KDM8 - KDM8 - Wikipedia

KDM8
Доступные конструкции PDB Поиск ортолога: PDBe RCSB Список идентификационных кодов PDB 3UYJ, 4AAP, 4ГАЗ, 4GJY, 4GJZ, 4QU1
Идентификаторы
Псевдонимы	KDM8, JMJD5, лизин деметилаза 8
Внешние идентификаторы	OMIM: 611917 MGI: 1924285 ГомолоГен: 49791 Генные карты: KDM8
Расположение гена (человек) Chr. Хромосома 16 (человек)[1] Группа 16п12.1 Начинать 27,203,495 бп[1] Конец 27,221,768 бп[1]
Расположение гена (Мышь) Chr. Хромосома 7 (мышь)[2] Группа 7 | 7 F3 Начинать 125,444,676 бп[2] Конец 125,462,269 бп[2]
Генная онтология Молекулярная функция • активность диоксигеназы • связывание хроматина • оксидоредуктазная активность • связывание ионов металлов • активность гистон-деметилазы (специфическая для H3-K36) • гистоновая деметилаза активность • GO: 0001948 связывание с белками • пептидазная активность • гидролазная активность • аминопептидазная активность • эндопептидазная активность • оксидоредуктазная активность, действующая на парные доноры, с включением или восстановлением молекулярного кислорода, 2-оксоглутарат в качестве одного донора и включение одного атома кислорода в оба донора • связывание метилированного гистона Сотовый компонент • ядро клетки • нуклеоплазма • цитозоль • хромосома Биологический процесс • регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • клеточный цикл • G2 / M переход митотического клеточного цикла • окислительно-восстановительный процесс • позитивная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • деметилирование гистона H3-K36 • транскрипция, ДНК-шаблон • протеолиз • организация хроматина • дестабилизация белков • циркадная регуляция экспрессии генов • отрицательная регуляция транскрипции, ДНК-шаблон • ритмический процесс Источники:Amigo / QuickGO
Ортологи
Разновидность	Человек	Мышь
Entrez	79831	77035
Ансамбль	ENSG00000155666	ENSMUSG00000030752
UniProt	Q8N371	Q9CXT6
RefSeq (мРНК)	NM_001145348 NM_024773	NM_029842
RefSeq (белок)	NP_001138820 NP_079049	NP_084118
Расположение (UCSC)	Chr 16: 27,2 - 27,22 Мб	Chr 7: 125.44 - 125.46 Мб
PubMed поиск	[3]	[4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человека Просмотр / редактирование мыши

Лизин деметилаза 8 это белок что у людей кодируется KDM8 ген.^[5]

Функция

Этот ген, вероятно, кодирует гистон лизин деметилаза. Исследования аналогичного белка на мышах указывают на потенциальную роль этого белка как подавитель опухолей. Альтернативно сращивание варианты расшифровки были описаны.

Рекомендации

1. ГРЧ38: Ансамбль выпуск 89: ENSG00000155666 - Ансамбль, Май 2017
2. GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000030752 - Ансамбль, Май 2017
3. "Справочник человека по PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
4. "Ссылка на Mouse PubMed:". Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
5. «Энтрез Ген: лизин деметилаза 8». Получено 2016-04-09.

дальнейшее чтение

• Сузуки Т., Минехата К., Акаги К., Дженкинс Н.А., Коупленд Н.Г. (2006). «Идентификация гена-супрессора опухоли с использованием инсерционного мутагенеза ретровирусов у мышей с дефицитом Blm». EMBO J. 25 (14): 3422–31. Дои:10.1038 / sj.emboj.7601215. ЧВК  1523184. PMID  16858412.

Эта статья включает текст из Национальная медицинская библиотека США, который находится в всеобщее достояние.