IQSEC1 - IQSEC1

IQSEC1
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3QWM, 4C0A
Идентификаторы
Псевдонимы	IQSEC1, ARF-GEP100, ARFGEP100, BRAG2, GEP100, мотив IQ и домен 1 Sec7, мотив IQ и домен Sec7 ArfGEF 1, IDDSSBA
Внешние идентификаторы	OMIM: 610166 MGI: 1196356 ГомолоГен: 82429 Генные карты: IQSEC1
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 3 (человек)[1] Группа 3п25.2-п25.1 Начинать 12,897,043 бп[1] Конец 13,283,281 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 6 (мышь)[2] Группа 6 D1 | 6 40,16 см Начинать 90,656,088 бп[2] Конец 90,988,685 бп[2]
Экспрессия РНК шаблон Дополнительные данные эталонного выражения
Генная онтология Молекулярная функция • активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • связывание липидов • ARF активность фактора обмена гуанил-нуклеотидов • GO: 0001948 связывание с белками Сотовый компонент • цитоплазма • мембрана • ядро клетки • ядрышко • внутриклеточная мембраносвязанная органелла Биологический процесс • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 положительная регуляция активности GTPase • регуляция передачи сигнала белка ARF • организация актинового цитоскелета • положительное регулирование миграции кератиноцитов • Положительное регулирование организации стыковок Источники:Амиго / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	9922	232227
Ансамбль	ENSG00000144711	ENSMUSG00000034312
UniProt	Q6DN90	Q8R0S2
RefSeq (мРНК)	NM_001134382 NM_014869 NM_001330619 NM_001376938	NM_001134383 NM_001134384 NM_182784 NM_001356440
RefSeq (белок)	NP_001127854 NP_001317548 NP_055684 NP_001363867	NP_001127855 NP_001127856 NP_001343369
Расположение (UCSC)	Chr 3: 12.9 - 13.28 Мб	Chr 6: 90.66 - 90.99 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Мотив IQ и белок 1, содержащий домен SEC7 также известный как АРФ-ГЭП₁₀₀ (АDP-рибозилирование Fактер - граммуаниновый нуклеотидEобмен пrotein - 100 кДа) представляет собой белок что у людей кодируется IQSEC1 ген.^[5][6]

Функция

АРФ-ГЭП₁₀₀ белок участвует в преобразование сигнала. Это фактор обмена гуаниновых нуклеотидов что способствует связыванию GTP к Фактор рибозилирования АДФ белок ARF6 и в меньшей степени ARF1 и ARF5.^[6] Это активирует активность ADP-рибозилирования целевого белка и заставляет его модифицировать свои субстраты. АРФ-ГЭП₁₀₀посредством активации ARF6, следовательно, участвует в управлении такими процессами, как эндоцитоз из плазматическая мембрана белки, E-кадгерин переработка и актин цитоскелет ремоделирование.^[7] АРФ-ГЭП₁₀₀ оказывается особенно важным в регулировании клеточная адгезия, со снижением уровня этого белка, вызывающим усиленное распространение и прикрепление клеток.^[8]

Он высоко экспрессируется в префронтальной коре и во всем остальном мозге и, как полагают, играет роль в обучении и памяти, поскольку был обнаружен как фосфорилированный на фосфорилированном экране PSD.^[9]

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000144711 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000034312 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Ген Entrez: мотив IQ IQSEC1 и домен 1 Sec7».
6. Someya A, Sata M, Takeda K, Pacheco-Rodriguez G, Ferrans VJ, Moss J, Vaughan M (февраль 2001 г.). "ARF-GEP100, гуанин-нуклеотидный обменный белок для фактора 6 ADP-рибозилирования". Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 98 (5): 2413–8. Дои:10.1073 / pnas.051634798. ЧВК  30152. PMID  11226253.
7. Хирои Т., Сомея А., Томпсон В., Мосс Дж., Воган М. (2006). «GEP100 / BRAG2: активатор фактора ADP-рибозилирования 6 для регуляции клеточной адгезии и актинового цитоскелета через E-кадгерин и α-катенин». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 103 (28): 10672–7. Дои:10.1073 / pnas.0604091103. ЧВК  1502290. PMID  16807291.
8. Данфи Дж. Л., Моравек Р., Лай К., Ласелл Т. К., Меланкон П., Казанова Дж. Э. (2006). «Arf6 GEF GEP100 / BRAG2 регулирует клеточную адгезию, контролируя эндоцитоз интегринов бета1». Curr. Биол. 16 (3): 315–20. Дои:10.1016 / j.cub.2005.12.032. ЧВК  3600433. PMID  16461286.
9. Trinidad JC, Specht CG, Thalhammer A, Schoepfer R, Burlingame AL (май 2006 г.). «Комплексная идентификация сайтов фосфорилирования в препаратах постсинаптической плотности». Мол. Клетка. Протеомика. 5 (5): 914–22. Дои:10.1074 / mcp.T500041-MCP200. PMID  16452087.

дальнейшее чтение

• Андерссон Б., Вентланд М.А., Рикафренте Д.Ю. и др. (1996). «Метод« двойного адаптера »для улучшения конструкции библиотеки дробовиков». Анальный. Биохим. 236 (1): 107–13. Дои:10.1006 / abio.1996.0138. PMID  8619474.
• Ю. В., Андерссон Б., Уорли К. С. и др. (1997). «Крупномасштабное конкатенационное секвенирование кДНК». Genome Res. 7 (4): 353–8. Дои:10.1101 / гр. 7.4.353. ЧВК  139146. PMID  9110174.
• Нагасе Т., Исикава К., Суяма М. и др. (1999). «Прогнозирование кодирующих последовательностей неидентифицированных генов человека. XI. Полные последовательности 100 новых клонов кДНК из мозга, которые кодируют большие белки in vitro». ДНК Res. 5 (5): 277–86. Дои:10.1093 / днарес / 5.5.277. PMID  9872452.
• Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002ПНАС ... 9916899М. Дои:10.1073 / pnas.242603899. ЧВК  139241. PMID  12477932.
• Босолей С.А., Едриховски М., Шварц Д. и др. (2004). «Широкомасштабная характеристика ядерных фосфопротеинов клеток HeLa». Proc. Natl. Акад. Sci. СОЕДИНЕННЫЕ ШТАТЫ АМЕРИКИ. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004ПНАС..10112130Б. Дои:10.1073 / pnas.0404720101. ЧВК  514446. PMID  15302935.
• Герхард Д.С., Вагнер Л., Фейнгольд Е.А. и др. (2004). "Статус, качество и расширение проекта NIH полноразмерной кДНК: Коллекция генов млекопитающих (MGC)". Genome Res. 14 (10B): 2121–7. Дои:10.1101 / гр.2596504. ЧВК  528928. PMID  15489334.

внешняя ссылка

• IQSEC1 + белок, + человеческий в Национальной медицинской библиотеке США Рубрики медицинской тематики (MeSH)