от членов семейства. Bovidae или из приматы (название вируса, оканчивающееся на –ine, например, bovine), и имя семейства хозяев для других вирусов (заканчивающееся на –id, например, equid). Герпесвирусы человека рассматриваются как исключение (человек скорее, чем гоминид). Согласно термину, производному от хозяина, виды в семействе Herpesviridae, которые делятся на подсемейства Alphaherpesvirinae, Betaherpesvirinae, и Гаммагерпесвирины, будет слово альфа-герпесвирус, бета-герпесвирус, или же гаммагерпесвирус добавлены соответственно. Виды в Herpesviridae которые не были отнесены к подсемейству, и виды в Аллохерпесвириды и Malacoherpesviridae буду иметь герпесвирус вместо этого после термина, производного от хоста. Наконец арабское число (1, 2, 3и т. д.) добавляется. Номера присваиваются в порядке наименования и не имеют подразумеваемого значения таксономических или биологических свойств вируса.
Пример такого имени: Собачий альфогерпесвирус 1. По этому названию можно установить, что основным естественным хозяином вируса является собака (т. Е. Член семейства Canidae; собаки и т. д.), что это член семьи Herpesviridae и подсемейство Alphaherpesvirinaeи что это первый герпесвирус, названный в честь которого псовые служат основными естественными хозяевами.
Ряд названий вирусов (например, Вирус Эпштейна-Барра, также известный как Человеческий гаммагерпесвирус 4) настолько широко используются, что может быть непрактично настаивать на их замене. Это привело к двойной номенклатуре в литературе некоторых вирусов герпеса.
Рекомендации
- ^ а б Дэвисон, Эндрю Дж .; Эберле, Ричард; Элерс, Бернхард; Hayward, Gary S .; МакГеоч, Дункан Дж .; Минсон, Энтони С .; Pellett, Philip E .; Ройзман, Бернард; Студдерт, Майкл Дж. (2009). «Порядок Herpesvirales». Архив вирусологии. 154 (1): 171–177. Дои:10.1007 / s00705-008-0278-4. ISSN 1432-8798. ЧВК 3552636. PMID 19066710.
- ^ МакГеоч, Дункан Дж .; Дэвисон, Эндрю Дж .; Долан, Эйдан; Собиратель, Дерек; Севилья-Рейес, Эдгар Э. (2008). ДОМИНГО, ЭСТЕБАН; ПАРИШ, КОЛИН Р .; ХОЛЛАНД, ДЖОН Дж. (Ред.). Происхождение и эволюция вирусов (Второе изд.). Лондон: Academic Press. стр.447 –475. ISBN 9780123741530.
- ^ «Список основных видов ICTV 2018b.v2». Международный комитет по таксономии вирусов. Получено 9 июля 2019.
- ^ О.А., Райдер; Берд, М. (1984). Одно лекарство: дань уважения Курту Бениршке, директору Центра воспроизводства исчезающих видов зоологического общества Сан-Диего и профессору патологии и репродуктивной медицины Калифорнийского университета в Сан-Диего от его студентов и коллег. Берлин, Гейдельберг: Springer. С. 296–308. ISBN 978-3-642-61749-2.
- ^ Дункан Дж. МакГеоч, Эндрю Дж. Дэвисон, Эйдан Долан, Дерек Гатерер, Эдгар Э. Севилья-Рейес (2008). Происхождение и эволюция вирусов (Второе изд.). Академическая пресса. с. Глава 20: 447–475.CS1 maint: несколько имен: список авторов (связь)
- ^ Сельвараджан Сигамани, Сундаресан; Чжао, Хайянь; Камау, Ивонн Н .; Baines, Joel D .; Тан, Лян (июнь 2013 г.). «Структура нуклеазного домена pUL15, упаковывающего ДНК вируса простого герпеса, предполагает эволюционное происхождение эукариотических и прокариотических вирусов». Журнал вирусологии. 87 (12): 7140–7148. Дои:10.1128 / JVI.00311-13. ISSN 1098-5514. ЧВК 3676077. PMID 23596306.
- ^ Ракус, Кшиштоф; Оуян, Пинг; Бутье, Максим; Ронсманс, Майган; Решнер, Анка; Ванцок, Екатерина; Язовецкая-Ракус, Иоанна; Вандерплашен, Ален (2013). «Cyprinid herpesvirus 3: интересный вирус для прикладных и фундаментальных исследований». Ветеринарные исследования. 44 (1): 85. Дои:10.1186/1297-9716-44-85. ISSN 0928-4249. ЧВК 3850573. PMID 24073814.
